More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_1389 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010501  PputW619_1389  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
961 aa  1941    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4011  glycosyl transferase group 1  35 
 
 
338 aa  127  1e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.186026  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4007  glycosyl transferase group 1  34.08 
 
 
388 aa  121  7.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0399427  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4006  glycosyl transferase group 1  30.45 
 
 
393 aa  116  2.0000000000000002e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.240057  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1733  glycosyl transferase, group 1  22.19 
 
 
384 aa  102  3e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1729  glycosyl transferase, group 1  23.25 
 
 
838 aa  99.8  2e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2369  glycosyl transferase group 1  28.72 
 
 
503 aa  98.2  7e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00182405 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2772  glycosyl transferase, group 1  24.51 
 
 
967 aa  90.5  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.602029  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2765  glycosyl transferase, group 1  27.25 
 
 
432 aa  88.2  6e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2314  glycosyl transferase group 1  34.45 
 
 
347 aa  87.8  9e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.055827  normal  0.292913 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2168  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.61 
 
 
815 aa  81.6  0.00000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1676  glycosyl transferase, group 1  31.92 
 
 
639 aa  81.6  0.00000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5686  glycosyl transferase, group 1  26.62 
 
 
455 aa  80.1  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.101413  normal  0.632336 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1334  glycosyltransferase, putative  27.35 
 
 
431 aa  79.3  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.218572  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0758  glycosyl transferase, group 1  24.64 
 
 
1241 aa  78.6  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3359  glycosyl transferase group 1  24.44 
 
 
434 aa  78.2  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2764  glycosyl transferase, group 1  27.41 
 
 
390 aa  76.6  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0448  glycosyl transferase, group 1  39.47 
 
 
364 aa  76.6  0.000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.717217 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0744  glycosyl transferase group 1  29.15 
 
 
1666 aa  75.9  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0139  glycosyl transferase group 1  38.89 
 
 
384 aa  76.3  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00161479 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2862  glycosyl transferase group 1  26.5 
 
 
343 aa  75.1  0.000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0920  glycosyl transferase, group 1  23.08 
 
 
831 aa  73.9  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1096  glycosyl transferase group 1  27.76 
 
 
392 aa  74.3  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.767278  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2752  glycosyl transferase group 1  26.74 
 
 
435 aa  73.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.904634  hitchhiker  0.000312196 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0769  glycosyl transferase group 1  24.15 
 
 
1241 aa  73.2  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.507904  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0854  glycosyl transferase, group 1  29.39 
 
 
494 aa  72.8  0.00000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.134874  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0017  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
377 aa  72.4  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3278  glycosyl transferase group 1  22.73 
 
 
850 aa  72.4  0.00000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5868  glycosyl transferase group 1  23.6 
 
 
420 aa  72  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3522  glycosyl transferase group 1  32.42 
 
 
385 aa  71.2  0.00000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.828408  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1534  glycosyl transferase group 1  29.22 
 
 
388 aa  70.9  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6239  glycosyltransferase WbpX  26.47 
 
 
460 aa  70.1  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4662  glycosyl transferase group 1  38.19 
 
 
350 aa  70.1  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0886148  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0219  glycosyl transferase, group 1  30.04 
 
 
415 aa  70.5  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1176  glycosyl transferase, group 1  32.99 
 
 
349 aa  70.1  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71930  glycosyltransferase WbpX  26.1 
 
 
460 aa  69.7  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2150  glycosyl transferase, group 1  32.84 
 
 
397 aa  68.2  0.0000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0739  glycosyl transferase group 1  28.35 
 
 
383 aa  66.6  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.738245  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8172  glycosyl transferase group 1  31.67 
 
 
356 aa  66.6  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3664  glycosyl transferase, group 1  35.94 
 
 
346 aa  66.6  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.032207  normal  0.177473 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  33.12 
 
 
382 aa  66.6  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1492  glycosyl transferase, group 1  25.74 
 
 
395 aa  66.6  0.000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0456  glycosyl transferase group 1  28.05 
 
 
366 aa  66.2  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4362  glycosyl transferase, group 1  37.1 
 
 
349 aa  65.5  0.000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0643  glycosyl transferase group 1  26.99 
 
 
413 aa  65.1  0.000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.984184 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0239  glycosyl transferase group 1  29.08 
 
 
381 aa  64.7  0.000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.836427 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4283  glycosyl transferase, group 1  23.57 
 
 
1229 aa  64.7  0.000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1273  glycosyl transferase, group 1  25.1 
 
 
380 aa  63.9  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00681714 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2081  glycosyl transferase group 1  26.14 
 
 
817 aa  63.9  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.994259 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1261  glycosyl transferase, group 1  26.17 
 
 
402 aa  63.2  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0763  glycosyl transferase, group 1  30 
 
 
337 aa  63.9  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2129  glycosyl transferase, group 1  21.35 
 
 
366 aa  63.5  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.819184  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1649  glycosyl transferase, group 1  27.43 
 
 
449 aa  63.5  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0395854  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4924  glycosyl transferase, group 1  27.91 
 
 
386 aa  63.2  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3858  glycosyl transferase, group 1  25.46 
 
 
321 aa  62.4  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.308755 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4470  glycosyl transferase group 1  27.18 
 
 
441 aa  62.4  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0081  mannosyltransferase  26.14 
 
 
346 aa  62.4  0.00000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.54497  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0745  glycosyl transferase, group 1  24.15 
 
 
426 aa  62  0.00000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0750  glycosyl transferase, group 1  26.67 
 
 
773 aa  62  0.00000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3369  glycosyl transferase, group 1  34.68 
 
 
417 aa  62  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00689338 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0209  glycosyl transferase, group 1  30.77 
 
 
386 aa  62  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.959787  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2941  glycosyl transferase, group 1  25.06 
 
 
1243 aa  62  0.00000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0084  glycosyl transferase group 1  26.14 
 
 
346 aa  62.4  0.00000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.248022  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0309  glycosyl transferase, group 1  28 
 
 
347 aa  62  0.00000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4162  glycosyl transferase group 1  37.12 
 
 
347 aa  61.6  0.00000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0349192  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0242  glycosyl transferase, group 1  29.44 
 
 
386 aa  61.6  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.19746 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2953  glycosyl transferase group 1  33.57 
 
 
372 aa  61.2  0.00000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.303965  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1800  glycosyl transferase, group 1  30.86 
 
 
394 aa  61.2  0.00000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.432856 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1162  glycosyl transferase group 1  27.43 
 
 
384 aa  61.2  0.00000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.020878  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1702  mannosyltransferase  25.22 
 
 
846 aa  61.2  0.00000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.529704  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0936  glycosyl transferase, group 1  21.4 
 
 
382 aa  61.2  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.22828 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3512  glycosyl transferase group 1  28.12 
 
 
369 aa  61.2  0.00000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.218401  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1631  glycosyl transferase group 1  25.22 
 
 
846 aa  61.2  0.00000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.343672  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1780  mannosyltransferase, putative  23.14 
 
 
1635 aa  60.5  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.731336  decreased coverage  0.0078788 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3018  hypothetical protein  22.37 
 
 
384 aa  60.8  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4785  glycosyl transferase group 1  36.84 
 
 
350 aa  60.8  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.195851  normal  0.262442 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1410  glycosyl transferase group 1  28.16 
 
 
381 aa  60.5  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.27124 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7046  putative glycosyltransferase  27.88 
 
 
473 aa  61.2  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.378884  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0229  glycosyl transferase, group 1  30.77 
 
 
386 aa  60.5  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0736189  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0232  glycosyl transferase group 1  25.17 
 
 
489 aa  60.1  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.709095 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3492  glycosyl transferase, group 1  29.46 
 
 
390 aa  59.7  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.695394  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0744  glycosyl transferase group 1  35.56 
 
 
363 aa  60.1  0.0000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.299994  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3839  glycosyl transferase, group 1  26.43 
 
 
444 aa  60.1  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.24097  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0769  glycosyl transferase group 1  28.71 
 
 
347 aa  60.1  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0662  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.75 
 
 
414 aa  60.1  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0648  glycosyl transferase, group 1 family protein  30 
 
 
414 aa  60.1  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.586366  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0219  glycosyl transferase, group 1  30.77 
 
 
360 aa  60.5  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1073  glycosyl transferase, group 1  22.8 
 
 
1261 aa  60.5  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.328377  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2191  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.75 
 
 
414 aa  60.1  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2516  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.75 
 
 
401 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.508098  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2894  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.75 
 
 
414 aa  60.1  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0048  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.75 
 
 
361 aa  59.7  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0824  glycosyl transferase group 1 protein  29.75 
 
 
361 aa  59.7  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0426  glycosyl transferase, group 1  29.52 
 
 
386 aa  59.7  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.129812  normal  0.34158 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2494  glycosyl transferase group 1  29.25 
 
 
452 aa  59.7  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.044708  normal  0.0808495 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5498  glycosyl transferase group 1  29.89 
 
 
381 aa  59.7  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21071  hypothetical protein  22.91 
 
 
1232 aa  59.3  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06140  glycosyltransferase  28.72 
 
 
379 aa  59.3  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.191303  normal  0.988146 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0485  putative glycosyl transferase  26.5 
 
 
471 aa  58.9  0.0000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0317  glycosyl transferase group 1  34.68 
 
 
343 aa  59.3  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>