More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1293 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1293  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 410 aa  815    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4955  glycosyl transferase group 1  27.89 
 
 		 405 aa  153  5.9999999999999996e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2753  glycosyl transferase group 1  32.04 
 
 		 388 aa  147  3e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.580745  normal  0.199234 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2420  glycosyl transferase, group 1  29.95 
 
 		 400 aa  136  8e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.959813 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3905  glycosyl transferase group 1  24.87 
 
 		 366 aa  112  8.000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.840872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0557  glycosyl transferase group 1  27.14 
 
 		 399 aa  99.4  1e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.808631  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3338  glycosyl transferase, group 1  28.62 
 
 		 415 aa  87  5e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.620464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2585  glycosyl transferase group 1  27.63 
 
 		 388 aa  84  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.341706  normal  0.530057 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5790  glycosyl transferase group 1  24.76 
 
 		 376 aa  83.6  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2257  glucosyltransferase  32.51 
 
 		 426 aa  80.5  0.00000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.150164  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5134  glycosyl transferase group 1  23.84 
 
 		 386 aa  75.1  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2869  glycosyl transferase, group 1  31.53 
 
 		 816 aa  74.7  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.541026 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0254  glycosyl transferase group 1  25.51 
 
 		 389 aa  74.7  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.401969  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1905  glycosyltransferase  35.71 
 
 		 402 aa  73.2  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  34.29 
 
 		 376 aa  73.2  0.000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4918  group 1 glycosyl transferase  24.58 
 
 		 366 aa  72.4  0.00000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3302  glycosyl transferase, group 1  34.43 
 
 		 387 aa  71.6  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2328  glycosyl transferase group 1  30.98 
 
 		 871 aa  70.9  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0207  glycosyl transferase group 1  28.52 
 
 		 398 aa  70.5  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1784  glycosyl transferase, group 1  34.9 
 
 		 379 aa  70.1  0.00000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4436  glycosyl transferase group 1  25.91 
 
 		 377 aa  69.7  0.00000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0144  glycosyltransferase-like protein  28.25 
 
 		 368 aa  69.7  0.00000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5160  glycosyl transferase group 1  35.5 
 
 		 800 aa  69.7  0.00000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.170469  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0577  glycosyl transferase, group 1  27.7 
 
 		 355 aa  69.3  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4161  glycosyl transferase group 1  28.06 
 
 		 392 aa  68.6  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2739  glycosyl transferase group 1  33.14 
 
 		 377 aa  68.2  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.363262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0624  glycosyl transferase group 1  33.14 
 
 		 379 aa  67  0.0000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.225322 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3964  glycosyl transferase group 1  26.15 
 
 		 1264 aa  66.6  0.0000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0153  glycosyl transferase, group 1  32.86 
 
 		 381 aa  66.6  0.0000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1427  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.73 
 
 		 404 aa  66.2  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04450  glycosyltransferase  36.36 
 
 		 405 aa  66.2  0.000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1143  glycosyl transferase group 1  30.73 
 
 		 404 aa  66.2  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0450  putative polysaccharide biosynthesis protein  33.75 
 
 		 365 aa  65.5  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3958  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 398 aa  65.1  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.630058  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5225  glycosyl transferase group 1  29.95 
 
 		 366 aa  64.3  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2434  glycosyl transferase, group 1  26.43 
 
 		 386 aa  63.9  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.433213 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1019  glycosyl transferase group 1  28.26 
 
 		 402 aa  64.3  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0900  glycosyl transferase group 1  34.19 
 
 		 381 aa  63.9  0.000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1524  putative glycosyl transferase  28.83 
 
 		 410 aa  63.5  0.000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5047  glycosyl transferase group 1  28.48 
 
 		 376 aa  63.5  0.000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.318515  normal  0.241933 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2168  glycosyl transferase group 1  30.92 
 
 		 399 aa  63.2  0.000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2305  glycosyltransferase  34.75 
 
 		 393 aa  63.2  0.000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1996  glycosyl transferase group 1  32.28 
 
 		 367 aa  62.4  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0691436 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1322  glycosyl transferase, group 1  25.93 
 
 		 342 aa  62.8  0.00000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000580469  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 		 419 aa  62.8  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1160  glycosyl transferase group 1  27.51 
 
 		 385 aa  62.8  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000209348 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4756  glycosyl transferase group 1  24.32 
 
 		 385 aa  62.4  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.493707  normal  0.0906731 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0769  glycosyl transferase, group 1  27.8 
 
 		 358 aa  62.8  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.660032  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1346  glycosyl transferase group 1  32.32 
 
 		 399 aa  62.4  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5452  glycosyl transferase group 1  31.9 
 
 		 438 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  hitchhiker  0.00474748 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1357  glycosyl transferase, group 1  40 
 
 		 362 aa  62.8  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1274  glucosyltransferase I  30.86 
 
 		 364 aa  62  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2088  glycosyl transferase group 1  29.17 
 
 		 347 aa  61.6  0.00000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6048  glycosyl transferase group 1  34.64 
 
 		 439 aa  62  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0604596 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1130  glycosyl transferase group 1  34.78 
 
 		 357 aa  62  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1373  glycosyl transferase, group 1  34.64 
 
 		 439 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6456  glycosyl transferase, group 1  34.64 
 
 		 439 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.338178  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1310  glycosyl transferase group 1  30.43 
 
 		 351 aa  61.6  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3411  glycosyl transferase, group 1  25.16 
 
 		 425 aa  61.2  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163553  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2105  glycosyl transferase group 1  28.35 
 
 		 371 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.352856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  24.63 
 
 		 398 aa  61.2  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0391  glycosyl transferase group 1  35.19 
 
 		 414 aa  61.2  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3950  glycosyl transferase group 1  30.22 
 
 		 372 aa  60.8  0.00000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2705  glycosyl transferase group 1  32.5 
 
 		 803 aa  60.8  0.00000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3643  glycosyl transferase, group 1  26.12 
 
 		 387 aa  60.8  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.590189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25631  glycosyl transferase, group 1  25.75 
 
 		 377 aa  60.8  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0016  glycosyl transferase group 1  35.77 
 
 		 380 aa  60.5  0.00000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0290375  normal  0.0192422 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0737  glycosyl transferase-like  35.14 
 
 		 382 aa  60.5  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4075  glycosyl transferase, group 1  29.28 
 
 		 744 aa  60.5  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2161  glycosyl transferase group 1  35.22 
 
 		 377 aa  60.5  0.00000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00492248 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4586  glycosyl transferase group 1  32.88 
 
 		 376 aa  60.1  0.00000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.746541 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  32.59 
 
 		 424 aa  60.1  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08810  glycosyltransferase  23.78 
 
 		 564 aa  60.1  0.00000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.139018  normal  0.49339 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3547  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  30.05 
 
 		 393 aa  59.7  0.00000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2730  glycosyl transferase, group 1  32.53 
 
 		 365 aa  59.7  0.00000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.9123 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  26.36 
 
 		 387 aa  59.7  0.00000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3803  glycosyl transferase group 1  25.23 
 
 		 390 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.395317 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3114  glycosyl transferase group 1  26.32 
 
 		 369 aa  58.9  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000549793  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5565  glycosyl transferase group 1  27.24 
 
 		 810 aa  59.3  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.896864 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3257  glycosyl transferase group 1  28 
 
 		 426 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5854  putative glycosyl transferase  26.58 
 
 		 381 aa  59.3  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0707632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2204  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 		 372 aa  59.3  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.200727  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  29.35 
 
 		 423 aa  59.3  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4263  glycosyl transferase, group 1  31.55 
 
 		 396 aa  58.5  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2602  glycosyl transferase, group 1  29.27 
 
 		 812 aa  58.5  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2152  glycosyl transferase family protein  25.64 
 
 		 371 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.540294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  28.75 
 
 		 391 aa  58.5  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0731  glycosyl transferase group 1  30.73 
 
 		 384 aa  58.5  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0974  glycosyl transferase, group 1  27.47 
 
 		 400 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.277341 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1252  phosphatidylserine decarboxylase  28.65 
 
 		 340 aa  58.9  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.277456  normal  0.603033 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2765  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.02 
 
 		 365 aa  58.5  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.367187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1480  glycosyl transferase, group 1:PHP-like  33.88 
 
 		 803 aa  58.2  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.117248 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0545  glycosyl transferase group 1  34.39 
 
 		 413 aa  57.8  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.194127  normal  0.310608 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2285  glycosyl transferase group 1  27.74 
 
 		 410 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0267673  normal  0.0567423 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  26.32 
 
 		 378 aa  58.2  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0580  glycosyl transferase group 1  35.19 
 
 		 399 aa  57.8  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.55279  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2808  glycosyl transferase group 1  30.49 
 
 		 424 aa  58.2  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3800  glycosyl transferase group 1  31.41 
 
 		 402 aa  57.8  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17673  normal  0.211423 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1365  glycosyl transferase, group 1  25.35 
 
 		 396 aa  57.8  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0275215  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2157  glycosyl transferase, group 1  29.44 
 
 		 385 aa  57.8  0.0000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.750957  normal  0.801991 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>