More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1176 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_1176  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
349 aa  684    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2455  glycosyl transferase group 1  59.52 
 
 
357 aa  317  1e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0769  glycosyl transferase group 1  45.77 
 
 
347 aa  273  2.0000000000000002e-72  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1676  glycosyl transferase, group 1  46.57 
 
 
639 aa  271  1e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8172  glycosyl transferase group 1  42.57 
 
 
356 aa  227  3e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2747  glycosyl transferase group 1  46.43 
 
 
381 aa  226  7e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000175186  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2749  glycosyl transferase group 1  45.34 
 
 
344 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.611394  hitchhiker  0.00344637 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2562  glycosyl transferase, group 1  43.83 
 
 
344 aa  218  1e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.118298 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4662  glycosyl transferase group 1  44.44 
 
 
350 aa  205  8e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0886148  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2314  glycosyl transferase group 1  44.55 
 
 
347 aa  200  3e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.055827  normal  0.292913 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0309  glycosyl transferase, group 1  36.72 
 
 
347 aa  174  1.9999999999999998e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3664  glycosyl transferase, group 1  37.13 
 
 
346 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.032207  normal  0.177473 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0317  glycosyl transferase group 1  39.86 
 
 
343 aa  164  3e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4785  glycosyl transferase group 1  44.44 
 
 
350 aa  162  9e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.195851  normal  0.262442 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4162  glycosyl transferase group 1  38.41 
 
 
347 aa  160  3e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0349192  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1681  glycosyl transferase, group 1  38.02 
 
 
303 aa  157  3e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.456944  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4362  glycosyl transferase, group 1  36.08 
 
 
349 aa  155  1e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0797  glycosyl transferase group 1  33.79 
 
 
360 aa  145  7.0000000000000006e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0763  glycosyl transferase, group 1  33.04 
 
 
337 aa  132  9e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0644  glycosyl transferase, group 1  32.77 
 
 
380 aa  120  3.9999999999999996e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0516  glycosyl transferase group 1  31.15 
 
 
360 aa  100  3e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.192039  normal  0.814109 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2575  glycosyl transferase, group 1  31.97 
 
 
339 aa  97.8  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.561026  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3512  glycosyl transferase group 1  29.09 
 
 
369 aa  97.4  3e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.218401  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0773  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 
457 aa  91.7  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  29.32 
 
 
413 aa  91.3  2e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0542  glycosyl transferase group 1  29.43 
 
 
351 aa  90.5  4e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1751  glycosyl transferase group 1  36.42 
 
 
453 aa  89.7  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1839  glycosyl transferase group 1  37.7 
 
 
362 aa  88.2  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0826  glycosyl transferase group 1  37.17 
 
 
350 aa  87.8  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4579  glycosyl transferase, group 1  33.92 
 
 
398 aa  87.4  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0122865  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3735  glycosyl transferase group 1  30.83 
 
 
355 aa  86.3  8e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0126  glycosyl transferase group 1  34.58 
 
 
371 aa  83.6  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  37.37 
 
 
367 aa  83.6  0.000000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0825  glycosyl transferase group 1  29.28 
 
 
382 aa  83.2  0.000000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2514  glycosyl transferase group 1  38.46 
 
 
351 aa  82.8  0.000000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0260745  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2096  glycosyltransferase  28.63 
 
 
415 aa  82  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  28.63 
 
 
419 aa  82  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1238  glycosyl transferase group 1  28.89 
 
 
349 aa  82  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0206606  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  32.62 
 
 
382 aa  81.3  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0010  glycosyl transferase, group 1  30.28 
 
 
467 aa  80.1  0.00000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.785418  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.28 
 
 
407 aa  79.7  0.00000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.728152  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1091  glycosyl transferase group 1  29.29 
 
 
378 aa  79.7  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5045  glycosyl transferase group 1  28.64 
 
 
422 aa  78.6  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.022612 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2826  glycosyl transferase group 1  37.42 
 
 
426 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.342836 
 
 
-
 
NC_004310  BR1503  lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase LpcC  36.6 
 
 
354 aa  77.8  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4314  glycosyl transferase group 1  32.53 
 
 
370 aa  78.2  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.712653  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4961  glycosyl transferase group 1  35.62 
 
 
396 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1453  lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase LpcC  36.6 
 
 
354 aa  77.8  0.0000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.642429  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7048  putative O-antigen export system permease protein  36.04 
 
 
638 aa  78.2  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1362  glycosyl transferase, group 1  27.07 
 
 
390 aa  77.8  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0392501  normal  0.0175449 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1351  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.12 
 
 
390 aa  77.4  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4604  glycosyl transferase group 1  28.24 
 
 
371 aa  77.8  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000112819  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1960  glycosyl transferase group 1  32.43 
 
 
426 aa  77.8  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000390342  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2139  glycosyl transferase group 1  25.69 
 
 
357 aa  77  0.0000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1851  glycosyl transferase group 1  32.19 
 
 
406 aa  77  0.0000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1443  glycosyl transferase group 1  32.37 
 
 
383 aa  76.6  0.0000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2637  glycosyl transferase, group 1  31.27 
 
 
421 aa  76.6  0.0000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.731543  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1456  glycosyl transferase group 1  33.63 
 
 
384 aa  76.3  0.0000000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.550034  hitchhiker  0.000088456 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5787  glycosyl transferase group 1  29.41 
 
 
415 aa  75.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5102  glycosyl transferase, group 1  29.54 
 
 
408 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  32.95 
 
 
409 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5190  glycosyl transferase, group 1  29.54 
 
 
408 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.370071  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5481  glycosyl transferase, group 1  29.54 
 
 
408 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.931135  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2715  glycosyl transferase group 1  34.11 
 
 
375 aa  75.5  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0012  glycosyl transferase group 1  29.3 
 
 
458 aa  75.1  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3847  glycosyl transferase, group 1  30.7 
 
 
360 aa  74.7  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2265  second mannosyl transferase  26.3 
 
 
336 aa  74.7  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000285845 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3776  glycosyl transferase, group 1  31.19 
 
 
371 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2858  group 1 glycosyl transferase  26.22 
 
 
393 aa  73.9  0.000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0448  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
364 aa  74.3  0.000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.717217 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3241  lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase  37.06 
 
 
349 aa  73.9  0.000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0421  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.81 
 
 
411 aa  73.9  0.000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0822776  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5214  glycosyl transferase group 1  28.5 
 
 
369 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00137382  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0853  glycosyl transferase group 1  30.28 
 
 
393 aa  73.9  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2209  glycosyl transferase group 1  30.54 
 
 
421 aa  73.9  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0688071 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4446  glycosyl transferase, group 1  33.16 
 
 
426 aa  73.6  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.342615  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0276  glycosyl transferase group 1  24.23 
 
 
342 aa  73.2  0.000000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.949437  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1573  glycosyl transferase group 1  29.57 
 
 
420 aa  73.2  0.000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.539919  normal  0.0199703 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3935  glycosyl transferase group 1  28.96 
 
 
367 aa  72.8  0.000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000241521  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  30.31 
 
 
423 aa  72.8  0.000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2854  glycosyl transferase group 1  25.13 
 
 
390 aa  72.8  0.000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3800  glycosyl transferase, group 1  32.93 
 
 
386 aa  72.8  0.000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2367  glycosyl transferase group 1  26.09 
 
 
387 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1661  glycosyl transferase group 1  33.01 
 
 
340 aa  72.4  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.781616  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1891  glycosyl transferase group 1  33.64 
 
 
382 aa  72.4  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3693  glycosyl transferase, group 1  37.93 
 
 
371 aa  72  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.419352 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2316  glycosyl transferase group 1  26.09 
 
 
387 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3411  glycosyl transferase, group 1  35.29 
 
 
425 aa  71.2  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163553  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1972  glycosyl transferase, group 1  33.73 
 
 
415 aa  71.6  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2081  glycosyl transferase group 1  30.13 
 
 
374 aa  72  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0171  glycosyl transferase, group 1  34.21 
 
 
419 aa  71.6  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.7931  normal  0.13729 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2594  glycosyl transferase group 1  25.93 
 
 
421 aa  71.6  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  25.54 
 
 
419 aa  71.6  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  31.14 
 
 
377 aa  71.2  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  34.09 
 
 
370 aa  71.2  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2752  glycosyl transferase group 1  28.16 
 
 
435 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.904634  hitchhiker  0.000312196 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5687  glycosyl transferase, group 1  29.86 
 
 
376 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.519018  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0713  glycosyl transferase, group 1  32.66 
 
 
405 aa  70.9  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0559363  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3565  glycosyl transferase group 1  34.84 
 
 
390 aa  71.2  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2849  glycosyl transferase, group 1  36 
 
 
407 aa  70.9  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.639359  normal  0.534113 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>