39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5603 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_5603  glycosyltransferase  100 
 
 
364 aa  764    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.183412  normal  0.950929 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1455  glycosyl transferase group 1  43.8 
 
 
759 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.402299  normal  0.663839 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5161  glycosyl transferase group 1  41.33 
 
 
747 aa  302  8.000000000000001e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.510872  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1622  hypothetical protein  36.73 
 
 
360 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.681183  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0865  glycosyl transferase, group 1  40.99 
 
 
763 aa  250  3e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.926448  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3115  hypothetical protein  40.06 
 
 
337 aa  244  1.9999999999999999e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1449  glycosyl transferase  35.55 
 
 
353 aa  243  3.9999999999999997e-63  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1785  hypothetical protein  37.2 
 
 
349 aa  241  2e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1363  glycosyl transferase group 1  39.47 
 
 
774 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.744845  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1236  glycosyl transferase group 1  36.34 
 
 
765 aa  213  3.9999999999999995e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0284  glycosyl transferase group 1  36.2 
 
 
780 aa  207  2e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3138  glycosyltransferase (group I)  33.16 
 
 
797 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.150629  normal  0.748341 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1241  hypothetical protein  34.88 
 
 
371 aa  196  8.000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1162  glycosyl transferase group 1  35.22 
 
 
790 aa  192  9e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0361  hypothetical protein  33.14 
 
 
378 aa  186  4e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1060  glycosyl transferase group 1  34.1 
 
 
789 aa  182  8.000000000000001e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.126752 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5324  glycosyltransferase  34.73 
 
 
759 aa  177  3e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0783  glycosyltransferase  31.37 
 
 
404 aa  176  5e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.482662  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0925  glycosyl transferase, group 1  33.82 
 
 
761 aa  171  2e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.259199  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2577  glycosyl transferase, group 1  34.11 
 
 
767 aa  168  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.161849  normal  0.709022 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1917  hypothetical protein  32.62 
 
 
339 aa  168  1e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4312  glycosyl transferase, group 1  30 
 
 
756 aa  165  1.0000000000000001e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.49569  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0740  glycosyl transferase, group 1  32.09 
 
 
823 aa  160  3e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0543  hypothetical protein  32.3 
 
 
338 aa  137  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.539162  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5215  putative glycosyltransferase  32.24 
 
 
340 aa  136  5e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.191261  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1965  hypothetical protein  31.65 
 
 
367 aa  133  6e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.234327 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3440  mannosyltransferase  31.45 
 
 
348 aa  132  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.106882  normal  0.942853 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3375  glycosyl transferase  31.78 
 
 
351 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000640117  hitchhiker  0.00216931 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7536  glycosyl transferase group 1  29.83 
 
 
762 aa  123  5e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.961442  normal  0.148012 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1053  putative glycosyltransferase  29.88 
 
 
340 aa  120  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2506  glycosyl transferase group 1  28.1 
 
 
774 aa  112  8.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3542  hypothetical protein  25.38 
 
 
357 aa  81.3  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000965679  normal  0.103099 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0944  hypothetical protein  22.25 
 
 
718 aa  64.3  0.000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0361  hypothetical protein  25.26 
 
 
480 aa  63.5  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1200  hypothetical protein  26.37 
 
 
348 aa  59.3  0.00000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3891  hypothetical protein  25.76 
 
 
703 aa  53.5  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1640  hypothetical protein  31.82 
 
 
424 aa  45.1  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1533  hypothetical protein  31.82 
 
 
424 aa  45.1  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1730  hypothetical protein  31.82 
 
 
424 aa  45.1  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000064452 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>