More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5854 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5854  putative glycosyl transferase  100 
 
 		 381 aa  791    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0707632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3861  putative glycosyltransferase  46.54 
 
 		 398 aa  351  1e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.862741 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0823  glycosyl transferase group 1  45.74 
 
 		 380 aa  348  1e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2469  glycosyl transferase group 1  44.03 
 
 		 380 aa  334  1e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.568723  normal  0.290599 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2585  glycosyl transferase group 1  28.17 
 
 		 388 aa  153  5.9999999999999996e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.341706  normal  0.530057 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5134  glycosyl transferase group 1  26.18 
 
 		 386 aa  133  3.9999999999999996e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0254  glycosyl transferase group 1  26.32 
 
 		 389 aa  116  5e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.401969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5790  glycosyl transferase group 1  23.82 
 
 		 376 aa  102  9e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4955  glycosyl transferase group 1  30.38 
 
 		 405 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0869  a-glycosyltransferase  26.33 
 
 		 358 aa  98.6  2e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.746857  normal  0.684774 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13791  hypothetical protein  26.45 
 
 		 389 aa  96.3  8e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3263  glycosyl transferase group 1  41.43 
 
 		 425 aa  88.6  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1310  glycosyl transferase group 1  26.49 
 
 		 351 aa  87  5e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1867  glycosyl transferase, group 1  37.91 
 
 		 412 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1913  glycosyl transferase, group 1  37.91 
 
 		 412 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.434704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1847  glycosyl transferase, group 1  37.91 
 
 		 412 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.469612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3338  glycosyl transferase, group 1  24.61 
 
 		 415 aa  83.6  0.000000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.620464  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5016  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.11 
 
 		 378 aa  82  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.506111  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2920  glycosyl transferase group 1  36.09 
 
 		 435 aa  82  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  32.49 
 
 		 390 aa  82.4  0.00000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  34.57 
 
 		 353 aa  81.6  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4198  glycosyl transferase group 1  32.86 
 
 		 405 aa  80.9  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0253  glycosyl transferase, group 1  32.04 
 
 		 358 aa  81.3  0.00000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2186  glycosyl transferase group 1  23.61 
 
 		 378 aa  81.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  30.62 
 
 		 377 aa  80.9  0.00000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28310  glycosyltransferase  37.24 
 
 		 417 aa  80.5  0.00000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0640064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4436  glycosyl transferase group 1  28.11 
 
 		 377 aa  80.1  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0244  glycosyl transferase, group 1  26.99 
 
 		 393 aa  79.7  0.00000000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.270247 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0029  glycosyltransferase  37.4 
 
 		 392 aa  79.3  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000827208  hitchhiker  0.00854387 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1062  glycosyl transferase group 1  34.15 
 
 		 400 aa  77.8  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5225  glycosyl transferase group 1  31.43 
 
 		 366 aa  77.4  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1381  glycosyl transferase group 1  30.97 
 
 		 397 aa  77  0.0000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000217179 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13048  transferase  35.95 
 
 		 414 aa  77  0.0000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00789661 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1106  glycosyl transferase, group 1  29.25 
 
 		 389 aa  75.5  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1276  glycosyl transferase group 1  33.59 
 
 		 378 aa  75.9  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.680838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1507  glycosyl transferase group 1  34.59 
 
 		 395 aa  75.9  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.255833 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3300  glycosyl transferase group 1  28.17 
 
 		 375 aa  75.9  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00341584  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2514  glycosyl transferase group 1  34.97 
 
 		 351 aa  74.7  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0260745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3286  putative lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase protein  30.5 
 
 		 419 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1032  glycosyl transferase group 1  29.84 
 
 		 390 aa  75.5  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4262  glycosyl transferase, group 1  37.5 
 
 		 410 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.666553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0290  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 		 370 aa  74.7  0.000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1381  glycosyl transferase group 1  32.3 
 
 		 391 aa  74.7  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1456  glycosyl transferase group 1  39.05 
 
 		 384 aa  74.7  0.000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.550034  hitchhiker  0.000088456 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0538  glycosyl transferase group 1  31.68 
 
 		 391 aa  74.7  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  31.88 
 
 		 360 aa  74.3  0.000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2801  glycosyl transferase group 1  27.12 
 
 		 393 aa  73.9  0.000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5248  glycosyl transferase, group 1  33.5 
 
 		 393 aa  73.9  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.663702 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1425  glycosyl transferase group 1  26.64 
 
 		 468 aa  73.9  0.000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.703524  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0498  glycosyl transferase group 1  37.3 
 
 		 378 aa  73.6  0.000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0567  glycosyl transferase group 1  40.71 
 
 		 437 aa  73.6  0.000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.923327  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0300  glycosyl transferase, group 1  32.3 
 
 		 398 aa  73.2  0.000000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.122036  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2745  glycosyl transferase group 1  28.33 
 
 		 341 aa  72.8  0.000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  25.64 
 
 		 419 aa  72.8  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1821  glycosyl transferase group 1  32.21 
 
 		 380 aa  72  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.500985 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  27.94 
 
 		 373 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6058  glycosyl transferase group 1  35.76 
 
 		 417 aa  72.4  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2096  glycosyltransferase  34.44 
 
 		 415 aa  72  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0126  glycosyl transferase group 1  37.42 
 
 		 371 aa  72  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0965  glycosyl transferase, group 1  27.98 
 
 		 398 aa  71.6  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.699884  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2420  glycosyl transferase, group 1  27.78 
 
 		 400 aa  71.6  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.959813 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0783  glycosyl transferase group 1  36.73 
 
 		 394 aa  72  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.492233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1495  glycosyl transferase, group 1  35.62 
 
 		 361 aa  71.6  0.00000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.507628  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0154  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.81 
 
 		 360 aa  70.9  0.00000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1133  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  33.33 
 
 		 377 aa  71.2  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  27.88 
 
 		 373 aa  71.2  0.00000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2328  glycosyl transferase group 1  33.14 
 
 		 871 aa  70.9  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0201  hypothetical protein  32.41 
 
 		 935 aa  70.9  0.00000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0790  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  35.66 
 
 		 400 aa  70.9  0.00000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000379704 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2762  glycosyl transferase, group 1  34.62 
 
 		 309 aa  70.9  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.873929  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2121  glycosyl transferase group 1  30.19 
 
 		 375 aa  70.9  0.00000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1602  hypothetical protein  30.57 
 
 		 388 aa  70.5  0.00000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2483  glycosyl transferase group 1  35.94 
 
 		 414 aa  70.5  0.00000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.391566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4652  glycosyl transferase group 1  33.54 
 
 		 396 aa  70.1  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2088  glycosyl transferase group 1  25.09 
 
 		 347 aa  70.1  0.00000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1498  glycosyl transferase, group 1  31.73 
 
 		 392 aa  70.1  0.00000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0242  glycosyl transferase, group 1  26.57 
 
 		 386 aa  70.1  0.00000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.19746 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2096  glycosyl transferase, group 1  36.09 
 
 		 410 aa  69.7  0.00000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1655  glycosyl transferase group 1  35.94 
 
 		 384 aa  68.9  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6015  glycosyl transferase group 1  31.66 
 
 		 384 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.44691 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3735  glycosyl transferase group 1  34.38 
 
 		 355 aa  68.9  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0354  glycosyl transferase group 1  25.91 
 
 		 402 aa  69.3  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000079613  normal  0.480518 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3484  glycosyl transferase group 1  35.71 
 
 		 379 aa  68.9  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1002  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.96 
 
 		 405 aa  68.6  0.0000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00183695  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2334  glycosyl transferase, group 1  30.92 
 
 		 376 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0688579  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1999  glycosyl transferase group 1  32.06 
 
 		 403 aa  68.6  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1499  glycosyl transferase, group 1  26.67 
 
 		 363 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 392 aa  68.2  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  28 
 
 		 391 aa  68.6  0.0000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  35.71 
 
 		 389 aa  67.8  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2469  glycosyl transferase group 1  37.4 
 
 		 537 aa  67.8  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3905  glycosyl transferase group 1  25.9 
 
 		 366 aa  67.8  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.840872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0890  glycosyl transferase, group 1  32.81 
 
 		 405 aa  67.8  0.0000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0223562  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2681  glycosyl transferase group 1  34.11 
 
 		 376 aa  67.8  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  29.27 
 
 		 536 aa  67.4  0.0000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3091  glycosyl transferase, group 1  35.37 
 
 		 770 aa  67.4  0.0000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.278852  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2464  glycosyl transferase group 1  32.78 
 
 		 394 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.200032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2655  glycosyl transferase, group 1  36.18 
 
 		 395 aa  67.4  0.0000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.268297  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0357  glycosyl transferase, group 1  30.85 
 
 		 375 aa  67.4  0.0000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2257  glucosyltransferase  31.45 
 
 		 426 aa  67  0.0000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.150164  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>