More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2738 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_2738  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
400 aa  789    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2358  Methyltransferase type 11  38.65 
 
 
634 aa  169  8e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.295252  hitchhiker  0.00225016 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1473  hypothetical protein  28.37 
 
 
383 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.574733  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0793  Glycosyltransferase-like protein  26.95 
 
 
384 aa  110  3e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3263  glycosyl transferase group 1  30.9 
 
 
381 aa  109  7.000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2671  glycosyl transferase, group 1  30.42 
 
 
408 aa  109  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.990429  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02595  glycosyltransferase  26.17 
 
 
382 aa  107  3e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.157205  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1401  glycosyl transferase group 1  30.84 
 
 
426 aa  107  4e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.52181  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2457  glycosyl transferase, group 1  25.58 
 
 
386 aa  106  6e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0302  glycosyltransferase  32.31 
 
 
383 aa  106  9e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.464413  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0126  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
371 aa  105  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1461  glycosyl transferase group 1  23.67 
 
 
381 aa  104  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.244211  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1591  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.94 
 
 
381 aa  104  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2808  glycosyl transferase group 1  30.06 
 
 
424 aa  104  3e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1148  glycosyl transferase group 1  35.9 
 
 
377 aa  103  5e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000501847  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3917  glycosyl transferase group 1  30.65 
 
 
380 aa  103  6e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3754  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.94 
 
 
381 aa  103  7e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1365  glycosyl transferase group 1  24.92 
 
 
414 aa  103  7e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000226511 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3091  glycosyl transferase, group 1  31.63 
 
 
770 aa  103  8e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.278852  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1664  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.2 
 
 
381 aa  102  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1629  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.94 
 
 
381 aa  100  6e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.170146 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1445  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.94 
 
 
381 aa  100  6e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1417  glycosyltransferase  23.94 
 
 
381 aa  100  6e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1418  glycosyltransferase  23.94 
 
 
381 aa  100  6e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1558  group 1 family glycosyl transferase  23.94 
 
 
381 aa  100  6e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0245  glycosyl transferase group 1  25.49 
 
 
396 aa  100  6e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0172332  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1702  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.94 
 
 
381 aa  99.8  9e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0208519  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3047  glycosyl transferase group 1  30.06 
 
 
374 aa  99  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.284334  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0155  glycosyl transferase, group 1  30.27 
 
 
361 aa  98.6  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  29.54 
 
 
413 aa  98.2  2e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1191  glycosyl transferase, group 1  22.46 
 
 
384 aa  98.2  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2715  glycosyl transferase group 1  31.51 
 
 
421 aa  98.2  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.770455 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1916  glycosyl transferase group 1  28.98 
 
 
378 aa  97.8  3e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1259  glycosyl transferase group 1  22.07 
 
 
381 aa  97.8  3e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.509892  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3899  glycosyl transferase group 1  30.15 
 
 
382 aa  95.1  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  31.46 
 
 
391 aa  94.7  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2773  glycosyl transferase, group 1  32.82 
 
 
348 aa  95.1  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1382  glycosyl transferase group 1  31.11 
 
 
376 aa  94.7  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0731677  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  27.64 
 
 
388 aa  94.4  3e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5000  glycosyl transferase group 1  32.47 
 
 
389 aa  93.6  5e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.704682 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4910  glycosyl transferase group 1  33.2 
 
 
388 aa  93.6  6e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.314758  hitchhiker  0.000347122 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3296  glycosyl transferase, group 1  30 
 
 
375 aa  93.2  7e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.229381 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3732  glycosyl transferase group 1  31.44 
 
 
388 aa  93.2  8e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.775732  normal  0.609704 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1259  glycosyl transferase group 1  30.19 
 
 
457 aa  93.2  8e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00525262  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0136  glycosyl transferase, group 1  34.45 
 
 
417 aa  92.8  8e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5555  glycosyl transferase, group 1  31.44 
 
 
388 aa  93.2  8e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.225972  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22800  glycosyl transferase group 1  24.63 
 
 
359 aa  92.8  9e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1509  glycosyl transferase, group 1  35.19 
 
 
425 aa  92.8  9e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3829  glycosyl transferase, group 1  31.6 
 
 
388 aa  92.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00562518  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3695  glycosyl transferase group 1  31.6 
 
 
388 aa  92.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.166947  normal  0.63748 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  30.89 
 
 
410 aa  91.3  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  32.28 
 
 
370 aa  92  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4579  glycosyl transferase, group 1  31.27 
 
 
398 aa  92  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0122865  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1712  glycosyl transferase, group 1  38.6 
 
 
388 aa  91.7  2e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.170704  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3285  glycosyl transferase, group 1  30.26 
 
 
375 aa  92  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.254091  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10750  glycosyltransferase  30.16 
 
 
399 aa  92  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.944872  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3347  glycosyl transferase, group 1  30.26 
 
 
375 aa  92  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0957138  normal  0.0861917 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3236  glycosyl transferase group 1  30.94 
 
 
374 aa  91.3  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0188616  hitchhiker  0.000126621 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2121  glycosyl transferase group 1  24.53 
 
 
375 aa  91.7  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03650  glycosyltransferase  35.98 
 
 
413 aa  91.3  3e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.736839  normal  0.451667 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  23.27 
 
 
536 aa  91.3  3e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0012  a-glycosyltransferase  25.38 
 
 
379 aa  91.3  3e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  32.76 
 
 
377 aa  90.9  3e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0957  glycosyl transferase, group 1  29.93 
 
 
386 aa  90.9  3e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.258156  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2695  glycosyl transferase, group 1  30.1 
 
 
374 aa  91.3  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2643  endo-1,4-beta-xylanase  27.97 
 
 
770 aa  90.9  4e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.739332  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4534  glycosyl transferase, group 1  31.2 
 
 
388 aa  90.5  4e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.429646  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  22.41 
 
 
395 aa  90.5  5e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1819  glycosyl transferase group 1  29.22 
 
 
373 aa  90.1  6e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103327  normal  0.199615 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0395  glycosyl transferase, group 1  21.9 
 
 
396 aa  90.1  6e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.288047  normal  0.0226805 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5192  glycosyl transferase group 1  30.86 
 
 
404 aa  90.1  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1425  glycosyl transferase group 1  32 
 
 
436 aa  90.1  7e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1304  group 1 glycosyl transferase  28.9 
 
 
388 aa  90.1  7e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0596732  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5094  glycosyl transferase group 1  26.82 
 
 
382 aa  89.7  7e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2267  glycosyl transferase, group 1  31.76 
 
 
388 aa  89.7  8e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.370121  normal  0.159353 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1655  glycosyl transferase group 1  28.35 
 
 
384 aa  89.7  8e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3857  glycosyl transferase group 1  27.72 
 
 
423 aa  89.7  8e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.352881  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0690  glycosyl transferase, group 1  26.86 
 
 
393 aa  89.4  9e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0992271  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3096  glycosyl transferase, group 1  30.42 
 
 
439 aa  89  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.332935  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0354  glycosyl transferase group 1  22.22 
 
 
402 aa  89  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000079613  normal  0.480518 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  23.08 
 
 
394 aa  89  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6048  glycosyl transferase group 1  31.36 
 
 
439 aa  88.6  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0604596 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2023  glycosyl transferase, group 1  27.4 
 
 
401 aa  88.6  2e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.334553  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1373  glycosyl transferase, group 1  31.23 
 
 
439 aa  88.2  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6456  glycosyl transferase, group 1  31.23 
 
 
439 aa  88.2  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.338178  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0799  glycosyl transferase, group 1  27.27 
 
 
378 aa  88.2  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  23.67 
 
 
408 aa  88.6  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  27.47 
 
 
410 aa  88.2  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4959  glycosyl transferase group 1  29.34 
 
 
399 aa  87.8  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2518  glycosyl transferase group 1  33.79 
 
 
411 aa  87.8  3e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.377974  normal  0.0256247 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1066  glycosyl transferase group 1  31.05 
 
 
385 aa  87.8  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.552097 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  26.45 
 
 
391 aa  87.8  3e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1803  glycosyl transferase, group 1  31.25 
 
 
409 aa  87.8  3e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0580  glycosyl transferase, group 1  32.03 
 
 
417 aa  88.2  3e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2126  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.81 
 
 
366 aa  87.4  4e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3572  glycosyl transferase, group 1  26.03 
 
 
389 aa  87.4  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.483254  normal  0.0128829 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0506  glycosyl transferase, group 1  30.23 
 
 
425 aa  87  5e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1696  glycosyl transferase group 1  26.89 
 
 
406 aa  87  5e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5452  glycosyl transferase group 1  29.06 
 
 
438 aa  87  5e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  hitchhiker  0.00474748 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0498  glycosyl transferase group 1  26.65 
 
 
378 aa  86.7  6e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>