More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3138 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3138  glycosyltransferase (group I)  100 
 
 
797 aa  1659    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.150629  normal  0.748341 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1363  glycosyl transferase group 1  41.76 
 
 
774 aa  642    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.744845  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5161  glycosyl transferase group 1  39.52 
 
 
747 aa  563  1.0000000000000001e-159  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.510872  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0865  glycosyl transferase, group 1  39 
 
 
763 aa  564  1.0000000000000001e-159  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.926448  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1236  glycosyl transferase group 1  37.88 
 
 
765 aa  563  1.0000000000000001e-159  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0925  glycosyl transferase, group 1  37.19 
 
 
761 aa  539  9.999999999999999e-153  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.259199  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0284  glycosyl transferase group 1  37.63 
 
 
780 aa  530  1e-149  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1060  glycosyl transferase group 1  35.96 
 
 
789 aa  523  1e-147  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.126752 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1455  glycosyl transferase group 1  35.75 
 
 
759 aa  525  1e-147  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.402299  normal  0.663839 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1162  glycosyl transferase group 1  37.06 
 
 
790 aa  522  1e-146  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5324  glycosyltransferase  35.74 
 
 
759 aa  488  1e-136  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0740  glycosyl transferase, group 1  31.93 
 
 
823 aa  426  1e-118  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2577  glycosyl transferase, group 1  32.76 
 
 
767 aa  406  1.0000000000000001e-112  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.161849  normal  0.709022 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4312  glycosyl transferase, group 1  31.53 
 
 
756 aa  391  1e-107  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.49569  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7536  glycosyl transferase group 1  30.71 
 
 
762 aa  352  1e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.961442  normal  0.148012 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2506  glycosyl transferase group 1  29.86 
 
 
774 aa  348  2e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1623  glycosyl transferase group 1  44.09 
 
 
386 aa  330  5.0000000000000004e-89  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0932889  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1786  glycosyl transferase, group 1  42.35 
 
 
391 aa  315  9.999999999999999e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3114  glycosyl transferase, group 1  39.21 
 
 
391 aa  306  1.0000000000000001e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1916  glycosyltransferase  38.77 
 
 
390 aa  299  1e-79  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1450  glycosyl transferase group 1  37.12 
 
 
411 aa  293  1e-77  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.925912  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1240  glycosyl transferase group 1  38.62 
 
 
395 aa  284  4.0000000000000003e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0782  glycosyl transferase group 1  35.53 
 
 
397 aa  278  3e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.215442  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0360  glycosyl transferase group 1  37.83 
 
 
405 aa  275  2.0000000000000002e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1449  glycosyl transferase  39.09 
 
 
353 aa  245  1.9999999999999999e-63  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5602  glycosyl transferase group 1  34.92 
 
 
399 aa  243  7.999999999999999e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.115159  normal  0.982088 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1622  hypothetical protein  36.87 
 
 
360 aa  234  4.0000000000000004e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.681183  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1785  hypothetical protein  36.24 
 
 
349 aa  225  2e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3438  glycosyl transferase group 1  32.28 
 
 
416 aa  219  2e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.908331 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3115  hypothetical protein  31.92 
 
 
337 aa  202  3e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5224  glycosyl transferase, group 1  28.88 
 
 
393 aa  197  5.000000000000001e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5603  glycosyltransferase  33.16 
 
 
364 aa  197  6e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.183412  normal  0.950929 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0361  hypothetical protein  32.37 
 
 
378 aa  194  5e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7428  glycosyl transferase group 1  30.21 
 
 
388 aa  191  5e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.223976  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3376  glycosyl transferase group 1  30.45 
 
 
399 aa  187  4e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000624508  hitchhiker  0.000924483 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1052  glycosyl transferase, group 1  29.43 
 
 
371 aa  186  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5216  glycosyl transferase, group 1  28.88 
 
 
392 aa  181  4e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.088872  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1042  glycosyl transferase, group 1  26.84 
 
 
378 aa  180  1e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5289  glycosyl transferase group 1  28.68 
 
 
405 aa  177  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.213842  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0790  glycosyl transferase, group 1  27.3 
 
 
393 aa  166  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0804  glycosyl transferase, group 1  27.3 
 
 
393 aa  166  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.26617  normal  0.0900137 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0785  glycosyl transferase, group 1  27.3 
 
 
393 aa  165  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.967061 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1917  hypothetical protein  29.18 
 
 
339 aa  164  7e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0783  glycosyltransferase  30.83 
 
 
404 aa  160  1e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.482662  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0542  glycosyl transferase group 1  27.25 
 
 
414 aa  157  7e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1241  hypothetical protein  30.49 
 
 
371 aa  155  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3440  mannosyltransferase  30.22 
 
 
348 aa  147  1e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.106882  normal  0.942853 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0543  hypothetical protein  28.46 
 
 
338 aa  135  3.9999999999999996e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.539162  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3375  glycosyl transferase  32.28 
 
 
351 aa  130  1.0000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000640117  hitchhiker  0.00216931 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1965  hypothetical protein  28.8 
 
 
367 aa  130  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.234327 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1053  putative glycosyltransferase  28.06 
 
 
340 aa  129  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5215  putative glycosyltransferase  28.89 
 
 
340 aa  112  3e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.191261  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2715  glycosyl transferase group 1  24.29 
 
 
375 aa  93.6  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3542  hypothetical protein  24.57 
 
 
357 aa  92  4e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000965679  normal  0.103099 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3005  hypothetical protein  25.94 
 
 
395 aa  83.2  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.036404  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35680  hypothetical protein  25.94 
 
 
395 aa  82.8  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000110612 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3942  glycosyl transferase group 1  27 
 
 
395 aa  83.2  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.484579  normal  0.520896 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6932  glycosyl transferase group 1  22.43 
 
 
1233 aa  80.9  0.00000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0899413 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0255  glycosyl transferase group 1  27.42 
 
 
358 aa  80.1  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1868  glycosyl transferase  26.07 
 
 
375 aa  78.2  0.0000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3213  glycosyl transferase group 1  20.86 
 
 
411 aa  77  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.312231  normal  0.69629 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1104  glycosyl transferase, group 1  25.75 
 
 
396 aa  76.6  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0552505  hitchhiker  0.00694846 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3533  glycosyl transferase, group 1 family protein PslF  21.85 
 
 
392 aa  75.9  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0609585  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0582  glycosyl transferase group 1  23.18 
 
 
374 aa  73.2  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.838889  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  25.82 
 
 
395 aa  72  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1473  hypothetical protein  26.27 
 
 
383 aa  71.6  0.00000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.574733  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  24.17 
 
 
408 aa  71.6  0.00000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4841  glycosyl transferase, group 1  22.74 
 
 
374 aa  71.2  0.00000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000142373  normal  0.0561788 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4050  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 
458 aa  70.9  0.00000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3305  glycosyl transferase, group 1  22.79 
 
 
392 aa  70.5  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0317499  normal  0.753589 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2856  glycosyl transferase, group 1  23.76 
 
 
388 aa  70.9  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.258995 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3353  glycosyl transferase group 1  22.99 
 
 
381 aa  70.5  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.207762  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0957  glycosyl transferase, group 1  27.2 
 
 
386 aa  70.9  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.258156  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2075  glycosyl transferase group 1  22.69 
 
 
381 aa  70.1  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1323  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  22.96 
 
 
405 aa  68.9  0.0000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000271597  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1080  glycosyl transferase group 1  22.88 
 
 
394 aa  68.9  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.184829  normal  0.928063 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1096  glycosyl transferase group 1  21.17 
 
 
392 aa  68.6  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.767278  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0070  glycosyl transferase group 1  27.9 
 
 
391 aa  68.6  0.0000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0307199 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2441  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  23.66 
 
 
446 aa  68.6  0.0000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.662083  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4489  glycosyl transferase group 1  24.91 
 
 
417 aa  67.8  0.0000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0285  glycosyl transferase group 1  27.68 
 
 
389 aa  67  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3106  glycosyl transferase group 1  25.64 
 
 
382 aa  66.2  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277853  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2141  glycosyltransferase  23.46 
 
 
416 aa  66.6  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00102383  normal  0.405566 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1085  glycosyl transferase, group 1  26.25 
 
 
430 aa  66.2  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2034  glycosyl transferase, group 1 family protein  21.91 
 
 
385 aa  65.9  0.000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0761  glycosyl transferase group 1  21.89 
 
 
748 aa  65.9  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1972  glycosyl transferase, group 1  26.87 
 
 
415 aa  65.9  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4283  glycosyl transferase, group 1  20.95 
 
 
396 aa  65.5  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00772283 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1589  glycosyltransferase  25.36 
 
 
393 aa  65.1  0.000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.679679 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5094  glycosyl transferase group 1  19.69 
 
 
382 aa  64.7  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0593  glycosyl transferase, group 1 family protein  21.05 
 
 
369 aa  64.3  0.000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  26.72 
 
 
387 aa  64.7  0.000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1514  glycosyl transferase group 1  21.75 
 
 
396 aa  64.3  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.426668  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  27.34 
 
 
426 aa  64.3  0.000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0395  glycosyl transferase group 1  23.04 
 
 
378 aa  64.3  0.000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.988234  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1066  glycosyl transferase group 1  28.72 
 
 
385 aa  64.3  0.000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.552097 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0793  Glycosyltransferase-like protein  23.57 
 
 
384 aa  63.5  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2372  glycosyl transferase, group 1  23.58 
 
 
383 aa  64.3  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.732911  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0798  glycosyl transferase, group 1  24.56 
 
 
372 aa  63.9  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4294  glycosyl transferase group 1  20.44 
 
 
405 aa  63.5  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.458687 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>