More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3376 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_3376  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
399 aa  785    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000624508  hitchhiker  0.000924483 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0542  glycosyl transferase group 1  54.65 
 
 
414 aa  378  1e-103  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7428  glycosyl transferase group 1  55.01 
 
 
388 aa  360  2e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.223976  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1052  glycosyl transferase, group 1  48.35 
 
 
371 aa  332  1e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5216  glycosyl transferase, group 1  47.94 
 
 
392 aa  325  8.000000000000001e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.088872  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5289  glycosyl transferase group 1  48.97 
 
 
405 aa  315  9.999999999999999e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.213842  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1042  glycosyl transferase, group 1  45.04 
 
 
378 aa  305  8.000000000000001e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5224  glycosyl transferase, group 1  44.5 
 
 
393 aa  301  1e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0790  glycosyl transferase, group 1  40.51 
 
 
393 aa  262  6e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0804  glycosyl transferase, group 1  40.51 
 
 
393 aa  262  6e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.26617  normal  0.0900137 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0785  glycosyl transferase, group 1  40.51 
 
 
393 aa  260  4e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.967061 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0740  glycosyl transferase, group 1  36.92 
 
 
823 aa  221  1.9999999999999999e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1916  glycosyltransferase  30.93 
 
 
390 aa  221  1.9999999999999999e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1450  glycosyl transferase group 1  33 
 
 
411 aa  219  5e-56  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.925912  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1363  glycosyl transferase group 1  35.94 
 
 
774 aa  219  6e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.744845  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5324  glycosyltransferase  37.24 
 
 
759 aa  218  2e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1623  glycosyl transferase group 1  31.38 
 
 
386 aa  213  3.9999999999999995e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0932889  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0925  glycosyl transferase, group 1  35.84 
 
 
761 aa  206  5e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.259199  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1162  glycosyl transferase group 1  32.03 
 
 
790 aa  200  3e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0865  glycosyl transferase, group 1  33.5 
 
 
763 aa  200  3e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.926448  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3138  glycosyltransferase (group I)  30.71 
 
 
797 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.150629  normal  0.748341 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1236  glycosyl transferase group 1  35.53 
 
 
765 aa  199  7.999999999999999e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0284  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
780 aa  198  1.0000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3114  glycosyl transferase, group 1  30.89 
 
 
391 aa  198  1.0000000000000001e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5161  glycosyl transferase group 1  31.28 
 
 
747 aa  195  1e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.510872  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1786  glycosyl transferase, group 1  30.21 
 
 
391 aa  194  2e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0782  glycosyl transferase group 1  31.78 
 
 
397 aa  192  8e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.215442  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2506  glycosyl transferase group 1  34.59 
 
 
774 aa  192  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1060  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
789 aa  190  4e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.126752 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1240  glycosyl transferase group 1  31.82 
 
 
395 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0360  glycosyl transferase group 1  30.53 
 
 
405 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5602  glycosyl transferase group 1  29.56 
 
 
399 aa  183  5.0000000000000004e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.115159  normal  0.982088 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1455  glycosyl transferase group 1  28.54 
 
 
759 aa  181  2e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.402299  normal  0.663839 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3438  glycosyl transferase group 1  34.74 
 
 
416 aa  169  7e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.908331 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7536  glycosyl transferase group 1  33.25 
 
 
762 aa  167  2.9999999999999998e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.961442  normal  0.148012 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4312  glycosyl transferase, group 1  26.74 
 
 
756 aa  164  2.0000000000000002e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.49569  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2577  glycosyl transferase, group 1  35.15 
 
 
767 aa  159  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.161849  normal  0.709022 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1080  glycosyl transferase group 1  29.07 
 
 
394 aa  80.9  0.00000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.184829  normal  0.928063 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2015  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 
382 aa  80.5  0.00000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  32.5 
 
 
370 aa  79  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0901  hypothetical protein  22.46 
 
 
372 aa  79  0.0000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0357056 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0249  glycosyl transferase group 1  25.61 
 
 
387 aa  78.2  0.0000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000132776  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4283  glycosyl transferase, group 1  24.76 
 
 
396 aa  76.6  0.0000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00772283 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2856  glycosyl transferase, group 1  26.1 
 
 
388 aa  75.1  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.258995 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2715  glycosyl transferase group 1  26.49 
 
 
375 aa  73.9  0.000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0095  glycosyl transferase group 1  30 
 
 
378 aa  72.8  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.844499 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2571  glycosyl transferase group 1  30.96 
 
 
386 aa  70.1  0.00000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3213  glycosyl transferase group 1  22.09 
 
 
411 aa  67.8  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.312231  normal  0.69629 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  29.37 
 
 
410 aa  66.6  0.0000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6234  glycosyl transferase group 1  32.03 
 
 
366 aa  66.2  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.130468  normal  0.465121 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1573  glycosyl transferase group 1  27.59 
 
 
420 aa  64.7  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.539919  normal  0.0199703 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3353  glycosyl transferase group 1  32.16 
 
 
381 aa  65.1  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.207762  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1114  glycosyltransferase (group I)  22.3 
 
 
404 aa  64.7  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1199  glycosyl transferase group 1  21 
 
 
356 aa  64.7  0.000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0236987  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4495  glycosyl transferase group 1  27.37 
 
 
394 aa  64.3  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5094  glycosyl transferase group 1  26.29 
 
 
382 aa  64.7  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4248  glycosyl transferase group 1  25.83 
 
 
356 aa  64.3  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2306  glycosyl transferase group 1  24.81 
 
 
379 aa  64.3  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.455622  normal  0.0637665 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1149  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
389 aa  63.9  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00373212  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4492  glycosyl transferase group 1  23.53 
 
 
399 aa  63.9  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0132524  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4841  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 
374 aa  63.9  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000142373  normal  0.0561788 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35680  hypothetical protein  24.71 
 
 
395 aa  63.5  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000110612 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3005  hypothetical protein  24.81 
 
 
395 aa  63.2  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.036404  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0357  glycosyl transferase, group 1  26.39 
 
 
375 aa  63.2  0.000000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5593  glycosyl transferase group 1  23.57 
 
 
440 aa  62.8  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1473  hypothetical protein  25.49 
 
 
383 aa  62.8  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.574733  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1547  glycosyl transferase, group 1  28.47 
 
 
397 aa  62.4  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.104847  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4272  glycosyl transferase group 1  28.24 
 
 
390 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  33.55 
 
 
426 aa  62.8  0.00000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0688  glycosyl transferase, group 1  24.12 
 
 
348 aa  62.4  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0761  glycosyl transferase group 1  26.71 
 
 
748 aa  61.6  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1868  glycosyl transferase  24.44 
 
 
375 aa  61.6  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3694  glycosyl transferase, group 1  32.94 
 
 
401 aa  62  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.414804 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3547  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  27.74 
 
 
393 aa  61.2  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13028  Glycosyl transferase group 1  23.84 
 
 
365 aa  61.2  0.00000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  25.97 
 
 
373 aa  61.2  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1712  glycosyl transferase, group 1  31.3 
 
 
388 aa  61.2  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.170704  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3533  glycosyl transferase, group 1 family protein PslF  29.32 
 
 
392 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0609585  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2343  glycosyl transferase group 1  26.07 
 
 
350 aa  60.8  0.00000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1972  glycosyl transferase, group 1  24.43 
 
 
415 aa  60.8  0.00000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0362  glycosyl transferase group 1  24.9 
 
 
380 aa  60.8  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0673622  normal  0.109102 
 
 
-
 
NC_002936  DET0978  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.72 
 
 
382 aa  60.5  0.00000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000355781  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0898  hypothetical protein  28.68 
 
 
407 aa  60.5  0.00000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1793  glycosyl transferase group 1  24.48 
 
 
388 aa  60.5  0.00000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.488843  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4332  glycosyl transferase group 1  27.45 
 
 
390 aa  60.5  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.112045 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1496  glycosyl transferase, group 1  27.02 
 
 
374 aa  59.7  0.00000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0826  glycosyl transferase group 1  31.02 
 
 
350 aa  59.7  0.00000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0880  glycosyl transferase group 1  32.61 
 
 
376 aa  59.7  0.00000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0960108 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1534  glycosyl transferase, group 1  25.16 
 
 
411 aa  59.7  0.00000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00818879  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1476  glycosyl transferase  26.51 
 
 
346 aa  58.9  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.621422  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1866  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  28.42 
 
 
396 aa  59.3  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6430  glycosyl transferase group 1  28.08 
 
 
366 aa  58.9  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.706841  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  26.05 
 
 
394 aa  58.9  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1785  glycosyl transferase group 1  25.38 
 
 
380 aa  58.5  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.296483 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1622  glycosyl transferase group 1  23.39 
 
 
402 aa  57.8  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2890  glycosyltransferase-like protein  34.13 
 
 
389 aa  57.8  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1838  glycosyl transferase group 1  27.41 
 
 
500 aa  58.2  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2826  glycosyl transferase group 1  29.91 
 
 
414 aa  57  0.0000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1806  glycosyl transferase group 1  27.88 
 
 
359 aa  56.6  0.0000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0869  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  26.63 
 
 
382 aa  56.6  0.0000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000612209  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>