More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4362 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_4362  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 349 aa  678    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0309  glycosyl transferase, group 1  60.93 
 
 		 347 aa  384  1e-105  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4162  glycosyl transferase group 1  60.82 
 
 		 347 aa  334  1e-90  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0349192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3664  glycosyl transferase, group 1  59.77 
 
 		 346 aa  331  1e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.032207  normal  0.177473 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8172  glycosyl transferase group 1  41.13 
 
 		 356 aa  226  4e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2314  glycosyl transferase group 1  41.23 
 
 		 347 aa  219  6e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.055827  normal  0.292913 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4662  glycosyl transferase group 1  43.67 
 
 		 350 aa  211  1e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0886148  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0769  glycosyl transferase group 1  37.98 
 
 		 347 aa  183  3e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1176  glycosyl transferase, group 1  37.35 
 
 		 349 aa  181  2e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4785  glycosyl transferase group 1  43.97 
 
 		 350 aa  178  1e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.195851  normal  0.262442 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2747  glycosyl transferase group 1  37.22 
 
 		 381 aa  167  2e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000175186  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2455  glycosyl transferase group 1  38.82 
 
 		 357 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0763  glycosyl transferase, group 1  37 
 
 		 337 aa  158  1e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1681  glycosyl transferase, group 1  36.25 
 
 		 303 aa  141  9.999999999999999e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.456944  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2749  glycosyl transferase group 1  36 
 
 		 344 aa  140  3e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.611394  hitchhiker  0.00344637 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1676  glycosyl transferase, group 1  32.84 
 
 		 639 aa  139  7e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1238  glycosyl transferase group 1  36.69 
 
 		 349 aa  138  1e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0206606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2562  glycosyl transferase, group 1  34.38 
 
 		 344 aa  132  6.999999999999999e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.118298 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0317  glycosyl transferase group 1  34.71 
 
 		 343 aa  122  9.999999999999999e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0516  glycosyl transferase group 1  32.01 
 
 		 360 aa  108  1e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.192039  normal  0.814109 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2575  glycosyl transferase, group 1  34.57 
 
 		 339 aa  106  5e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.561026  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0797  glycosyl transferase group 1  31.11 
 
 		 360 aa  105  9e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2139  glycosyl transferase group 1  24.1 
 
 		 357 aa  103  6e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0644  glycosyl transferase, group 1  31.15 
 
 		 380 aa  97.8  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2671  glycosyl transferase, group 1  38.73 
 
 		 408 aa  93.2  6e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.990429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3727  glycosyl transferase group 1  30 
 
 		 672 aa  91.3  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3512  glycosyl transferase group 1  26.4 
 
 		 369 aa  90.9  3e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.218401  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0690  glycosyl transferase, group 1  35.04 
 
 		 394 aa  90.9  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1401  glycosyl transferase group 1  41.67 
 
 		 426 aa  90.5  4e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.52181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0569  glycosyl transferase group 1  36.7 
 
 		 422 aa  90.5  4e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0542  glycosyl transferase group 1  37.5 
 
 		 351 aa  89.4  8e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9234  putative glycosyl transferase, group 1  39.31 
 
 		 388 aa  89.4  9e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5045  glycosyl transferase group 1  30.55 
 
 		 422 aa  88.6  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.022612 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1960  glycosyl transferase group 1  34.15 
 
 		 426 aa  89  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000390342  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0631  glycosyl transferase group 1  39.29 
 
 		 394 aa  87.8  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1424  glycosyl transferase group 1  35 
 
 		 440 aa  88.2  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3735  glycosyl transferase group 1  32.52 
 
 		 355 aa  87.4  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2721  glycosyl transferase, group 1  35.04 
 
 		 364 aa  87  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.134421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0773  glycosyl transferase group 1  27.86 
 
 		 457 aa  86.7  5e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1724  group 1 glycosyl transferase  41.36 
 
 		 440 aa  85.1  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0814072  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0761  glycosyl transferase group 1  28.14 
 
 		 748 aa  85.1  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0713  glycosyl transferase, group 1  36.94 
 
 		 405 aa  84.3  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0559363  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0205  glycosyl transferase, group 1  36.8 
 
 		 454 aa  84.3  0.000000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0740  putative glycosyl transferase  30.54 
 
 		 442 aa  84  0.000000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.053122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0126  glycosyl transferase group 1  34.14 
 
 		 371 aa  83.6  0.000000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4708  glycosyl transferase group 1  39.07 
 
 		 374 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.392081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0766  glycosyl transferase group 1  36.87 
 
 		 420 aa  83.2  0.000000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.676437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0615  glycosyl transferase, group 1  36.87 
 
 		 420 aa  83.2  0.000000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0722468  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  29.57 
 
 		 423 aa  82.4  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1748  glycosyl transferase group 1  38.46 
 
 		 402 aa  82.4  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0115341 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11330  glycosyltransferase  38.81 
 
 		 403 aa  81.6  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.902273 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4579  glycosyl transferase, group 1  33.91 
 
 		 398 aa  80.9  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0122865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2594  glycosyl transferase group 1  28.63 
 
 		 421 aa  81.3  0.00000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0017  glycosyl transferase group 1  23.28 
 
 		 377 aa  80.5  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0972  glycosyl transferase, group 1  38.04 
 
 		 379 aa  80.5  0.00000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.775545  normal  0.23686 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1762  glycosyl transferase, group 1  36.04 
 
 		 406 aa  80.5  0.00000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.379632 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  36.32 
 
 		 370 aa  79.7  0.00000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1171  glycosyl transferase group 1  34.11 
 
 		 366 aa  80.1  0.00000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.059053 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3926  glucosyltransferase  36 
 
 		 411 aa  79.7  0.00000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2654  glycosyl transferase, group 1  40.41 
 
 		 388 aa  79.7  0.00000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0179694  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3892  glycosyl transferase group 1  32.32 
 
 		 408 aa  79.7  0.00000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1839  glycosyl transferase group 1  39.33 
 
 		 362 aa  79.7  0.00000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1051  glycosyl transferase, group 1  33.92 
 
 		 445 aa  79.7  0.00000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.876229 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2150  glycosyl transferase, group 1  32.71 
 
 		 397 aa  79.7  0.00000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0348  glycosyl transferase group 1  34.07 
 
 		 739 aa  79.3  0.00000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  34.62 
 
 		 382 aa  79.3  0.00000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4103  glycosyl transferase group 1  34.56 
 
 		 400 aa  78.6  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.355354 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4240  glycosyl transferase group 1  39.73 
 
 		 418 aa  79  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2129  glycosyl transferase, group 1  24.69 
 
 		 366 aa  78.6  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.819184  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4583  glycosyl transferase group 1  38.82 
 
 		 396 aa  79  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1812  glycosyl transferase, group 1  34.05 
 
 		 406 aa  79  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  40.57 
 
 		 367 aa  79  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1681  glycosyl transferase group 1  30.47 
 
 		 366 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.082633  normal  0.656807 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0506  glycosyl transferase, group 1  38.13 
 
 		 425 aa  78.2  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2376  glycosyl transferase group 1  30.26 
 
 		 372 aa  78.6  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2978  glycosyltransferase-like protein  30.91 
 
 		 357 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3091  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 		 770 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.278852  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  33.5 
 
 		 379 aa  78.6  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3106  glycosyl transferase group 1  38.33 
 
 		 382 aa  77.8  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3106  glycosyl transferase group 1  29.65 
 
 		 435 aa  77.8  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0239  glycosyl transferase group 1  34.78 
 
 		 381 aa  77.8  0.0000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.836427 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  33.66 
 
 		 373 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2777  glycosyl transferase, group 1  34.54 
 
 		 382 aa  77.4  0.0000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2799  glycosyl transferase, group 1  27.97 
 
 		 421 aa  77.4  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3722  glycosyl transferase, group 1  34.56 
 
 		 400 aa  77.8  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3800  glycosyl transferase, group 1  29.91 
 
 		 386 aa  77.4  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3522  glycosyl transferase group 1  31.31 
 
 		 385 aa  77  0.0000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.828408  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1433  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.49 
 
 		 409 aa  76.6  0.0000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.985375  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0012  glycosyl transferase group 1  31.1 
 
 		 458 aa  76.6  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0494  glycosyl transferase group 1  30.57 
 
 		 398 aa  76.3  0.0000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3411  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 		 425 aa  76.3  0.0000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  31.48 
 
 		 414 aa  76.3  0.0000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0136  glycosyl transferase, group 1  34.43 
 
 		 417 aa  76.3  0.0000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2081  glycosyl transferase group 1  34.14 
 
 		 374 aa  75.9  0.0000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0903  lipopolysaccharide N-acetylglucosaminyltransferase  35.67 
 
 		 366 aa  75.9  0.0000000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0854  glycosyl transferase, group 1  33.77 
 
 		 404 aa  75.9  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0579816 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1456  glycosyl transferase group 1  35 
 
 		 384 aa  75.5  0.000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.550034  hitchhiker  0.000088456 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0758  glycosyl transferase group 1  35.33 
 
 		 371 aa  75.5  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.11154 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0357  glycosyl transferase, group 1  28.88 
 
 		 375 aa  75.9  0.000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  26.26 
 
 		 387 aa  75.5  0.000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.990869 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>