More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2414 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA2414  glycosyl transferase group 1 family protein  100 
 
 
360 aa  723    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0171  glycosyl transferase, group 1  28.32 
 
 
389 aa  87  5e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1805  glycosyl transferase, group 1  29.37 
 
 
372 aa  84  0.000000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0777  glycosyl transferase, group 1  24.66 
 
 
384 aa  78.6  0.0000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.135676  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0355  glycosyl transferase, group 1  22.55 
 
 
375 aa  76.3  0.0000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1373  glycosyl transferase group 1  30.41 
 
 
447 aa  70.9  0.00000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3878  glycosyl transferase group 1  28.27 
 
 
535 aa  70.1  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05800  glycosyltransferase  27.88 
 
 
437 aa  69.7  0.00000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.504823  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1051  putative transferase  26.41 
 
 
384 aa  68.6  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1929  glycosyl transferase, group 1  30.77 
 
 
409 aa  68.2  0.0000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2912  glycosyl transferase group 1  25.86 
 
 
412 aa  67.8  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.341746  normal  0.205284 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4272  glycosyl transferase group 1  24.84 
 
 
390 aa  67.8  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0158  glycosyl transferase, group 1  30.8 
 
 
398 aa  67.4  0.0000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2685  glycosyl transferase group 1  25.86 
 
 
412 aa  67.4  0.0000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.481855  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0616  glycosyltransferase, group 1  26.72 
 
 
414 aa  66.6  0.0000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0206  glycosyl transferase, group 1  33.91 
 
 
399 aa  66.6  0.0000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0767  glycosyl transferase group 1  26.72 
 
 
414 aa  66.6  0.0000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4332  glycosyl transferase group 1  24.51 
 
 
390 aa  66.6  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.112045 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1825  glycosyl transferase group 1  30.46 
 
 
353 aa  65.1  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5040  glycosyl transferase, group 1  26.6 
 
 
362 aa  63.2  0.000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3107  glycosyl transferase, group 1  28.71 
 
 
475 aa  63.2  0.000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.27638  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4841  glycosyl transferase, group 1  25.9 
 
 
374 aa  62.4  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000142373  normal  0.0561788 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2807  glycosyl transferase group 1  25.37 
 
 
412 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2737  glycosyl transferase group 1  27.71 
 
 
416 aa  61.6  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.829529  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2157  glycosyl transferase, group 1  27.78 
 
 
385 aa  60.8  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.750957  normal  0.801991 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1494  glycosyl transferase group 1  37.66 
 
 
399 aa  60.5  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37583  predicted protein  30.84 
 
 
400 aa  60.8  0.00000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.17568  hitchhiker  0.00128126 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4708  glycosyl transferase group 1  29.49 
 
 
418 aa  60.5  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.514087 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1425  glycosyl transferase group 1  21.5 
 
 
468 aa  60.5  0.00000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.703524  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2279  glycosyl transferase group 1  29.51 
 
 
373 aa  60.1  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1937  glycosyl transferase, group 1  28.14 
 
 
412 aa  60.5  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0111  glycosyltransferase  44.16 
 
 
401 aa  60.1  0.00000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.451915  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  28.3 
 
 
382 aa  60.1  0.00000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5565  glycosyl transferase group 1  24.66 
 
 
810 aa  59.3  0.00000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.896864 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0169  glycosyltransferase-like protein  33.33 
 
 
751 aa  59.3  0.00000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.672061  normal  0.17945 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1537  glycosyl transferase group 1  35 
 
 
385 aa  59.3  0.00000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.728307 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1685  glycosyl transferase group 1  28.41 
 
 
859 aa  58.9  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.159285 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1349  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.29 
 
 
387 aa  59.3  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0584  glycosyl transferase group 1  26.24 
 
 
373 aa  58.9  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.83028  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1385  glycosyl transferase group 1  28.32 
 
 
415 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.011099 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1243  glycosyl transferase group 1  26.7 
 
 
366 aa  59.3  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.160132  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1866  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  24.43 
 
 
396 aa  58.9  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1128  glycosyltransferase  25.14 
 
 
394 aa  58.2  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0685342  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2650  glycosyl transferase, group 1  23.05 
 
 
357 aa  58.2  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0235  glycosyl transferase group 1  23.36 
 
 
373 aa  58.2  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.118803 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6868  glycosyl transferase group 1  29.67 
 
 
424 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1433  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.92 
 
 
409 aa  57.8  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.985375  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  34.95 
 
 
423 aa  57.8  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2840  glycosyl transferase, group 1  26.87 
 
 
403 aa  57  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0670  glycosyl transferase, group 1  27.09 
 
 
371 aa  57  0.0000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1186  glycosyl transferase, group 1  28.11 
 
 
427 aa  57  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0635  glycosyl transferase group 1  26.25 
 
 
403 aa  57  0.0000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3471  glycosyl transferase, group 1  26.28 
 
 
390 aa  57  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.152793  normal  0.0339025 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2778  glycosyl transferase, group 1  28.9 
 
 
413 aa  57  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.298779 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1526  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 
397 aa  56.6  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00489758  normal  0.775583 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0898  hypothetical protein  27.63 
 
 
407 aa  56.2  0.0000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1116  glycosyltransferase  27.93 
 
 
413 aa  56.2  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1382  glycosyltransferase-like protein  22.71 
 
 
387 aa  56.2  0.0000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.702037  normal  0.362808 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0504  glycosyl transferase group 1  30.5 
 
 
391 aa  56.2  0.0000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0105  glycosyl transferase group 1  27.81 
 
 
385 aa  56.2  0.0000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1492  glycosyl transferase, group 1  27.33 
 
 
395 aa  56.2  0.0000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1080  glycosyl transferase group 1  37.76 
 
 
394 aa  56.2  0.0000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.184829  normal  0.928063 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5249  glycosyl transferase group 1  25.14 
 
 
386 aa  56.2  0.0000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0668  glycosyl transferase, group 1  36 
 
 
378 aa  55.5  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000385091 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2854  glycosyl transferase group 1  29.24 
 
 
390 aa  55.8  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  26.12 
 
 
370 aa  55.5  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0917  glycosyl transferase group 1  29.65 
 
 
382 aa  55.5  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0393  glycosyl transferase group 1  25.3 
 
 
403 aa  55.5  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.190389  normal  0.881453 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1114  glycosyltransferase (group I)  25.86 
 
 
404 aa  55.1  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2141  glycosyltransferase  30.83 
 
 
416 aa  54.7  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00102383  normal  0.405566 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0199  hypothetical protein  27.91 
 
 
754 aa  55.1  0.000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0290  glycosyl transferase, group 1  38.46 
 
 
370 aa  55.1  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02010  glycosyltransferase  31.25 
 
 
389 aa  55.1  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.472903  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  26.59 
 
 
373 aa  55.1  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2570  glycosyl transferase group 1  27.05 
 
 
402 aa  54.7  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0654  glycosyl transferase group 1  25.9 
 
 
392 aa  55.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.871092  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1998  glycosyl transferase group 1  24.26 
 
 
379 aa  55.1  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1723  glycosyl transferase, group 1  24.12 
 
 
380 aa  54.7  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.952593  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  29.39 
 
 
346 aa  55.1  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5018  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.45 
 
 
377 aa  54.3  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.437821  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2965  hypothetical protein  22.7 
 
 
342 aa  54.3  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3522  glycosyl transferase group 1  29.82 
 
 
385 aa  54.3  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.828408  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1502  glycosyl transferase, group 1  26.36 
 
 
420 aa  54.7  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0327  hypothetical protein  22.71 
 
 
364 aa  54.3  0.000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.37182  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3851  glycosyl transferase, group 1  26.01 
 
 
353 aa  54.7  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.243477 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2544  glycosyl transferase, group 1  26.26 
 
 
401 aa  54.3  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.434322  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3565  glycosyl transferase group 1  28.09 
 
 
390 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3989  glycosyl transferase, group 1  24.13 
 
 
361 aa  54.3  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1197  glycosyl transferase, group 1  24.89 
 
 
374 aa  54.3  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0309  hypothetical protein  22.71 
 
 
364 aa  54.3  0.000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000373885  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2285  glycosyl transferase group 1  26.2 
 
 
410 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0267673  normal  0.0567423 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  26.06 
 
 
424 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3118  glycosyl transferase group 1  28.95 
 
 
390 aa  53.9  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.353961  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1496  glycosyl transferase, group 1  21.82 
 
 
374 aa  53.9  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3220  glycosyl transferase, group 1  29.82 
 
 
673 aa  53.9  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1062  glycosyl transferase group 1  35.35 
 
 
400 aa  53.9  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2971  glycosyl transferase group 1  22.9 
 
 
391 aa  53.9  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.176769  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3146  glycosyl transferase group 1  25.26 
 
 
382 aa  53.9  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.500538  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0795  glycosyl transferase group 1  27.59 
 
 
368 aa  53.9  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7428  glycosyl transferase group 1  35.71 
 
 
388 aa  53.5  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.223976  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>