More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3917 on replicon NC_010578
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010578  Bind_3917  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
380 aa  768    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1473  hypothetical protein  27.39 
 
 
383 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.574733  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2457  glycosyl transferase, group 1  32.73 
 
 
386 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4017  glycosyl transferase group 1  28.5 
 
 
384 aa  114  3e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.174092  normal  0.606388 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2738  glycosyl transferase group 1  30.65 
 
 
400 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3263  glycosyl transferase group 1  29.16 
 
 
381 aa  106  8e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22800  glycosyl transferase group 1  24.33 
 
 
359 aa  105  9e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3236  glycosyl transferase group 1  38.33 
 
 
374 aa  105  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0188616  hitchhiker  0.000126621 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2671  glycosyl transferase, group 1  33.12 
 
 
408 aa  105  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.990429  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1382  glycosyl transferase group 1  31.41 
 
 
376 aa  102  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0731677  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3091  glycosyl transferase, group 1  33.1 
 
 
770 aa  100  4e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.278852  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3047  glycosyl transferase group 1  31.39 
 
 
374 aa  100  4e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.284334  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1803  glycosyl transferase, group 1  32.92 
 
 
409 aa  97.8  3e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10750  glycosyltransferase  29.29 
 
 
399 aa  97.8  3e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.944872  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2807  glycosyl transferase group 1  26.98 
 
 
412 aa  96.7  6e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1191  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 
384 aa  95.9  9e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0285  glycosyl transferase group 1  27.11 
 
 
389 aa  95.5  1e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  28.73 
 
 
370 aa  95.9  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1573  glycosyl transferase group 1  31.97 
 
 
420 aa  95.9  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.539919  normal  0.0199703 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2695  glycosyl transferase, group 1  36.02 
 
 
374 aa  93.6  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0395  glycosyl transferase, group 1  20.63 
 
 
396 aa  93.2  6e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.288047  normal  0.0226805 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3296  glycosyl transferase, group 1  30.29 
 
 
375 aa  93.2  7e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.229381 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3285  glycosyl transferase, group 1  35.56 
 
 
375 aa  92.8  8e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.254091  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3347  glycosyl transferase, group 1  35.56 
 
 
375 aa  92.8  8e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0957138  normal  0.0861917 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  29.21 
 
 
414 aa  92.8  9e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1731  N-acetylglucosaminyl-phosphatidylinositol biosynthetic protein  26.56 
 
 
376 aa  92  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.183221  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1181  glycosyl transferase group 1  28.22 
 
 
419 aa  92  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6075  glycosyl transferase group 1  29.53 
 
 
390 aa  91.3  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.353621  normal  0.425913 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  24.38 
 
 
360 aa  92  2e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0713  glycosyl transferase, group 1  31.11 
 
 
405 aa  90.9  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0559363  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3059  glycosyl transferase group 1  34.43 
 
 
374 aa  90.5  5e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000425383  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1839  glycosyl transferase group 1  28.77 
 
 
362 aa  90.5  5e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0359  glycosyl transferase group 1  29.6 
 
 
410 aa  90.1  6e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3857  glycosyl transferase group 1  25.58 
 
 
423 aa  89.7  7e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.352881  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  25.07 
 
 
419 aa  89.4  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3592  glycosyl transferase group 1  24.88 
 
 
412 aa  89.4  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.157633  hitchhiker  0.00114643 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1304  group 1 glycosyl transferase  28.67 
 
 
388 aa  89  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0596732  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7902  glycosyltransferase  27.54 
 
 
406 aa  88.2  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  28.81 
 
 
367 aa  88.6  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2685  glycosyl transferase group 1  25.06 
 
 
412 aa  88.6  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.481855  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  26.21 
 
 
360 aa  88.2  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0302  glycosyltransferase  25.84 
 
 
383 aa  87.8  3e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.464413  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2912  glycosyl transferase group 1  24.94 
 
 
412 aa  87.8  3e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.341746  normal  0.205284 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1751  glycosyl transferase group 1  27.75 
 
 
453 aa  86.7  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3369  glycosyl transferase, group 1  29.5 
 
 
417 aa  86.3  8e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00689338 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1866  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  26.18 
 
 
396 aa  86.3  8e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4604  glycosyl transferase group 1  27.96 
 
 
371 aa  86.3  8e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000112819  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1787  glycosyl transferase group 1  28.76 
 
 
383 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1748  glycosyl transferase group 1  30.46 
 
 
402 aa  85.9  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0115341 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2643  endo-1,4-beta-xylanase  27.25 
 
 
770 aa  85.5  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.739332  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3735  glycosyl transferase group 1  24.3 
 
 
355 aa  85.5  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  27.87 
 
 
426 aa  84.7  0.000000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0569  glycosyl transferase group 1  31.9 
 
 
422 aa  84.7  0.000000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  25.57 
 
 
413 aa  84  0.000000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2285  glycosyl transferase group 1  27.18 
 
 
410 aa  84.3  0.000000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0267673  normal  0.0567423 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4495  glycosyl transferase group 1  27.97 
 
 
394 aa  84  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2961  glycosyl transferase, group 1  35.96 
 
 
382 aa  84  0.000000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.197137  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4876  glycosyl transferase group 1  32.58 
 
 
370 aa  83.6  0.000000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.756058  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3899  glycosyl transferase group 1  28.15 
 
 
382 aa  83.2  0.000000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1852  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  26.39 
 
 
769 aa  83.2  0.000000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00784394  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3282  glycosyl transferase, group 1  29.29 
 
 
377 aa  83.2  0.000000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3244  glycosyl transferase, group 1  30.23 
 
 
367 aa  83.2  0.000000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.912834  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2976  glycosyl transferase group 1  28.89 
 
 
417 aa  82.8  0.000000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.82983  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  23.51 
 
 
388 aa  82.8  0.000000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4271  glycosyl transferase group 1  25.95 
 
 
369 aa  82  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2358  Methyltransferase type 11  31.9 
 
 
634 aa  82.4  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.295252  hitchhiker  0.00225016 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3411  glycosyl transferase, group 1  26.49 
 
 
425 aa  82.4  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163553  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3145  glycosyl transferase, group 1  22.75 
 
 
427 aa  82  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.116626  normal  0.0485856 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0202  glycosyl transferase, group 1  23.75 
 
 
369 aa  82.8  0.00000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3550  glycosyl transferase, group 1  28.53 
 
 
378 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.750733 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2666  group 1 glycosyl transferase  29.17 
 
 
367 aa  81.6  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.882197  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  26.42 
 
 
378 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0245  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
396 aa  81.3  0.00000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0172332  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1819  glycosyl transferase group 1  31.11 
 
 
373 aa  81.3  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103327  normal  0.199615 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0675  glycosyl transferase, group 1  30.62 
 
 
376 aa  81.3  0.00000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.102281  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1581  glycosyl transferase, group 1  24.28 
 
 
359 aa  80.9  0.00000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12216  hypothetical protein  28.15 
 
 
385 aa  81.3  0.00000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0054  glycosyl transferase group 1  23.22 
 
 
364 aa  80.9  0.00000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.000000226756  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3146  glycosyl transferase group 1  32.43 
 
 
384 aa  80.9  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.833609  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2884  glycosyl transferase group 1  28.9 
 
 
417 aa  80.1  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11330  glycosyltransferase  29.22 
 
 
403 aa  80.1  0.00000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.902273 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3257  glycosyl transferase group 1  23.12 
 
 
426 aa  80.1  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2461  glycosyl transferase group 1  27.08 
 
 
374 aa  79.7  0.00000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2597  glycosyl transferase group 1  30.5 
 
 
367 aa  79.3  0.00000000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0676  glycosyl transferase group 1  34.1 
 
 
374 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  24.37 
 
 
373 aa  79  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1964  glycosyl transferase group 1  26.88 
 
 
388 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3514  glycosyl transferase group 1  28.45 
 
 
376 aa  79  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00713418 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0840  glycosyl transferase group 1  25.37 
 
 
398 aa  79  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.755568 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0205  glycosyl transferase, group 1  33.04 
 
 
454 aa  79  0.0000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0533  putative mannosyltransferase  27.1 
 
 
372 aa  78.2  0.0000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1652  glycosyltransferase  23.8 
 
 
350 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0657  glycosyltransferase  23.58 
 
 
358 aa  78.6  0.0000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.326106  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2323  glycosyl transferase, group 1  25.08 
 
 
378 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0341  glycosyl transferase, group 1  32.14 
 
 
344 aa  78.6  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.000281472  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2591  glycosyl transferase, group 1  33.2 
 
 
373 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0529  mannosyltransferase, putative  27.1 
 
 
372 aa  77.8  0.0000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.142302  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2606  glycosyl transferase group 1  29.41 
 
 
398 aa  77.4  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2237  glycosyl transferase, group 1  26.88 
 
 
388 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.180955 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1762  glycosyl transferase, group 1  30.43 
 
 
406 aa  77.8  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.379632 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>