More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3290 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_3290  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
344 aa  717    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0856  glycosyl transferase group 1  47.94 
 
 
348 aa  335  5e-91  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0476116 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0509  glycosyl transferase group 1  45.29 
 
 
349 aa  313  1.9999999999999998e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0510  glycosyl transferase group 1  42.82 
 
 
347 aa  298  1e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6507  glycosyl transferase group 1  40 
 
 
356 aa  250  3e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2517  glycosyl transferase, group 1  38.73 
 
 
356 aa  187  2e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.706118  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0975  glycosyl transferase group 1  34.38 
 
 
356 aa  180  2.9999999999999997e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2011  glycosyl transferase group 1  31.21 
 
 
373 aa  124  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4137  glycosyl transferase group 1  27.65 
 
 
431 aa  112  7.000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000953773 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4383  glycosyl transferase, group 1  29.09 
 
 
535 aa  112  9e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.315819  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3369  glycosyl transferase, group 1  29.83 
 
 
417 aa  109  8.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00689338 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0690  glycosyl transferase, group 1  29.48 
 
 
394 aa  109  9.000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2139  glycosyl transferase group 1  30.45 
 
 
357 aa  108  1e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0139  glycosyl transferase group 1  29.78 
 
 
384 aa  108  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00161479 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3776  glycosyl transferase, group 1  28.65 
 
 
371 aa  106  7e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1702  glycosyl transferase, group 1  28.62 
 
 
360 aa  105  1e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.127413  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0928  a-glycosyltransferase  26.42 
 
 
374 aa  103  3e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0110486 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  28.08 
 
 
382 aa  103  4e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5863  glycosyl transferase group 1  27.92 
 
 
444 aa  103  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4314  glycosyl transferase group 1  29.14 
 
 
370 aa  103  5e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.712653  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5959  glycosyl transferase group 1  27.42 
 
 
376 aa  103  6e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.519919  normal  0.10834 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2862  glycosyl transferase group 1  28.46 
 
 
343 aa  101  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1171  glycosyl transferase group 1  30.15 
 
 
366 aa  101  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.059053 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0722  glycosyl transferase group 1  28.88 
 
 
524 aa  100  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.799351  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  27.96 
 
 
370 aa  100  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0936  glycosyl transferase, group 1  30.43 
 
 
382 aa  100  5e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.22828 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4604  glycosyl transferase group 1  30.19 
 
 
371 aa  100  5e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000112819  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6732  glycosyl transferase group 1  28.88 
 
 
394 aa  99.4  9e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1530  glycosyl transferase group 1  28.37 
 
 
393 aa  97.8  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5496  glycosyl transferase group 1  28.68 
 
 
381 aa  98.2  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2953  glycosyl transferase group 1  27.17 
 
 
372 aa  97.4  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.303965  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0761  glycosyl transferase, group 1  26.69 
 
 
349 aa  97.8  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.082681  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1492  glycosyl transferase, group 1  26.72 
 
 
395 aa  97.8  3e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4438  glycosyl transferase group 1  27.12 
 
 
381 aa  97.1  4e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1035  glycosyl transferase, group 1  32.96 
 
 
366 aa  97.1  4e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.788925  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0017  glycosyl transferase group 1  27.92 
 
 
377 aa  96.7  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0394  glycosyl transferase group 1  24.74 
 
 
374 aa  95.5  1e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.538009  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0910  glycosyl transferase group 1  29.71 
 
 
417 aa  95.5  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0358  glycosyl transferase, group 1  28.35 
 
 
382 aa  95.1  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.348726  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0347  glycosyl transferase group 1  28.82 
 
 
369 aa  95.9  1e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3800  glycosyl transferase, group 1  30.11 
 
 
386 aa  94.4  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2150  glycosyl transferase, group 1  28.82 
 
 
397 aa  94.7  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1956  glycosyl transferase group 1  28.14 
 
 
382 aa  94.7  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3522  glycosyl transferase group 1  27.24 
 
 
385 aa  94.7  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.828408  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0239  glycosyl transferase group 1  28.15 
 
 
381 aa  94  3e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.836427 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1265  glycosyl transferase, group 1  27.74 
 
 
376 aa  94.4  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3359  glycosyl transferase group 1  26.32 
 
 
434 aa  93.2  6e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0772  glycosyl transferase group 1  27.64 
 
 
358 aa  93.2  6e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.494029  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2752  glycosyl transferase group 1  32.79 
 
 
435 aa  93.2  6e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.904634  hitchhiker  0.000312196 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7046  putative glycosyltransferase  28.69 
 
 
473 aa  92  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.378884  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3799  glycosyl transferase, group 1  29.62 
 
 
386 aa  92.4  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3778  glycosyl transferase, group 1  26.2 
 
 
382 aa  91.7  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.729941  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3712  putative glycosyl transferases group 1 protein  28.36 
 
 
419 aa  91.7  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2483  mannosyltransferase B  26.53 
 
 
375 aa  91.3  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0534516  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0491  glycosyl transferase, group 1  28 
 
 
381 aa  91.3  2e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0048  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.47 
 
 
361 aa  90.9  3e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0824  glycosyl transferase group 1 protein  30.47 
 
 
361 aa  90.9  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0235  glycosyl transferase group 1  27.9 
 
 
373 aa  90.9  3e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.118803 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0537  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.06 
 
 
364 aa  90.9  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2582  glycosyl transferase group 1  27.97 
 
 
369 aa  90.9  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.411312 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0648  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.47 
 
 
414 aa  90.9  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.586366  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2183  glycosyl transferase group 1  28.28 
 
 
370 aa  90.5  4e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4665  glycosyl transferase group 1  26.41 
 
 
367 aa  90.5  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0528  glycosyl transferase group 1  24.59 
 
 
368 aa  90.5  4e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2894  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.47 
 
 
414 aa  90.5  4e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2191  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.47 
 
 
414 aa  90.5  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0662  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.47 
 
 
414 aa  90.5  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2516  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.47 
 
 
401 aa  90.5  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.508098  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0239  mannosyltransferase  27.62 
 
 
351 aa  89.7  6e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.205695  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5868  glycosyl transferase group 1  27.18 
 
 
420 aa  89.7  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0533  putative mannosyltransferase  31.4 
 
 
372 aa  89.4  8e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1310  glycosyl transferase, group 1  26.01 
 
 
354 aa  89  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.731702  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1327  glycosyl transferase, group 1  26.01 
 
 
354 aa  89  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.294333 
 
 
-
 
NC_004310  BR0529  mannosyltransferase, putative  31.69 
 
 
372 aa  88.2  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.142302  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0558  glycosyl transferase group 1  25.54 
 
 
381 aa  88.6  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2193  glycosyltransferase  26.19 
 
 
375 aa  88.2  2e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00106475  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4271  glycosyl transferase group 1  26.73 
 
 
400 aa  88.2  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.614702 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1346  glycosyl transferase, group 1  26.01 
 
 
354 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.718458 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0978  glycosyl transferase group 1  24.83 
 
 
378 aa  87.4  3e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.625979  hitchhiker  0.00043945 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4385  glycosyl transferase group 1  26.62 
 
 
378 aa  87.4  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.610092  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2838  glycosyl transferase group 1  27.08 
 
 
373 aa  87.4  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.326547  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2903  glycosyl transferase group 1  25.98 
 
 
358 aa  87  4e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3357  glycosyl transferase group 1  25.43 
 
 
437 aa  86.7  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6016  glycosyl transferase group 1  26.22 
 
 
380 aa  86.7  6e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.435427 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2316  glycosyl transferase group 1  27.54 
 
 
387 aa  86.7  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2367  glycosyl transferase group 1  27.54 
 
 
387 aa  86.7  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1229  putative glycosyltransferase  37.07 
 
 
1219 aa  86.3  7e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.197488  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0016  glycosyl transferase group 1  26.69 
 
 
361 aa  86.3  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5687  glycosyl transferase, group 1  23.35 
 
 
376 aa  85.9  8e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.519018  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0857  glycosyl transferase group 1  27.41 
 
 
378 aa  85.9  8e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0168119 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0289  glycosyl transferase group 1  26.65 
 
 
378 aa  86.3  8e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3583  glycosyl transferase, group 1  24.5 
 
 
408 aa  85.9  9e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1273  glycosyl transferase, group 1  25.15 
 
 
380 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00681714 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0456  glycosyl transferase group 1  28.06 
 
 
366 aa  85.9  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0129  mannosyltransferase  25.4 
 
 
374 aa  84  0.000000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00122575 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3278  glycosyl transferase group 1  28.85 
 
 
850 aa  84.3  0.000000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5201  group 1 glycosyl transferase  27.59 
 
 
430 aa  84  0.000000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.131899  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4015  glycosyl transferase, group 1  26.64 
 
 
384 aa  84  0.000000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4549  glycosyl transferase group 1  27.47 
 
 
672 aa  83.6  0.000000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.643981  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6238  glycosyltransferase WbpY  23.31 
 
 
375 aa  83.2  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>