More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1236 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_1236  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
765 aa  1560    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1060  glycosyl transferase group 1  51.01 
 
 
789 aa  724    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.126752 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0925  glycosyl transferase, group 1  50.14 
 
 
761 aa  687    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.259199  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1162  glycosyl transferase group 1  53.72 
 
 
790 aa  832    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5324  glycosyltransferase  48.18 
 
 
759 aa  703    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0865  glycosyl transferase, group 1  48.85 
 
 
763 aa  705    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.926448  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1363  glycosyl transferase group 1  57.35 
 
 
774 aa  856    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.744845  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0284  glycosyl transferase group 1  46.99 
 
 
780 aa  682    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5161  glycosyl transferase group 1  41.32 
 
 
747 aa  580  1e-164  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.510872  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3138  glycosyltransferase (group I)  37.88 
 
 
797 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.150629  normal  0.748341 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1455  glycosyl transferase group 1  40.03 
 
 
759 aa  562  1e-158  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.402299  normal  0.663839 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2577  glycosyl transferase, group 1  45.47 
 
 
767 aa  558  1e-157  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.161849  normal  0.709022 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0740  glycosyl transferase, group 1  41.52 
 
 
823 aa  511  1e-143  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2506  glycosyl transferase group 1  34.36 
 
 
774 aa  374  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4312  glycosyl transferase, group 1  30.27 
 
 
756 aa  370  1e-101  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.49569  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7536  glycosyl transferase group 1  34.47 
 
 
762 aa  342  1e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.961442  normal  0.148012 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1623  glycosyl transferase group 1  40.64 
 
 
386 aa  323  7e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0932889  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1450  glycosyl transferase group 1  40.36 
 
 
411 aa  309  2.0000000000000002e-82  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.925912  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1786  glycosyl transferase, group 1  40 
 
 
391 aa  295  2e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3114  glycosyl transferase, group 1  38.71 
 
 
391 aa  289  1e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1916  glycosyltransferase  38.07 
 
 
390 aa  278  3e-73  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0360  glycosyl transferase group 1  40.58 
 
 
405 aa  276  8e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1240  glycosyl transferase group 1  40.05 
 
 
395 aa  270  8.999999999999999e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0782  glycosyl transferase group 1  37.28 
 
 
397 aa  264  4.999999999999999e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.215442  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5602  glycosyl transferase group 1  35.66 
 
 
399 aa  244  5e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.115159  normal  0.982088 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1622  hypothetical protein  36.28 
 
 
360 aa  223  9.999999999999999e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.681183  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3115  hypothetical protein  35.48 
 
 
337 aa  220  7.999999999999999e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5603  glycosyltransferase  36.34 
 
 
364 aa  213  1e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.183412  normal  0.950929 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3438  glycosyl transferase group 1  35.23 
 
 
416 aa  206  1e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.908331 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1449  glycosyl transferase  32.96 
 
 
353 aa  200  6e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1785  hypothetical protein  30.99 
 
 
349 aa  198  3e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5224  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
393 aa  196  1e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3376  glycosyl transferase group 1  35.03 
 
 
399 aa  192  2e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000624508  hitchhiker  0.000924483 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1052  glycosyl transferase, group 1  35.05 
 
 
371 aa  191  5.999999999999999e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5216  glycosyl transferase, group 1  32.98 
 
 
392 aa  184  7e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.088872  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7428  glycosyl transferase group 1  33.96 
 
 
388 aa  183  8.000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.223976  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1042  glycosyl transferase, group 1  33.51 
 
 
378 aa  179  2e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5289  glycosyl transferase group 1  34.41 
 
 
405 aa  176  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.213842  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0542  glycosyl transferase group 1  32.83 
 
 
414 aa  172  3e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0783  glycosyltransferase  33.33 
 
 
404 aa  162  2e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.482662  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1241  hypothetical protein  33.14 
 
 
371 aa  162  2e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5215  putative glycosyltransferase  38.32 
 
 
340 aa  162  2e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.191261  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0790  glycosyl transferase, group 1  31.18 
 
 
393 aa  162  2e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0804  glycosyl transferase, group 1  31.18 
 
 
393 aa  162  2e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.26617  normal  0.0900137 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0785  glycosyl transferase, group 1  31.64 
 
 
393 aa  162  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.967061 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0543  hypothetical protein  38.3 
 
 
338 aa  158  3e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.539162  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3440  mannosyltransferase  32.94 
 
 
348 aa  157  6e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.106882  normal  0.942853 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1053  putative glycosyltransferase  37.05 
 
 
340 aa  155  4e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0361  hypothetical protein  30.88 
 
 
378 aa  148  3e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1917  hypothetical protein  30.42 
 
 
339 aa  139  2e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3375  glycosyl transferase  35.8 
 
 
351 aa  127  1e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000640117  hitchhiker  0.00216931 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1965  hypothetical protein  32.41 
 
 
367 aa  122  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.234327 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4283  glycosyl transferase, group 1  29.97 
 
 
396 aa  86.3  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00772283 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3353  glycosyl transferase group 1  27.84 
 
 
381 aa  85.5  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.207762  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2856  glycosyl transferase, group 1  27.05 
 
 
388 aa  76.3  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.258995 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0095  glycosyl transferase group 1  33.74 
 
 
378 aa  74.7  0.000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.844499 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2571  glycosyl transferase group 1  25.41 
 
 
386 aa  73.6  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2715  glycosyl transferase group 1  26.52 
 
 
375 aa  72  0.00000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0676  glycosyl transferase, group 1  28.67 
 
 
396 aa  71.6  0.00000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.063849  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35680  hypothetical protein  28.77 
 
 
395 aa  71.2  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000110612 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3533  glycosyl transferase, group 1 family protein PslF  25.68 
 
 
392 aa  70.9  0.00000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0609585  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4841  glycosyl transferase, group 1  25.17 
 
 
374 aa  70.1  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000142373  normal  0.0561788 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6234  glycosyl transferase group 1  28.12 
 
 
366 aa  70.5  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.130468  normal  0.465121 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3005  hypothetical protein  28.77 
 
 
395 aa  69.7  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.036404  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0761  glycosyl transferase group 1  24.28 
 
 
748 aa  67  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3942  glycosyl transferase group 1  25.14 
 
 
395 aa  67  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.484579  normal  0.520896 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1114  glycosyltransferase (group I)  23.62 
 
 
404 aa  66.6  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  22.74 
 
 
536 aa  66.2  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3305  glycosyl transferase, group 1  25.36 
 
 
392 aa  65.5  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0317499  normal  0.753589 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6388  glycosyl transferase group 1  29.81 
 
 
438 aa  65.1  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.570684  normal  0.371052 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1473  hypothetical protein  26.27 
 
 
383 aa  64.7  0.000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.574733  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2141  glycosyltransferase  24.6 
 
 
416 aa  64.3  0.000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00102383  normal  0.405566 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3213  glycosyl transferase group 1  24.1 
 
 
411 aa  64.3  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.312231  normal  0.69629 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3362  glycosyl transferase, group 1  26.51 
 
 
433 aa  63.9  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0581443 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0255  glycosyl transferase group 1  31.77 
 
 
358 aa  63.9  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0582  glycosyl transferase group 1  20.68 
 
 
374 aa  63.9  0.00000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.838889  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5640  glycosyl transferase, group 1  29.49 
 
 
438 aa  63.2  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.172665 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2343  glycosyl transferase group 1  26.02 
 
 
350 aa  63.2  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2372  glycosyl transferase, group 1  26.63 
 
 
383 aa  62.4  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.732911  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3727  glycosyl transferase group 1  26.64 
 
 
672 aa  62.4  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121085  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6430  glycosyl transferase group 1  26.21 
 
 
366 aa  62  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.706841  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0395  glycosyl transferase group 1  22.22 
 
 
378 aa  62  0.00000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.988234  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5195  glycosyl transferase group 1  25.48 
 
 
396 aa  62  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.3048e-16 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  21.95 
 
 
388 aa  61.6  0.00000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1135  glycosyl transferase, group 1  27.2 
 
 
380 aa  61.6  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.683403  hitchhiker  0.00885425 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1996  glycosyl transferase group 1  29.3 
 
 
364 aa  61.6  0.00000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.55506 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  28.23 
 
 
393 aa  61.2  0.00000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0241  lipopolysaccharide transferase family protein  22.8 
 
 
384 aa  61.2  0.00000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5045  glycosyl transferase group 1  26.17 
 
 
422 aa  60.8  0.00000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.022612 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1191  glycosyl transferase, group 1  24.4 
 
 
384 aa  60.5  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1819  glycosyl transferase group 1  26.64 
 
 
373 aa  60.5  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103327  normal  0.199615 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4161  glycosyl transferase group 1  30.61 
 
 
392 aa  60.1  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1104  glycosyl transferase, group 1  24.8 
 
 
396 aa  60.1  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0552505  hitchhiker  0.00694846 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2900  glycosyl transferase, group 1  25.78 
 
 
421 aa  60.1  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6048  glycosyl transferase group 1  28.8 
 
 
439 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0604596 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5452  glycosyl transferase group 1  28.3 
 
 
438 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  hitchhiker  0.00474748 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  27 
 
 
378 aa  58.5  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  27.1 
 
 
423 aa  58.5  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1373  glycosyl transferase, group 1  28.8 
 
 
439 aa  58.5  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6456  glycosyl transferase, group 1  28.8 
 
 
439 aa  58.5  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.338178  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>