More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_3690 on replicon NC_008043
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008043  TM1040_3690  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 369 aa  732    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.633764 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7224  glycosyl transferase group 1  47.35 
 
 		 383 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.175027  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4585  glycosyl transferase group 1  38.78 
 
 		 365 aa  210  4e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6472  glycosyl transferase group 1  47.7 
 
 		 374 aa  206  4e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.251363  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7103  glycosyl transferase group 1  39.3 
 
 		 362 aa  199  7e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.683895  normal  0.803622 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0229  glycosyl transferase, group 1  37.4 
 
 		 476 aa  189  5e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5959  glycosyl transferase group 1  38.14 
 
 		 364 aa  186  7e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0411689 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3935  glycosyltransferase  37.25 
 
 		 366 aa  178  2e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0737  glycosyl transferase-like  33.33 
 
 		 382 aa  143  4e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0358  glycosyl transferase group 1  31.43 
 
 		 373 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3907  glycosyl transferase, group 1  30.39 
 
 		 370 aa  120  4.9999999999999996e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.086745 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1334  glycosyl transferase group 1  39.66 
 
 		 385 aa  77.4  0.0000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0790  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  36.15 
 
 		 400 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000379704 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  30.71 
 
 		 373 aa  74.3  0.000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2328  glycosyl transferase group 1  38.94 
 
 		 871 aa  73.6  0.000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5066  glycosyl transferase group 1  37.59 
 
 		 375 aa  72.8  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0577  glycosyl transferase, group 1  33.91 
 
 		 355 aa  72.4  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5510  glycosyl transferase group 1  35.94 
 
 		 399 aa  72.4  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.264139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2705  glycosyl transferase group 1  40.98 
 
 		 803 aa  70.9  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2602  glycosyl transferase, group 1  34.75 
 
 		 812 aa  70.9  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1999  glycosyl transferase group 1  35.1 
 
 		 403 aa  70.5  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0312  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 389 aa  70.9  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8172  glycosyl transferase group 1  33.88 
 
 		 356 aa  70.1  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0738  glycosyl transferase group 1  21.83 
 
 		 358 aa  70.5  0.00000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2869  glycosyl transferase, group 1  35.81 
 
 		 816 aa  70.5  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.541026 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1007  glycosyl transferase, group 1  40.22 
 
 		 416 aa  70.1  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.643015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5047  glycosyl transferase group 1  35.87 
 
 		 376 aa  69.7  0.00000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.318515  normal  0.241933 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0894  glycosyl transferase group 1  31.97 
 
 		 381 aa  69.3  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.346832  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0048  SqdX  29.26 
 
 		 382 aa  68.9  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2323  glycosyl transferase, group 1  27.68 
 
 		 378 aa  68.9  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2257  glucosyltransferase  37.67 
 
 		 426 aa  68.6  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.150164  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18561  SqdX  29.27 
 
 		 377 aa  68.2  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.330873  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2758  glycosyl transferase group 1  32.41 
 
 		 356 aa  68.2  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0673851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4586  glycosyl transferase group 1  37.11 
 
 		 376 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.746541 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4652  glycosyl transferase group 1  33.83 
 
 		 396 aa  68.6  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21361  SqdX  31.01 
 
 		 382 aa  67.8  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1130  glycosyl transferase group 1  31.74 
 
 		 357 aa  67  0.0000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0202  glycosyl transferase, group 1  26.92 
 
 		 369 aa  67.4  0.0000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2695  glycosyl transferase, group 1  32.34 
 
 		 374 aa  67  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1276  glycosyl transferase group 1  27.08 
 
 		 378 aa  67  0.0000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.680838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3958  glycosyl transferase group 1  40.91 
 
 		 398 aa  66.6  0.0000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.630058  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1110  glycosyl transferase, group 1  36.84 
 
 		 419 aa  66.6  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1191  glycosyl transferase, group 1  29.25 
 
 		 384 aa  66.6  0.0000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0375  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.5 
 
 		 462 aa  66.6  0.0000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0579  sulfolipid sulfoquinovosyldiacylglycerol biosynthesis protein  36.8 
 
 		 377 aa  66.6  0.0000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  0.138904 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0432  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.5 
 
 		 459 aa  66.2  0.0000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.568874  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1265  SqdX  31.01 
 
 		 382 aa  66.2  0.0000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0799  glycosyl transferase, group 1  35.16 
 
 		 378 aa  66.2  0.0000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1655  glycosyl transferase group 1  32.56 
 
 		 384 aa  65.9  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3547  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  35.66 
 
 		 393 aa  65.5  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18561  SqdX  27.2 
 
 		 373 aa  65.9  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.213199  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17190  glycosyl transferase group 1  32.37 
 
 		 387 aa  65.9  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00501  SqdX  27.95 
 
 		 381 aa  65.9  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18751  SqdX  27.2 
 
 		 377 aa  65.5  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2072  glycosyl transferase group 1  29.41 
 
 		 374 aa  64.7  0.000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  27.69 
 
 		 395 aa  65.5  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5565  glycosyl transferase group 1  33.57 
 
 		 810 aa  65.1  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.896864 
 
 
-
 
NC_006682  CNM02480  conserved hypothetical protein  39.51 
 
 		 621 aa  64.7  0.000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1480  glycosyl transferase, group 1:PHP-like  34.45 
 
 		 803 aa  65.5  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.117248 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1758  SqdX  27.2 
 
 		 377 aa  65.5  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2141  glycosyl transferase group 1  30.83 
 
 		 394 aa  65.1  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.835748  hitchhiker  0.00544709 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5198  glycosyl transferase group 1  38.46 
 
 		 426 aa  64.7  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.603506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1622  glycosyl transferase group 1  25.43 
 
 		 402 aa  64.3  0.000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1032  glycosyl transferase group 1  36.57 
 
 		 390 aa  64.7  0.000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0604  glycosyl transferase group 1  35.92 
 
 		 819 aa  64.7  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2463  glycosyl transferase, group 1  34.19 
 
 		 385 aa  64.3  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11160  glycosyl transferase group 1  29.51 
 
 		 383 aa  63.9  0.000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0511  glycosyl transferase group 1  30.08 
 
 		 381 aa  63.5  0.000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2903  glycosyl transferase, group 1  32.62 
 
 		 827 aa  63.5  0.000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0301322 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  43.01 
 
 		 367 aa  63.5  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1131  glycosyl transferase group 1  38.98 
 
 		 904 aa  63.2  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.845699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0690  glycosyl transferase, group 1  35.71 
 
 		 393 aa  63.2  0.000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0992271  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1989  glycosyl transferase group 1  34.07 
 
 		 820 aa  63.2  0.000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0847  glycosyl transferase group 1  35.58 
 
 		 381 aa  63.2  0.000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00663707  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2710  glycosyl transferase group 1  35.48 
 
 		 367 aa  63.2  0.000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.395873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0413  glycosyl transferase, group 1  25.33 
 
 		 386 aa  63.2  0.000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.818994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1593  glycosyl transferase, group 1  31.11 
 
 		 403 aa  62.8  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6124  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  31.31 
 
 		 375 aa  62.4  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.176978  normal  0.382869 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0197  glycosyl transferase group 1  27.13 
 
 		 378 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1019  glycosyl transferase group 1  33.57 
 
 		 402 aa  62.8  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1294  glycosyl transferase  33.09 
 
 		 379 aa  62.4  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17931  SqdX  24.78 
 
 		 382 aa  62.8  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.335649  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0731  glycosyl transferase group 1  36 
 
 		 384 aa  62.8  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3140  glycosyl transferase group 1  35.25 
 
 		 381 aa  61.6  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  32.12 
 
 		 360 aa  61.6  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0414  glycosyl transferase group 1  45.78 
 
 		 363 aa  62  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2305  glycosyltransferase  42.35 
 
 		 393 aa  61.6  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0051  SqdX  27.84 
 
 		 381 aa  61.6  0.00000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12220  glycosyltransferase  29.94 
 
 		 432 aa  62  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.296579  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2161  glycosyl transferase group 1  34.97 
 
 		 377 aa  62  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00492248 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1409  glycosyl transferase group 1  32.37 
 
 		 355 aa  61.6  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.201538 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1723  glycosyl transferase, group 1  31.58 
 
 		 380 aa  61.6  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.952593  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0297  putative glycosyl transferase  34.78 
 
 		 362 aa  61.6  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  28.37 
 
 		 382 aa  61.2  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2502  glycosyl transferase group 1  34.88 
 
 		 377 aa  61.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.861736 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3484  glycosyl transferase group 1  32.14 
 
 		 379 aa  60.8  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4328  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  37.5 
 
 		 381 aa  61.2  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00438832  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1540  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 		 414 aa  61.2  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1231  glycosyl transferase group 1  26.91 
 
 		 372 aa  61.2  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2737  glycosyl transferase group 1  32.64 
 
 		 416 aa  60.8  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.829529  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>