207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01298 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_01298  predicted glycosyltransferase  100 
 
 
361 aa  750    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.65788  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0821  glycosyl transferase group 1  24 
 
 
351 aa  102  8e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.534399  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1188  glycosyl transferase, group 1  28.08 
 
 
360 aa  99  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4909  group 1 glycosyl transferase  24.6 
 
 
364 aa  98.6  1e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3679  glycosyl transferase group 1  27.66 
 
 
375 aa  98.2  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.568294 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2015  glycosyl transferase, group 1  27.09 
 
 
382 aa  80.9  0.00000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0590  glycosyl transferase, group 1  21.97 
 
 
380 aa  80.5  0.00000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.248802  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1623  glycosyl transferase group 1  29.31 
 
 
386 aa  73.9  0.000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0932889  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2343  glycosyl transferase group 1  24.22 
 
 
350 aa  72.4  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0095  glycosyl transferase group 1  25.09 
 
 
378 aa  71.6  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.844499 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1080  glycosyl transferase group 1  23.38 
 
 
394 aa  70.1  0.00000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.184829  normal  0.928063 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3241  lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase  27.47 
 
 
349 aa  66.6  0.0000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1786  glycosyl transferase, group 1  28.32 
 
 
391 aa  65.5  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3114  glycosyl transferase, group 1  27.96 
 
 
391 aa  65.9  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0580  glycosyl transferase, group 1  24.38 
 
 
417 aa  63.5  0.000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1753  glycosyl transferase group 1  21.88 
 
 
359 aa  63.2  0.000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.908553  decreased coverage  0.00756127 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0582  glycosyl transferase group 1  20.66 
 
 
374 aa  62.4  0.00000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.838889  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1450  glycosyl transferase group 1  26.32 
 
 
411 aa  62  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.925912  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3774  glycosyl transferase group 1  25.4 
 
 
372 aa  60.5  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291858  normal  0.904998 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5224  glycosyl transferase, group 1  24.57 
 
 
393 aa  60.1  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1456  glycosyl transferase, group 1  23.98 
 
 
409 aa  60.1  0.00000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1106  glycosyl transferase, group 1  23.2 
 
 
364 aa  59.3  0.00000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.525955  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2773  glycosyl transferase, group 1  23.91 
 
 
348 aa  58.9  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1996  glycosyl transferase group 1  22.22 
 
 
364 aa  58.2  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.55506 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4272  glycosyl transferase group 1  22.46 
 
 
390 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0782  glycosyl transferase group 1  23.12 
 
 
397 aa  58.5  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.215442  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1110  glycosyl transferase, group 1  24.5 
 
 
419 aa  58.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3596  glycosyl transferase group 1  23.24 
 
 
393 aa  58.5  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0722  glycosyl transferase, group 1  24.39 
 
 
357 aa  57.8  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.261837  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5216  glycosyl transferase, group 1  28.49 
 
 
392 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.088872  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5602  glycosyl transferase group 1  23.74 
 
 
399 aa  57.4  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.115159  normal  0.982088 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4332  glycosyl transferase group 1  22.46 
 
 
390 aa  57.4  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.112045 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0723  glycosyltransferase-like protein  22.13 
 
 
396 aa  57.4  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0880  glycosyl transferase group 1  24.71 
 
 
376 aa  57.4  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0960108 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1916  glycosyltransferase  27.78 
 
 
390 aa  57  0.0000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5161  glycosyl transferase group 1  26.17 
 
 
747 aa  57  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.510872  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1854  glycosyl transferase group 1  28.67 
 
 
377 aa  57  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4450  GumI protein  24.79 
 
 
350 aa  56.6  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3376  glycosyl transferase group 1  26.9 
 
 
399 aa  56.6  0.0000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000624508  hitchhiker  0.000924483 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2306  glycosyl transferase group 1  23.47 
 
 
379 aa  56.6  0.0000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.455622  normal  0.0637665 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  23.77 
 
 
379 aa  56.2  0.0000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1363  glycosyl transferase group 1  23.77 
 
 
774 aa  55.8  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.744845  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01399  exopolysaccharide xanthan biosynthesis glycosyltransferase GumI  21.54 
 
 
349 aa  55.8  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.490868  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4124  glycosyl transferase, group 1  21.72 
 
 
349 aa  55.8  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1934  glycosyl transferase, group 1  23.23 
 
 
367 aa  55.8  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.142623 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2126  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.43 
 
 
366 aa  55.1  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2506  glycosyl transferase group 1  24.58 
 
 
774 aa  55.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2856  glycosyl transferase, group 1  23.08 
 
 
388 aa  55.1  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.258995 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1785  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
380 aa  54.3  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.296483 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1126  glycosyl transferase group 1  26.21 
 
 
360 aa  54.3  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1349  glycosyl transferase group 1  22.51 
 
 
394 aa  54.7  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2586  glycosyl transferase group 1  23.46 
 
 
384 aa  54.3  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.687638 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1042  glycosyl transferase, group 1  22.38 
 
 
378 aa  54.3  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4092  glycosyl transferase group 1  25.1 
 
 
359 aa  54.3  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4876  glycosyl transferase group 1  24.02 
 
 
370 aa  53.5  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.756058  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4353  glycosyl transferase, group 1  23.14 
 
 
373 aa  53.5  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.144729  normal  0.010377 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1370  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.14 
 
 
373 aa  53.5  0.000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.165091  normal  0.289041 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1253  glycosyl transferase group 1  24.18 
 
 
351 aa  53.1  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.708089  normal  0.587919 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0516  glycosyl transferase group 1  22.06 
 
 
360 aa  53.1  0.000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.192039  normal  0.814109 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2188  glycosyl transferase, group 1  23.26 
 
 
411 aa  53.1  0.000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.891642  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4312  glycosyl transferase, group 1  25.84 
 
 
756 aa  52.8  0.000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.49569  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0240  glucosyltransferase  25.19 
 
 
364 aa  52.4  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1007  glycosyl transferase, group 1  25.19 
 
 
416 aa  52.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.643015  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3847  glycosyl transferase, group 1  24.16 
 
 
360 aa  52.8  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3353  glycosyl transferase group 1  24.64 
 
 
381 aa  52  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.207762  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02595  glycosyltransferase  24.07 
 
 
382 aa  52  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.157205  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3891  glycosyl transferase group 1  30.2 
 
 
377 aa  52.4  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.14972  normal  0.743624 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0542  glycosyl transferase group 1  25.28 
 
 
414 aa  51.6  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4438  glycosyl transferase, group 1  27.27 
 
 
370 aa  51.6  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.356751  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0826  glycosyl transferase group 1  29.1 
 
 
350 aa  51.6  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2571  glycosyl transferase group 1  21.03 
 
 
386 aa  51.6  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5066  glycosyl transferase group 1  22.35 
 
 
375 aa  51.2  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3184  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  28.57 
 
 
404 aa  51.2  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0925  glycosyl transferase, group 1  23.95 
 
 
761 aa  50.4  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.259199  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2854  glycosyl transferase group 1  21.93 
 
 
390 aa  50.4  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2121  glycosyl transferase group 1  26.44 
 
 
375 aa  50.8  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  25.12 
 
 
370 aa  50.8  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3212  glycosyl transferase group 1  23.84 
 
 
374 aa  50.4  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.283031  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2715  glycosyl transferase group 1  20.92 
 
 
375 aa  50.1  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1060  glycosyl transferase group 1  23.53 
 
 
789 aa  50.1  0.00006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.126752 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3140  zinc carboxypeptidase A metalloprotease (M14)  21.55 
 
 
357 aa  50.1  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0299032 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3865  glycosyl transferase group 1  23.9 
 
 
666 aa  50.1  0.00006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00141274 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0241  lipopolysaccharide transferase family protein  23.77 
 
 
384 aa  49.7  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0767  glycosyl transferase group 1  22.73 
 
 
414 aa  49.7  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0616  glycosyltransferase, group 1  22.73 
 
 
414 aa  49.7  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0772  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.57 
 
 
397 aa  49.7  0.00008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0395  glycosyl transferase group 1  22.84 
 
 
378 aa  49.7  0.00008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.988234  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0454  glycosyl transferase, group 1  23.3 
 
 
384 aa  49.3  0.00009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0138667 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4652  glycosyl transferase group 1  23.56 
 
 
396 aa  48.9  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2152  glycosyl transferase family protein  20.92 
 
 
371 aa  49.3  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.540294  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5324  glycosyltransferase  22.22 
 
 
759 aa  49.3  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0042  glycosyl transferase, group 1  23.03 
 
 
344 aa  49.3  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  21.63 
 
 
378 aa  48.9  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4444  glycosyl transferase group 1  21.96 
 
 
373 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0794772  hitchhiker  0.000041841 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  25.18 
 
 
367 aa  49.3  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4266  glycosyl transferase, group 1  22.37 
 
 
395 aa  48.9  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0993  putative cell division protease FtsH-like protein  24.52 
 
 
360 aa  48.9  0.0001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2861  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
366 aa  48.9  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1417  glycosyltransferase  23.03 
 
 
381 aa  48.5  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2186  glycosyl transferase group 1  20.13 
 
 
377 aa  48.1  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>