More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0354 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_0354  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
343 aa  679    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0017  glycosyl transferase group 1  30.45 
 
 
377 aa  129  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0752  glycosyl transferase, group 1  38.4 
 
 
423 aa  122  7e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0491  glycosyl transferase, group 1  29.12 
 
 
381 aa  117  1.9999999999999998e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1156  glycosyl transferase group 1  37.2 
 
 
371 aa  115  8.999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.242648  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5201  group 1 glycosyl transferase  30.04 
 
 
430 aa  112  1.0000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.131899  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6238  glycosyltransferase WbpY  38.01 
 
 
375 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0419  glycosyl transferase, group 1  36.96 
 
 
370 aa  109  6e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2862  glycosyl transferase group 1  30.38 
 
 
343 aa  109  8.000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2316  glycosyl transferase group 1  26.79 
 
 
387 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2367  glycosyl transferase group 1  26.79 
 
 
387 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71920  glycosyltransferase WbpY  35.75 
 
 
375 aa  107  3e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0139  glycosyl transferase group 1  36.47 
 
 
384 aa  107  4e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00161479 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2361  glycosyl transferase group 1  36.82 
 
 
377 aa  105  8e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0208064 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3583  glycosyl transferase, group 1  33.92 
 
 
408 aa  105  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3369  glycosyl transferase, group 1  32.99 
 
 
417 aa  105  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00689338 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5687  glycosyl transferase, group 1  31.74 
 
 
376 aa  105  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.519018  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  33.46 
 
 
382 aa  105  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4314  glycosyl transferase group 1  32.95 
 
 
370 aa  104  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.712653  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4936  glycosyl transferase, group 1  31.13 
 
 
443 aa  104  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4271  glycosyl transferase group 1  34.81 
 
 
400 aa  104  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.614702 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0744  glycosyl transferase group 1  34.96 
 
 
363 aa  103  4e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.299994  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3566  glycosyl transferase group 1  33.99 
 
 
390 aa  102  9e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0715685  normal  0.505955 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1171  glycosyl transferase group 1  28.36 
 
 
366 aa  102  9e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.059053 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3491  glycosyl transferase, group 1  34.38 
 
 
440 aa  102  9e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.76367  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2483  mannosyltransferase B  28.25 
 
 
375 aa  102  1e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0534516  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1558  glycosyl transferase group 1  28.21 
 
 
374 aa  101  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.899676  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0741  glycosyl transferase group 1  33.73 
 
 
435 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4183  glycosyl transferase group 1  32.96 
 
 
362 aa  100  3e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  32.71 
 
 
370 aa  100  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1273  glycosyl transferase, group 1  32.17 
 
 
380 aa  100  3e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00681714 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2193  glycosyltransferase  27.88 
 
 
375 aa  100  3e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00106475  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06140  glycosyltransferase  31.65 
 
 
379 aa  99.4  7e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.191303  normal  0.988146 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4137  glycosyl transferase group 1  31.23 
 
 
431 aa  97.8  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000953773 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2167  mannosyltransferase B  29.63 
 
 
381 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4438  glycosyl transferase group 1  32.11 
 
 
381 aa  98.2  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0388  glycosyltransferase  32.2 
 
 
373 aa  97.4  3e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.230246  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2953  glycosyl transferase group 1  30.9 
 
 
372 aa  97.4  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.303965  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2011  glycosyl transferase group 1  32.53 
 
 
373 aa  97.8  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1969  glycosyl transferase group 1  31.8 
 
 
372 aa  97.4  4e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1409  glycosyl transferase group 1  36.36 
 
 
355 aa  97.1  5e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.201538 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6341  glycosyl transferase group 1  34.33 
 
 
354 aa  96.7  5e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.263433  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2129  glycosyl transferase, group 1  27.27 
 
 
366 aa  96.7  6e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.819184  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3776  glycosyl transferase, group 1  30.88 
 
 
371 aa  95.5  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0772  glycosyl transferase group 1  33.62 
 
 
358 aa  95.1  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.494029  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0239  glycosyl transferase group 1  34.38 
 
 
381 aa  94.7  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.836427 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1385  glycosyl transferase group 1  30.54 
 
 
398 aa  94  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.106503  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0732  glycosyl transferase, group 1  30.99 
 
 
428 aa  94.4  3e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3860  glycosyl transferase, group 1  31.03 
 
 
442 aa  94.4  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.185874 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2078  glycosyl transferase group 1  33.47 
 
 
464 aa  94  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.382452 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1333  glycosyl transferase, group 1 family protein, putative  34.36 
 
 
343 aa  93.6  4e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0456  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
366 aa  93.2  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4015  glycosyl transferase, group 1  31.18 
 
 
384 aa  93.2  5e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0129  mannosyltransferase  34.65 
 
 
374 aa  92.8  7e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00122575 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4383  glycosyl transferase, group 1  31.34 
 
 
535 aa  92.8  8e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.315819  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0394  glycosyl transferase group 1  26.42 
 
 
374 aa  92.8  8e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.538009  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3357  glycosyl transferase group 1  26.5 
 
 
437 aa  92.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4604  glycosyl transferase group 1  26.23 
 
 
371 aa  91.3  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000112819  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2776  glycosyl transferase, group 1  34.11 
 
 
418 aa  91.3  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0357  glycosyl transferase, group 1  30.63 
 
 
389 aa  91.3  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.137349  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5879  glycosyl transferase group 1  33.73 
 
 
395 aa  90.9  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.734858 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1801  glycosyl transferase WbpY  30.1 
 
 
380 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0707089 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3447  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.35 
 
 
369 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0476  glycosyl transferase group 1  27.76 
 
 
361 aa  90.5  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0742  glycosyl transferase group 1  35.56 
 
 
367 aa  90.5  4e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0263167  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0663  glycosyl transferase group 1  31.58 
 
 
433 aa  90.1  5e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.002459  normal  0.0324915 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0928  a-glycosyltransferase  25.93 
 
 
374 aa  89.7  6e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0110486 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0347  glycosyl transferase, group 1  32.82 
 
 
340 aa  89.7  7e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.302336 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1380  glycosyl transferase group 1  30.86 
 
 
375 aa  89.4  7e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0558  glycosyl transferase group 1  32.58 
 
 
381 aa  89.4  8e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6345  glycosyl transferase group 1  34.41 
 
 
364 aa  89.4  9e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.378586  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1681  glycosyl transferase group 1  34.14 
 
 
366 aa  88.6  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.082633  normal  0.656807 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1413  mannosyltransferase  27.46 
 
 
354 aa  88.2  2e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.953806  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2150  glycosyl transferase, group 1  31.5 
 
 
397 aa  88.2  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5473  glycosyl transferase group 1  31.84 
 
 
375 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3359  glycosyl transferase group 1  23.99 
 
 
434 aa  87.8  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2211  protein RfbU  27.85 
 
 
353 aa  87.8  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00229627  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0296  glycosyl transferase, group 1  29.17 
 
 
346 aa  87.8  3e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3578  glycosyl transferase  31.03 
 
 
412 aa  87.4  3e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.643047  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0761  glycosyl transferase, group 1  31.3 
 
 
349 aa  87.4  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.082681  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0722  glycosyl transferase group 1  27.96 
 
 
524 aa  87.4  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.799351  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0978  glycosyl transferase group 1  27.9 
 
 
378 aa  87  4e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.625979  hitchhiker  0.00043945 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2130  glycosyl transferase, group 1  28.81 
 
 
370 aa  87  4e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.799297  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0448  glycosyl transferase, group 1  33.93 
 
 
364 aa  87  4e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.717217 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2312  hypothetical protein  27.4 
 
 
353 aa  87  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.167078  normal  0.0536505 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5894  glycosyl transferase group 1  36.63 
 
 
382 aa  87  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.262799  normal  0.416223 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2425  hypothetical protein  27.4 
 
 
353 aa  87  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.274223  hitchhiker  0.000381891 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2084  glycosyl transferase group 1  35.29 
 
 
420 aa  87  5e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5868  glycosyl transferase group 1  25.09 
 
 
420 aa  86.7  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01121  hypothetical protein  24.69 
 
 
354 aa  86.7  5e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3229  glycosyl transferase, group 1  28.95 
 
 
371 aa  86.7  6e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.453901  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0720  glycosyl transferase, group 1  36.76 
 
 
408 aa  86.3  6e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.450212 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0494  glycosyl transferase group 1  28.23 
 
 
398 aa  86.3  7e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2903  glycosyl transferase group 1  29.21 
 
 
358 aa  85.9  0.000000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0464  glycosyl transferase group 1  30.43 
 
 
394 aa  85.9  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3492  glycosyl transferase, group 1  33.9 
 
 
390 aa  85.5  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.695394  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1702  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 
360 aa  84.7  0.000000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.127413  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0081  mannosyltransferase  31.91 
 
 
346 aa  84.3  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.54497  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0770  glycosyl transferase, group 1  30.5 
 
 
399 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0084  glycosyl transferase group 1  31.91 
 
 
346 aa  84.3  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.248022  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>