More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7224 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_7224  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
383 aa  727    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.175027  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6472  glycosyl transferase group 1  79.89 
 
 
374 aa  429  1e-119  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.251363  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4585  glycosyl transferase group 1  41.83 
 
 
365 aa  253  5.000000000000001e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5959  glycosyl transferase group 1  47.06 
 
 
364 aa  246  4e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0411689 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3690  glycosyl transferase, group 1  46.3 
 
 
369 aa  237  2e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.633764 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7103  glycosyl transferase group 1  45 
 
 
362 aa  227  3e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.683895  normal  0.803622 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0229  glycosyl transferase, group 1  41.82 
 
 
476 aa  210  3e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3935  glycosyltransferase  43.73 
 
 
366 aa  204  3e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0737  glycosyl transferase-like  34.85 
 
 
382 aa  158  2e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3907  glycosyl transferase, group 1  33.42 
 
 
370 aa  143  4e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.086745 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0358  glycosyl transferase group 1  33.23 
 
 
373 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0579  sulfolipid sulfoquinovosyldiacylglycerol biosynthesis protein  44.54 
 
 
377 aa  92.4  1e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  0.138904 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8172  glycosyl transferase group 1  39.41 
 
 
356 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0432  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.58 
 
 
459 aa  86.7  6e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.568874  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0375  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.58 
 
 
462 aa  86.7  6e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1480  glycosyl transferase, group 1:PHP-like  35.24 
 
 
803 aa  83.2  0.000000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.117248 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3384  glycosyl transferase group 1  33.96 
 
 
410 aa  83.2  0.000000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.320283  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5565  glycosyl transferase group 1  36.76 
 
 
810 aa  82  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.896864 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3140  glycosyl transferase group 1  42.74 
 
 
381 aa  80.9  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1586  glycosyl transferase, group 1  27.69 
 
 
355 aa  79.7  0.00000000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.381696  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1668  glycogen synthase  45.3 
 
 
411 aa  79  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00501  SqdX  36.24 
 
 
381 aa  79  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  39.08 
 
 
367 aa  78.2  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0604  glycosyl transferase group 1  37.41 
 
 
819 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0761  glycosyl transferase group 1  40 
 
 
748 aa  78.6  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  47.42 
 
 
373 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1681  glycosyl transferase, group 1  40.22 
 
 
303 aa  77.8  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.456944  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1843  glycosyl transferase group 1  43.48 
 
 
396 aa  77.4  0.0000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  41.13 
 
 
370 aa  77.4  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5245  glycosyl transferase, group 1  36.6 
 
 
410 aa  77  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.844139 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18561  SqdX  32.77 
 
 
377 aa  77.4  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.330873  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4643  glycosyl transferase group 1  35.21 
 
 
376 aa  77  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000017343  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2339  glycosyl transferase, group 1  39.39 
 
 
381 aa  76.6  0.0000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0051  SqdX  39.72 
 
 
381 aa  76.6  0.0000000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2884  glycosyl transferase group 1  38.56 
 
 
417 aa  76.3  0.0000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2502  glycosyl transferase group 1  37.5 
 
 
377 aa  75.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.861736 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3612  glycosyl transferase group 1  37.5 
 
 
377 aa  76.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4916  glycosyl transferase group 1  40.15 
 
 
377 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559859 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1424  glycosyl transferase group 1  35.71 
 
 
440 aa  75.5  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2826  glycosyl transferase group 1  38.65 
 
 
426 aa  76.3  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.342836 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0048  SqdX  38.57 
 
 
382 aa  75.1  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2976  glycosyl transferase group 1  37.34 
 
 
417 aa  75.1  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.82983  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21361  SqdX  34.75 
 
 
382 aa  75.1  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4898  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.14 
 
 
380 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1265  SqdX  34.75 
 
 
382 aa  74.3  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2081  glycosyl transferase group 1  33.5 
 
 
374 aa  74.7  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0399  glycosyl transferase, group 1  36.57 
 
 
377 aa  74.3  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17931  SqdX  33.57 
 
 
382 aa  74.7  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.335649  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4495  glycosyl transferase family protein  32.14 
 
 
380 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0506  glycosyl transferase, group 1  31.46 
 
 
425 aa  73.9  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2502  glycosyl transferase, group 1  38.41 
 
 
387 aa  73.6  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.417702 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18751  SqdX  30.89 
 
 
377 aa  73.6  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0758  glycosyl transferase group 1  37.61 
 
 
371 aa  73.6  0.000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.11154 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2688  glycosyl transferase group 1  36.11 
 
 
387 aa  73.6  0.000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.504834  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3085  glycosyl transferase group 1  32.97 
 
 
409 aa  73.2  0.000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18561  SqdX  30.89 
 
 
373 aa  73.2  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.213199  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1758  SqdX  30.89 
 
 
377 aa  73.2  0.000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4589  glycosyl transferase group 1  28.49 
 
 
381 aa  73.2  0.000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3917  glycosyl transferase group 1  31.09 
 
 
380 aa  72.8  0.000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1501  glycosyl transferase, group 1  31.44 
 
 
412 aa  72.8  0.000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1839  glycosyl transferase group 1  38.15 
 
 
362 aa  72.8  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5675  glycosyl transferase group 1  33.52 
 
 
388 aa  72.4  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.333063 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2213  glycosyl transferase group 1  35.57 
 
 
395 aa  72.4  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4662  glycosyl transferase group 1  38.93 
 
 
350 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0886148  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50356  glycosyl transferase, group 1  35.77 
 
 
507 aa  72.4  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1068  glycosyl transferase group 1  32.97 
 
 
658 aa  72.4  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.114697  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4881  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.3 
 
 
380 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0368  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.2 
 
 
380 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.31592  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0675  glycosyl transferase, group 1  34 
 
 
376 aa  72  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.102281  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2328  glycosyl transferase group 1  37.08 
 
 
871 aa  71.6  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2376  glycosyl transferase group 1  40.38 
 
 
372 aa  71.6  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4907  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.43 
 
 
380 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.957632  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7048  putative O-antigen export system permease protein  39.71 
 
 
638 aa  71.2  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0142  glycosyl transferase, group 1  34.92 
 
 
404 aa  70.9  0.00000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5192  glycosyl transferase group 1  37.04 
 
 
404 aa  70.9  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0826  glycosyl transferase group 1  37.75 
 
 
350 aa  70.5  0.00000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4513  glycosyl transferase family protein  30.53 
 
 
380 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2278  glycosyl transferase, group 1  30.28 
 
 
369 aa  70.5  0.00000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0724331  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0498  glycosyl transferase group 1  32.21 
 
 
378 aa  70.5  0.00000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4872  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.53 
 
 
380 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2314  glycosyl transferase group 1  39.74 
 
 
347 aa  70.1  0.00000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.055827  normal  0.292913 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2869  glycosyl transferase, group 1  34.83 
 
 
816 aa  70.1  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.541026 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2602  glycosyl transferase, group 1  30.89 
 
 
812 aa  70.1  0.00000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1089  glycosyl transferase group 1  24.82 
 
 
355 aa  70.1  0.00000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.221071  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5160  glycosyl transferase group 1  40 
 
 
800 aa  70.1  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.170469  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2152  glycosyl transferase, group 1  32.14 
 
 
387 aa  70.1  0.00000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0552  glycosyl transferase  27.97 
 
 
383 aa  69.7  0.00000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.219482 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1176  glycosyl transferase, group 1  37.65 
 
 
349 aa  69.7  0.00000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1748  glycosyl transferase group 1  34.92 
 
 
402 aa  69.3  0.00000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0115341 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2121  glycosyl transferase group 1  33.06 
 
 
375 aa  69.3  0.00000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1723  glycosyl transferase, group 1  26.07 
 
 
380 aa  69.3  0.00000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.952593  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2562  glycosyl transferase, group 1  41.06 
 
 
344 aa  68.9  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.118298 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0126  glycosyl transferase group 1  37.93 
 
 
371 aa  69.3  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0542  glycosyl transferase group 1  40.48 
 
 
351 aa  68.9  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1259  glycosyl transferase group 1  32.6 
 
 
457 aa  69.3  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00525262  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  28 
 
 
414 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1507  glycosyl transferase group 1  38.24 
 
 
395 aa  68.2  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.255833 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3682  glycosyl transferase group 1  38.36 
 
 
368 aa  68.2  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.558213  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3613  glycosyl transferase domain-containing protein  30.33 
 
 
816 aa  68.2  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.103069  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1433  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.04 
 
 
409 aa  68.2  0.0000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.985375  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>