More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3694 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3694  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 401 aa  800    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.414804 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6234  glycosyl transferase group 1  59.44 
 
 		 366 aa  432  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.130468  normal  0.465121 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6430  glycosyl transferase group 1  59.78 
 
 		 366 aa  432  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.706841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0676  glycosyl transferase, group 1  34.89 
 
 		 396 aa  184  3e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.063849  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4841  glycosyl transferase, group 1  30.36 
 
 		 374 aa  181  2e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000142373  normal  0.0561788 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1996  glycosyl transferase group 1  30.42 
 
 		 364 aa  144  2e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.55506 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0250  glycosyl transferase, group 1  29.02 
 
 		 374 aa  134  3e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.430935  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2715  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 375 aa  106  8e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1080  glycosyl transferase group 1  32.08 
 
 		 394 aa  105  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.184829  normal  0.928063 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1547  glycosyl transferase, group 1  31.49 
 
 		 397 aa  103  6e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.104847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5248  glycosyl transferase, group 1  35.81 
 
 		 393 aa  101  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.663702 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0582  glycosyl transferase group 1  23.33 
 
 		 374 aa  100  6e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.838889  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0241  lipopolysaccharide transferase family protein  29.41 
 
 		 384 aa  98.2  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2015  glycosyl transferase, group 1  24.64 
 
 		 382 aa  97.8  3e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3942  glycosyl transferase group 1  34.29 
 
 		 395 aa  97.4  4e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.484579  normal  0.520896 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1498  glycosyl transferase, group 1  34.8 
 
 		 392 aa  93.2  7e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3353  glycosyl transferase group 1  30.91 
 
 		 381 aa  89.7  9e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.207762  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2571  glycosyl transferase group 1  31.3 
 
 		 386 aa  88.6  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1104  glycosyl transferase, group 1  31.44 
 
 		 396 aa  88.2  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0552505  hitchhiker  0.00694846 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1753  glycosyl transferase group 1  25.77 
 
 		 359 aa  86.7  8e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.908553  decreased coverage  0.00756127 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2856  glycosyl transferase, group 1  26.65 
 
 		 388 aa  85.9  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.258995 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2909  glycosyl transferase, group 1  33.63 
 
 		 362 aa  85.5  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0395  glycosyl transferase group 1  21.76 
 
 		 378 aa  85.1  0.000000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.988234  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  24.93 
 
 		 377 aa  82.8  0.000000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0955  glycosyl transferase group 1  32.59 
 
 		 364 aa  82.8  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.607833  normal  0.284207 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0255  glycosyl transferase group 1  28.16 
 
 		 358 aa  81.6  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0731  glycosyl transferase, group 1  40.43 
 
 		 397 aa  79.7  0.00000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.238036 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0723  glycosyltransferase-like protein  30.74 
 
 		 396 aa  79  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0253  glycosyl transferase, group 1  26.19 
 
 		 358 aa  75.5  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4579  glycosyl transferase, group 1  28.76 
 
 		 398 aa  73.9  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0122865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0095  glycosyl transferase group 1  31.18 
 
 		 378 aa  73.6  0.000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.844499 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3106  glycosyl transferase group 1  29.35 
 
 		 382 aa  73.2  0.000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4092  glycosyl transferase group 1  36.69 
 
 		 359 aa  73.2  0.000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4416  glycosyl transferase group 1  30.17 
 
 		 398 aa  72.4  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2306  glycosyl transferase group 1  26.55 
 
 		 379 aa  72  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.455622  normal  0.0637665 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0126  glycosyl transferase group 1  25.9 
 
 		 371 aa  72  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0193  glycosyl transferase, group 1  28.3 
 
 		 398 aa  71.2  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2282  glycosyl transferase group 1  26.14 
 
 		 381 aa  70.9  0.00000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.823032  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1042  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 		 378 aa  70.1  0.00000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5565  glycosyl transferase group 1  32.47 
 
 		 810 aa  69.7  0.00000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.896864 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4609  glycosyl transferase, group 1  30.18 
 
 		 416 aa  69.7  0.00000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.955462  normal  0.431404 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3116  glycosyl transferase group 1  33.14 
 
 		 377 aa  69.3  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.304233 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1128  glycosyltransferase  20.18 
 
 		 394 aa  69.3  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0685342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1868  glycosyl transferase  34.19 
 
 		 375 aa  68.9  0.0000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0865  glycosyl transferase, group 1  27.55 
 
 		 763 aa  68.9  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.926448  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3362  glycosyl transferase, group 1  28.48 
 
 		 433 aa  68.6  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0581443 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2075  glycosyl transferase group 1  30.22 
 
 		 381 aa  68.6  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  23.13 
 
 		 387 aa  67.8  0.0000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2343  glycosyl transferase group 1  25.87 
 
 		 350 aa  67.8  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2752  glycosyl transferase, group 1  29.81 
 
 		 401 aa  67.8  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0826  glycosyl transferase group 1  31.67 
 
 		 350 aa  68.2  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2434  glycosyl transferase, group 1  26.34 
 
 		 386 aa  67.4  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.433213 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2900  glycosyl transferase, group 1  36.57 
 
 		 421 aa  67.4  0.0000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5224  glycosyl transferase, group 1  28.46 
 
 		 393 aa  67.4  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2506  glycosyl transferase group 1  27.65 
 
 		 774 aa  67  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3301  glycosyl transferase, group 1  34.92 
 
 		 422 aa  66.6  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.758108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3569  glycosyl transferase, group 1  26.82 
 
 		 369 aa  66.6  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.798632  decreased coverage  0.00507344 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  24.46 
 
 		 408 aa  66.6  0.0000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4196  glycosyl transferase group 1  27.68 
 
 		 366 aa  66.6  0.0000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3532  glycosyl transferase group 1  31.55 
 
 		 428 aa  66.6  0.0000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00173558  normal  0.0189831 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0025  glycosyl transferase, group 1  32.17 
 
 		 374 aa  66.2  0.0000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2522  glycosyl transferase  31.3 
 
 		 364 aa  66.2  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.810552  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1066  glycosyl transferase group 1  28.03 
 
 		 385 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.552097 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2889  glycosyl transferase, group 1  27.21 
 
 		 389 aa  65.1  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.228881  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0211  glycosyl transferase group 1  29.22 
 
 		 393 aa  65.5  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0831973 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  31.82 
 
 		 373 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0732  group 1 glycosyl transferase  30.45 
 
 		 358 aa  64.7  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0243925 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1866  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  25.7 
 
 		 396 aa  65.1  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  30.58 
 
 		 423 aa  65.1  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2609  UDP-N-acetylglucosamine  35.47 
 
 		 420 aa  65.1  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00070619 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  27.09 
 
 		 414 aa  64.3  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4244  glycosyl transferase, group 1  29.75 
 
 		 417 aa  64.7  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.772955 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2372  glycosyl transferase, group 1  27.49 
 
 		 383 aa  64.3  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.732911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2668  glycosyl transferase, group 1  27.34 
 
 		 502 aa  64.3  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1369  Glycosyltransferase-like protein  29.32 
 
 		 357 aa  64.7  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.473124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 		 360 aa  63.9  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3658  glycosyl transferase, group 1  29.1 
 
 		 386 aa  63.9  0.000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.151561  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0740  glycosyl transferase, group 1  26.72 
 
 		 823 aa  64.3  0.000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2614  glycosyl transferase, group 1  27.21 
 
 		 388 aa  64.3  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.201254  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  30.94 
 
 		 399 aa  64.3  0.000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  26.88 
 
 		 415 aa  64.3  0.000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02650  UDP-N-acetylglucosamine: 1L-myo-inositol-1-phosphate 1-alpha-D-N-acetylglucosaminyltransferase  38.01 
 
 		 431 aa  63.9  0.000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.298746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4332  glycosyl transferase group 1  29.11 
 
 		 390 aa  63.9  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.112045 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  25.26 
 
 		 379 aa  63.9  0.000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0398  glycosyl transferase group 1  29.66 
 
 		 448 aa  63.5  0.000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.348364  hitchhiker  0.00367672 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  29.08 
 
 		 423 aa  63.5  0.000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2577  glycosyl transferase, group 1  28.78 
 
 		 767 aa  63.5  0.000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.161849  normal  0.709022 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1349  glycosyl transferase group 1  27.19 
 
 		 394 aa  62.8  0.000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0821  glycosyl transferase group 1  28.16 
 
 		 351 aa  62.8  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.534399  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2087  UDP-N-acetylglucosamine  28.67 
 
 		 424 aa  62.8  0.00000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4272  glycosyl transferase group 1  29.11 
 
 		 390 aa  62.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2442  glycosyl transferase, group 1  29.18 
 
 		 382 aa  62.8  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1613  glycosyl transferase group 1  30.46 
 
 		 409 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.659761  hitchhiker  0.00171863 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2253  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.38 
 
 		 371 aa  61.6  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.531555  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0569  glycosyl transferase group 1  31.44 
 
 		 422 aa  61.6  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1905  glycosyl transferase group 1  30.46 
 
 		 409 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.297933 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1477  glycosyl transferase group 1  28 
 
 		 406 aa  61.6  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2519  putative lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyl transferase  29.1 
 
 		 384 aa  62  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.050684 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  26.45 
 
 		 373 aa  62  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1198  glycosyl transferase group 1  28.7 
 
 		 388 aa  61.6  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>