38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_1449 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_1449  glycosyl transferase  100 
 
 
353 aa  723    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3115  hypothetical protein  53.85 
 
 
337 aa  395  1e-109  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1785  hypothetical protein  52.99 
 
 
349 aa  360  2e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1622  hypothetical protein  42.65 
 
 
360 aa  291  2e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.681183  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5161  glycosyl transferase group 1  43.32 
 
 
747 aa  277  2e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.510872  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1455  glycosyl transferase group 1  43.54 
 
 
759 aa  276  3e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.402299  normal  0.663839 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0865  glycosyl transferase, group 1  39.07 
 
 
763 aa  246  3e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.926448  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1363  glycosyl transferase group 1  40.86 
 
 
774 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.744845  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3138  glycosyltransferase (group I)  39.09 
 
 
797 aa  245  8e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.150629  normal  0.748341 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5603  glycosyltransferase  35.55 
 
 
364 aa  243  3.9999999999999997e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.183412  normal  0.950929 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0284  glycosyl transferase group 1  36.81 
 
 
780 aa  229  7e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4312  glycosyl transferase, group 1  37.68 
 
 
756 aa  225  8e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.49569  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1162  glycosyl transferase group 1  38.12 
 
 
790 aa  215  9e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5324  glycosyltransferase  34.77 
 
 
759 aa  209  4e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1917  hypothetical protein  33.33 
 
 
339 aa  206  6e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0361  hypothetical protein  35.04 
 
 
378 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1241  hypothetical protein  33.62 
 
 
371 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1236  glycosyl transferase group 1  32.96 
 
 
765 aa  200  1.9999999999999998e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2577  glycosyl transferase, group 1  35.99 
 
 
767 aa  200  3e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.161849  normal  0.709022 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1060  glycosyl transferase group 1  33.72 
 
 
789 aa  189  8e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.126752 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0925  glycosyl transferase, group 1  35.47 
 
 
761 aa  186  4e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.259199  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0783  glycosyltransferase  32.78 
 
 
404 aa  186  6e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.482662  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0740  glycosyl transferase, group 1  33.43 
 
 
823 aa  182  8.000000000000001e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3440  mannosyltransferase  31.71 
 
 
348 aa  153  5e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.106882  normal  0.942853 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0543  hypothetical protein  29.61 
 
 
338 aa  143  5e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.539162  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2506  glycosyl transferase group 1  28.92 
 
 
774 aa  142  7e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7536  glycosyl transferase group 1  30.45 
 
 
762 aa  135  8e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.961442  normal  0.148012 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5215  putative glycosyltransferase  28.96 
 
 
340 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.191261  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1053  putative glycosyltransferase  27.09 
 
 
340 aa  133  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1965  hypothetical protein  28.74 
 
 
367 aa  131  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.234327 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3375  glycosyl transferase  28.08 
 
 
351 aa  117  3.9999999999999997e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000640117  hitchhiker  0.00216931 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3542  hypothetical protein  25.09 
 
 
357 aa  88.6  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000965679  normal  0.103099 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0361  hypothetical protein  23.23 
 
 
480 aa  54.7  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3891  hypothetical protein  21.81 
 
 
703 aa  45.4  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1200  hypothetical protein  23.57 
 
 
348 aa  44.3  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1640  hypothetical protein  31.71 
 
 
424 aa  43.1  0.007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1533  hypothetical protein  31.71 
 
 
424 aa  43.1  0.007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1730  hypothetical protein  31.71 
 
 
424 aa  43.1  0.007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000064452 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>