283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0542 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_0542  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
414 aa  798    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3376  glycosyl transferase group 1  53.22 
 
 
399 aa  375  1e-103  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000624508  hitchhiker  0.000924483 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7428  glycosyl transferase group 1  54.05 
 
 
388 aa  371  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.223976  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1052  glycosyl transferase, group 1  51.14 
 
 
371 aa  338  9e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5216  glycosyl transferase, group 1  50.13 
 
 
392 aa  338  9.999999999999999e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.088872  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5289  glycosyl transferase group 1  49.38 
 
 
405 aa  326  4.0000000000000003e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.213842  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1042  glycosyl transferase, group 1  46.46 
 
 
378 aa  319  3.9999999999999996e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5224  glycosyl transferase, group 1  46.02 
 
 
393 aa  319  6e-86  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0790  glycosyl transferase, group 1  43.24 
 
 
393 aa  300  4e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0804  glycosyl transferase, group 1  43.24 
 
 
393 aa  300  4e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.26617  normal  0.0900137 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0785  glycosyl transferase, group 1  43 
 
 
393 aa  294  2e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.967061 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1450  glycosyl transferase group 1  33.76 
 
 
411 aa  223  6e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.925912  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1363  glycosyl transferase group 1  35.68 
 
 
774 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.744845  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5324  glycosyltransferase  34.31 
 
 
759 aa  215  9.999999999999999e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1623  glycosyl transferase group 1  31.63 
 
 
386 aa  215  9.999999999999999e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0932889  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1916  glycosyltransferase  32.18 
 
 
390 aa  214  1.9999999999999998e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1162  glycosyl transferase group 1  32.91 
 
 
790 aa  207  2e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0740  glycosyl transferase, group 1  34.45 
 
 
823 aa  208  2e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0782  glycosyl transferase group 1  34.22 
 
 
397 aa  207  4e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.215442  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0925  glycosyl transferase, group 1  34.6 
 
 
761 aa  206  5e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.259199  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1060  glycosyl transferase group 1  33.49 
 
 
789 aa  202  7e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.126752 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2506  glycosyl transferase group 1  35.54 
 
 
774 aa  202  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1240  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
395 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1786  glycosyl transferase, group 1  31.63 
 
 
391 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0865  glycosyl transferase, group 1  33.74 
 
 
763 aa  196  4.0000000000000005e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.926448  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0360  glycosyl transferase group 1  31.7 
 
 
405 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3438  glycosyl transferase group 1  36.52 
 
 
416 aa  190  4e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.908331 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5161  glycosyl transferase group 1  30.92 
 
 
747 aa  190  5e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.510872  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1236  glycosyl transferase group 1  32.83 
 
 
765 aa  189  9e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3114  glycosyl transferase, group 1  30.35 
 
 
391 aa  187  3e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5602  glycosyl transferase group 1  30.94 
 
 
399 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.115159  normal  0.982088 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7536  glycosyl transferase group 1  35.93 
 
 
762 aa  182  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.961442  normal  0.148012 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2577  glycosyl transferase, group 1  33.41 
 
 
767 aa  177  4e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.161849  normal  0.709022 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0284  glycosyl transferase group 1  30.86 
 
 
780 aa  176  9e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3138  glycosyltransferase (group I)  28.5 
 
 
797 aa  172  1e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.150629  normal  0.748341 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4312  glycosyl transferase, group 1  26.18 
 
 
756 aa  164  3e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.49569  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1455  glycosyl transferase group 1  27.62 
 
 
759 aa  161  2e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.402299  normal  0.663839 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1080  glycosyl transferase group 1  30.71 
 
 
394 aa  72.8  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.184829  normal  0.928063 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2715  glycosyl transferase group 1  28.67 
 
 
375 aa  71.2  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0249  glycosyl transferase group 1  23.69 
 
 
387 aa  67.8  0.0000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000132776  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2826  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
414 aa  67.4  0.0000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2015  glycosyl transferase, group 1  23.16 
 
 
382 aa  67  0.0000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2571  glycosyl transferase group 1  31.67 
 
 
386 aa  66.6  0.0000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0901  hypothetical protein  22.93 
 
 
372 aa  64.3  0.000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0357056 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1573  glycosyl transferase group 1  31.5 
 
 
420 aa  64.7  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.539919  normal  0.0199703 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0095  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
378 aa  63.9  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.844499 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1547  glycosyl transferase, group 1  28.72 
 
 
397 aa  63.9  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.104847  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  34.78 
 
 
370 aa  63.9  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5593  glycosyl transferase group 1  25.42 
 
 
440 aa  62.8  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1998  glycosyl transferase group 1  27.18 
 
 
379 aa  61.6  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3091  glycosyl transferase, group 1  34.15 
 
 
770 aa  62.4  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.278852  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  30 
 
 
370 aa  62.4  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2671  glycosyl transferase, group 1  29.41 
 
 
408 aa  62  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.990429  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4248  glycosyl transferase group 1  23.33 
 
 
356 aa  61.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  26.73 
 
 
423 aa  60.8  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0688  glycosyl transferase, group 1  23.67 
 
 
348 aa  60.8  0.00000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4283  glycosyl transferase, group 1  26.22 
 
 
396 aa  59.7  0.00000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00772283 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0898  hypothetical protein  30.32 
 
 
407 aa  59.7  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1996  glycosyl transferase group 1  25.48 
 
 
364 aa  59.3  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.55506 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2343  glycosyl transferase group 1  26.51 
 
 
350 aa  59.3  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3694  glycosyl transferase, group 1  29.39 
 
 
401 aa  59.7  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.414804 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0582  glycosyl transferase group 1  23.89 
 
 
374 aa  59.3  0.0000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.838889  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0362  glycosyl transferase group 1  27.08 
 
 
380 aa  58.2  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0673622  normal  0.109102 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3353  glycosyl transferase group 1  29.84 
 
 
381 aa  58.9  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.207762  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6932  glycosyl transferase group 1  26.86 
 
 
1233 aa  58.9  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0899413 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  20.89 
 
 
401 aa  57.8  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3533  glycosyl transferase, group 1 family protein PslF  25.19 
 
 
392 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0609585  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3362  glycosyl transferase, group 1  32.41 
 
 
433 aa  57.4  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0581443 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2856  glycosyl transferase, group 1  26.98 
 
 
388 aa  57.4  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.258995 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0676  glycosyl transferase, group 1  28.02 
 
 
396 aa  57.4  0.0000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.063849  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1473  hypothetical protein  23.69 
 
 
383 aa  57  0.0000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.574733  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1373  glycosyl transferase, group 1  27.71 
 
 
439 aa  57  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6048  glycosyl transferase group 1  27.71 
 
 
439 aa  57  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0604596 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6456  glycosyl transferase, group 1  27.71 
 
 
439 aa  57  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.338178  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1866  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  25.3 
 
 
396 aa  56.6  0.0000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2414  glycosyl transferase group 1 family protein  36.45 
 
 
360 aa  55.8  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0880  glycosyl transferase group 1  35.38 
 
 
376 aa  56.2  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0960108 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6430  glycosyl transferase group 1  25.58 
 
 
366 aa  55.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.706841  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6234  glycosyl transferase group 1  25.81 
 
 
366 aa  55.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.130468  normal  0.465121 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2909  glycosyl transferase, group 1  27.96 
 
 
362 aa  56.2  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  32.97 
 
 
410 aa  56.2  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0740  glycosyl transferase, group 1  30.86 
 
 
368 aa  55.1  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0250  glycosyl transferase, group 1  24.52 
 
 
374 aa  55.5  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.430935  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1964  glycosyl transferase group 1  28.1 
 
 
385 aa  55.5  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0014923 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0713  glycosyl transferase, group 1  29.01 
 
 
405 aa  55.5  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0559363  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35680  hypothetical protein  24.89 
 
 
395 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000110612 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4495  glycosyl transferase group 1  27.43 
 
 
394 aa  54.7  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0207  glycosyl transferase group 1  30.16 
 
 
398 aa  54.7  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2815  hypothetical protein  27.91 
 
 
341 aa  54.3  0.000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0235  glycosyl transferase group 1  26.61 
 
 
373 aa  54.3  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.118803 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2807  glycosyl transferase group 1  27.46 
 
 
412 aa  54.3  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1681  glycosyl transferase, group 1  30.97 
 
 
303 aa  54.3  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.456944  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1353  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  29.15 
 
 
388 aa  53.9  0.000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.652721  normal  0.416501 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3693  glycosyl transferase, group 1  31.28 
 
 
371 aa  53.9  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.419352 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2912  glycosyl transferase group 1  27.44 
 
 
412 aa  53.5  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.341746  normal  0.205284 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01298  predicted glycosyltransferase  24.19 
 
 
361 aa  53.5  0.000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.65788  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1496  glycosyl transferase, group 1  24.21 
 
 
374 aa  53.9  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0375  Glycosyltransferase-like protein  30.3 
 
 
569 aa  53.5  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3592  glycosyl transferase group 1  28.53 
 
 
412 aa  53.5  0.000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.157633  hitchhiker  0.00114643 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0826  glycosyl transferase group 1  33.73 
 
 
350 aa  53.5  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>