More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3893 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_3893  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
374 aa  774    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0894  a-glycosyltransferase  38.62 
 
 
380 aa  236  7e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00308239  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2431  glycosyl transferase, group 1  30 
 
 
364 aa  152  8e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.704693  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4959  glycosyl transferase group 1  33.71 
 
 
399 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0197  glycosyl transferase group 1  30.69 
 
 
378 aa  136  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3445  glycosyl transferase, group 1  30.18 
 
 
389 aa  135  9e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.129839  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0192  glycosyl transferase group 1  30.69 
 
 
378 aa  135  9e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.480032  normal  0.0682367 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1540  group 1 glycosyl transferase  28.57 
 
 
378 aa  133  5e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.213513  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1135  glycosyl transferase, group 1  28.2 
 
 
380 aa  127  3e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.683403  hitchhiker  0.00885425 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0984  glycosyl transferase group 1  29.48 
 
 
403 aa  122  8e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0137415 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2773  glycosyl transferase group 1  25.93 
 
 
385 aa  117  3e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.576476 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1473  hypothetical protein  27.65 
 
 
383 aa  109  7.000000000000001e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.574733  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1803  glycosyl transferase, group 1  32.04 
 
 
409 aa  97.4  4e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3091  glycosyl transferase, group 1  30.43 
 
 
770 aa  93.2  7e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.278852  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  32.88 
 
 
387 aa  92  2e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0285  glycosyl transferase group 1  28.28 
 
 
389 aa  89.7  8e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3285  glycosyl transferase, group 1  24.66 
 
 
375 aa  89  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.254091  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3347  glycosyl transferase, group 1  24.66 
 
 
375 aa  89  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0957138  normal  0.0861917 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3296  glycosyl transferase, group 1  25.63 
 
 
375 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.229381 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2747  glycosyl transferase group 1  27.78 
 
 
381 aa  88.2  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000175186  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0516  glycosyl transferase group 1  27.43 
 
 
360 aa  84  0.000000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.192039  normal  0.814109 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22800  glycosyl transferase group 1  23.95 
 
 
359 aa  83.6  0.000000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3106  glycosyl transferase group 1  26.86 
 
 
382 aa  81.6  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277853  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3550  glycosyl transferase, group 1  28.87 
 
 
378 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.750733 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3098  glycosyl transferase, group 1  28.34 
 
 
376 aa  80.9  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.034289  normal  0.933214 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2961  glycosyl transferase, group 1  27.62 
 
 
382 aa  81.3  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.197137  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3282  glycosyl transferase, group 1  28.42 
 
 
377 aa  79.7  0.00000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3059  glycosyl transferase group 1  30.82 
 
 
374 aa  79.3  0.00000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000425383  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4579  glycosyl transferase, group 1  34.25 
 
 
398 aa  79.3  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0122865  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3514  glycosyl transferase group 1  28.41 
 
 
376 aa  79.3  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00713418 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2681  glycosyl transferase group 1  27.88 
 
 
376 aa  79.3  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0234  glycosyl transferase group 1  33.53 
 
 
385 aa  79  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4495  glycosyl transferase group 1  30.41 
 
 
394 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1373  glycosyl transferase group 1  22.13 
 
 
689 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.167388  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1819  glycosyl transferase group 1  30.57 
 
 
373 aa  78.6  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103327  normal  0.199615 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  28.9 
 
 
424 aa  77.4  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0377  glycosyl transferase group 1  29.25 
 
 
404 aa  77.4  0.0000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000391271  normal  0.137742 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1382  glycosyl transferase group 1  26.21 
 
 
376 aa  77  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0731677  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2962  glycosyl transferase, group 1  29.52 
 
 
409 aa  77  0.0000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.355294  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4876  glycosyl transferase group 1  29.27 
 
 
370 aa  77  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.756058  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10750  glycosyltransferase  28.83 
 
 
399 aa  77  0.0000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.944872  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0587  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
387 aa  76.6  0.0000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0792  glycosyl transferase group 1  27.76 
 
 
375 aa  76.6  0.0000000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17190  glycosyl transferase group 1  27.14 
 
 
387 aa  76.6  0.0000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0244  glycosyl transferase, group 1  30 
 
 
393 aa  76.6  0.0000000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.270247 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0737  glycosyl transferase-like  30.05 
 
 
382 aa  76.3  0.0000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12216  hypothetical protein  30.11 
 
 
385 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2671  glycosyl transferase, group 1  26.64 
 
 
408 aa  75.9  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.990429  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0986  glycosyl transferase group 1  29.85 
 
 
429 aa  75.5  0.000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.32714  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1456  glycosyl transferase group 1  31.28 
 
 
384 aa  75.1  0.000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.550034  hitchhiker  0.000088456 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0044  glycosyltransferase  34.27 
 
 
353 aa  74.7  0.000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3522  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 
385 aa  75.5  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.828408  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1509  glycosyl transferase, group 1  30.99 
 
 
425 aa  74.7  0.000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6075  glycosyl transferase group 1  28.76 
 
 
390 aa  74.3  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.353621  normal  0.425913 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0199  glycosyl transferase group 1  29.05 
 
 
394 aa  74.3  0.000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00799925  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0126  glycosyl transferase group 1  31.71 
 
 
371 aa  74.3  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0826  glycosyl transferase group 1  28.63 
 
 
350 aa  74.3  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4446  glycosyl transferase, group 1  27.17 
 
 
426 aa  73.9  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.342615  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0302  glycosyltransferase  26.59 
 
 
383 aa  73.9  0.000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.464413  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0769  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
347 aa  73.9  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  27.01 
 
 
389 aa  74.3  0.000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  27.53 
 
 
392 aa  73.9  0.000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4652  glycosyl transferase group 1  26.67 
 
 
396 aa  73.6  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2965  hypothetical protein  25.83 
 
 
342 aa  73.2  0.000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8172  glycosyl transferase group 1  31.68 
 
 
356 aa  73.6  0.000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  28.5 
 
 
413 aa  73.2  0.000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0470  glycosyl transferase group 1  28.14 
 
 
456 aa  73.2  0.000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1091  glycosyl transferase group 1  28.16 
 
 
378 aa  73.2  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1683  glycosyl transferase, group 1  29.28 
 
 
385 aa  72.8  0.000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  26.64 
 
 
370 aa  72.8  0.000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2815  hypothetical protein  22.78 
 
 
341 aa  72.4  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0838  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.5 
 
 
419 aa  72.8  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0880  glycosyl transferase group 1  25.66 
 
 
376 aa  72  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0960108 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0136  glycosyl transferase, group 1  30.33 
 
 
417 aa  72.8  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3357  glycosyl transferase group 1  29 
 
 
437 aa  72.8  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2150  glycosyl transferase, group 1  25.22 
 
 
397 aa  72  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1682  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.37 
 
 
420 aa  71.6  0.00000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.961392 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  29 
 
 
415 aa  71.6  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4162  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 
347 aa  71.6  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0349192  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  27.94 
 
 
353 aa  71.6  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0972  glycosyl transferase, group 1  29.61 
 
 
379 aa  72  0.00000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.775545  normal  0.23686 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1492  glycosyl transferase, group 1  28.8 
 
 
395 aa  71.2  0.00000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3047  glycosyl transferase group 1  30.88 
 
 
374 aa  72  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.284334  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2765  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.44 
 
 
365 aa  71.6  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.367187  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1392  ABC transporter related  26.92 
 
 
654 aa  71.6  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.760197  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  26 
 
 
394 aa  72  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2645  glycosyl transferase, group 1  33.99 
 
 
369 aa  71.2  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.490098  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  28.49 
 
 
423 aa  71.2  0.00000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0846  glycosyl transferase, group 1  29.09 
 
 
405 aa  71.2  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.87203  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0941  glycosyl transferase group 1  28.18 
 
 
325 aa  71.2  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.018842  normal  0.494408 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01302  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.45 
 
 
359 aa  71.2  0.00000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.378301  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0354  glycosyl transferase group 1  26.7 
 
 
402 aa  71.2  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000079613  normal  0.480518 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  32.54 
 
 
367 aa  70.9  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0431  glycosyl transferase group 1  27.3 
 
 
380 aa  70.9  0.00000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.16111  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4438  glycosyl transferase, group 1  23.62 
 
 
370 aa  70.9  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.356751  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4083  glycosyl transferase group 1  26.67 
 
 
399 aa  70.5  0.00000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31920  UDP-N-acetylglucosamine: 1L-myo-inositol-1-phosphate 1-alpha-D-N-acetylglucosaminyltransferase  26.91 
 
 
420 aa  70.5  0.00000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3301  glycosyl transferase, group 1  28.18 
 
 
422 aa  70.1  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.758108  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2514  glycosyl transferase group 1  30.05 
 
 
351 aa  70.1  0.00000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0260745  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0900  glycosyl transferase group 1  27.8 
 
 
381 aa  70.1  0.00000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>