More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_4586 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_4586  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
376 aa  741    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.746541 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5047  glycosyl transferase group 1  95.21 
 
 
376 aa  679    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.318515  normal  0.241933 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4357  glycosyl transferase group 1  75.68 
 
 
375 aa  511  1e-144  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0758  glycosyl transferase group 1  27.69 
 
 
371 aa  84.7  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.11154 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0604  glycosyl transferase group 1  38.51 
 
 
819 aa  80.5  0.00000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4955  glycosyl transferase group 1  27.5 
 
 
405 aa  76.6  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1310  glycosyl transferase group 1  36.89 
 
 
351 aa  73.6  0.000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1480  glycosyl transferase, group 1:PHP-like  33.93 
 
 
803 aa  72  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.117248 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2602  glycosyl transferase, group 1  34.72 
 
 
812 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6393  glycosyl transferase group 1  34.95 
 
 
391 aa  70.5  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.224471 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1996  glycosyl transferase group 1  35.17 
 
 
367 aa  69.3  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0691436 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2869  glycosyl transferase, group 1  35.56 
 
 
816 aa  69.3  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.541026 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3690  glycosyl transferase, group 1  37.11 
 
 
369 aa  68.9  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.633764 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0090  glycosyl transferase, group 1  32.45 
 
 
378 aa  68.6  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.22562 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2328  glycosyl transferase group 1  36.8 
 
 
871 aa  68.2  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1696  glycosyl transferase group 1  34.17 
 
 
406 aa  67.8  0.0000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2161  glycosyl transferase group 1  39.45 
 
 
377 aa  67.8  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00492248 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1989  glycosyl transferase group 1  35.5 
 
 
820 aa  67.8  0.0000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4436  glycosyl transferase group 1  26.01 
 
 
377 aa  67.8  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2088  glycosyl transferase group 1  38.83 
 
 
347 aa  66.6  0.0000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3237  putative glycosyltransferase  47.44 
 
 
343 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1322  glycosyl transferase group 1  47.44 
 
 
343 aa  66.2  0.0000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.156305 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0598  glycosyl transferase group 1  24.78 
 
 
385 aa  65.9  0.000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5598  glycosyl transferase, group 1  35.42 
 
 
344 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.529066 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2737  glycosyl transferase group 1  35.86 
 
 
416 aa  65.9  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.829529  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0579  sulfolipid sulfoquinovosyldiacylglycerol biosynthesis protein  33.8 
 
 
377 aa  65.9  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  0.138904 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2187  glycosyl transferase group 1  46.15 
 
 
344 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0604226  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1822  glycosyl transferase, group 1  34.23 
 
 
345 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.179572  normal  0.795159 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1039  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.5 
 
 
344 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.147415  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2294  glycosyl transferase group 1  46.15 
 
 
344 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1660  diacylglycerol kinase  46.15 
 
 
521 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2309  glycosyl transferase, group 1  46.15 
 
 
344 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1007  glycosyl transferase group 1  46.15 
 
 
344 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.204668  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2271  glycosyl transferase, group 1  46.15 
 
 
344 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.693911  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2753  glycosyl transferase group 1  25.68 
 
 
388 aa  65.1  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.580745  normal  0.199234 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0390  glycosyl transferase, group 1 family protein  46.15 
 
 
344 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1855  glycosyl transferase, group 1 family protein  46.15 
 
 
344 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1107  glycosyl transferase, group 1 family protein  46.15 
 
 
344 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.509455  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1274  glycosyl transferase, group 1 family protein  46.15 
 
 
344 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18561  SqdX  30 
 
 
373 aa  64.3  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.213199  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1412  glycosyl transferase, group 1 family protein  46.15 
 
 
344 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.299983  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0759  glycosyl transferase, group 1 family protein  46.15 
 
 
344 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3682  glycosyl transferase group 1  36.02 
 
 
368 aa  64.3  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.558213  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1267  glycosyl transferase, group 1 family protein  46.15 
 
 
344 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3140  glycosyl transferase group 1  38.32 
 
 
381 aa  63.9  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0904  glycosyl transferase, group 1  48.72 
 
 
372 aa  63.9  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6498  glycosyl transferase, group 1  29.74 
 
 
412 aa  63.9  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18751  SqdX  30 
 
 
377 aa  63.9  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32760  Glycosyl transferase, group 1 protein  47.44 
 
 
353 aa  63.5  0.000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0737  glycosyl transferase-like  33.33 
 
 
382 aa  63.2  0.000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13791  hypothetical protein  21.47 
 
 
389 aa  62.8  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4916  glycosyl transferase group 1  34.48 
 
 
377 aa  62.8  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559859 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1174  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.46 
 
 
403 aa  62  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2339  glycosyl transferase, group 1  37.82 
 
 
381 aa  62  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0577  glycosyl transferase, group 1  29.63 
 
 
355 aa  62.4  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2028  glycosyl transferase group 1  43.59 
 
 
343 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0125805  normal  0.984429 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0636  glycosyl transferase, group 1  48.1 
 
 
350 aa  62.4  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0666764  normal  0.102308 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0399  glycosyl transferase, group 1  33.05 
 
 
377 aa  62.4  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2715  glycosyl transferase group 1  32.64 
 
 
421 aa  62.8  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.770455 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0940  glycosyl transferase, group 1  47.44 
 
 
375 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.487064  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0048  SqdX  36.07 
 
 
382 aa  62  0.00000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1758  SqdX  29.17 
 
 
377 aa  61.6  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2858  group 1 glycosyl transferase  24 
 
 
393 aa  61.6  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4147  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  35.9 
 
 
379 aa  61.6  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0691  glycosyl transferase, group 1  30.48 
 
 
377 aa  62  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0533386  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4490  glycosyl transferase group 1  47.44 
 
 
351 aa  61.6  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2903  glycosyl transferase, group 1  36.21 
 
 
827 aa  61.6  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0301322 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4643  glycosyl transferase group 1  33.62 
 
 
376 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000017343  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2548  glycosyl transferase group 1  33.9 
 
 
380 aa  61.6  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.339834  normal  0.873854 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0697  glycosyl transferase group 1  30.6 
 
 
772 aa  60.8  0.00000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00501  SqdX  34.17 
 
 
381 aa  61.2  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2081  glycosyl transferase group 1  38.79 
 
 
381 aa  61.2  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.212135  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1622  glycosyl transferase, group 1  47.95 
 
 
352 aa  61.2  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21361  SqdX  33.6 
 
 
382 aa  61.2  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2034  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.66 
 
 
385 aa  60.5  0.00000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1012  glycosyl transferase, group 1  34.46 
 
 
406 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0088  glycosyl transferase group 1  33.78 
 
 
369 aa  60.8  0.00000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.323047  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  29.18 
 
 
353 aa  60.8  0.00000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1817  glycosyl transferase, group 1  37.4 
 
 
385 aa  60.8  0.00000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18561  SqdX  27.56 
 
 
377 aa  60.8  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.330873  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1265  SqdX  33.6 
 
 
382 aa  60.5  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2469  glycosyl transferase group 1  34.51 
 
 
380 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.568723  normal  0.290599 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1912  glycosyl transferase group 1  44.87 
 
 
350 aa  60.5  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4972  glycosyl transferase group 1  39.25 
 
 
365 aa  60.5  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22600  putative glycosyl transferase  38.26 
 
 
351 aa  60.5  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.809409  hitchhiker  0.000260588 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4606  putative glycosyl transferase, group 1  28.79 
 
 
377 aa  60.1  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0423402  normal  0.43747 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3745  group 1 glycosyl transferase  32.48 
 
 
385 aa  60.1  0.00000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10200  Glycosyl transferase, group 1  32.19 
 
 
403 aa  60.1  0.00000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1793  glycosyl transferase group 1  42.02 
 
 
358 aa  60.1  0.00000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.479162 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2129  glycosyl transferase group 1  42.02 
 
 
358 aa  60.1  0.00000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.740192 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6499  glycosyl transferase, group 1  32.91 
 
 
384 aa  60.1  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2084  hypothetical protein  44.87 
 
 
356 aa  59.7  0.00000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11160  glycosyl transferase group 1  26.42 
 
 
383 aa  60.1  0.00000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5565  glycosyl transferase group 1  29.58 
 
 
810 aa  59.7  0.00000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.896864 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  31.61 
 
 
446 aa  59.7  0.00000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1293  glycosyl transferase, group 1  33.55 
 
 
410 aa  59.7  0.00000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1631  glycosyl transferase, group 1  47.95 
 
 
352 aa  59.7  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.54694  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  30.08 
 
 
373 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2212  glycosyl transferase group 1  30 
 
 
439 aa  59.3  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006682  CNM02480  conserved hypothetical protein  48.48 
 
 
621 aa  59.3  0.0000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>