34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0543 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_0543  hypothetical protein  100 
 
 
338 aa  666    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.539162  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3375  glycosyl transferase  60.7 
 
 
351 aa  296  3e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000640117  hitchhiker  0.00216931 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1965  hypothetical protein  55.39 
 
 
367 aa  267  2e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.234327 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1053  putative glycosyltransferase  51.22 
 
 
340 aa  262  6e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5215  putative glycosyltransferase  49.24 
 
 
340 aa  256  3e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.191261  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0865  glycosyl transferase, group 1  38.91 
 
 
763 aa  204  2e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.926448  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2577  glycosyl transferase, group 1  44 
 
 
767 aa  189  5e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.161849  normal  0.709022 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1363  glycosyl transferase group 1  37.65 
 
 
774 aa  177  2e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.744845  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1785  hypothetical protein  30.09 
 
 
349 aa  177  3e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5324  glycosyltransferase  35.65 
 
 
759 aa  175  8e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1236  glycosyl transferase group 1  38.3 
 
 
765 aa  172  5.999999999999999e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1162  glycosyl transferase group 1  35.24 
 
 
790 aa  172  9e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3115  hypothetical protein  29.91 
 
 
337 aa  166  5e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1060  glycosyl transferase group 1  36.78 
 
 
789 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.126752 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1241  hypothetical protein  36.72 
 
 
371 aa  161  2e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1455  glycosyl transferase group 1  32.11 
 
 
759 aa  160  3e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.402299  normal  0.663839 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0284  glycosyl transferase group 1  34.45 
 
 
780 aa  157  2e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1449  glycosyl transferase  28.74 
 
 
353 aa  155  1e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5161  glycosyl transferase group 1  32.32 
 
 
747 aa  154  2e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.510872  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3138  glycosyltransferase (group I)  29.18 
 
 
797 aa  151  2e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.150629  normal  0.748341 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0740  glycosyl transferase, group 1  36.65 
 
 
823 aa  151  2e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5603  glycosyltransferase  32.3 
 
 
364 aa  150  4e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.183412  normal  0.950929 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1622  hypothetical protein  30.25 
 
 
360 aa  149  7e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.681183  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0361  hypothetical protein  33.43 
 
 
378 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0783  glycosyltransferase  34.05 
 
 
404 aa  144  3e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.482662  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3440  mannosyltransferase  37.13 
 
 
348 aa  142  8e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.106882  normal  0.942853 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7536  glycosyl transferase group 1  36.28 
 
 
762 aa  139  7.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.961442  normal  0.148012 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0925  glycosyl transferase, group 1  35.48 
 
 
761 aa  136  4e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.259199  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4312  glycosyl transferase, group 1  30.56 
 
 
756 aa  132  7.999999999999999e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.49569  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2506  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
774 aa  124  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1917  hypothetical protein  28.96 
 
 
339 aa  110  3e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0361  hypothetical protein  34.48 
 
 
480 aa  51.6  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3891  hypothetical protein  54.35 
 
 
703 aa  45.8  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2270  hypothetical protein  48.89 
 
 
672 aa  43.5  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.417256  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>