More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4011 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_4011  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
338 aa  677    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.186026  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4006  glycosyl transferase group 1  37.45 
 
 
393 aa  168  1e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.240057  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4007  glycosyl transferase group 1  36.96 
 
 
388 aa  164  3e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0399427  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1389  glycosyl transferase group 1  35 
 
 
961 aa  142  7e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2369  glycosyl transferase group 1  36.18 
 
 
503 aa  122  7e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00182405 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0643  glycosyl transferase group 1  34.45 
 
 
413 aa  103  5e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.984184 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5686  glycosyl transferase, group 1  32.46 
 
 
455 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.101413  normal  0.632336 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1729  glycosyl transferase, group 1  25.81 
 
 
838 aa  90.1  4e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2590  glycosyl transferase group 1  32.37 
 
 
389 aa  89  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.998711  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1334  glycosyltransferase, putative  30.68 
 
 
431 aa  89  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.218572  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2976  glycosyl transferase, group 1  32.37 
 
 
389 aa  89  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0192  glycosyl transferase group 1  30.93 
 
 
388 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6239  glycosyltransferase WbpX  31.25 
 
 
460 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2772  glycosyl transferase, group 1  31.47 
 
 
967 aa  85.9  8e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.602029  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71930  glycosyltransferase WbpX  30.36 
 
 
460 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1073  glycosyl transferase, group 1  26.17 
 
 
1261 aa  84.7  0.000000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.328377  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2941  glycosyl transferase, group 1  30.41 
 
 
1243 aa  84  0.000000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1409  glycosyl transferase group 1  36.54 
 
 
355 aa  83.2  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.201538 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4016  glycosyl transferase, group 1  33.88 
 
 
423 aa  82.4  0.000000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4924  glycosyl transferase, group 1  30.58 
 
 
386 aa  82  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3578  glycosyl transferase  31.67 
 
 
412 aa  82.4  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.643047  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0492  mannosyltransferase A  24.44 
 
 
743 aa  80.1  0.00000000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.700737  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0745  glycosyl transferase, group 1  30.43 
 
 
426 aa  79.3  0.00000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4511  glycosyl transferase group 1  28.67 
 
 
456 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0769  glycosyl transferase group 1  30.95 
 
 
1241 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.507904  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1615  capsular polysaccharide biosynthesis glycosyltransferase WcbB, putative  27.48 
 
 
447 aa  78.2  0.0000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.921217  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2168  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.09 
 
 
815 aa  76.6  0.0000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4974  glycosyl transferase group 1  28.43 
 
 
456 aa  76.3  0.0000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.34629 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1976  glycosyl transferase group 1  32.16 
 
 
541 aa  75.9  0.0000000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0537449  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5364  glycosyl transferase group 1  30.89 
 
 
432 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1780  mannosyltransferase, putative  27.27 
 
 
1635 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.731336  decreased coverage  0.0078788 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0920  glycosyl transferase, group 1  29.03 
 
 
831 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2295  glycosyl transferase, group 1  29.69 
 
 
412 aa  73.9  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.380309  normal  0.302559 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3278  glycosyl transferase group 1  23.43 
 
 
850 aa  73.6  0.000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0758  glycosyl transferase, group 1  30.95 
 
 
1241 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0739  glycosyl transferase group 1  28.74 
 
 
383 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.738245  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3566  glycosyl transferase group 1  32.34 
 
 
407 aa  72.8  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5498  glycosyl transferase group 1  34.74 
 
 
381 aa  72.8  0.000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3275  glycosyl transferase group 1  29.31 
 
 
380 aa  71.2  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1702  mannosyltransferase  25.71 
 
 
846 aa  71.6  0.00000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.529704  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2967  glycosyl transferase, group 1  27.59 
 
 
1915 aa  71.6  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2582  glycosyl transferase group 1  29.55 
 
 
369 aa  71.2  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.411312 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2582  glycosyl transferase group 1  27.59 
 
 
1332 aa  71.6  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.35538  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1631  glycosyl transferase group 1  25.71 
 
 
846 aa  71.6  0.00000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.343672  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1801  glycosyl transferase WbpY  32.24 
 
 
380 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0707089 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3858  glycosyl transferase, group 1  29.5 
 
 
321 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.308755 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1326  glycosyltransferase, putative  30.13 
 
 
383 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5026  glycosyl transferase group 1  31.34 
 
 
459 aa  71.2  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.728089 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5069  glycosyl transferase group 1  32.68 
 
 
434 aa  70.5  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.750506  normal  0.0356262 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1162  glycosyl transferase group 1  29.79 
 
 
384 aa  70.1  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.020878  normal 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4283  glycosyl transferase, group 1  26.91 
 
 
1229 aa  69.7  0.00000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06140  glycosyltransferase  31.73 
 
 
379 aa  70.1  0.00000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.191303  normal  0.988146 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4183  glycosyl transferase group 1  35.84 
 
 
362 aa  69.3  0.00000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1534  glycosyl transferase group 1  27.11 
 
 
388 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2308  glycosyltransferase, putative  30.18 
 
 
383 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.865333  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0744  glycosyl transferase group 1  35.85 
 
 
363 aa  68.6  0.0000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.299994  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1470  Glycosyltransferase-like protein  33.16 
 
 
440 aa  68.6  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.755998 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8689  glycosyl transferase group 1  28.26 
 
 
435 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1681  glycosyl transferase group 1  30.71 
 
 
366 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.082633  normal  0.656807 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6411  glycosyl transferase group 1  28.26 
 
 
435 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0520  putative glycosyltransferase  30.18 
 
 
383 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.326748  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1079  putative glycosyltransferase  30.18 
 
 
383 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.256775  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0232  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
489 aa  68.2  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.709095 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2186  putative glycosyltransferase  30.18 
 
 
383 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3302  WcbB  30.18 
 
 
383 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.176129  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1171  glycosyl transferase group 1  33.83 
 
 
366 aa  67.8  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.059053 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2254  glycosyl transferase, group 1  29.05 
 
 
358 aa  67.8  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0765492  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3255  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.18 
 
 
372 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3291  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.18 
 
 
372 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7580  WbdA; mannosyl transferase A  30.73 
 
 
377 aa  67  0.0000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.207702  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1159  glycosyl transferase group 1  26.33 
 
 
1398 aa  67.4  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0412511  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0770  glycosyl transferase, group 1  29.19 
 
 
399 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3020  hypothetical protein  24.81 
 
 
417 aa  67  0.0000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0354  glycosyl transferase group 1  38.58 
 
 
343 aa  66.6  0.0000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2724  glycosyl transferase group 1  28.29 
 
 
430 aa  67  0.0000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1410  glycosyl transferase group 1  33.06 
 
 
381 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.27124 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2862  glycosyl transferase group 1  30.29 
 
 
343 aa  66.6  0.0000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3492  glycosyl transferase, group 1  32.7 
 
 
390 aa  66.6  0.0000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.695394  normal 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3832  glycosyl transferase, group 1  25.27 
 
 
426 aa  66.6  0.0000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.175097  normal  0.13882 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0804  group 1 glycosyl transferase  29.34 
 
 
425 aa  65.1  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.817981  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1962  mannosyltransferase  28.79 
 
 
859 aa  65.5  0.000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000841107  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1991  glycosyl transferase group 1  29.65 
 
 
358 aa  65.5  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000239658 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6341  glycosyl transferase group 1  30.04 
 
 
354 aa  65.1  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.263433  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  29.49 
 
 
382 aa  64.7  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1310  glycosyl transferase, group 1  30.63 
 
 
354 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.731702  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1327  glycosyl transferase, group 1  30.63 
 
 
354 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.294333 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2011  glycosyl transferase group 1  28.04 
 
 
373 aa  64.3  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5391  glycosyl transferase group 1  34.84 
 
 
375 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.919124 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1896  glycosyl transferase group 1  27.63 
 
 
860 aa  63.9  0.000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00121907  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1156  glycosyl transferase group 1  30.52 
 
 
371 aa  64.3  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.242648  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2434  glycosyl transferase group 1  29.84 
 
 
426 aa  63.9  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.121663  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1346  glycosyl transferase, group 1  30.11 
 
 
354 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.718458 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0017  glycosyl transferase group 1  27.93 
 
 
377 aa  63.9  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2892  glycosyl transferase group 1  26.36 
 
 
354 aa  63.5  0.000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3359  glycosyl transferase group 1  25.65 
 
 
434 aa  63.5  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0773  glycosyl transferase group 1  31.82 
 
 
457 aa  63.2  0.000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4273  glycosyl transferase group 1  31.44 
 
 
407 aa  62.8  0.000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2316  glycosyl transferase group 1  27.17 
 
 
387 aa  62.8  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0750  glycosyl transferase, group 1  28.25 
 
 
773 aa  62.8  0.000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2367  glycosyl transferase group 1  27.17 
 
 
387 aa  62.8  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>