More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2343 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2343  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 350 aa  717    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2015  glycosyl transferase, group 1  29.75 
 
 		 382 aa  101  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0095  glycosyl transferase group 1  30.38 
 
 		 378 aa  92  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.844499 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0676  glycosyl transferase, group 1  27.74 
 
 		 396 aa  89.7  7e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.063849  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2856  glycosyl transferase, group 1  28.19 
 
 		 388 aa  83.2  0.000000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.258995 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2571  glycosyl transferase group 1  25.61 
 
 		 386 aa  81.6  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3353  glycosyl transferase group 1  29.91 
 
 		 381 aa  80.5  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.207762  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1753  glycosyl transferase group 1  22.95 
 
 		 359 aa  80.5  0.00000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.908553  decreased coverage  0.00756127 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0250  glycosyl transferase, group 1  29.41 
 
 		 374 aa  79.3  0.00000000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.430935  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1868  glycosyl transferase  29 
 
 		 375 aa  79  0.0000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4909  group 1 glycosyl transferase  27.97 
 
 		 364 aa  77  0.0000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0395  glycosyl transferase group 1  24.55 
 
 		 378 aa  76.3  0.0000000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.988234  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0241  lipopolysaccharide transferase family protein  28.64 
 
 		 384 aa  74.7  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6234  glycosyl transferase group 1  29.29 
 
 		 366 aa  74.7  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.130468  normal  0.465121 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01298  predicted glycosyltransferase  24.22 
 
 		 361 aa  72.4  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.65788  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2715  glycosyl transferase group 1  28.04 
 
 		 375 aa  72.4  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5224  glycosyl transferase, group 1  28.21 
 
 		 393 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2306  glycosyl transferase group 1  28.16 
 
 		 379 aa  70.5  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.455622  normal  0.0637665 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2577  glycosyl transferase, group 1  25.94 
 
 		 767 aa  70.1  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.161849  normal  0.709022 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6430  glycosyl transferase group 1  27.16 
 
 		 366 aa  70.1  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.706841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0255  glycosyl transferase group 1  27.14 
 
 		 358 aa  69.3  0.00000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1916  glycosyltransferase  25.9 
 
 		 390 aa  68.6  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0723  glycosyltransferase-like protein  29.72 
 
 		 396 aa  68.6  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2442  glycosyl transferase, group 1  34.35 
 
 		 382 aa  67.4  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3694  glycosyl transferase, group 1  25.87 
 
 		 401 aa  67.8  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.414804 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0865  glycosyl transferase, group 1  26.26 
 
 		 763 aa  67.4  0.0000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.926448  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2518  glycosyl transferase group 1  26.11 
 
 		 411 aa  66.2  0.0000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.377974  normal  0.0256247 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1240  glycosyl transferase group 1  29.95 
 
 		 395 aa  65.9  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3114  glycosyl transferase, group 1  27.6 
 
 		 391 aa  65.9  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2506  glycosyl transferase group 1  24.4 
 
 		 774 aa  64.3  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1691  glycogen synthase  25.1 
 
 		 409 aa  64.3  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.533865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0821  glycosyl transferase group 1  26.21 
 
 		 351 aa  64.3  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.534399  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4935  UDP-N-acetylglucosamine  28.1 
 
 		 466 aa  63.5  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0773  glycosyl transferase group 1  26.33 
 
 		 457 aa  63.5  0.000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0840  glycosyl transferase group 1  26.64 
 
 		 398 aa  63.5  0.000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.755568 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1236  glycosyl transferase group 1  26.02 
 
 		 765 aa  63.2  0.000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0168  glycosyl transferase  30.61 
 
 		 374 aa  63.5  0.000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.627515 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6162  glycosyl transferase group 1  25.31 
 
 		 434 aa  63.5  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.189514 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2753  glycosyl transferase group 1  24.6 
 
 		 394 aa  63.2  0.000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1080  glycosyl transferase group 1  25.74 
 
 		 394 aa  62.8  0.000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.184829  normal  0.928063 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0294  glycosyl transferase, group 1  28.71 
 
 		 413 aa  62.8  0.000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3942  glycosyl transferase group 1  27.18 
 
 		 395 aa  62.8  0.000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.484579  normal  0.520896 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3679  glycosyl transferase group 1  28.11 
 
 		 375 aa  62  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.568294 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0582  glycosyl transferase group 1  27.09 
 
 		 374 aa  62.4  0.00000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.838889  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1148  glycosyl transferase group 1  21.74 
 
 		 377 aa  62.4  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000501847  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2317  glycogen synthase  28.98 
 
 		 409 aa  62  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  24.19 
 
 		 408 aa  61.6  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1104  glycosyl transferase, group 1  27.51 
 
 		 396 aa  61.2  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0552505  hitchhiker  0.00694846 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1498  glycosyl transferase, group 1  32.09 
 
 		 392 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1562  glycosyl transferase group 1  27.6 
 
 		 381 aa  60.8  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.395728  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2267  glycosyl transferase, group 1  24.71 
 
 		 388 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.370121  normal  0.159353 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21730  glycogen synthase  23.9 
 
 		 404 aa  60.5  0.00000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1450  glycosyl transferase group 1  29.72 
 
 		 411 aa  60.5  0.00000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.925912  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2152  glycogen synthase  24.56 
 
 		 386 aa  60.1  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00171657  hitchhiker  0.00515414 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4878  hypothetical protein  24.29 
 
 		 371 aa  60.1  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.299925  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1751  glycosyl transferase group 1  28.25 
 
 		 453 aa  60.1  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1926  glycosyl transferase group 1  27.95 
 
 		 395 aa  59.7  0.00000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00887755  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0925  glycosyl transferase, group 1  24.46 
 
 		 761 aa  59.3  0.00000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.259199  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3376  glycosyl transferase group 1  26.69 
 
 		 399 aa  59.3  0.00000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000624508  hitchhiker  0.000924483 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  23.94 
 
 		 419 aa  59.3  0.00000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1173  glycogen synthase  25.26 
 
 		 404 aa  59.3  0.00000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0423768 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2522  glycosyl transferase  26.6 
 
 		 364 aa  58.9  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.810552  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  27.61 
 
 		 401 aa  58.9  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4841  glycosyl transferase, group 1  22.71 
 
 		 374 aa  58.9  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000142373  normal  0.0561788 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  25 
 
 		 377 aa  58.9  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56030  hypothetical protein  24.29 
 
 		 371 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5161  glycosyl transferase group 1  24.29 
 
 		 747 aa  58.9  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.510872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5216  glycosyl transferase, group 1  25.29 
 
 		 392 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.088872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1964  glycosyl transferase group 1  25.42 
 
 		 388 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3732  glycosyl transferase group 1  24.81 
 
 		 388 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.775732  normal  0.609704 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  26.14 
 
 		 395 aa  58.5  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4534  glycosyl transferase, group 1  24.31 
 
 		 388 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.429646  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3438  glycosyl transferase group 1  25.9 
 
 		 416 aa  58.2  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.908331 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5555  glycosyl transferase, group 1  24.81 
 
 		 388 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.225972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1042  glycosyl transferase, group 1  28.23 
 
 		 378 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2483  glycosyl transferase group 1  26.49 
 
 		 414 aa  58.2  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.391566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  27.78 
 
 		 378 aa  58.5  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1688  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 		 400 aa  58.5  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  25.32 
 
 		 424 aa  57.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0228  glycosyl transferase, group 1  24.28 
 
 		 401 aa  57.8  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.631935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1421  glycogen synthase  24.53 
 
 		 431 aa  57.4  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0373  glycosyl transferase, group 1  23.77 
 
 		 386 aa  57.8  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5602  glycosyl transferase group 1  24.79 
 
 		 399 aa  57.8  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.115159  normal  0.982088 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3532  glycosyl transferase group 1  27.84 
 
 		 428 aa  57.8  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00173558  normal  0.0189831 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5248  glycosyl transferase, group 1  33.12 
 
 		 393 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.663702 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2909  glycosyl transferase, group 1  30.57 
 
 		 362 aa  57.8  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5074  UDP-N-acetylglucosamine  26.23 
 
 		 418 aa  57.8  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.838773  normal  0.526532 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2075  glycosyl transferase group 1  30.38 
 
 		 381 aa  57.4  0.0000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1253  glycosyl transferase group 1  27.37 
 
 		 351 aa  57.4  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.708089  normal  0.587919 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3829  glycosyl transferase, group 1  24.31 
 
 		 388 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00562518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3695  glycosyl transferase group 1  24.31 
 
 		 388 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.166947  normal  0.63748 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4450  GumI protein  28.31 
 
 		 350 aa  57.4  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2591  glycosyl transferase, group 1  26.57 
 
 		 373 aa  56.6  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01600  glycogen synthase  25.3 
 
 		 404 aa  56.6  0.0000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5045  glycosyl transferase group 1  25.71 
 
 		 422 aa  56.2  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.022612 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1978  glycogen synthase  26.43 
 
 		 406 aa  55.8  0.0000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.215698 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0890  glycosyl transferase group 1  25.84 
 
 		 435 aa  55.8  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.102744  decreased coverage  0.000533539 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4910  glycosyl transferase group 1  23.64 
 
 		 388 aa  55.8  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.314758  hitchhiker  0.000347122 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2237  glycosyl transferase, group 1  24.75 
 
 		 388 aa  55.5  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.180955 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0782  glycosyl transferase group 1  28.16 
 
 		 397 aa  55.5  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.215442  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>