More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2577 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2577  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 767 aa  1515    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.161849  normal  0.709022 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0925  glycosyl transferase, group 1  50.48 
 
 		 761 aa  651    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.259199  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0740  glycosyl transferase, group 1  50.34 
 
 		 823 aa  687    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1060  glycosyl transferase group 1  47.55 
 
 		 789 aa  657    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.126752 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1363  glycosyl transferase group 1  45.74 
 
 		 774 aa  629  1e-179  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.744845  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5324  glycosyltransferase  44.86 
 
 		 759 aa  615  1e-175  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1162  glycosyl transferase group 1  42.47 
 
 		 790 aa  615  1e-175  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1236  glycosyl transferase group 1  45.47 
 
 		 765 aa  590  1e-167  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0865  glycosyl transferase, group 1  41.87 
 
 		 763 aa  575  1.0000000000000001e-163  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.926448  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0284  glycosyl transferase group 1  42.11 
 
 		 780 aa  578  1.0000000000000001e-163  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1455  glycosyl transferase group 1  37.45 
 
 		 759 aa  503  1e-141  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.402299  normal  0.663839 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5161  glycosyl transferase group 1  37.36 
 
 		 747 aa  490  1e-137  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.510872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3138  glycosyltransferase (group I)  32.76 
 
 		 797 aa  436  1e-121  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.150629  normal  0.748341 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2506  glycosyl transferase group 1  35.93 
 
 		 774 aa  381  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7536  glycosyl transferase group 1  37.62 
 
 		 762 aa  368  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.961442  normal  0.148012 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4312  glycosyl transferase, group 1  29.32 
 
 		 756 aa  349  1e-94  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.49569  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1623  glycosyl transferase group 1  37.27 
 
 		 386 aa  283  1e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0932889  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1786  glycosyl transferase, group 1  36.81 
 
 		 391 aa  277  5e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3114  glycosyl transferase, group 1  36.15 
 
 		 391 aa  273  7e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1450  glycosyl transferase group 1  35.6 
 
 		 411 aa  272  2e-71  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.925912  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0360  glycosyl transferase group 1  37.67 
 
 		 405 aa  253  9.000000000000001e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1240  glycosyl transferase group 1  38.46 
 
 		 395 aa  251  5e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0782  glycosyl transferase group 1  36.29 
 
 		 397 aa  245  1.9999999999999999e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.215442  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1916  glycosyltransferase  32.8 
 
 		 390 aa  228  4e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3115  hypothetical protein  35.5 
 
 		 337 aa  222  1.9999999999999999e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1449  glycosyl transferase  35.99 
 
 		 353 aa  211  5e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1785  hypothetical protein  33.73 
 
 		 349 aa  210  8e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3438  glycosyl transferase group 1  37.77 
 
 		 416 aa  206  2e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.908331 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5602  glycosyl transferase group 1  32.32 
 
 		 399 aa  205  2e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.115159  normal  0.982088 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0543  hypothetical protein  42.41 
 
 		 338 aa  186  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.539162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5224  glycosyl transferase, group 1  33.25 
 
 		 393 aa  183  1e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1052  glycosyl transferase, group 1  33.51 
 
 		 371 aa  182  2e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1622  hypothetical protein  31.84 
 
 		 360 aa  182  2e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.681183  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1042  glycosyl transferase, group 1  33.51 
 
 		 378 aa  180  8e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0542  glycosyl transferase group 1  33.41 
 
 		 414 aa  180  1e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5603  glycosyltransferase  34.11 
 
 		 364 aa  174  5e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.183412  normal  0.950929 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5216  glycosyl transferase, group 1  32 
 
 		 392 aa  173  1e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.088872  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5289  glycosyl transferase group 1  34.25 
 
 		 405 aa  172  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.213842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0790  glycosyl transferase, group 1  34.88 
 
 		 393 aa  169  1e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0804  glycosyl transferase, group 1  34.88 
 
 		 393 aa  169  1e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.26617  normal  0.0900137 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0785  glycosyl transferase, group 1  34.88 
 
 		 393 aa  169  1e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.967061 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3376  glycosyl transferase group 1  35.53 
 
 		 399 aa  169  2e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000624508  hitchhiker  0.000924483 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3440  mannosyltransferase  37.5 
 
 		 348 aa  163  1e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.106882  normal  0.942853 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7428  glycosyl transferase group 1  32.71 
 
 		 388 aa  162  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.223976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1965  hypothetical protein  41.79 
 
 		 367 aa  156  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.234327 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0783  glycosyltransferase  34.83 
 
 		 404 aa  155  2.9999999999999998e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.482662  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1241  hypothetical protein  35.55 
 
 		 371 aa  150  9e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0361  hypothetical protein  33.98 
 
 		 378 aa  146  1e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1917  hypothetical protein  30.72 
 
 		 339 aa  144  5e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5215  putative glycosyltransferase  36.14 
 
 		 340 aa  142  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.191261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1053  putative glycosyltransferase  36.31 
 
 		 340 aa  139  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3375  glycosyl transferase  39.69 
 
 		 351 aa  137  9.999999999999999e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000640117  hitchhiker  0.00216931 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2715  glycosyl transferase group 1  30.39 
 
 		 375 aa  95.5  3e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0395  glycosyl transferase group 1  20.71 
 
 		 378 aa  87.8  8e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.988234  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4604  glycosyl transferase group 1  26.42 
 
 		 371 aa  83.2  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000112819  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3353  glycosyl transferase group 1  26.55 
 
 		 381 aa  81.3  0.00000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.207762  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0095  glycosyl transferase group 1  32.24 
 
 		 378 aa  80.1  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.844499 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2571  glycosyl transferase group 1  25.95 
 
 		 386 aa  80.1  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6234  glycosyl transferase group 1  27.4 
 
 		 366 aa  77.8  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.130468  normal  0.465121 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2856  glycosyl transferase, group 1  27.89 
 
 		 388 aa  77.4  0.0000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.258995 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1080  glycosyl transferase group 1  30.5 
 
 		 394 aa  75.9  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.184829  normal  0.928063 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0582  glycosyl transferase group 1  22.1 
 
 		 374 aa  75.1  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.838889  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1104  glycosyl transferase, group 1  26.33 
 
 		 396 aa  73.6  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0552505  hitchhiker  0.00694846 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6932  glycosyl transferase group 1  28.63 
 
 		 1233 aa  73.2  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0899413 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  25.97 
 
 		 413 aa  73.2  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0761  glycosyl transferase group 1  26.38 
 
 		 748 aa  72.4  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6430  glycosyl transferase group 1  26.67 
 
 		 366 aa  72  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.706841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0880  glycosyl transferase group 1  35.92 
 
 		 376 aa  72  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0960108 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0616  glycosyltransferase, group 1  26.43 
 
 		 414 aa  71.2  0.00000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0767  glycosyl transferase group 1  26.43 
 
 		 414 aa  71.2  0.00000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  27.84 
 
 		 409 aa  70.5  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0898  hypothetical protein  35.85 
 
 		 407 aa  70.5  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  27.71 
 
 		 401 aa  70.5  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1354  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.06 
 
 		 382 aa  70.5  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3942  glycosyl transferase group 1  26.17 
 
 		 395 aa  70.5  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.484579  normal  0.520896 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2677  glycosyl transferase family protein  34.39 
 
 		 1267 aa  69.7  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2343  glycosyl transferase group 1  25.94 
 
 		 350 aa  70.1  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0171  glycosyl transferase, group 1  30.09 
 
 		 389 aa  69.7  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0957  glycosyl transferase, group 1  23.5 
 
 		 386 aa  69.7  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.258156  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  31.14 
 
 		 385 aa  68.6  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2637  glycosyl transferase, group 1  31.5 
 
 		 421 aa  68.6  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.731543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4841  glycosyl transferase, group 1  26.67 
 
 		 374 aa  68.2  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000142373  normal  0.0561788 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1996  glycosyl transferase group 1  24.37 
 
 		 364 aa  68.2  0.0000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.55506 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2826  glycosyl transferase group 1  32.19 
 
 		 414 aa  68.6  0.0000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2023  glycosyl transferase, group 1  24.32 
 
 		 401 aa  68.2  0.0000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.334553  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  28.51 
 
 		 370 aa  67.8  0.0000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1287  glycosyl transferase group 1  29.24 
 
 		 392 aa  67.8  0.0000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0839  glycosyl transferase group 1  26.07 
 
 		 395 aa  67.8  0.0000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0770239  normal  0.045052 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  32.63 
 
 		 393 aa  67.4  0.0000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  26.21 
 
 		 419 aa  67  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3547  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  28.23 
 
 		 393 aa  67  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0294  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 		 413 aa  67.4  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3522  glycosyl transferase group 1  29.84 
 
 		 385 aa  66.6  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.828408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2745  glycosyl transferase family protein  29.78 
 
 		 1267 aa  67  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.636531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1562  glycosyl transferase group 1  32.44 
 
 		 381 aa  67.4  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.395728  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0723  glycosyltransferase-like protein  31.28 
 
 		 396 aa  67  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7048  putative O-antigen export system permease protein  33.85 
 
 		 638 aa  66.2  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3213  glycosyl transferase group 1  26.09 
 
 		 411 aa  66.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.312231  normal  0.69629 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2760  glycosyl transferase group 1  33.67 
 
 		 1039 aa  66.2  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1510  glycosyl transferase, group 1  30.94 
 
 		 415 aa  66.2  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>