More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3664 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3664  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
346 aa  655    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.032207  normal  0.177473 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4362  glycosyl transferase, group 1  59.18 
 
 
349 aa  323  2e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0309  glycosyl transferase, group 1  52.77 
 
 
347 aa  321  9.999999999999999e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4162  glycosyl transferase group 1  54.52 
 
 
347 aa  278  9e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0349192  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4662  glycosyl transferase group 1  46.57 
 
 
350 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0886148  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2314  glycosyl transferase group 1  42.77 
 
 
347 aa  218  8.999999999999998e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.055827  normal  0.292913 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8172  glycosyl transferase group 1  42.17 
 
 
356 aa  211  2e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0769  glycosyl transferase group 1  37.61 
 
 
347 aa  189  9e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1176  glycosyl transferase, group 1  37.43 
 
 
349 aa  186  4e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1676  glycosyl transferase, group 1  37.39 
 
 
639 aa  186  5e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4785  glycosyl transferase group 1  45.56 
 
 
350 aa  176  4e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.195851  normal  0.262442 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2455  glycosyl transferase group 1  41.09 
 
 
357 aa  176  6e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0763  glycosyl transferase, group 1  40.96 
 
 
337 aa  157  4e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2749  glycosyl transferase group 1  39.03 
 
 
344 aa  152  7e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.611394  hitchhiker  0.00344637 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2747  glycosyl transferase group 1  38.03 
 
 
381 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000175186  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2562  glycosyl transferase, group 1  37.73 
 
 
344 aa  144  2e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.118298 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1238  glycosyl transferase group 1  36.6 
 
 
349 aa  136  4e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0206606  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1681  glycosyl transferase, group 1  35.71 
 
 
303 aa  129  7.000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.456944  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0317  glycosyl transferase group 1  34.64 
 
 
343 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2575  glycosyl transferase, group 1  33.92 
 
 
339 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.561026  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0516  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
360 aa  110  4.0000000000000004e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.192039  normal  0.814109 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0644  glycosyl transferase, group 1  35.71 
 
 
380 aa  99.4  9e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0797  glycosyl transferase group 1  31.77 
 
 
360 aa  96.3  8e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3106  glycosyl transferase group 1  28.38 
 
 
435 aa  93.6  5e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3512  glycosyl transferase group 1  27.53 
 
 
369 aa  89.4  8e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.218401  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3090  glycosyl transferase, group 1  34.98 
 
 
440 aa  89.4  8e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2654  glycosyl transferase, group 1  40.23 
 
 
388 aa  89  1e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0179694  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1401  glycosyl transferase group 1  40.15 
 
 
426 aa  89  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.52181  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0205  glycosyl transferase, group 1  43.51 
 
 
454 aa  89  1e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2129  glycosyl transferase, group 1  26.75 
 
 
366 aa  87.8  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.819184  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5510  glycosyl transferase group 1  41.28 
 
 
399 aa  88.2  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.264139  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0569  glycosyl transferase group 1  35.41 
 
 
422 aa  87  4e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1171  glycosyl transferase group 1  35.71 
 
 
366 aa  86.3  8e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.059053 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0506  glycosyl transferase, group 1  36.94 
 
 
425 aa  85.5  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  35.86 
 
 
367 aa  85.5  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0013  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
389 aa  84.3  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.636661  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9217  putative glycosyl transferase, group 1  33.15 
 
 
383 aa  84.7  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0631  glycosyl transferase group 1  37.57 
 
 
394 aa  85.1  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0235  glycosyl transferase group 1  30.93 
 
 
373 aa  84.3  0.000000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.118803 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0330  glycosyl transferase group 1  39.91 
 
 
388 aa  84.3  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0196896  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1191  glycosyl transferase, group 1  29.02 
 
 
384 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  34.75 
 
 
382 aa  84.3  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1096  glycosyl transferase group 1  34.95 
 
 
392 aa  84.3  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.767278  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1839  glycosyl transferase group 1  34.48 
 
 
362 aa  84  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3522  glycosyl transferase group 1  35.38 
 
 
385 aa  84  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.828408  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2777  glycosyl transferase, group 1  40.88 
 
 
382 aa  83.6  0.000000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2150  glycosyl transferase, group 1  34.6 
 
 
397 aa  83.6  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2511  glycosyl transferase group 1  32.22 
 
 
376 aa  83.2  0.000000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.093555  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2721  glycosyl transferase, group 1  37.57 
 
 
364 aa  83.2  0.000000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.134421  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2081  glycosyl transferase group 1  32.79 
 
 
374 aa  82.8  0.000000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11840  glycosyltransferase  37 
 
 
411 aa  82.8  0.000000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.363429  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0348  glycosyl transferase group 1  35.71 
 
 
739 aa  82.8  0.000000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4597  glycosyl transferase group 1  36.72 
 
 
415 aa  82.8  0.000000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.211799  normal  0.982264 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0012  glycosyl transferase group 1  32.18 
 
 
458 aa  82.8  0.000000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0615  glycosyl transferase, group 1  39.26 
 
 
420 aa  82.4  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0722468  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0744  glycosyl transferase, group 1  34.94 
 
 
384 aa  82.4  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.348162  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2671  glycosyl transferase, group 1  31.66 
 
 
408 aa  82  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.990429  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0766  glycosyl transferase group 1  39.26 
 
 
420 aa  82.4  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.676437  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4604  glycosyl transferase group 1  30.42 
 
 
371 aa  82  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000112819  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2433  glycosyl transferase, group 1  31.46 
 
 
417 aa  81.3  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.287149 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3906  glycosyl transferase, group 1  40.74 
 
 
416 aa  81.3  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0901376 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0542  glycosyl transferase group 1  42.63 
 
 
351 aa  82  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2492  glycosyl transferase, group 1  40.88 
 
 
371 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.637644  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2460  glycosyl transferase group 1  35.07 
 
 
443 aa  80.9  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000528788  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0010  glycosyl transferase, group 1  31.32 
 
 
467 aa  80.9  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.785418  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0136  glycosyl transferase, group 1  41.61 
 
 
417 aa  80.9  0.00000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  33.61 
 
 
377 aa  80.5  0.00000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
370 aa  80.5  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4240  glycosyl transferase group 1  38.36 
 
 
418 aa  80.1  0.00000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3727  glycosyl transferase group 1  26.95 
 
 
672 aa  79.7  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121085  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1926  glycosyl transferase group 1  32.22 
 
 
395 aa  79.7  0.00000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00887755  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0773  glycosyl transferase group 1  29.9 
 
 
457 aa  79.7  0.00000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0112  UDP-sugar hydrolase  34.18 
 
 
367 aa  79.3  0.00000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3926  glucosyltransferase  34.83 
 
 
411 aa  79.3  0.00000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  32.52 
 
 
419 aa  79  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3106  glycosyl transferase group 1  31.38 
 
 
382 aa  79  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277853  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2372  glycosyl transferase, group 1  33.48 
 
 
383 aa  79  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.732911  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2139  glycosyl transferase group 1  23.6 
 
 
357 aa  79  0.0000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0407  glycosyl transferase group 1  33.66 
 
 
750 aa  79.3  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5045  glycosyl transferase group 1  27.43 
 
 
422 aa  78.2  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.022612 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11330  glycosyltransferase  35.98 
 
 
403 aa  78.2  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.902273 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4295  glycosyl transferase group 1  33.74 
 
 
416 aa  78.2  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0106355  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1724  group 1 glycosyl transferase  32.28 
 
 
440 aa  78.2  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0814072  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0758  glycosyl transferase group 1  34.65 
 
 
371 aa  78.6  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.11154 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1443  glycosyl transferase group 1  37.84 
 
 
383 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0285  glycosyl transferase group 1  30 
 
 
389 aa  77  0.0000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  31.5 
 
 
379 aa  77  0.0000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1960  glycosyl transferase group 1  30.96 
 
 
426 aa  77  0.0000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000390342  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0713  glycosyl transferase, group 1  35.89 
 
 
405 aa  77  0.0000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0559363  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2457  glycosyl transferase, group 1  31.73 
 
 
386 aa  77  0.0000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1812  glycosyl transferase, group 1  33.74 
 
 
406 aa  77  0.0000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1744  glycosyl transferase group 1  37.5 
 
 
348 aa  76.6  0.0000000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  39.66 
 
 
370 aa  76.6  0.0000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4583  glycosyl transferase group 1  36.54 
 
 
396 aa  76.6  0.0000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4652  glycosyl transferase group 1  31.56 
 
 
396 aa  76.3  0.0000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3565  glycosyl transferase group 1  39.26 
 
 
390 aa  76.3  0.0000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3892  glycosyl transferase group 1  31.55 
 
 
408 aa  76.3  0.0000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0761  glycosyl transferase group 1  32.24 
 
 
748 aa  76.3  0.0000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2953  glycosyl transferase group 1  27.48 
 
 
372 aa  76.3  0.0000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.303965  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1972  glycosyl transferase, group 1  31.36 
 
 
415 aa  76.3  0.0000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>