More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1455 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_1455  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
759 aa  1576    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.402299  normal  0.663839 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0865  glycosyl transferase, group 1  42.07 
 
 
763 aa  635    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.926448  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5161  glycosyl transferase group 1  53.37 
 
 
747 aa  836    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.510872  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1363  glycosyl transferase group 1  42.8 
 
 
774 aa  615  9.999999999999999e-175  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.744845  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1162  glycosyl transferase group 1  41.47 
 
 
790 aa  571  1e-161  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1236  glycosyl transferase group 1  40.03 
 
 
765 aa  562  1e-158  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5324  glycosyltransferase  37.74 
 
 
759 aa  536  1e-151  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3138  glycosyltransferase (group I)  35.75 
 
 
797 aa  525  1e-147  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.150629  normal  0.748341 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0925  glycosyl transferase, group 1  37.53 
 
 
761 aa  509  1e-143  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.259199  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1060  glycosyl transferase group 1  37.58 
 
 
789 aa  508  9.999999999999999e-143  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.126752 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0284  glycosyl transferase group 1  37.79 
 
 
780 aa  501  1e-140  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0740  glycosyl transferase, group 1  36.5 
 
 
823 aa  476  1e-133  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2577  glycosyl transferase, group 1  37.31 
 
 
767 aa  472  1.0000000000000001e-131  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.161849  normal  0.709022 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2506  glycosyl transferase group 1  34.14 
 
 
774 aa  396  1e-108  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4312  glycosyl transferase, group 1  31.33 
 
 
756 aa  381  1e-104  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.49569  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7536  glycosyl transferase group 1  32.56 
 
 
762 aa  377  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.961442  normal  0.148012 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1786  glycosyl transferase, group 1  43.4 
 
 
391 aa  326  1e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1450  glycosyl transferase group 1  40 
 
 
411 aa  316  9.999999999999999e-85  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.925912  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5603  glycosyltransferase  43.8 
 
 
364 aa  314  4.999999999999999e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.183412  normal  0.950929 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1623  glycosyl transferase group 1  38.16 
 
 
386 aa  311  2.9999999999999997e-83  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0932889  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1785  hypothetical protein  45.95 
 
 
349 aa  311  4e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1240  glycosyl transferase group 1  39.39 
 
 
395 aa  305  3.0000000000000004e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0360  glycosyl transferase group 1  39.16 
 
 
405 aa  303  7.000000000000001e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3114  glycosyl transferase, group 1  37.8 
 
 
391 aa  291  4e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1916  glycosyltransferase  37.37 
 
 
390 aa  287  4e-76  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1449  glycosyl transferase  43.54 
 
 
353 aa  276  8e-73  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3115  hypothetical protein  42.25 
 
 
337 aa  273  9e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0782  glycosyl transferase group 1  35.04 
 
 
397 aa  271  2.9999999999999997e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.215442  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1622  hypothetical protein  37.17 
 
 
360 aa  253  1e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.681183  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5602  glycosyl transferase group 1  32.9 
 
 
399 aa  223  9.999999999999999e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.115159  normal  0.982088 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3438  glycosyl transferase group 1  33.77 
 
 
416 aa  222  1.9999999999999999e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.908331 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1241  hypothetical protein  35.74 
 
 
371 aa  201  3e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0361  hypothetical protein  33.88 
 
 
378 aa  201  5e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0783  glycosyltransferase  31.42 
 
 
404 aa  187  8e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.482662  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1052  glycosyl transferase, group 1  28.8 
 
 
371 aa  179  1e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3376  glycosyl transferase group 1  28.54 
 
 
399 aa  177  7e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000624508  hitchhiker  0.000924483 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1917  hypothetical protein  33.53 
 
 
339 aa  175  1.9999999999999998e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5289  glycosyl transferase group 1  31.79 
 
 
405 aa  174  7.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.213842  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7428  glycosyl transferase group 1  29.64 
 
 
388 aa  172  3e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.223976  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5224  glycosyl transferase, group 1  27.84 
 
 
393 aa  170  8e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1042  glycosyl transferase, group 1  28.68 
 
 
378 aa  168  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5216  glycosyl transferase, group 1  28.12 
 
 
392 aa  166  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.088872  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3440  mannosyltransferase  33.53 
 
 
348 aa  163  9e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.106882  normal  0.942853 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0785  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 
393 aa  153  1e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.967061 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1965  hypothetical protein  30.92 
 
 
367 aa  152  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.234327 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0790  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 
393 aa  152  2e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0804  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 
393 aa  152  2e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.26617  normal  0.0900137 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0543  hypothetical protein  32.11 
 
 
338 aa  148  3e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.539162  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0542  glycosyl transferase group 1  27.99 
 
 
414 aa  145  4e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5215  putative glycosyltransferase  30.21 
 
 
340 aa  137  9.999999999999999e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.191261  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3375  glycosyl transferase  29.91 
 
 
351 aa  134  7.999999999999999e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000640117  hitchhiker  0.00216931 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1053  putative glycosyltransferase  27.27 
 
 
340 aa  124  8e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3533  glycosyl transferase, group 1 family protein PslF  23.3 
 
 
392 aa  83.2  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0609585  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35680  hypothetical protein  24.31 
 
 
395 aa  82.4  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000110612 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3542  hypothetical protein  26.25 
 
 
357 aa  81.6  0.00000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000965679  normal  0.103099 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22800  glycosyl transferase group 1  26.43 
 
 
359 aa  81.3  0.00000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3305  glycosyl transferase, group 1  22.33 
 
 
392 aa  80.5  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0317499  normal  0.753589 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0361  hypothetical protein  24.68 
 
 
480 aa  79.3  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3942  glycosyl transferase group 1  25.94 
 
 
395 aa  78.6  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.484579  normal  0.520896 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1104  glycosyl transferase, group 1  27.97 
 
 
396 aa  75.5  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0552505  hitchhiker  0.00694846 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3353  glycosyl transferase group 1  32.56 
 
 
381 aa  74.3  0.000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.207762  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3091  glycosyl transferase, group 1  23.88 
 
 
770 aa  72.4  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.278852  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0255  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 
358 aa  70.9  0.00000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3005  hypothetical protein  23.69 
 
 
395 aa  70.1  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.036404  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2715  glycosyl transferase group 1  23.51 
 
 
375 aa  68.9  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2571  glycosyl transferase group 1  31.44 
 
 
386 aa  67  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4283  glycosyl transferase, group 1  21.62 
 
 
396 aa  67  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00772283 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0395  glycosyl transferase group 1  26.54 
 
 
378 aa  66.6  0.000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.988234  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5045  glycosyl transferase group 1  28.8 
 
 
422 aa  65.9  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.022612 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5022  glycosyl transferase group 1  26.15 
 
 
395 aa  65.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2677  glycosyl transferase family protein  29.94 
 
 
1267 aa  65.1  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2075  glycosyl transferase group 1  23.51 
 
 
381 aa  64.7  0.000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1868  glycosyl transferase  22.83 
 
 
375 aa  64.7  0.000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4652  glycosyl transferase group 1  22.03 
 
 
396 aa  64.7  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1128  glycosyltransferase  26.15 
 
 
394 aa  63.5  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0685342  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1977  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.48 
 
 
443 aa  63.2  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.26927  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2745  glycosyl transferase family protein  28.05 
 
 
1267 aa  63.2  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.636531  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0389  glycosyl transferase group 1  25.88 
 
 
359 aa  63.2  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2262  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.48 
 
 
495 aa  63.2  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.333753  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  23.68 
 
 
395 aa  62.8  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0998  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.48 
 
 
499 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0627  UDP-N-acetylglucosamine  24.48 
 
 
438 aa  62.8  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21071  hypothetical protein  21.5 
 
 
1232 aa  62.8  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1287  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.48 
 
 
443 aa  63.2  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0688  glycosyl transferase, group 1  24.2 
 
 
348 aa  62.4  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2023  glycosyl transferase, group 1  25.74 
 
 
401 aa  62.4  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.334553  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.48 
 
 
443 aa  61.6  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.233611  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3028  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.48 
 
 
498 aa  61.6  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.220926  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2517  glycosyl transferase group 1  26.07 
 
 
405 aa  61.6  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.587179  normal  0.0541201 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3157  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.48 
 
 
443 aa  61.6  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4196  glycosyl transferase group 1  25.09 
 
 
366 aa  61.6  0.00000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1547  glycosyl transferase, group 1  23.82 
 
 
397 aa  61.2  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.104847  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1199  glycosyl transferase group 1  27.84 
 
 
356 aa  61.2  0.00000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0236987  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1682  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.57 
 
 
420 aa  61.2  0.00000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.961392 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2856  glycosyl transferase, group 1  26.98 
 
 
388 aa  61.2  0.00000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.258995 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1191  glycosyl transferase, group 1  23.32 
 
 
384 aa  61.2  0.00000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0957  glycosyl transferase, group 1  24.74 
 
 
386 aa  60.8  0.00000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.258156  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0898  hypothetical protein  25.93 
 
 
407 aa  60.1  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1730  hypothetical protein  23.45 
 
 
424 aa  60.1  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000064452 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1640  hypothetical protein  23.45 
 
 
424 aa  60.1  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>