More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0285 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0285  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 389 aa  810    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1473  hypothetical protein  39.07 
 
 		 383 aa  274  2.0000000000000002e-72  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.574733  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3047  glycosyl transferase group 1  29.18 
 
 		 374 aa  139  6e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.284334  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22800  glycosyl transferase group 1  30.79 
 
 		 359 aa  137  2e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1191  glycosyl transferase, group 1  26.9 
 
 		 384 aa  138  2e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3296  glycosyl transferase, group 1  30 
 
 		 375 aa  138  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.229381 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3285  glycosyl transferase, group 1  29.74 
 
 		 375 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.254091  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3347  glycosyl transferase, group 1  29.74 
 
 		 375 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0957138  normal  0.0861917 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1382  glycosyl transferase group 1  31.01 
 
 		 376 aa  133  5e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0731677  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2681  glycosyl transferase group 1  31.54 
 
 		 376 aa  133  6.999999999999999e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3282  glycosyl transferase, group 1  31.22 
 
 		 377 aa  130  4.0000000000000003e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1304  group 1 glycosyl transferase  27.98 
 
 		 388 aa  129  7.000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0596732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1803  glycosyl transferase, group 1  34.35 
 
 		 409 aa  129  1.0000000000000001e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3514  glycosyl transferase group 1  33.02 
 
 		 376 aa  127  5e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00713418 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2461  glycosyl transferase group 1  27.56 
 
 		 374 aa  125  9e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12216  hypothetical protein  31.37 
 
 		 385 aa  124  2e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  28.08 
 
 		 413 aa  124  2e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4876  glycosyl transferase group 1  28.46 
 
 		 370 aa  124  4e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.756058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2961  glycosyl transferase, group 1  29.36 
 
 		 382 aa  123  6e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.197137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2671  glycosyl transferase, group 1  32.56 
 
 		 408 aa  122  9e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.990429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1819  glycosyl transferase group 1  27.65 
 
 		 373 aa  122  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103327  normal  0.199615 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3091  glycosyl transferase, group 1  30.11 
 
 		 770 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.278852  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3263  glycosyl transferase group 1  31.42 
 
 		 381 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2457  glycosyl transferase, group 1  28.29 
 
 		 386 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3550  glycosyl transferase, group 1  27.27 
 
 		 378 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.750733 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2695  glycosyl transferase, group 1  26.02 
 
 		 374 aa  116  6e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3146  glycosyl transferase group 1  31.68 
 
 		 384 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.833609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3098  glycosyl transferase, group 1  27.3 
 
 		 376 aa  113  7.000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.034289  normal  0.933214 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6075  glycosyl transferase group 1  24.94 
 
 		 390 aa  113  7.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.353621  normal  0.425913 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3236  glycosyl transferase group 1  26.37 
 
 		 374 aa  112  8.000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0188616  hitchhiker  0.000126621 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2765  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.2 
 
 		 365 aa  112  9e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.367187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3106  glycosyl transferase group 1  26.65 
 
 		 435 aa  112  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3059  glycosyl transferase group 1  32.18 
 
 		 374 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000425383  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  31.67 
 
 		 415 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  26.58 
 
 		 373 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0761  glycosyl transferase group 1  36.81 
 
 		 748 aa  109  6e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0972  glycosyl transferase, group 1  27.64 
 
 		 379 aa  110  6e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.775545  normal  0.23686 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3727  glycosyl transferase group 1  29.76 
 
 		 672 aa  109  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10750  glycosyltransferase  29.77 
 
 		 399 aa  109  9.000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.944872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6048  glycosyl transferase group 1  33.63 
 
 		 439 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0604596 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1373  glycosyl transferase, group 1  33.63 
 
 		 439 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6456  glycosyl transferase, group 1  33.63 
 
 		 439 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.338178  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1977  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.42 
 
 		 443 aa  108  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.26927  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.42 
 
 		 443 aa  108  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.233611  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2262  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.42 
 
 		 495 aa  108  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.333753  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3028  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.42 
 
 		 498 aa  108  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.220926  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5452  glycosyl transferase group 1  33.94 
 
 		 438 aa  108  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  hitchhiker  0.00474748 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0998  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.42 
 
 		 499 aa  108  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3157  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.42 
 
 		 443 aa  108  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1287  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.42 
 
 		 443 aa  108  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1795  phosphoheptose isomerase  31.77 
 
 		 650 aa  107  3e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5179  glycosyl transferase group 1  28.05 
 
 		 378 aa  107  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0894  a-glycosyltransferase  30.17 
 
 		 380 aa  107  4e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00308239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3857  glycosyl transferase group 1  26.3 
 
 		 423 aa  107  4e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.352881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22830  glycosyl transferase group 1  25.19 
 
 		 385 aa  107  4e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5593  glycosyl transferase group 1  27.94 
 
 		 440 aa  107  5e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0302  glycosyltransferase  28.96 
 
 		 383 aa  105  2e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.464413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0171  glycosyl transferase, group 1  28.47 
 
 		 422 aa  104  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6388  glycosyl transferase group 1  33.49 
 
 		 438 aa  105  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.570684  normal  0.371052 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5640  glycosyl transferase, group 1  33.49 
 
 		 438 aa  105  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.172665 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  25.13 
 
 		 395 aa  104  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0839  glycosyl transferase group 1  29.55 
 
 		 395 aa  104  3e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0770239  normal  0.045052 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  31.02 
 
 		 419 aa  103  4e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5045  glycosyl transferase group 1  29.15 
 
 		 422 aa  103  7e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.022612 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02595  glycosyltransferase  24.33 
 
 		 382 aa  102  9e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.157205  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1764  putative glycosyl transferase  29.5 
 
 		 398 aa  102  1e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0831707  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3803  glycosyl transferase group 1  32.14 
 
 		 437 aa  102  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  30.91 
 
 		 378 aa  102  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  29.37 
 
 		 423 aa  102  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4880  glycosyl transferase group 1  32.14 
 
 		 437 aa  102  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.240257  normal  0.0389994 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4959  glycosyl transferase group 1  28.72 
 
 		 399 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2372  glycosyl transferase, group 1  28.05 
 
 		 383 aa  101  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.732911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  29.33 
 
 		 446 aa  101  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  25.93 
 
 		 360 aa  101  2e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  24.28 
 
 		 408 aa  100  3e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3118  glycosyl transferase group 1  24.15 
 
 		 390 aa  100  4e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.353961  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0050  glycosyl transferase  31.58 
 
 		 360 aa  100  4e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000000688339  normal  0.0134291 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4017  glycosyl transferase group 1  27.89 
 
 		 384 aa  100  4e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.174092  normal  0.606388 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0587  glycosyl transferase group 1  26.23 
 
 		 387 aa  100  5e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3845  group 1 glycosyl transferase  29.89 
 
 		 411 aa  100  5e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000452091  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0690  glycosyl transferase, group 1  31.25 
 
 		 393 aa  100  6e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0992271  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0740  putative glycosyl transferase  30.73 
 
 		 442 aa  99.8  8e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.053122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1365  glycosyl transferase group 1  28.04 
 
 		 414 aa  99.4  9e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000226511 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1496  glycosyl transferase, group 1  31.67 
 
 		 364 aa  99.4  9e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.476221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1092  glycosyl transferase group 1  25.93 
 
 		 381 aa  99.4  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  30.54 
 
 		 377 aa  99  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2643  endo-1,4-beta-xylanase  28.32 
 
 		 770 aa  98.2  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.739332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0155  glycosyl transferase, group 1  28.41 
 
 		 361 aa  98.2  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4390  glycosyl transferase, group 1  30.8 
 
 		 419 aa  98.2  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.907942  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0880  glycosyl transferase group 1  36.54 
 
 		 376 aa  98.6  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0960108 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0837  glycosyl transferase, group 1  29.11 
 
 		 379 aa  98.2  2e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.120693  normal  0.126015 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0357  glycosyl transferase, group 1  30.89 
 
 		 375 aa  98.2  2e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50356  glycosyl transferase, group 1  31.28 
 
 		 507 aa  97.4  4e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2082  glycosyl transferase group 1  25.32 
 
 		 378 aa  96.7  6e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02589  Glycosyltransferase  25.52 
 
 		 403 aa  96.3  7e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.147496  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2431  glycosyl transferase, group 1  26.3 
 
 		 364 aa  96.7  7e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.704693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0202  glycosyl transferase, group 1  25.52 
 
 		 369 aa  96.7  7e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0197  glycosyl transferase group 1  27.03 
 
 		 378 aa  96.3  8e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  29.3 
 
 		 410 aa  95.9  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0787  glycosyl transferase group 1  29.54 
 
 		 417 aa  95.9  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>