More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_3114 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_3114  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 391 aa  796    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1786  glycosyl transferase, group 1  64.1 
 
 		 391 aa  497  1e-139  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1450  glycosyl transferase group 1  58.31 
 
 		 411 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.925912  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1623  glycosyl transferase group 1  55.82 
 
 		 386 aa  425  1e-118  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0932889  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1916  glycosyltransferase  46.7 
 
 		 390 aa  354  2e-96  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0865  glycosyl transferase, group 1  42.75 
 
 		 763 aa  323  3e-87  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.926448  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1162  glycosyl transferase group 1  38.42 
 
 		 790 aa  308  8e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3138  glycosyltransferase (group I)  39.21 
 
 		 797 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.150629  normal  0.748341 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5324  glycosyltransferase  39.19 
 
 		 759 aa  305  9.000000000000001e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1363  glycosyl transferase group 1  37.44 
 
 		 774 aa  302  8.000000000000001e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.744845  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0284  glycosyl transferase group 1  39.3 
 
 		 780 aa  295  8e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0925  glycosyl transferase, group 1  37.96 
 
 		 761 aa  294  2e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.259199  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5161  glycosyl transferase group 1  39.78 
 
 		 747 aa  294  2e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.510872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0740  glycosyl transferase, group 1  37.89 
 
 		 823 aa  293  5e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1455  glycosyl transferase group 1  37.8 
 
 		 759 aa  291  2e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.402299  normal  0.663839 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1236  glycosyl transferase group 1  38.71 
 
 		 765 aa  289  5.0000000000000004e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1060  glycosyl transferase group 1  37.23 
 
 		 789 aa  283  5.000000000000001e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.126752 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0782  glycosyl transferase group 1  36.9 
 
 		 397 aa  281  2e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.215442  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0360  glycosyl transferase group 1  37.27 
 
 		 405 aa  276  5e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1240  glycosyl transferase group 1  37.7 
 
 		 395 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2577  glycosyl transferase, group 1  36.15 
 
 		 767 aa  249  5e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.161849  normal  0.709022 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4312  glycosyl transferase, group 1  34.66 
 
 		 756 aa  249  7e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.49569  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5602  glycosyl transferase group 1  35.79 
 
 		 399 aa  246  4e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.115159  normal  0.982088 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2506  glycosyl transferase group 1  35.26 
 
 		 774 aa  234  2.0000000000000002e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7536  glycosyl transferase group 1  35.39 
 
 		 762 aa  222  9.999999999999999e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.961442  normal  0.148012 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3438  glycosyl transferase group 1  31.56 
 
 		 416 aa  216  7e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.908331 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1052  glycosyl transferase, group 1  34.79 
 
 		 371 aa  214  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5224  glycosyl transferase, group 1  33.16 
 
 		 393 aa  211  2e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7428  glycosyl transferase group 1  35.11 
 
 		 388 aa  207  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.223976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5216  glycosyl transferase, group 1  33.15 
 
 		 392 aa  204  2e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.088872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1042  glycosyl transferase, group 1  31.5 
 
 		 378 aa  203  5e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0790  glycosyl transferase, group 1  32.46 
 
 		 393 aa  200  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0804  glycosyl transferase, group 1  32.46 
 
 		 393 aa  200  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.26617  normal  0.0900137 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0785  glycosyl transferase, group 1  32.11 
 
 		 393 aa  196  5.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.967061 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5289  glycosyl transferase group 1  32.97 
 
 		 405 aa  196  6e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.213842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3376  glycosyl transferase group 1  30.08 
 
 		 399 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000624508  hitchhiker  0.000924483 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0542  glycosyl transferase group 1  30.37 
 
 		 414 aa  178  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2141  glycosyltransferase  27.41 
 
 		 416 aa  85.9  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00102383  normal  0.405566 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3533  glycosyl transferase, group 1 family protein PslF  24.63 
 
 		 392 aa  76.6  0.0000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0609585  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0245  glycosyl transferase group 1  24.29 
 
 		 396 aa  75.5  0.000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0172332  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3605  glycosyl transferase, group 1  24.17 
 
 		 405 aa  75.5  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1788 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0839  glycosyl transferase group 1  23.85 
 
 		 395 aa  75.1  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0770239  normal  0.045052 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3005  hypothetical protein  25.57 
 
 		 395 aa  73.2  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.036404  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  24.15 
 
 		 388 aa  73.2  0.000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0395  glycosyl transferase group 1  25.41 
 
 		 378 aa  73.2  0.000000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.988234  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35680  hypothetical protein  22.51 
 
 		 395 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000110612 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  29.84 
 
 		 426 aa  72  0.00000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0957  glycosyl transferase, group 1  25.7 
 
 		 386 aa  72.8  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.258156  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1191  glycosyl transferase, group 1  24.93 
 
 		 384 aa  70.9  0.00000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1080  glycosyl transferase group 1  26.74 
 
 		 394 aa  70.9  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.184829  normal  0.928063 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2715  glycosyl transferase group 1  22.57 
 
 		 375 aa  70.1  0.00000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1596  glycosyl transferase, group 1  27.87 
 
 		 386 aa  69.7  0.00000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4294  glycosyl transferase group 1  25.91 
 
 		 405 aa  69.7  0.00000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.458687 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0249  glycosyl transferase group 1  22.3 
 
 		 387 aa  69.3  0.0000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000132776  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1229  putative glycosyltransferase  22.19 
 
 		 1219 aa  68.6  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.197488  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3818  glycosyl transferase, group 1  23.79 
 
 		 397 aa  67.4  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.406425 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3353  glycosyl transferase group 1  27.72 
 
 		 381 aa  67  0.0000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.207762  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2343  glycosyl transferase group 1  27.6 
 
 		 350 aa  65.9  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01298  predicted glycosyltransferase  27.96 
 
 		 361 aa  65.9  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.65788  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0901  hypothetical protein  25 
 
 		 372 aa  65.9  0.000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0357056 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4492  glycosyl transferase group 1  20.82 
 
 		 399 aa  65.1  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0132524  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3376  glycosyl transferase, group 1  24.22 
 
 		 432 aa  65.1  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.666648  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0582  glycosyl transferase group 1  25.66 
 
 		 374 aa  65.1  0.000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.838889  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2571  glycosyl transferase group 1  28.4 
 
 		 386 aa  64.7  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1085  glycosyl transferase, group 1  24.56 
 
 		 430 aa  65.5  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1114  glycosyltransferase (group I)  24.9 
 
 		 404 aa  64.7  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4604  glycosyl transferase group 1  26.16 
 
 		 371 aa  64.7  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000112819  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0802  a-glycosyltransferase  23.2 
 
 		 429 aa  63.9  0.000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0022358 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1171  glycosyl transferase group 1  23.53 
 
 		 366 aa  63.9  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.059053 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3305  glycosyl transferase, group 1  22.85 
 
 		 392 aa  63.2  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0317499  normal  0.753589 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0241  lipopolysaccharide transferase family protein  24.79 
 
 		 384 aa  63.2  0.000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21071  hypothetical protein  22.26 
 
 		 1232 aa  63.2  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0095  glycosyl transferase group 1  26.4 
 
 		 378 aa  62.8  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.844499 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4489  glycosyl transferase group 1  27.53 
 
 		 417 aa  62.4  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  25.65 
 
 		 409 aa  62.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0986  glycosyl transferase group 1  24.58 
 
 		 429 aa  62.4  0.00000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.32714  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1737  glycosyl transferase, group 1  24.54 
 
 		 395 aa  62.8  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1121  glycosyl transferase group 1  25.2 
 
 		 386 aa  62.8  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.606067  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4196  glycosyl transferase group 1  25.1 
 
 		 366 aa  61.6  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2261  glycosyl transferase, group 1  25.56 
 
 		 410 aa  61.2  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2856  glycosyl transferase, group 1  22.83 
 
 		 388 aa  60.8  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.258995 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1140  glycosyl transferase group 1  24.3 
 
 		 386 aa  60.5  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.960546  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3449  glycosyl transferase group 1  27.35 
 
 		 394 aa  60.1  0.00000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2594  glycosyl transferase group 1  23.77 
 
 		 421 aa  60.1  0.00000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3727  glycosyl transferase group 1  21.77 
 
 		 672 aa  60.1  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1638  glycosyl transferase group 1  26.79 
 
 		 519 aa  59.7  0.00000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2409  glycosyl transferase, group 1  24.56 
 
 		 406 aa  58.9  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0587  glycosyl transferase group 1  22.7 
 
 		 387 aa  59.3  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0142  glycosyl transferase, group 1  24.02 
 
 		 404 aa  59.3  0.0000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1473  hypothetical protein  22.82 
 
 		 383 aa  58.2  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.574733  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2146  glycosyl transferase group 1  25.49 
 
 		 434 aa  58.9  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.322466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5430  glycosyl transferase group 1  22.38 
 
 		 378 aa  58.2  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0792  glycosyl transferase group 1  25.23 
 
 		 375 aa  57.8  0.0000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5094  glycosyl transferase group 1  19.12 
 
 		 382 aa  57.8  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26810  glycosyltransferase  26.6 
 
 		 723 aa  57.4  0.0000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2082  glycosyl transferase group 1  22.18 
 
 		 378 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1785  glycosyl transferase group 1  23.14 
 
 		 380 aa  57.8  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.296483 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0218  glycosyl transferase group 1  26.71 
 
 		 480 aa  57.4  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.031233  normal  0.255038 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0678  glycosyl transferase, group 1  23.44 
 
 		 411 aa  57.4  0.0000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0695146  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4283  glycosyl transferase, group 1  24.24 
 
 		 396 aa  57  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00772283 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>