More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2671 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_2671  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
408 aa  798    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.990429  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3091  glycosyl transferase, group 1  40.1 
 
 
770 aa  276  4e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.278852  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1803  glycosyl transferase, group 1  41.75 
 
 
409 aa  233  7.000000000000001e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1473  hypothetical protein  38.11 
 
 
383 aa  167  2e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.574733  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3263  glycosyl transferase group 1  37.22 
 
 
381 aa  164  3e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1191  glycosyl transferase, group 1  31.94 
 
 
384 aa  143  4e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0302  glycosyltransferase  33 
 
 
383 aa  142  9.999999999999999e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.464413  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2457  glycosyl transferase, group 1  32.41 
 
 
386 aa  134  3e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22800  glycosyl transferase group 1  28.04 
 
 
359 aa  133  6e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02595  glycosyltransferase  32.82 
 
 
382 aa  130  3e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.157205  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2461  glycosyl transferase group 1  33.42 
 
 
374 aa  129  1.0000000000000001e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3857  glycosyl transferase group 1  34.08 
 
 
423 aa  129  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.352881  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2961  glycosyl transferase, group 1  38.75 
 
 
382 aa  126  6e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.197137  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0285  glycosyl transferase group 1  32.56 
 
 
389 aa  126  7e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3285  glycosyl transferase, group 1  33.07 
 
 
375 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.254091  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3347  glycosyl transferase, group 1  33.07 
 
 
375 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0957138  normal  0.0861917 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3296  glycosyl transferase, group 1  33.07 
 
 
375 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.229381 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5500  glycosyl transferase group 1  38.21 
 
 
455 aa  125  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0983279 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1051  glycosyl transferase, group 1  37.56 
 
 
445 aa  124  3e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.876229 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1181  glycosyl transferase group 1  28.97 
 
 
419 aa  123  5e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5179  glycosyl transferase group 1  34.95 
 
 
378 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0073  glycosyl transferase, group 1  38.06 
 
 
448 aa  120  3e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  28.68 
 
 
419 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3550  glycosyl transferase, group 1  30.32 
 
 
378 aa  120  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.750733 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4959  glycosyl transferase group 1  29.2 
 
 
399 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3047  glycosyl transferase group 1  31.47 
 
 
374 aa  120  4.9999999999999996e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.284334  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  31.84 
 
 
373 aa  120  6e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1507  glycosyl transferase group 1  39.63 
 
 
395 aa  119  9.999999999999999e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.255833 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4876  glycosyl transferase group 1  36.92 
 
 
370 aa  118  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.756058  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1819  glycosyl transferase group 1  31 
 
 
373 aa  117  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103327  normal  0.199615 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3845  group 1 glycosyl transferase  33.33 
 
 
411 aa  117  5e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000452091  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3735  glycosyl transferase group 1  31.1 
 
 
355 aa  115  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2433  glycosyl transferase, group 1  32.04 
 
 
417 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.287149 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3236  glycosyl transferase group 1  32.26 
 
 
374 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0188616  hitchhiker  0.000126621 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1382  glycosyl transferase group 1  31.33 
 
 
376 aa  114  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0731677  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2695  glycosyl transferase, group 1  32.65 
 
 
374 aa  114  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2643  endo-1,4-beta-xylanase  29.25 
 
 
770 aa  114  4.0000000000000004e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.739332  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1304  group 1 glycosyl transferase  31.81 
 
 
388 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0596732  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2431  glycosyl transferase, group 1  30.62 
 
 
364 aa  112  9e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.704693  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  35.62 
 
 
414 aa  112  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6075  glycosyl transferase group 1  30.15 
 
 
390 aa  112  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.353621  normal  0.425913 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  24.42 
 
 
360 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2518  glycosyl transferase group 1  35.78 
 
 
411 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.377974  normal  0.0256247 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2773  glycosyl transferase group 1  35.06 
 
 
385 aa  110  4.0000000000000004e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.576476 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12216  hypothetical protein  29.21 
 
 
385 aa  110  5e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3098  glycosyl transferase, group 1  36.32 
 
 
376 aa  110  6e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.034289  normal  0.933214 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2738  glycosyl transferase group 1  30.14 
 
 
400 aa  110  7.000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0783  glycosyl transferase group 1  39.69 
 
 
394 aa  109  8.000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.492233  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0972  glycosyl transferase, group 1  31.25 
 
 
379 aa  109  8.000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.775545  normal  0.23686 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  33.1 
 
 
370 aa  109  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0984  glycosyl transferase group 1  32.91 
 
 
403 aa  107  3e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0137415 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4244  glycosyl transferase, group 1  33.8 
 
 
417 aa  107  4e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.772955 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4652  glycosyl transferase group 1  29.79 
 
 
396 aa  106  6e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1495  glycosyl transferase, group 1  31.75 
 
 
361 aa  106  8e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.507628  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5953  UDP-N-acetylglucosamine  34.43 
 
 
443 aa  106  8e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2681  glycosyl transferase group 1  28.95 
 
 
376 aa  106  9e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0126  glycosyl transferase group 1  32.5 
 
 
371 aa  105  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2655  glycosyl transferase, group 1  37.27 
 
 
395 aa  105  1e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.268297  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1839  glycosyl transferase group 1  36.8 
 
 
362 aa  105  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02000  glycosyltransferase  35.68 
 
 
452 aa  105  2e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10750  glycosyltransferase  33.33 
 
 
399 aa  104  3e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.944872  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4017  glycosyl transferase group 1  31.46 
 
 
384 aa  104  3e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.174092  normal  0.606388 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0017  glycosyl transferase group 1  39.13 
 
 
366 aa  104  3e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0190487  normal  0.0199927 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3059  glycosyl transferase group 1  30.87 
 
 
374 aa  104  3e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000425383  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4609  UDP-N-acetylglucosamine  36.1 
 
 
450 aa  103  4e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3146  glycosyl transferase group 1  35.29 
 
 
384 aa  103  5e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.833609  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0136  glycosyl transferase, group 1  33.91 
 
 
417 aa  103  6e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2514  glycosyl transferase group 1  36.21 
 
 
351 aa  103  6e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0260745  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0894  a-glycosyltransferase  30.58 
 
 
380 aa  103  7e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00308239  normal 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3917  glycosyl transferase group 1  32.49 
 
 
380 aa  103  8e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0171  glycosyl transferase, group 1  36.59 
 
 
422 aa  102  8e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0209  glycosyl transferase, group 1  35.55 
 
 
386 aa  103  8e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.959787  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2913  putative glycosyltransferase  31.28 
 
 
434 aa  102  1e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3445  glycosyl transferase, group 1  30.55 
 
 
389 aa  102  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.129839  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3514  glycosyl transferase group 1  33.85 
 
 
376 aa  102  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00713418 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1573  glycosyl transferase group 1  38.86 
 
 
420 aa  102  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.539919  normal  0.0199703 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3000  glycosyl transferase, group 1  35.32 
 
 
384 aa  102  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0763479  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0347  glycosyl transferase group 1  25.83 
 
 
369 aa  102  1e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1912  galactosyltransferase  31.14 
 
 
389 aa  102  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0537  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.19 
 
 
364 aa  101  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5074  UDP-N-acetylglucosamine  34.88 
 
 
418 aa  102  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.838773  normal  0.526532 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0219  glycosyl transferase, group 1  35.07 
 
 
360 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0229  glycosyl transferase, group 1  35.07 
 
 
386 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0736189  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3899  glycosyl transferase group 1  30.33 
 
 
382 aa  101  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0695  UDP-N-acetylglucosamine  32.14 
 
 
431 aa  100  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4137  glycosyl transferase group 1  31.87 
 
 
431 aa  101  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000953773 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3278  glycosyl transferase group 1  29.44 
 
 
850 aa  100  4e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1540  group 1 glycosyl transferase  28.99 
 
 
378 aa  100  4e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.213513  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2807  glycosyl transferase group 1  35.11 
 
 
412 aa  100  4e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  35.66 
 
 
367 aa  100  6e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3282  glycosyl transferase, group 1  34.9 
 
 
377 aa  100  6e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0235  glycosyl transferase group 1  31.08 
 
 
373 aa  100  6e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.118803 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  30.04 
 
 
390 aa  100  6e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0857  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
355 aa  100  6e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.123894  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2078  glycosyl transferase, group 1  32.49 
 
 
377 aa  99.8  7e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.206868  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4314  glycosyl transferase group 1  33.72 
 
 
370 aa  99  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.712653  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5045  glycosyl transferase, group 1  30.66 
 
 
415 aa  99  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.462239 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4331  glycosyl transferase group 1  30.14 
 
 
422 aa  99.4  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0666241 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2826  glycosyl transferase group 1  32.37 
 
 
414 aa  99.4  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2912  glycosyl transferase group 1  35.91 
 
 
412 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.341746  normal  0.205284 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>