299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3532 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_3532  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
428 aa  850    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00173558  normal  0.0189831 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5248  glycosyl transferase, group 1  39.85 
 
 
393 aa  241  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.663702 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1498  glycosyl transferase, group 1  37.7 
 
 
392 aa  226  8e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0676  glycosyl transferase, group 1  27.65 
 
 
396 aa  100  5e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.063849  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1996  glycosyl transferase group 1  26.37 
 
 
364 aa  94  5e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.55506 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2015  glycosyl transferase, group 1  26.09 
 
 
382 aa  88.2  2e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4841  glycosyl transferase, group 1  27.48 
 
 
374 aa  87.8  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000142373  normal  0.0561788 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0250  glycosyl transferase, group 1  28.3 
 
 
374 aa  88.2  3e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.430935  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1547  glycosyl transferase, group 1  28.37 
 
 
397 aa  84.3  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.104847  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4092  glycosyl transferase group 1  32.44 
 
 
359 aa  78.6  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2715  glycosyl transferase group 1  28.27 
 
 
375 aa  77.4  0.0000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0582  glycosyl transferase group 1  24.18 
 
 
374 aa  77  0.0000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.838889  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0395  glycosyl transferase group 1  20.85 
 
 
378 aa  76.3  0.000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.988234  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4609  glycosyl transferase, group 1  29.73 
 
 
416 aa  75.1  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.955462  normal  0.431404 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3942  glycosyl transferase group 1  27.44 
 
 
395 aa  75.5  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.484579  normal  0.520896 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0562  glycosyltransferase  27.51 
 
 
416 aa  72.4  0.00000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.841887  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6430  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
366 aa  71.6  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.706841  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2442  glycosyl transferase, group 1  27.41 
 
 
382 aa  71.6  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3694  glycosyl transferase, group 1  28.45 
 
 
401 aa  72  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.414804 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1868  glycosyl transferase  32.98 
 
 
375 aa  70.9  0.00000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2522  glycosyl transferase  27.57 
 
 
364 aa  69.3  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.810552  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3353  glycosyl transferase group 1  23.18 
 
 
381 aa  69.3  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.207762  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0255  glycosyl transferase group 1  29.77 
 
 
358 aa  69.3  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2306  glycosyl transferase group 1  33.56 
 
 
379 aa  68.6  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.455622  normal  0.0637665 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3116  glycosyl transferase group 1  30.67 
 
 
377 aa  68.6  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.304233 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2282  glycosyl transferase group 1  36.62 
 
 
381 aa  68.6  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.823032  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1104  glycosyl transferase, group 1  26.04 
 
 
396 aa  68.2  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0552505  hitchhiker  0.00694846 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0731  glycosyl transferase, group 1  38.1 
 
 
397 aa  67.8  0.0000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.238036 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2343  glycosyl transferase group 1  25.86 
 
 
350 aa  67  0.0000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5882  glycosyl transferase group 1  32.76 
 
 
405 aa  65.9  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.72005 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0241  lipopolysaccharide transferase family protein  29.44 
 
 
384 aa  64.7  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2749  glycosyl transferase group 1  21.77 
 
 
393 aa  64.7  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000830011 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1080  glycosyl transferase group 1  27.18 
 
 
394 aa  65.1  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.184829  normal  0.928063 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1916  glycosyl transferase, group 1  29.17 
 
 
383 aa  64.3  0.000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2075  glycosyl transferase group 1  32.16 
 
 
381 aa  63.9  0.000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0732  group 1 glycosyl transferase  31.36 
 
 
358 aa  63.5  0.000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0243925 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2571  glycosyl transferase group 1  23.77 
 
 
386 aa  63.2  0.000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0137  glycosyl transferase, group 1  26.19 
 
 
411 aa  63.2  0.000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0776455  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3362  glycosyl transferase group 1  21.37 
 
 
393 aa  62.4  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2328  glycosyl transferase group 1  29.94 
 
 
871 aa  62.4  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1668  glycogen synthase  32.47 
 
 
411 aa  60.5  0.00000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2460  glycosyl transferase group 1  29.34 
 
 
381 aa  60.5  0.00000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1369  Glycosyltransferase-like protein  28.64 
 
 
357 aa  59.7  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.473124  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2185  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
408 aa  59.3  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0289  glycosyl transferase, group 1  24.88 
 
 
405 aa  59.3  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6234  glycosyl transferase group 1  29.79 
 
 
366 aa  58.9  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.130468  normal  0.465121 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2856  glycosyl transferase, group 1  26.5 
 
 
388 aa  58.5  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.258995 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1653  glycosyl transferase, group 1  28.69 
 
 
374 aa  58.5  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4432  glycosyl transferase, group 1  26.11 
 
 
370 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.224895  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0636  glycosyl transferase group 1  26.69 
 
 
389 aa  57.8  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0521552  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  31.18 
 
 
410 aa  57.8  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1396  glycosyl transferase group 1  30.11 
 
 
440 aa  57.8  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0657789  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0095  glycosyl transferase group 1  28.36 
 
 
378 aa  57.8  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.844499 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3774  glycosyl transferase group 1  36.5 
 
 
372 aa  57.4  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291858  normal  0.904998 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3865  glycosyl transferase group 1  34.87 
 
 
666 aa  56.6  0.0000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00141274 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0569  glycosyl transferase group 1  31.94 
 
 
422 aa  56.6  0.0000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1032  glycosyl transferase group 1  27.68 
 
 
390 aa  55.8  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2096  glycosyltransferase  28.25 
 
 
415 aa  56.2  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3375  glycosyl transferase group 1  29.21 
 
 
399 aa  55.5  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.133943  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5152  glycosyl transferase group 1  29.73 
 
 
377 aa  55.8  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.011173  decreased coverage  0.000105469 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  23.31 
 
 
360 aa  55.8  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2194  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.86 
 
 
378 aa  54.7  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.222793  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3184  glycosyl transferase group 1  30.54 
 
 
389 aa  55.1  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3146  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.86 
 
 
378 aa  54.7  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1032  glycosyl transferase group 1  27.59 
 
 
413 aa  54.7  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3123  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.86 
 
 
385 aa  54.7  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.435597  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2067  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.86 
 
 
385 aa  54.7  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0833703  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0713  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.86 
 
 
385 aa  54.7  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0869  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2547  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.86 
 
 
385 aa  54.7  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1838  glycosyl transferase group 1  31.28 
 
 
500 aa  54.7  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3086  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.86 
 
 
385 aa  54.7  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0767  glycosyl transferase group 1  29.7 
 
 
414 aa  54.3  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1173  glycogen synthase  25.09 
 
 
404 aa  54.3  0.000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0423768 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  40.23 
 
 
393 aa  54.3  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1978  glycogen synthase  27.98 
 
 
406 aa  54.3  0.000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.215698 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0616  glycosyltransferase, group 1  29.7 
 
 
414 aa  54.3  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1992  hypothetical protein  26.78 
 
 
382 aa  54.3  0.000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.073088  normal  0.53449 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2409  glycosyl transferase, group 1  24.6 
 
 
406 aa  53.9  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1486  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.23 
 
 
378 aa  54.3  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.153331  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0054  glycosyl transferase group 1  39.16 
 
 
392 aa  53.9  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.218747 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0723  glycosyltransferase-like protein  24.48 
 
 
396 aa  53.5  0.000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0793  glycogen synthase  30.48 
 
 
395 aa  53.5  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1675  glycosyl transferase, group 1  30.77 
 
 
366 aa  53.5  0.000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.447182  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  25.27 
 
 
408 aa  53.5  0.000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3101  glycosyltransferase  30.27 
 
 
392 aa  53.1  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.325178  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1421  glycogen synthase  26.16 
 
 
431 aa  53.1  0.000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15860  glycogen synthase  24.52 
 
 
397 aa  52.8  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.121629  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5607  glycosyl transferase group 1  30.32 
 
 
428 aa  53.1  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08810  glycosyltransferase  41.98 
 
 
564 aa  52.8  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.139018  normal  0.49339 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3362  glycosyl transferase, group 1  28.02 
 
 
433 aa  52.8  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0581443 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4272  glycosyl transferase group 1  24.56 
 
 
390 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1362  glycosyl transferase, group 1  25.62 
 
 
390 aa  52  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0392501  normal  0.0175449 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2112  glycogen synthase  28.9 
 
 
396 aa  52.4  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  24.31 
 
 
370 aa  51.6  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0354  glycosyl transferase group 1  24.68 
 
 
381 aa  51.6  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2612  glycosyl transferase group 1  28.27 
 
 
407 aa  51.6  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.198557 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1062  glycosyl transferase group 1  30.38 
 
 
400 aa  52  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2869  glycosyl transferase, group 1  27.55 
 
 
816 aa  52.4  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.541026 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3300  glycosyl transferase group 1  28.5 
 
 
375 aa  52.4  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00341584  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3604  glycosyl transferase group 1  29.55 
 
 
387 aa  51.6  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.592965  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>