More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4006 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_4006  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
393 aa  778    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.240057  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4007  glycosyl transferase group 1  57.25 
 
 
388 aa  390  1e-107  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0399427  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4011  glycosyl transferase group 1  37.45 
 
 
338 aa  143  6e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.186026  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2369  glycosyl transferase group 1  31.9 
 
 
503 aa  133  6.999999999999999e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00182405 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1389  glycosyl transferase group 1  29.18 
 
 
961 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2295  glycosyl transferase, group 1  34.83 
 
 
412 aa  85.9  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.380309  normal  0.302559 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2941  glycosyl transferase, group 1  25.8 
 
 
1243 aa  82.4  0.00000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0750  glycosyl transferase, group 1  32.14 
 
 
773 aa  82.8  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0232  glycosyl transferase group 1  29.15 
 
 
489 aa  81.6  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.709095 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2168  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.78 
 
 
815 aa  78.2  0.0000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0456  glycosyl transferase group 1  36.09 
 
 
366 aa  73.6  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2772  glycosyl transferase, group 1  25.94 
 
 
967 aa  71.6  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.602029  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6239  glycosyltransferase WbpX  28.93 
 
 
460 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4470  glycosyl transferase group 1  29.96 
 
 
441 aa  71.2  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71930  glycosyltransferase WbpX  28.51 
 
 
460 aa  70.5  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0854  glycosyl transferase, group 1  30.62 
 
 
494 aa  70.1  0.00000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.134874  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5687  glycosyl transferase, group 1  31.1 
 
 
376 aa  70.1  0.00000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.519018  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2724  glycosyl transferase group 1  30.82 
 
 
430 aa  68.9  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0761  glycosyl transferase group 1  33.16 
 
 
748 aa  69.3  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2582  glycosyl transferase group 1  29.57 
 
 
369 aa  69.3  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.411312 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3832  glycosyl transferase, group 1  31.34 
 
 
426 aa  68.2  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.175097  normal  0.13882 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0744  glycosyl transferase group 1  26.62 
 
 
1666 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1096  glycosyl transferase group 1  29.26 
 
 
392 aa  67.8  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.767278  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4016  glycosyl transferase, group 1  32.93 
 
 
423 aa  67.8  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0239  glycosyl transferase group 1  30.21 
 
 
381 aa  67.4  0.0000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.836427 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2129  glycosyl transferase, group 1  26.28 
 
 
366 aa  66.2  0.0000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.819184  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1800  glycosyl transferase, group 1  32.11 
 
 
394 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.432856 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1334  glycosyltransferase, putative  34.96 
 
 
431 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.218572  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3057  glycosyl transferase, group 1  33.1 
 
 
409 aa  65.5  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2593  glycosyl transferase group 1  27.45 
 
 
354 aa  65.1  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1073  glycosyl transferase, group 1  23.02 
 
 
1261 aa  65.5  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.328377  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6732  glycosyl transferase group 1  29.73 
 
 
394 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0394  glycosyl transferase group 1  26.34 
 
 
374 aa  63.9  0.000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.538009  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3290  glycosyl transferase group 1  26.91 
 
 
344 aa  63.9  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2367  glycosyl transferase group 1  27.1 
 
 
387 aa  63.5  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3839  glycosyl transferase, group 1  29.12 
 
 
444 aa  63.5  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.24097  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2314  glycosyl transferase group 1  30.72 
 
 
347 aa  63.5  0.000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.055827  normal  0.292913 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0235  glycosyl transferase group 1  34.18 
 
 
373 aa  63.5  0.000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.118803 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2316  glycosyl transferase group 1  27.1 
 
 
387 aa  63.5  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1330  glycosyltransferase WbpX, putative  29.06 
 
 
520 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1896  glycosyl transferase group 1  30.72 
 
 
860 aa  63.2  0.000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00121907  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0856  glycosyl transferase group 1  24.48 
 
 
348 aa  63.2  0.000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0476116 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1962  mannosyltransferase  30.57 
 
 
859 aa  63.2  0.000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000841107  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0857  glycosyl transferase group 1  27.1 
 
 
378 aa  63.2  0.000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0168119 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0393  putative glycosyl transferase, group 1  25.08 
 
 
388 aa  62.4  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.336091  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1326  glycosyltransferase, putative  28.52 
 
 
383 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0598  glycosyl transferase group 1  22.67 
 
 
385 aa  62.4  0.00000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1649  glycosyl transferase, group 1  28.97 
 
 
449 aa  62.4  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0395854  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2953  glycosyl transferase group 1  27.01 
 
 
372 aa  62.4  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.303965  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1729  glycosyl transferase, group 1  29.63 
 
 
838 aa  62  0.00000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1733  glycosyl transferase, group 1  21.18 
 
 
384 aa  61.6  0.00000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5959  glycosyl transferase group 1  24.07 
 
 
376 aa  62  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.519919  normal  0.10834 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0017  glycosyl transferase group 1  27.54 
 
 
377 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1492  glycosyl transferase, group 1  27.31 
 
 
395 aa  61.6  0.00000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2100  glycosyl transferase, group 1  32.78 
 
 
400 aa  61.6  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.200616 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1035  glycosyl transferase, group 1  27.4 
 
 
366 aa  61.6  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.788925  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2807  glycosyl transferase group 1  28.65 
 
 
412 aa  61.6  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4283  glycosyl transferase, group 1  25.61 
 
 
1229 aa  60.8  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5686  glycosyl transferase, group 1  29.41 
 
 
455 aa  60.5  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.101413  normal  0.632336 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2150  glycosyl transferase, group 1  32.79 
 
 
397 aa  60.5  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0763  glycosyl transferase, group 1  32.2 
 
 
337 aa  60.1  0.00000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5868  glycosyl transferase group 1  23.83 
 
 
420 aa  60.1  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2646  glycosyl transferase, group 1  25.37 
 
 
351 aa  60.1  0.00000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.637547  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2081  glycosyl transferase group 1  29.54 
 
 
817 aa  59.7  0.00000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.994259 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2976  glycosyl transferase, group 1  28.7 
 
 
389 aa  59.7  0.00000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2590  glycosyl transferase group 1  28.7 
 
 
389 aa  59.7  0.00000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.998711  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0219  glycosyl transferase, group 1  28.08 
 
 
415 aa  59.7  0.00000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2505  glycosyl transferase, group 1  33.81 
 
 
409 aa  59.3  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3522  glycosyl transferase group 1  33.74 
 
 
385 aa  59.3  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.828408  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2328  glycosyl transferase group 1  31.48 
 
 
871 aa  59.3  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04591  putative glycosyl transferase, group 1  25.08 
 
 
388 aa  59.3  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.453112  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3078  glycosyl transferase group 1  36.18 
 
 
408 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1615  capsular polysaccharide biosynthesis glycosyltransferase WcbB, putative  26.85 
 
 
447 aa  58.5  0.0000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.921217  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1534  glycosyl transferase group 1  25.97 
 
 
388 aa  58.5  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6341  glycosyl transferase group 1  32.37 
 
 
354 aa  58.2  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.263433  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0179  glycosyl transferase group 1  31.65 
 
 
378 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.203748  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1184  glycosyl transferase, group 1  30.19 
 
 
412 aa  58.5  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1385  glycosyl transferase group 1  30.2 
 
 
398 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.106503  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0491  glycosyl transferase, group 1  28.21 
 
 
381 aa  58.9  0.0000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1681  glycosyl transferase, group 1  32.5 
 
 
303 aa  58.5  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.456944  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3776  glycosyl transferase, group 1  29.8 
 
 
371 aa  58.2  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2892  glycosyl transferase group 1  24.51 
 
 
354 aa  57.8  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6507  glycosyl transferase group 1  28.93 
 
 
356 aa  57.8  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06140  glycosyltransferase  34.46 
 
 
379 aa  57.8  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.191303  normal  0.988146 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2492  glycosyl transferase, group 1  34.2 
 
 
371 aa  58.2  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.637644  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2167  mannosyltransferase B  27.08 
 
 
381 aa  57.8  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2862  glycosyl transferase group 1  25.6 
 
 
343 aa  58.2  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1409  glycosyl transferase group 1  32.86 
 
 
355 aa  57.4  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.201538 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3369  glycosyl transferase, group 1  36.05 
 
 
417 aa  57.4  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00689338 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0745  glycosyl transferase, group 1  28.31 
 
 
426 aa  57.4  0.0000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0758  glycosyl transferase, group 1  26.25 
 
 
1241 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0139  glycosyl transferase group 1  32.89 
 
 
384 aa  57.4  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00161479 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0769  glycosyl transferase group 1  24.4 
 
 
1241 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.507904  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0509  glycosyl transferase group 1  29.38 
 
 
349 aa  57  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0631  glycosyl transferase group 1  31.76 
 
 
394 aa  57.4  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3591  glycosyl transferase group 1  31.9 
 
 
416 aa  57.4  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0625  glycosyl transferase group 1  25.3 
 
 
372 aa  57.4  0.0000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1620  glycosyl transferase group 1  27.72 
 
 
380 aa  57.4  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3018  hypothetical protein  26.38 
 
 
384 aa  57  0.0000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1676  glycosyl transferase, group 1  28.95 
 
 
639 aa  57  0.0000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>