198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0644 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_0644  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
380 aa  723    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0797  glycosyl transferase group 1  52.51 
 
 
360 aa  313  1.9999999999999998e-84  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2747  glycosyl transferase group 1  39.16 
 
 
381 aa  145  8.000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000175186  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1176  glycosyl transferase, group 1  33.61 
 
 
349 aa  126  5e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2749  glycosyl transferase group 1  36.01 
 
 
344 aa  122  9.999999999999999e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.611394  hitchhiker  0.00344637 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1681  glycosyl transferase, group 1  38.41 
 
 
303 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.456944  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0317  glycosyl transferase group 1  38.72 
 
 
343 aa  117  5e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2562  glycosyl transferase, group 1  35 
 
 
344 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.118298 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0769  glycosyl transferase group 1  30.11 
 
 
347 aa  102  1e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2455  glycosyl transferase group 1  34.8 
 
 
357 aa  100  3e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1676  glycosyl transferase, group 1  28.93 
 
 
639 aa  100  4e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8172  glycosyl transferase group 1  30.18 
 
 
356 aa  97.1  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4662  glycosyl transferase group 1  34.78 
 
 
350 aa  95.5  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0886148  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2314  glycosyl transferase group 1  31.38 
 
 
347 aa  89.7  7e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.055827  normal  0.292913 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3664  glycosyl transferase, group 1  36.12 
 
 
346 aa  89.7  8e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.032207  normal  0.177473 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0309  glycosyl transferase, group 1  32.08 
 
 
347 aa  89.4  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0763  glycosyl transferase, group 1  31.98 
 
 
337 aa  86.3  8e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3512  glycosyl transferase group 1  24.18 
 
 
369 aa  84  0.000000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.218401  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4785  glycosyl transferase group 1  33.56 
 
 
350 aa  79.7  0.00000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.195851  normal  0.262442 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4362  glycosyl transferase, group 1  29.58 
 
 
349 aa  79  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4162  glycosyl transferase group 1  31.1 
 
 
347 aa  75.1  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0349192  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0542  glycosyl transferase group 1  30.43 
 
 
351 aa  70.5  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0825  glycosyl transferase group 1  30.81 
 
 
382 aa  68.6  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2575  glycosyl transferase, group 1  29.79 
 
 
339 aa  63.5  0.000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.561026  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3861  putative glycosyltransferase  37.68 
 
 
398 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.862741 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5790  glycosyl transferase group 1  31.97 
 
 
376 aa  60.1  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0060  glycosyl transferase group 1  33.59 
 
 
656 aa  58.5  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.19162  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6393  glycosyl transferase group 1  34.15 
 
 
391 aa  58.2  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.224471 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0823  glycosyl transferase group 1  36.09 
 
 
380 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1238  glycosyl transferase group 1  31.77 
 
 
349 aa  57  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0206606  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4073  glycosyl transferase group 1  34.21 
 
 
377 aa  56.6  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.728215 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2469  glycosyl transferase group 1  35.34 
 
 
380 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.568723  normal  0.290599 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2858  group 1 glycosyl transferase  26.46 
 
 
393 aa  56.6  0.0000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2492  glycosyl transferase, group 1  31.4 
 
 
371 aa  55.5  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.637644  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2548  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
380 aa  55.8  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.339834  normal  0.873854 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2679  glycosyl transferase group 1  32.26 
 
 
678 aa  54.7  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.341256 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1751  glycosyl transferase group 1  26.94 
 
 
453 aa  53.9  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1001  glycosyl transferase group 1  29.47 
 
 
411 aa  53.9  0.000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4093  glycosyl transferase, group 1  27.11 
 
 
378 aa  53.5  0.000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.12802  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4961  glycosyl transferase group 1  30.08 
 
 
396 aa  53.1  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2372  glycosyl transferase group 1  24.68 
 
 
376 aa  53.1  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00451515  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1389  glycosyl transferase group 1  32.32 
 
 
961 aa  53.1  0.000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3547  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  32.95 
 
 
393 aa  53.1  0.000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2727  glycosyl transferase, group 1  29.65 
 
 
401 aa  53.1  0.000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2128  glycosyl transferase group 1  30.92 
 
 
435 aa  52.8  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.555992 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2052  glycosyl transferase group 1  30.25 
 
 
412 aa  52.4  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000028188  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1362  glycosyl transferase, group 1  27.84 
 
 
390 aa  52  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0392501  normal  0.0175449 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1007  glycosyl transferase group 1  32.26 
 
 
669 aa  51.6  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.192205  normal  0.137378 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  27.57 
 
 
353 aa  51.6  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0734  glycosyl transferase, group 1  32.22 
 
 
471 aa  51.6  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.399263 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4018  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 
381 aa  51.6  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2078  hypothetical protein  30.39 
 
 
500 aa  52  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1063  glycosyl transferase group 1  26.62 
 
 
389 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0481917 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0542  glycosyl transferase group 1  31.54 
 
 
808 aa  51.2  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5586  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.41 
 
 
473 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5634  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.41 
 
 
473 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1590  glycosyl transferase, group 1  30 
 
 
468 aa  50.8  0.00003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00816719  decreased coverage  0.0063014 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1034  glycosyl transferase group 1  26.62 
 
 
389 aa  51.2  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4565  glycosyl transferase group 1  27.05 
 
 
390 aa  50.8  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.736327  normal  0.593461 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4160  hypothetical protein  32.56 
 
 
529 aa  50.8  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0468499  normal  0.187813 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4446  glycosyl transferase, group 1  34.56 
 
 
426 aa  50.8  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.342615  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3522  glycosyl transferase group 1  32.45 
 
 
385 aa  50.8  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.828408  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1817  glycosyl transferase, group 1  39.77 
 
 
385 aa  50.4  0.00005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3893  glycosyl transferase group 1  32.98 
 
 
374 aa  50.4  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1969  glycosyl transferase group 1  27.84 
 
 
372 aa  50.1  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3090  glycosyl transferase, group 1  33.94 
 
 
440 aa  49.7  0.00008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1989  glycosyl transferase group 1  37.11 
 
 
820 aa  48.9  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1760  glycosyl transferase, group 1  32.23 
 
 
349 aa  49.3  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.266862 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0695  UDP-N-acetylglucosamine  31.49 
 
 
431 aa  49.3  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0234  glycosyl transferase group 1  30.74 
 
 
385 aa  49.3  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6932  glycosyl transferase group 1  27.1 
 
 
1233 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0899413 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.26 
 
 
407 aa  48.5  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.728152  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2469  glycosyl transferase group 1  28.08 
 
 
537 aa  48.5  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3906  glycosyl transferase, group 1  28.5 
 
 
416 aa  48.1  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0901376 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7224  glycosyl transferase group 1  35.85 
 
 
383 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.175027  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2583  glycosyl transferase group 1  35.16 
 
 
361 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.491975 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2688  glycosyl transferase group 1  27.16 
 
 
387 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.504834  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1898  glycosyl transferase group 1  43.75 
 
 
416 aa  48.5  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24550  hypothetical protein  30.22 
 
 
507 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1812  glycosyl transferase, group 1  29.24 
 
 
406 aa  47.8  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0179  glycosyl transferase group 1  33.96 
 
 
390 aa  47.8  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0604  glycosyl transferase group 1  37.97 
 
 
819 aa  48.1  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2909  glycosyl transferase group 1  30.83 
 
 
568 aa  47.4  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2096  glycosyltransferase  31.25 
 
 
415 aa  47.4  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4972  glycosyl transferase group 1  31.82 
 
 
365 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2981  glycosyl transferase, group 1  26.59 
 
 
570 aa  47.4  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.791461  normal  0.930626 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3009  glycosyl transferase, group 1  26.36 
 
 
743 aa  47  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.188402  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0392  glycosyl transferase group 1  30.43 
 
 
375 aa  47  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2076  glycosyl transferase group 1  31.3 
 
 
540 aa  47.4  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.323693  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0869  a-glycosyltransferase  38.36 
 
 
358 aa  46.6  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.746857  normal  0.684774 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6507  glycosyl transferase group 1  27.59 
 
 
356 aa  47  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2186  glycosyl transferase group 1  26.03 
 
 
378 aa  47  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1408  glycosyl transferase family protein  31.15 
 
 
930 aa  46.6  0.0007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.370987  normal  0.266781 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2773  glycosyl transferase, group 1  38.24 
 
 
430 aa  46.6  0.0008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3222  glycosyl transferase, group 1  26.46 
 
 
365 aa  46.2  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0374  glycosyltransferase  22.68 
 
 
351 aa  45.8  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3447  group 1 glycosyl transferase  30.33 
 
 
395 aa  45.8  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0201  hypothetical protein  27.2 
 
 
935 aa  45.8  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3774  glycosyl transferase group 1  45.76 
 
 
390 aa  46.2  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.872783  normal  0.105154 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0798  glycosyl transferase group 1  31.5 
 
 
396 aa  45.4  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.607654  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>