More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1620 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1620  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 380 aa  775    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1261  glycosyl transferase, group 1  51.98 
 
 		 402 aa  356  3.9999999999999996e-97  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1689  glycosyl transferase, group 1  39.53 
 
 		 381 aa  263  3e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1683  glycosyl transferase, group 1  34.19 
 
 		 385 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0725  glycosyl transferase, group 1  29.77 
 
 		 382 aa  155  8e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1969  glycosyl transferase group 1  23.08 
 
 		 372 aa  113  5e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4314  glycosyl transferase group 1  29.41 
 
 		 370 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.712653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  28.11 
 
 		 370 aa  106  7e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3776  glycosyl transferase, group 1  27.98 
 
 		 371 aa  105  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1539  glycosyl transferase, group 1  27.39 
 
 		 360 aa  99.8  8e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.29057 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0388  glycosyltransferase  26.78 
 
 		 373 aa  93.2  6e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.230246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0016  glycosyl transferase group 1  26.91 
 
 		 361 aa  92.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1544  mannosyltransferase, putative  25.16 
 
 		 370 aa  89.4  1e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3360  glycosyl transferase, group 1  26 
 
 		 355 aa  89  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.730903 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3800  glycosyl transferase, group 1  39.1 
 
 		 386 aa  86.3  9e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0347  glycosyl transferase, group 1  27.3 
 
 		 340 aa  85.9  0.000000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.302336 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3369  glycosyl transferase, group 1  27.55 
 
 		 417 aa  85.5  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00689338 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3229  glycosyl transferase, group 1  27.36 
 
 		 371 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.453901  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0424  glycosyl transferase, group 1  28.76 
 
 		 380 aa  84.3  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132418  normal  0.166856 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2752  glycosyl transferase group 1  35.59 
 
 		 435 aa  84.3  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.904634  hitchhiker  0.000312196 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3359  glycosyl transferase group 1  36.44 
 
 		 434 aa  84.3  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0464  glycosyl transferase group 1  37.82 
 
 		 394 aa  84  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0798  glycosyl transferase group 1  30.09 
 
 		 396 aa  83.2  0.000000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.607654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2139  glycosyl transferase group 1  34.71 
 
 		 357 aa  82  0.00000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  25.24 
 
 		 382 aa  81.6  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5868  glycosyl transferase group 1  34.11 
 
 		 420 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0017  glycosyl transferase group 1  26.58 
 
 		 377 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1068  glycosyl transferase group 1  28.06 
 
 		 371 aa  81.3  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.378739  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5204  group 1 glycosyl transferase  24.68 
 
 		 364 aa  81.3  0.00000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5496  glycosyl transferase group 1  41.44 
 
 		 381 aa  81.3  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3778  glycosyl transferase, group 1  28.4 
 
 		 382 aa  80.9  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.729941  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2367  glycosyl transferase group 1  37.89 
 
 		 387 aa  80.5  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4604  glycosyl transferase group 1  24.4 
 
 		 371 aa  80.5  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000112819  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2316  glycosyl transferase group 1  37.89 
 
 		 387 aa  80.5  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2807  glycosyl transferase group 1  29.22 
 
 		 412 aa  80.5  0.00000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3592  glycosyl transferase group 1  30.36 
 
 		 412 aa  80.1  0.00000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.157633  hitchhiker  0.00114643 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1558  glycosyl transferase group 1  22.92 
 
 		 374 aa  80.1  0.00000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.899676  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0476  glycosyl transferase group 1  25.16 
 
 		 361 aa  80.1  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5498  glycosyl transferase group 1  26.86 
 
 		 381 aa  79.3  0.00000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0273  glycosyl transferase group 1  27.01 
 
 		 374 aa  79  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3357  glycosyl transferase group 1  33.94 
 
 		 437 aa  79  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0579  sulfolipid sulfoquinovosyldiacylglycerol biosynthesis protein  38.52 
 
 		 377 aa  79.3  0.0000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  0.138904 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2912  glycosyl transferase group 1  30 
 
 		 412 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.341746  normal  0.205284 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1265  glycosyl transferase, group 1  27.62 
 
 		 376 aa  79  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0772  glycosyl transferase group 1  44.9 
 
 		 358 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.494029  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5565  glycosyl transferase group 1  29.58 
 
 		 810 aa  78.2  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.896864 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2685  glycosyl transferase group 1  29.55 
 
 		 412 aa  77.4  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.481855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3799  glycosyl transferase, group 1  25.66 
 
 		 386 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2594  glycosyl transferase group 1  25.93 
 
 		 421 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3522  glycosyl transferase group 1  26.46 
 
 		 385 aa  77.4  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.828408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0761  glycosyl transferase, group 1  27.96 
 
 		 349 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.082681  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2313  glycosyl transferase group 1  26.57 
 
 		 364 aa  77.4  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1702  glycosyl transferase, group 1  34.96 
 
 		 360 aa  77  0.0000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.127413  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2365  glycosyl transferase group 1  26.22 
 
 		 364 aa  77  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.230735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2838  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 373 aa  77  0.0000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.326547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0690  glycosyl transferase, group 1  38.28 
 
 		 394 aa  76.3  0.0000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1171  glycosyl transferase group 1  37.29 
 
 		 366 aa  75.9  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.059053 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3447  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.44 
 
 		 369 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1530  glycosyl transferase group 1  21.94 
 
 		 393 aa  75.5  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3951  glycosyl transferase group 1  39.22 
 
 		 408 aa  75.5  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.703007 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3121  glycosyl transferase, group 1  26.5 
 
 		 383 aa  74.7  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000483528  unclonable  0.0000199281 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0239  glycosyl transferase group 1  26.93 
 
 		 381 aa  74.7  0.000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.836427 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1800  glycosyl transferase, group 1  24.34 
 
 		 394 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.432856 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0456  glycosyl transferase group 1  24.04 
 
 		 366 aa  74.7  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1492  glycosyl transferase, group 1  33.91 
 
 		 395 aa  74.7  0.000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  24.68 
 
 		 360 aa  74.3  0.000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0080  glycosyl transferase group 1  31.45 
 
 		 404 aa  73.9  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0394  glycosyl transferase group 1  30.3 
 
 		 374 aa  74.3  0.000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.538009  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0758  glycosyl transferase group 1  30.99 
 
 		 371 aa  73.9  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.11154 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5863  glycosyl transferase group 1  33.64 
 
 		 444 aa  73.2  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2150  glycosyl transferase, group 1  26.38 
 
 		 397 aa  73.2  0.000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0773  glycosyl transferase group 1  41.35 
 
 		 457 aa  73.2  0.000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0235  glycosyl transferase group 1  26.41 
 
 		 373 aa  72.8  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.118803 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1019  glycosyl transferase group 1  31.88 
 
 		 402 aa  72.4  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4446  glycosyl transferase, group 1  30 
 
 		 426 aa  72.8  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.342615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2737  glycosyl transferase group 1  35.66 
 
 		 416 aa  72  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.829529  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0239  mannosyltransferase  22.59 
 
 		 351 aa  71.6  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.205695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1173  glycogen synthase  25.79 
 
 		 404 aa  72  0.00000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0423768 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2192  glycosyl transferase, group 1  27.89 
 
 		 437 aa  71.6  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.111626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3735  glycosyl transferase group 1  23.97 
 
 		 355 aa  71.6  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0533  putative mannosyltransferase  23.43 
 
 		 372 aa  71.2  0.00000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2129  glycosyl transferase, group 1  27.5 
 
 		 366 aa  71.2  0.00000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.819184  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6016  glycosyl transferase group 1  25.49 
 
 		 380 aa  70.9  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.435427 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0347  glycosyl transferase group 1  21.56 
 
 		 369 aa  70.9  0.00000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0529  mannosyltransferase, putative  23.43 
 
 		 372 aa  70.5  0.00000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.142302  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2957  glycosyl transferase group 1  24.66 
 
 		 395 aa  70.1  0.00000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000652955 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2285  glycosyl transferase group 1  27.48 
 
 		 410 aa  70.1  0.00000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0267673  normal  0.0567423 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2513  glycosyl transferase, group 1  23.26 
 
 		 377 aa  69.7  0.00000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.368438  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1334  glycosyl transferase group 1  33.09 
 
 		 385 aa  69.7  0.00000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2167  mannosyltransferase B  31.25 
 
 		 381 aa  69.7  0.00000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2130  glycosyl transferase, group 1  30.77 
 
 		 370 aa  69.3  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.799297  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1273  glycosyl transferase, group 1  23.21 
 
 		 380 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00681714 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6932  glycosyl transferase group 1  30.51 
 
 		 1233 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0899413 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3057  glycosyl transferase, group 1  32.92 
 
 		 409 aa  68.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1073  glycosyl transferase, group 1  32.35 
 
 		 1261 aa  68.2  0.0000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.328377  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1681  glycosyl transferase, group 1  36.13 
 
 		 303 aa  68.6  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.456944  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4385  glycosyl transferase group 1  23.6 
 
 		 378 aa  68.2  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.610092  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3275  glycosyl transferase group 1  33.04 
 
 		 380 aa  67.8  0.0000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2862  glycosyl transferase group 1  24.92 
 
 		 343 aa  68.2  0.0000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1579  glycosyl transferase group 1  26.23 
 
 		 394 aa  67.8  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000114352  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>