More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6472 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_6472  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 374 aa  696    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.251363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7224  glycosyl transferase group 1  79.82 
 
 		 383 aa  429  1e-119  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.175027  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4585  glycosyl transferase group 1  46.15 
 
 		 365 aa  266  4e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5959  glycosyl transferase group 1  47.9 
 
 		 364 aa  232  9e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0411689 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3690  glycosyl transferase, group 1  46.49 
 
 		 369 aa  226  4e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.633764 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7103  glycosyl transferase group 1  46.69 
 
 		 362 aa  219  7.999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.683895  normal  0.803622 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0229  glycosyl transferase, group 1  42.48 
 
 		 476 aa  218  1e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3935  glycosyltransferase  45.51 
 
 		 366 aa  198  1.0000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0737  glycosyl transferase-like  35.37 
 
 		 382 aa  161  2e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3907  glycosyl transferase, group 1  36.22 
 
 		 370 aa  145  9e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.086745 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0358  glycosyl transferase group 1  33.73 
 
 		 373 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8172  glycosyl transferase group 1  39.11 
 
 		 356 aa  87.8  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0432  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.58 
 
 		 459 aa  85.9  0.000000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.568874  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0375  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.58 
 
 		 462 aa  85.9  0.000000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0579  sulfolipid sulfoquinovosyldiacylglycerol biosynthesis protein  41.18 
 
 		 377 aa  84  0.000000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  0.138904 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0368  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.59 
 
 		 380 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.31592  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4495  glycosyl transferase family protein  30.87 
 
 		 380 aa  82  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4898  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.87 
 
 		 380 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18561  SqdX  33.05 
 
 		 377 aa  82  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.330873  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3384  glycosyl transferase group 1  34.38 
 
 		 410 aa  80.5  0.00000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.320283  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4881  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.2 
 
 		 380 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1480  glycosyl transferase, group 1:PHP-like  35.16 
 
 		 803 aa  79.7  0.00000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.117248 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4907  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.86 
 
 		 380 aa  79.3  0.00000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.957632  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4872  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.2 
 
 		 380 aa  79.3  0.00000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7048  putative O-antigen export system permease protein  40.28 
 
 		 638 aa  79.3  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4589  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 		 381 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4513  glycosyl transferase family protein  29.53 
 
 		 380 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1989  glycosyl transferase group 1  35.95 
 
 		 820 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3140  glycosyl transferase group 1  42.42 
 
 		 381 aa  77.4  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  42.36 
 
 		 370 aa  77.8  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1668  glycogen synthase  45.3 
 
 		 411 aa  77.4  0.0000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2976  glycosyl transferase group 1  36.26 
 
 		 417 aa  77  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.82983  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2152  glycosyl transferase, group 1  34.29 
 
 		 387 aa  77  0.0000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0580  glycosyl transferase, group 1  42.28 
 
 		 417 aa  77  0.0000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1681  glycosyl transferase, group 1  41.71 
 
 		 303 aa  77  0.0000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.456944  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18751  SqdX  31.36 
 
 		 377 aa  77  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0773  glycosyl transferase group 1  38.69 
 
 		 457 aa  76.6  0.0000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2869  glycosyl transferase, group 1  33.17 
 
 		 816 aa  76.6  0.0000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.541026 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1758  SqdX  31.36 
 
 		 377 aa  76.6  0.0000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18561  SqdX  31.36 
 
 		 373 aa  76.6  0.0000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.213199  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4657  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.86 
 
 		 380 aa  76.3  0.0000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2884  glycosyl transferase group 1  37.74 
 
 		 417 aa  76.3  0.0000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5012  group 1 family glycosyl transferase  28.86 
 
 		 380 aa  76.3  0.0000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0604  glycosyl transferase group 1  35.97 
 
 		 819 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2826  glycosyl transferase group 1  40.62 
 
 		 426 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.342836 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1723  glycosyl transferase, group 1  24.46 
 
 		 380 aa  74.7  0.000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.952593  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  41.36 
 
 		 367 aa  74.7  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1265  SqdX  35.21 
 
 		 382 aa  74.3  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21361  SqdX  35.21 
 
 		 382 aa  74.7  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0051  SqdX  38.03 
 
 		 381 aa  73.9  0.000000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2328  glycosyl transferase group 1  41.8 
 
 		 871 aa  73.6  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5565  glycosyl transferase group 1  36.64 
 
 		 810 aa  73.6  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.896864 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  45.83 
 
 		 373 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0761  glycosyl transferase group 1  36.43 
 
 		 748 aa  73.6  0.000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17931  SqdX  32.86 
 
 		 382 aa  72.8  0.000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.335649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0048  SqdX  36.88 
 
 		 382 aa  72.8  0.000000000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1424  glycosyl transferase group 1  39.86 
 
 		 440 aa  72.8  0.000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1306  glycosyl transferase group 1  23.56 
 
 		 355 aa  72.8  0.000000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00501  SqdX  34.44 
 
 		 381 aa  72.8  0.000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1839  glycosyl transferase group 1  41.61 
 
 		 362 aa  72.8  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2213  glycosyl transferase group 1  35.71 
 
 		 395 aa  72  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2376  glycosyl transferase group 1  41.51 
 
 		 372 aa  71.6  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2606  glycosyl transferase group 1  43.64 
 
 		 398 aa  71.6  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1843  glycosyl transferase group 1  34.88 
 
 		 396 aa  71.6  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1586  glycosyl transferase, group 1  23.08 
 
 		 355 aa  71.6  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.381696  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4643  glycosyl transferase group 1  34.21 
 
 		 376 aa  71.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000017343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0965  glycosyl transferase, group 1  36.52 
 
 		 398 aa  70.9  0.00000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.699884  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2903  glycosyl transferase, group 1  33.13 
 
 		 827 aa  70.9  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0301322 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2339  glycosyl transferase, group 1  41.88 
 
 		 381 aa  71.2  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0413  glycosyl transferase, group 1  30.05 
 
 		 386 aa  70.9  0.00000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.818994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2314  glycosyl transferase group 1  37.58 
 
 		 347 aa  70.5  0.00000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.055827  normal  0.292913 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11160  glycosyl transferase group 1  32.77 
 
 		 383 aa  70.1  0.00000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0879  glycosyl transferase, group 1  43.48 
 
 		 393 aa  70.1  0.00000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.418877  normal  0.357161 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1259  glycosyl transferase group 1  28.24 
 
 		 457 aa  70.1  0.00000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00525262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6757  UDP-N-acetylglucosamine  41.23 
 
 		 417 aa  69.7  0.00000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0758  glycosyl transferase group 1  29.06 
 
 		 371 aa  69.7  0.00000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.11154 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5245  glycosyl transferase, group 1  30.64 
 
 		 410 aa  69.7  0.00000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844139 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0357  glycosyl transferase, group 1  32.41 
 
 		 375 aa  69.7  0.00000000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4579  glycosyl transferase, group 1  34.62 
 
 		 398 aa  69.3  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0122865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0506  glycosyl transferase, group 1  31.46 
 
 		 425 aa  69.3  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0857  glycosyl transferase group 1  24.46 
 
 		 355 aa  68.9  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.123894  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2502  glycosyl transferase, group 1  35.46 
 
 		 387 aa  68.9  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417702 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4916  glycosyl transferase group 1  36.5 
 
 		 377 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559859 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0399  glycosyl transferase, group 1  36.5 
 
 		 377 aa  68.9  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  25 
 
 		 415 aa  68.9  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2562  glycosyl transferase, group 1  37.1 
 
 		 344 aa  68.9  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.118298 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2602  glycosyl transferase, group 1  35.92 
 
 		 812 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1176  glycosyl transferase, group 1  36.31 
 
 		 349 aa  68.6  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2161  glycosyl transferase group 1  40.17 
 
 		 377 aa  68.2  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00492248 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3917  glycosyl transferase group 1  30.98 
 
 		 380 aa  68.6  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2688  glycosyl transferase group 1  34.03 
 
 		 387 aa  68.6  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.504834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5302  glycosyl transferase group 1  45 
 
 		 351 aa  68.2  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3612  glycosyl transferase group 1  35.04 
 
 		 377 aa  67.8  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1382  glycosyl transferase group 1  32.99 
 
 		 376 aa  67.8  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0731677  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0790  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  38.02 
 
 		 400 aa  67.8  0.0000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000379704 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2900  glycosyl transferase, group 1  40.34 
 
 		 421 aa  67.8  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2502  glycosyl transferase group 1  35.04 
 
 		 377 aa  68.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.861736 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5192  glycosyl transferase group 1  36.11 
 
 		 404 aa  67.4  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50356  glycosyl transferase, group 1  33.58 
 
 		 507 aa  67.4  0.0000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2081  glycosyl transferase group 1  30.27 
 
 		 374 aa  67.4  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>