More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_7103 on replicon NC_012858
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012858  Rleg_7103  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
362 aa  719    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.683895  normal  0.803622 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5959  glycosyl transferase group 1  83.7 
 
 
364 aa  580  1e-164  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0411689 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4585  glycosyl transferase group 1  54.34 
 
 
365 aa  360  2e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3935  glycosyltransferase  55.21 
 
 
366 aa  324  1e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0229  glycosyl transferase, group 1  41.62 
 
 
476 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3690  glycosyl transferase, group 1  39.59 
 
 
369 aa  199  6e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.633764 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7224  glycosyl transferase group 1  45.43 
 
 
383 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.175027  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6472  glycosyl transferase group 1  45.31 
 
 
374 aa  188  1e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.251363  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3907  glycosyl transferase, group 1  33.24 
 
 
370 aa  154  2e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.086745 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0737  glycosyl transferase-like  31.61 
 
 
382 aa  137  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0358  glycosyl transferase group 1  34.3 
 
 
373 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2715  glycosyl transferase group 1  41.86 
 
 
421 aa  93.6  4e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.770455 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2072  glycosyl transferase group 1  32.93 
 
 
374 aa  90.9  3e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  36.65 
 
 
378 aa  90.5  4e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1099  glycosyl transferase, group 1  35.48 
 
 
380 aa  90.1  6e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.209796  normal  0.0258816 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  29.33 
 
 
409 aa  86.3  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  29.44 
 
 
373 aa  85.9  9e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3180  glycosyl transferase, group 1  24.71 
 
 
409 aa  84  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.780891  normal  0.107104 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2479  glycosyl transferase group 1  24.72 
 
 
380 aa  78.6  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0145757  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2669  glycosyl transferase, group 1  38.84 
 
 
404 aa  77.8  0.0000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2963  glycosyl transferase group 1  34.81 
 
 
383 aa  77.4  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.160992  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2808  glycosyl transferase group 1  34.29 
 
 
424 aa  77  0.0000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0825  glycosyl transferase group 1  35.56 
 
 
382 aa  76.6  0.0000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2253  glycosyl transferase, group 1  37.42 
 
 
413 aa  76.6  0.0000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.790793 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1201  WbwZ  30.38 
 
 
369 aa  76.3  0.0000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3213  glycosyl transferase group 1  34.44 
 
 
383 aa  75.5  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1507  glycosyl transferase group 1  34.23 
 
 
395 aa  75.5  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.255833 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2105  glycosyl transferase group 1  34.68 
 
 
371 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.352856  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1276  glycosyl transferase group 1  27.41 
 
 
378 aa  75.9  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.680838  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3883  glycosyl transferase group 1  33.96 
 
 
395 aa  75.9  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3696  glycosyl transferase group 1  32.49 
 
 
394 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.651098  normal  0.816575 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0090  glycosyl transferase, group 1  38.52 
 
 
378 aa  74.7  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.22562 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1294  glycosyl transferase  31.67 
 
 
379 aa  75.1  0.000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4535  glycosyl transferase, group 1  32.49 
 
 
394 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0532155  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3828  glycosyl transferase, group 1  32.49 
 
 
394 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.146208  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  40.98 
 
 
399 aa  75.1  0.000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2213  glycosyl transferase group 1  34.97 
 
 
395 aa  75.1  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0552  glycosyl transferase  32.39 
 
 
383 aa  74.3  0.000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.219482 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  37.93 
 
 
389 aa  74.3  0.000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  33.91 
 
 
370 aa  73.9  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0511  glycosyl transferase group 1  29.73 
 
 
381 aa  73.9  0.000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18751  SqdX  29.6 
 
 
377 aa  73.6  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1821  glycosyl transferase group 1  29.61 
 
 
380 aa  73.2  0.000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.500985 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2152  glycosyl transferase family protein  36.18 
 
 
371 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.540294  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18561  SqdX  29.6 
 
 
373 aa  73.2  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.213199  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  25.21 
 
 
414 aa  73.2  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3484  glycosyl transferase group 1  27.24 
 
 
379 aa  72.8  0.000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0321  glycosyl transferase group 1  39.73 
 
 
388 aa  72.8  0.000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1989  glycosyl transferase group 1  35 
 
 
820 aa  72.8  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2591  glycosyl transferase, group 1  27.41 
 
 
373 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2268  glycosyl transferase, group 1  30.69 
 
 
394 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459114  normal  0.160076 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1068  glycosyl transferase group 1  30.94 
 
 
658 aa  71.6  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.114697  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  31.69 
 
 
360 aa  70.9  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2134  glycosyl transferase group 1  32 
 
 
370 aa  71.2  0.00000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.873369  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0249  glycosyl transferase group 1  32.43 
 
 
387 aa  70.9  0.00000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000132776  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2495  glycosyl transferase group 1  31.75 
 
 
392 aa  70.5  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.402405  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1758  SqdX  28.8 
 
 
377 aa  70.5  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3754  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.11 
 
 
381 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2177  putative glycosyl transferase  33.13 
 
 
385 aa  70.1  0.00000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.010709  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1131  glycosyl transferase group 1  32.19 
 
 
904 aa  70.1  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.845699  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1591  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.11 
 
 
381 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11043  glycosyltransferase  24.54 
 
 
377 aa  70.1  0.00000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.265999  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1629  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.11 
 
 
381 aa  70.1  0.00000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.170146 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1445  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.11 
 
 
381 aa  70.1  0.00000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1417  glycosyltransferase  29.11 
 
 
381 aa  70.1  0.00000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1418  glycosyltransferase  29.11 
 
 
381 aa  70.1  0.00000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2409  glycosyl transferase group 1  37.68 
 
 
660 aa  70.1  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.360311  normal  0.103606 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1558  group 1 family glycosyl transferase  29.11 
 
 
381 aa  70.1  0.00000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2758  glycosyl transferase group 1  37.9 
 
 
356 aa  70.1  0.00000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0673851  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  39.67 
 
 
398 aa  70.1  0.00000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1702  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.11 
 
 
381 aa  69.7  0.00000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0208519  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0126  glycosyl transferase group 1  38.84 
 
 
371 aa  69.7  0.00000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18561  SqdX  28.8 
 
 
377 aa  69.3  0.00000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.330873  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0155  glycosyl transferase, group 1  38.33 
 
 
361 aa  68.9  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1964  glycosyl transferase group 1  30.72 
 
 
385 aa  69.3  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0014923 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1907  glycosyl transferase, group 1  40.94 
 
 
426 aa  68.9  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.278952  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2717  glycosyl transferase, group 1  37.66 
 
 
389 aa  69.3  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114307  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0012  a-glycosyltransferase  27.07 
 
 
379 aa  68.9  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5554  glycosyl transferase, group 1  31.41 
 
 
394 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.731163  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1189  glycosyl transferase group 1  27.17 
 
 
383 aa  68.9  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1664  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.11 
 
 
381 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4643  glycosyl transferase group 1  35 
 
 
376 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000017343  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0054  glycosyl transferase group 1  24.88 
 
 
305 aa  68.6  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.510495  normal  0.478799 
 
 
-
 
NC_006686  CND02330  transferase, putative  24.76 
 
 
783 aa  68.6  0.0000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.795386  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2328  glycosyl transferase group 1  33.82 
 
 
871 aa  68.6  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50356  glycosyl transferase, group 1  29.17 
 
 
507 aa  68.6  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1480  glycosyl transferase, group 1:PHP-like  30.57 
 
 
803 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.117248 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0579  sulfolipid sulfoquinovosyldiacylglycerol biosynthesis protein  36.89 
 
 
377 aa  68.2  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  0.138904 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1668  glycogen synthase  41.44 
 
 
411 aa  68.6  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  39.02 
 
 
394 aa  68.6  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1843  glycosyl transferase group 1  26.28 
 
 
396 aa  68.6  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0351  glycosyl transferase group 1  25.26 
 
 
374 aa  68.2  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.652004 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21361  SqdX  34.09 
 
 
382 aa  68.6  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2407  glycosyl transferase, group 1  33.82 
 
 
387 aa  67.4  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126337  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1265  SqdX  34.09 
 
 
382 aa  67.4  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2514  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  32.12 
 
 
411 aa  67.8  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54576  normal  0.0718636 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4580  glycosyl transferase, group 1  30.95 
 
 
378 aa  67.8  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0054  glycosyl transferase group 1  25.98 
 
 
364 aa  67.8  0.0000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.000000226756  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12420  glycosyltransferase  29.1 
 
 
381 aa  67.8  0.0000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0338746  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0399  glycosyl transferase, group 1  32.03 
 
 
377 aa  67.8  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>