37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1965 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_1965  hypothetical protein  100 
 
 
367 aa  734    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.234327 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0543  hypothetical protein  55.09 
 
 
338 aa  294  2e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.539162  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1053  putative glycosyltransferase  50.14 
 
 
340 aa  274  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5215  putative glycosyltransferase  50 
 
 
340 aa  271  1e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.191261  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3375  glycosyl transferase  47.5 
 
 
351 aa  235  8e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000640117  hitchhiker  0.00216931 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0865  glycosyl transferase, group 1  36.81 
 
 
763 aa  206  4e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.926448  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2577  glycosyl transferase, group 1  41.49 
 
 
767 aa  182  6e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.161849  normal  0.709022 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1363  glycosyl transferase group 1  35.96 
 
 
774 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.744845  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1455  glycosyl transferase group 1  31.21 
 
 
759 aa  173  5e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.402299  normal  0.663839 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1785  hypothetical protein  30.86 
 
 
349 aa  169  6e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1162  glycosyl transferase group 1  34.48 
 
 
790 aa  169  8e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1060  glycosyl transferase group 1  35.51 
 
 
789 aa  168  2e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.126752 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0284  glycosyl transferase group 1  35.31 
 
 
780 aa  164  2.0000000000000002e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5161  glycosyl transferase group 1  30.99 
 
 
747 aa  162  7e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.510872  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0740  glycosyl transferase, group 1  34.85 
 
 
823 aa  161  1e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3115  hypothetical protein  31.8 
 
 
337 aa  159  1e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3138  glycosyltransferase (group I)  30.29 
 
 
797 aa  158  1e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.150629  normal  0.748341 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1236  glycosyl transferase group 1  33.52 
 
 
765 aa  156  5.0000000000000005e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1622  hypothetical protein  30.95 
 
 
360 aa  156  5.0000000000000005e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.681183  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5603  glycosyltransferase  32.29 
 
 
364 aa  154  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.183412  normal  0.950929 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5324  glycosyltransferase  32.5 
 
 
759 aa  154  2.9999999999999998e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1449  glycosyl transferase  29.59 
 
 
353 aa  149  5e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0361  hypothetical protein  33.99 
 
 
378 aa  149  5e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1241  hypothetical protein  34.2 
 
 
371 aa  146  5e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3440  mannosyltransferase  35.33 
 
 
348 aa  139  7.999999999999999e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.106882  normal  0.942853 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7536  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
762 aa  134  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.961442  normal  0.148012 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2506  glycosyl transferase group 1  34.15 
 
 
774 aa  133  3.9999999999999996e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0925  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
761 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.259199  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0783  glycosyltransferase  32.68 
 
 
404 aa  124  3e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.482662  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4312  glycosyl transferase, group 1  26.59 
 
 
756 aa  112  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.49569  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1917  hypothetical protein  26.22 
 
 
339 aa  107  3e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0361  hypothetical protein  40.45 
 
 
480 aa  60.5  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1640  hypothetical protein  30.32 
 
 
424 aa  50.1  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1730  hypothetical protein  30.32 
 
 
424 aa  50.1  0.00006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000064452 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1533  hypothetical protein  30.32 
 
 
424 aa  50.1  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1200  hypothetical protein  35.21 
 
 
348 aa  47.4  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3891  hypothetical protein  29.86 
 
 
703 aa  44.7  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>