More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0725 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_0725  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
382 aa  783    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1261  glycosyl transferase, group 1  31.09 
 
 
402 aa  159  8e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1620  glycosyl transferase group 1  29.77 
 
 
380 aa  156  5.0000000000000005e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1689  glycosyl transferase, group 1  28.86 
 
 
381 aa  123  6e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1969  glycosyl transferase group 1  27.37 
 
 
372 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5204  group 1 glycosyl transferase  27.07 
 
 
364 aa  110  4.0000000000000004e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1956  glycosyl transferase group 1  24.81 
 
 
382 aa  108  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0388  glycosyltransferase  27.89 
 
 
373 aa  104  3e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.230246  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3776  glycosyl transferase, group 1  27.73 
 
 
371 aa  102  9e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3799  glycosyl transferase, group 1  25.72 
 
 
386 aa  100  5e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1544  mannosyltransferase, putative  25.19 
 
 
370 aa  99.4  8e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3360  glycosyl transferase, group 1  24 
 
 
355 aa  98.2  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.730903 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0016  glycosyl transferase group 1  25.62 
 
 
361 aa  90.9  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1683  glycosyl transferase, group 1  26.28 
 
 
385 aa  90.1  6e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4314  glycosyl transferase group 1  23.1 
 
 
370 aa  88.2  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.712653  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0017  glycosyl transferase group 1  28.38 
 
 
377 aa  88.6  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
382 aa  87  5e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1539  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 
360 aa  86.3  9e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.29057 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0239  glycosyl transferase group 1  25.8 
 
 
381 aa  84.7  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.836427 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  24.14 
 
 
370 aa  85.1  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0853  glycosyl transferase group 1  28.81 
 
 
393 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0347  glycosyl transferase, group 1  23.44 
 
 
340 aa  84.3  0.000000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.302336 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2193  glycosyltransferase  22.8 
 
 
375 aa  84.3  0.000000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00106475  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0533  putative mannosyltransferase  23.06 
 
 
372 aa  84  0.000000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0394  glycosyl transferase group 1  24.87 
 
 
374 aa  84  0.000000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.538009  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2129  glycosyl transferase, group 1  29.78 
 
 
366 aa  83.6  0.000000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.819184  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0456  glycosyl transferase group 1  23.18 
 
 
366 aa  83.6  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0690  glycosyl transferase, group 1  31.35 
 
 
394 aa  83.6  0.000000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1492  glycosyl transferase, group 1  30.6 
 
 
395 aa  83.6  0.000000000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0529  mannosyltransferase, putative  23.06 
 
 
372 aa  83.2  0.000000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.142302  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0239  mannosyltransferase  28.8 
 
 
351 aa  82.4  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.205695  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2483  mannosyltransferase B  22.66 
 
 
375 aa  82  0.00000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0534516  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3800  glycosyl transferase, group 1  30.05 
 
 
386 aa  79.7  0.00000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0769  glycosyl transferase group 1  27.56 
 
 
1241 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.507904  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1896  glycosyl transferase group 1  27.39 
 
 
860 aa  79  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00121907  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0476  glycosyl transferase group 1  22.62 
 
 
361 aa  79  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1962  mannosyltransferase  27.39 
 
 
859 aa  79.3  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000841107  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6507  glycosyl transferase group 1  26.53 
 
 
356 aa  78.6  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1035  glycosyl transferase, group 1  26.97 
 
 
366 aa  78.6  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.788925  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1744  glycosyl transferase, group 1  25.21 
 
 
343 aa  78.2  0.0000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0761  glycosyl transferase, group 1  26.48 
 
 
349 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.082681  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0081  mannosyltransferase  27.95 
 
 
346 aa  77  0.0000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.54497  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0347  glycosyl transferase group 1  27.2 
 
 
369 aa  77  0.0000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0084  glycosyl transferase group 1  27.95 
 
 
346 aa  77  0.0000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.248022  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3369  glycosyl transferase, group 1  30.64 
 
 
417 aa  76.6  0.0000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00689338 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0774  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.52 
 
 
361 aa  76.3  0.000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0289  glycosyl transferase group 1  27.96 
 
 
378 aa  75.9  0.000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1558  glycosyl transferase group 1  26.18 
 
 
374 aa  75.9  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.899676  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0758  glycosyl transferase, group 1  27.4 
 
 
1241 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0358  glycosyl transferase, group 1  28.33 
 
 
382 aa  73.9  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.348726  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4604  glycosyl transferase group 1  22.31 
 
 
371 aa  73.9  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000112819  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0276  glycosyl transferase group 1  25.31 
 
 
342 aa  73.6  0.000000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.949437  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2365  glycosyl transferase group 1  22.98 
 
 
364 aa  72.8  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.230735  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2130  glycosyl transferase, group 1  27.49 
 
 
370 aa  72.4  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.799297  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4137  glycosyl transferase group 1  29.31 
 
 
431 aa  72.8  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000953773 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3290  glycosyl transferase group 1  27.85 
 
 
344 aa  72.4  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2316  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
387 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2367  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
387 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0228  glycosyl transferase, group 1  24.1 
 
 
1089 aa  71.6  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2313  glycosyl transferase group 1  23.95 
 
 
364 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3359  glycosyl transferase group 1  28.33 
 
 
434 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3278  glycosyl transferase group 1  24.4 
 
 
850 aa  72  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5687  glycosyl transferase, group 1  22.82 
 
 
376 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.519018  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1702  glycosyl transferase, group 1  25.44 
 
 
360 aa  71.2  0.00000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.127413  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2579  glycosyl transferase group 1  24.21 
 
 
609 aa  71.2  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2028  glycosyltransferase  23.7 
 
 
353 aa  70.5  0.00000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.949426  normal  0.904409 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2957  glycosyl transferase group 1  22.29 
 
 
395 aa  70.5  0.00000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000652955 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1171  glycosyl transferase group 1  23.84 
 
 
366 aa  70.1  0.00000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.059053 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2752  glycosyl transferase group 1  29.94 
 
 
435 aa  69.7  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.904634  hitchhiker  0.000312196 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2967  glycosyl transferase, group 1  25.5 
 
 
1915 aa  69.7  0.00000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0235  glycosyl transferase group 1  23.08 
 
 
373 aa  69.3  0.00000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.118803 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6340  glycosyl transferase group 1  23.43 
 
 
377 aa  69.7  0.00000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2941  glycosyl transferase, group 1  25.83 
 
 
1243 aa  69.7  0.00000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2011  glycosyl transferase group 1  26.41 
 
 
373 aa  69.3  0.00000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06150  glycosyltransferase  22.74 
 
 
382 aa  68.6  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.369332  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1729  glycosyl transferase, group 1  30.12 
 
 
838 aa  68.6  0.0000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0928  a-glycosyltransferase  22.12 
 
 
374 aa  68.2  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0110486 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4985  glycosyl transferase group 1  28.11 
 
 
394 aa  67.8  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.655947  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3474  glycosyl transferases group 1 protein  28.73 
 
 
422 aa  67.8  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.649202  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0061  glycosyl transferase group 1  32.5 
 
 
391 aa  67.4  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.659761  normal  0.125882 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1530  glycosyl transferase group 1  28.65 
 
 
393 aa  67.4  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5959  glycosyl transferase group 1  23.81 
 
 
376 aa  67.4  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.519919  normal  0.10834 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4385  glycosyl transferase group 1  25.44 
 
 
378 aa  66.6  0.0000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.610092  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4283  glycosyl transferase, group 1  26.29 
 
 
1229 aa  66.6  0.0000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5496  glycosyl transferase group 1  26.53 
 
 
381 aa  66.2  0.0000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1265  glycosyl transferase, group 1  23.03 
 
 
376 aa  65.9  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2265  second mannosyl transferase  26.39 
 
 
336 aa  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000285845 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1496  glycosyl transferase, group 1  26.86 
 
 
364 aa  65.9  0.000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.476221  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0772  glycosyl transferase group 1  25.91 
 
 
358 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.494029  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0978  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.59 
 
 
382 aa  65.1  0.000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000355781  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1409  glycosyl transferase group 1  26.59 
 
 
355 aa  65.5  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.201538 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2764  glycosyl transferase, group 1  24.79 
 
 
390 aa  65.5  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2772  glycosyl transferase, group 1  23.4 
 
 
967 aa  65.1  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.602029  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1631  glycosyl transferase group 1  29.07 
 
 
846 aa  65.1  0.000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.343672  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0978  glycosyl transferase group 1  27.12 
 
 
378 aa  64.7  0.000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.625979  hitchhiker  0.00043945 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6238  glycosyltransferase WbpY  22.05 
 
 
375 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1702  mannosyltransferase  29.07 
 
 
846 aa  64.7  0.000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.529704  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5868  glycosyl transferase group 1  28.26 
 
 
420 aa  64.3  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1800  glycosyl transferase, group 1  25.77 
 
 
394 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.432856 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0326  glycosyl transferase, group 1  26.69 
 
 
375 aa  64.3  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.221475  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>