More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1681 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_1681  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
303 aa  569  1e-161  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.456944  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2562  glycosyl transferase, group 1  53.09 
 
 
344 aa  246  3e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.118298 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2749  glycosyl transferase group 1  55.19 
 
 
344 aa  245  8e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.611394  hitchhiker  0.00344637 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0317  glycosyl transferase group 1  51.52 
 
 
343 aa  230  2e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2747  glycosyl transferase group 1  48.02 
 
 
381 aa  227  2e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000175186  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1176  glycosyl transferase, group 1  38.02 
 
 
349 aa  157  3e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2314  glycosyl transferase group 1  36.23 
 
 
347 aa  145  1e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.055827  normal  0.292913 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8172  glycosyl transferase group 1  35.8 
 
 
356 aa  139  7.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4662  glycosyl transferase group 1  44.53 
 
 
350 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0886148  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0797  glycosyl transferase group 1  37.12 
 
 
360 aa  132  6e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4362  glycosyl transferase, group 1  36.36 
 
 
349 aa  120  3e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2455  glycosyl transferase group 1  37.54 
 
 
357 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0769  glycosyl transferase group 1  32.65 
 
 
347 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4785  glycosyl transferase group 1  37.87 
 
 
350 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.195851  normal  0.262442 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0309  glycosyl transferase, group 1  35.66 
 
 
347 aa  110  4.0000000000000004e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0644  glycosyl transferase, group 1  41.55 
 
 
380 aa  107  3e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0763  glycosyl transferase, group 1  34.93 
 
 
337 aa  105  1e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3664  glycosyl transferase, group 1  34.97 
 
 
346 aa  103  5e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.032207  normal  0.177473 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1238  glycosyl transferase group 1  34.16 
 
 
349 aa  100  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0206606  normal 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4162  glycosyl transferase group 1  34.15 
 
 
347 aa  94.7  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0349192  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1676  glycosyl transferase, group 1  29.73 
 
 
639 aa  93.6  4e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  32.91 
 
 
419 aa  92  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4609  UDP-N-acetylglucosamine  36.82 
 
 
450 aa  91.3  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0073  glycosyl transferase, group 1  38.75 
 
 
448 aa  90.9  2e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5074  UDP-N-acetylglucosamine  35.6 
 
 
418 aa  87.8  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.838773  normal  0.526532 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  40.53 
 
 
370 aa  87.4  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3727  glycosyl transferase group 1  30.74 
 
 
672 aa  87.8  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121085  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  28.76 
 
 
373 aa  86.3  7e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0331  glycosyl transferase, group 1  35.77 
 
 
482 aa  85.9  9e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2376  glycosyl transferase group 1  32.29 
 
 
372 aa  84.7  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  30.09 
 
 
423 aa  83.2  0.000000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0398  glycosyl transferase group 1  36.23 
 
 
448 aa  82.8  0.000000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.348364  hitchhiker  0.00367672 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2609  UDP-N-acetylglucosamine  33.61 
 
 
420 aa  82.8  0.000000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00070619 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2575  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
339 aa  83.2  0.000000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.561026  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6162  glycosyl transferase group 1  34.16 
 
 
434 aa  82.8  0.000000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.189514 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0494  UDP-N-acetylglucosamine  35.25 
 
 
428 aa  81.6  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3512  glycosyl transferase group 1  27.91 
 
 
369 aa  80.9  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.218401  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1051  glycosyl transferase, group 1  37.56 
 
 
445 aa  81.3  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.876229 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2087  UDP-N-acetylglucosamine  31.67 
 
 
424 aa  81.3  0.00000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0956  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.01 
 
 
435 aa  80.9  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.611098  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5593  glycosyl transferase group 1  28.76 
 
 
440 aa  79.7  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1681  glycosyl transferase group 1  32.27 
 
 
366 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.082633  normal  0.656807 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0758  glycosyl transferase group 1  31.38 
 
 
371 aa  78.6  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.11154 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2913  putative glycosyltransferase  34.65 
 
 
434 aa  78.6  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0713  glycosyl transferase, group 1  34.88 
 
 
405 aa  78.6  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0559363  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5045  glycosyl transferase group 1  29.87 
 
 
422 aa  78.2  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.022612 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1960  glycosyl transferase group 1  32.64 
 
 
426 aa  78.6  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000390342  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.51 
 
 
407 aa  78.2  0.0000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.728152  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0695  UDP-N-acetylglucosamine  34.43 
 
 
431 aa  78.2  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0569  glycosyl transferase group 1  32.92 
 
 
422 aa  77.4  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31920  UDP-N-acetylglucosamine: 1L-myo-inositol-1-phosphate 1-alpha-D-N-acetylglucosaminyltransferase  32.38 
 
 
420 aa  78.2  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0205  glycosyl transferase, group 1  36.18 
 
 
454 aa  77.4  0.0000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8224  UDP-N-acetylglucosamine  33.6 
 
 
427 aa  78.2  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673631  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5500  glycosyl transferase group 1  37.1 
 
 
455 aa  77.8  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0983279 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0761  glycosyl transferase group 1  34.83 
 
 
748 aa  77.4  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0890  glycosyl transferase group 1  31.91 
 
 
435 aa  76.6  0.0000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.102744  decreased coverage  0.000533539 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0631  glycosyl transferase group 1  38.6 
 
 
394 aa  76.6  0.0000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0880  glycosyl transferase group 1  35.61 
 
 
376 aa  76.3  0.0000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0960108 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1001  glycosyl transferase group 1  29.49 
 
 
411 aa  76.3  0.0000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1751  glycosyl transferase group 1  34.11 
 
 
453 aa  75.9  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1091  glycosyl transferase group 1  32.74 
 
 
378 aa  75.9  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0358  glycosyl transferase group 1  33.65 
 
 
405 aa  75.5  0.000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0234  glycosyl transferase group 1  37.2 
 
 
385 aa  75.5  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3891  glycosyl transferase group 1  40.62 
 
 
377 aa  75.5  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.14972  normal  0.743624 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  29.7 
 
 
414 aa  75.1  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0154  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.74 
 
 
360 aa  74.3  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  27.69 
 
 
401 aa  74.7  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2637  glycosyl transferase, group 1  31.54 
 
 
421 aa  74.3  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.731543  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1748  glycosyl transferase group 1  32.77 
 
 
402 aa  74.3  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0115341 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4017  glycosyl transferase group 1  45.08 
 
 
384 aa  74.3  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.174092  normal  0.606388 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0775  glycosyltransferase-like protein  40.27 
 
 
371 aa  74.7  0.000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2213  glycosyl transferase group 1  36.99 
 
 
395 aa  74.7  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0357  glycosyl transferase, group 1  27.07 
 
 
375 aa  74.3  0.000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2761  glycosyl transferase group 1  33.18 
 
 
419 aa  73.9  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.399192  normal  0.235509 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2900  glycosyl transferase, group 1  32.37 
 
 
421 aa  73.9  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  32.87 
 
 
367 aa  73.9  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4271  glycosyl transferase group 1  30.14 
 
 
400 aa  74.3  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.614702 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  30.33 
 
 
423 aa  73.9  0.000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3106  glycosyl transferase group 1  35.65 
 
 
382 aa  73.6  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277853  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3362  glycosyl transferase, group 1  36.53 
 
 
433 aa  73.6  0.000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0581443 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6498  glycosyl transferase, group 1  35.18 
 
 
412 aa  73.6  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  29.92 
 
 
382 aa  73.6  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3778  glycosyl transferase, group 1  30.43 
 
 
382 aa  73.2  0.000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.729941  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1916  glycosyl transferase, group 1  29.65 
 
 
383 aa  73.2  0.000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0740  putative glycosyl transferase  31.97 
 
 
442 aa  73.2  0.000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.053122  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1812  glycosyl transferase, group 1  33.17 
 
 
406 aa  73.2  0.000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3926  glucosyltransferase  38.04 
 
 
411 aa  72.8  0.000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4336  UDP-N-acetylglucosamine  34 
 
 
429 aa  72.4  0.000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.913017 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5787  glycosyl transferase group 1  32.67 
 
 
415 aa  72.4  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0790  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  38.33 
 
 
400 aa  72.4  0.000000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000379704 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0827  glycosyl transferase, group 1  32.59 
 
 
450 aa  72.4  0.000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.621975  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2081  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
374 aa  72.4  0.000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0653  UDP-N-acetylglucosamine  35.75 
 
 
443 aa  72  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.119521  hitchhiker  0.000107829 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  37.45 
 
 
393 aa  72.4  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1839  glycosyl transferase group 1  33.94 
 
 
362 aa  72.4  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0744  glycosyl transferase, group 1  30.7 
 
 
384 aa  71.6  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.348162  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4050  glycosyl transferase, group 1  32.11 
 
 
458 aa  72  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4579  glycosyl transferase, group 1  34.95 
 
 
398 aa  72  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0122865  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  37.5 
 
 
377 aa  72  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1689  glycosyl transferase, group 1  27.2 
 
 
381 aa  72  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>