More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4785 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_4785  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
350 aa  649    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.195851  normal  0.262442 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4662  glycosyl transferase group 1  70.11 
 
 
350 aa  382  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0886148  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2314  glycosyl transferase group 1  52.23 
 
 
347 aa  263  3e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.055827  normal  0.292913 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8172  glycosyl transferase group 1  47.01 
 
 
356 aa  239  6.999999999999999e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0769  glycosyl transferase group 1  44.09 
 
 
347 aa  236  4e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0309  glycosyl transferase, group 1  42.24 
 
 
347 aa  226  6e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1176  glycosyl transferase, group 1  42.49 
 
 
349 aa  209  4e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3664  glycosyl transferase, group 1  46.29 
 
 
346 aa  208  1e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.032207  normal  0.177473 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4162  glycosyl transferase group 1  45.48 
 
 
347 aa  199  6e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0349192  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4362  glycosyl transferase, group 1  44.51 
 
 
349 aa  198  1.0000000000000001e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1676  glycosyl transferase, group 1  37.71 
 
 
639 aa  189  8e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2747  glycosyl transferase group 1  39.83 
 
 
381 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000175186  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2455  glycosyl transferase group 1  46.01 
 
 
357 aa  176  8e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0763  glycosyl transferase, group 1  40.12 
 
 
337 aa  163  4.0000000000000004e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0317  glycosyl transferase group 1  40.11 
 
 
343 aa  151  1e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2749  glycosyl transferase group 1  40.63 
 
 
344 aa  151  2e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.611394  hitchhiker  0.00344637 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1681  glycosyl transferase, group 1  41.9 
 
 
303 aa  140  3.9999999999999997e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.456944  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2562  glycosyl transferase, group 1  36.25 
 
 
344 aa  130  4.0000000000000003e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.118298 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1238  glycosyl transferase group 1  36.47 
 
 
349 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0206606  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0797  glycosyl transferase group 1  31.44 
 
 
360 aa  112  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2575  glycosyl transferase, group 1  37.64 
 
 
339 aa  108  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.561026  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3512  glycosyl transferase group 1  28.42 
 
 
369 aa  105  1e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.218401  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0644  glycosyl transferase, group 1  32.65 
 
 
380 aa  102  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0773  glycosyl transferase group 1  31.42 
 
 
457 aa  96.3  6e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2494  glycosyl transferase group 1  30.25 
 
 
452 aa  94.7  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.044708  normal  0.0808495 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0516  glycosyl transferase group 1  32.5 
 
 
360 aa  94.7  2e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.192039  normal  0.814109 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0136  glycosyl transferase, group 1  42.57 
 
 
417 aa  89.4  8e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2511  glycosyl transferase group 1  38.92 
 
 
376 aa  89  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.093555  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3522  glycosyl transferase group 1  36.07 
 
 
385 aa  88.6  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.828408  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0012  glycosyl transferase group 1  33.22 
 
 
458 aa  87.4  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3658  glycosyl transferase group 1  33.74 
 
 
452 aa  87  4e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0710404  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4579  glycosyl transferase, group 1  35.22 
 
 
398 aa  87  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0122865  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2150  glycosyl transferase, group 1  34.3 
 
 
397 aa  85.9  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0010  glycosyl transferase, group 1  32.06 
 
 
467 aa  84.7  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.785418  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  40.61 
 
 
367 aa  84.7  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1812  glycosyl transferase, group 1  35.08 
 
 
406 aa  85.1  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0713  glycosyl transferase, group 1  39.13 
 
 
405 aa  82.8  0.000000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0559363  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5045  glycosyl transferase group 1  29.18 
 
 
422 aa  82.4  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.022612 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2514  glycosyl transferase group 1  35.62 
 
 
351 aa  82  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0260745  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2518  glycosyl transferase group 1  32.91 
 
 
411 aa  82  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.377974  normal  0.0256247 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2654  glycosyl transferase, group 1  38.59 
 
 
388 aa  82.4  0.00000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0179694  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1001  glycosyl transferase group 1  29.67 
 
 
411 aa  81.6  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5500  glycosyl transferase group 1  36.41 
 
 
455 aa  81.3  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0983279 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2799  glycosyl transferase, group 1  30.35 
 
 
421 aa  81.6  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0126  glycosyl transferase group 1  34.8 
 
 
371 aa  81.3  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7902  glycosyltransferase  41.89 
 
 
406 aa  80.9  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  38.1 
 
 
370 aa  80.9  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1573  glycosyl transferase group 1  31.89 
 
 
420 aa  81.3  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.539919  normal  0.0199703 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1149  glycosyl transferase group 1  40.37 
 
 
389 aa  80.1  0.00000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00373212  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8230  glycosyl transferase group 1  27.4 
 
 
414 aa  79.3  0.00000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  29.96 
 
 
423 aa  79  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2028  glycosyltransferase  30.7 
 
 
353 aa  79  0.0000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.949426  normal  0.904409 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2637  glycosyl transferase, group 1  31.06 
 
 
421 aa  79  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.731543  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5510  glycosyl transferase group 1  34.3 
 
 
399 aa  78.2  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.264139  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2953  glycosyl transferase group 1  27.65 
 
 
372 aa  78.6  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.303965  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1839  glycosyl transferase group 1  42.47 
 
 
362 aa  78.2  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06140  glycosyltransferase  35.1 
 
 
379 aa  78.6  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.191303  normal  0.988146 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0357  glycosyl transferase, group 1  27.01 
 
 
375 aa  78.6  0.0000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  31.98 
 
 
353 aa  77.4  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  31.87 
 
 
414 aa  77.8  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2588  glycosyl transferase, group 1  32.85 
 
 
426 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3090  glycosyl transferase, group 1  31.53 
 
 
440 aa  77  0.0000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2873  group 1 glycosyl transferase  27.16 
 
 
421 aa  77  0.0000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0880  glycosyl transferase group 1  39.52 
 
 
376 aa  77  0.0000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0960108 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2081  glycosyl transferase group 1  34.93 
 
 
374 aa  76.6  0.0000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1751  glycosyl transferase group 1  32.09 
 
 
453 aa  76.6  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1051  glycosyl transferase, group 1  34.45 
 
 
445 aa  76.6  0.0000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.876229 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0825  glycosyl transferase group 1  28.36 
 
 
382 aa  76.6  0.0000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0171  glycosyl transferase, group 1  38.15 
 
 
419 aa  76.3  0.0000000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.7931  normal  0.13729 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1748  glycosyl transferase group 1  31.47 
 
 
402 aa  76.3  0.0000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0115341 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1184  glycosyl transferase, group 1  38.79 
 
 
412 aa  75.9  0.0000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0758  glycosyl transferase group 1  36.31 
 
 
371 aa  75.9  0.0000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.11154 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1201  WbwZ  24.19 
 
 
369 aa  75.5  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2594  glycosyl transferase group 1  25.72 
 
 
421 aa  75.1  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0506  glycosyl transferase, group 1  30.73 
 
 
425 aa  75.9  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3565  glycosyl transferase group 1  37.2 
 
 
390 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2962  glycosyl transferase, group 1  37.44 
 
 
409 aa  75.5  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.355294  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0330  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
388 aa  75.1  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0196896  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  31.76 
 
 
419 aa  75.1  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0744  glycosyl transferase, group 1  32.49 
 
 
384 aa  75.1  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.348162  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4017  glycosyl transferase group 1  32.03 
 
 
384 aa  74.7  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.174092  normal  0.606388 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4958  glycosyl transferase group 1  28.46 
 
 
419 aa  73.9  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.830088 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3583  glycosyl transferase, group 1  32.18 
 
 
408 aa  74.3  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1076  glycosyl transferase, group 1  26.2 
 
 
337 aa  73.6  0.000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1389  glycosyl transferase group 1  33.72 
 
 
961 aa  73.6  0.000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0129  mannosyltransferase  31.07 
 
 
374 aa  73.2  0.000000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00122575 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  23.21 
 
 
390 aa  73.2  0.000000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2920  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
435 aa  73.2  0.000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0485  putative glycosyl transferase  26.3 
 
 
471 aa  72.8  0.000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  21.4 
 
 
410 aa  72.8  0.000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4495  glycosyl transferase group 1  29.72 
 
 
394 aa  72.8  0.000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2137  glycosyl transferase group 1  29.59 
 
 
440 aa  72.8  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.875323  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2186  glycosyl transferase group 1  27.35 
 
 
378 aa  72.8  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5102  glycosyl transferase, group 1  28.88 
 
 
408 aa  72.8  0.000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5190  glycosyl transferase, group 1  28.88 
 
 
408 aa  72.8  0.000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.370071  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5481  glycosyl transferase, group 1  28.88 
 
 
408 aa  72.8  0.000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.931135  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4073  glycosyl transferase group 1  32.76 
 
 
377 aa  72.8  0.000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.728215 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  32.48 
 
 
409 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4271  glycosyl transferase group 1  32.58 
 
 
400 aa  72  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.614702 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1762  glycosyl transferase, group 1  31.47 
 
 
406 aa  72.4  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.379632 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>