More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2585 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_2585  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
388 aa  801    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.341706  normal  0.530057 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0254  glycosyl transferase group 1  40.21 
 
 
389 aa  291  2e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.401969  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5134  glycosyl transferase group 1  38.92 
 
 
386 aa  275  1.0000000000000001e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2469  glycosyl transferase group 1  30.55 
 
 
380 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.568723  normal  0.290599 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5790  glycosyl transferase group 1  30.1 
 
 
376 aa  171  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0823  glycosyl transferase group 1  30.03 
 
 
380 aa  159  7e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3861  putative glycosyltransferase  30.55 
 
 
398 aa  157  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.862741 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5854  putative glycosyl transferase  28.17 
 
 
381 aa  153  5.9999999999999996e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0707632  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13791  hypothetical protein  29.25 
 
 
389 aa  129  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3338  glycosyl transferase, group 1  27.93 
 
 
415 aa  125  2e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.620464  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4436  glycosyl transferase group 1  29.55 
 
 
377 aa  120  3e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0869  a-glycosyltransferase  29.07 
 
 
358 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.746857  normal  0.684774 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3905  glycosyl transferase group 1  27.55 
 
 
366 aa  110  5e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.840872  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6700  glycosyl transferase group 1  23.85 
 
 
396 aa  108  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.49841  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2801  glycosyl transferase group 1  29.07 
 
 
393 aa  107  3e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1310  glycosyl transferase group 1  31.36 
 
 
351 aa  98.6  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2088  glycosyl transferase group 1  32.73 
 
 
347 aa  97.8  3e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2753  glycosyl transferase group 1  27.91 
 
 
388 aa  97.4  4e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.580745  normal  0.199234 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 
387 aa  94.4  3e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4955  glycosyl transferase group 1  30.3 
 
 
405 aa  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0557  glycosyl transferase group 1  26.69 
 
 
399 aa  90.1  6e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.808631  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1686  glycosyl transferase, group 1  23.89 
 
 
359 aa  89  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2186  glycosyl transferase group 1  25.34 
 
 
378 aa  87.4  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2420  glycosyl transferase, group 1  26.48 
 
 
400 aa  85.5  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.959813 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1293  glycosyl transferase, group 1  27.63 
 
 
410 aa  84  0.000000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2502  glycosyl transferase, group 1  28.33 
 
 
387 aa  84  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.417702 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0824  glycosyl transferase group 1  28.52 
 
 
384 aa  83.6  0.000000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31396  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2903  glycosyl transferase, group 1  33.51 
 
 
827 aa  83.2  0.000000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0301322 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0354  glycosyl transferase group 1  26.25 
 
 
402 aa  82.8  0.000000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000079613  normal  0.480518 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2869  glycosyl transferase, group 1  32.98 
 
 
816 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.541026 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  33.04 
 
 
391 aa  82.4  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17190  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 
387 aa  81.3  0.00000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1365  glycosyl transferase group 1  23.72 
 
 
414 aa  80.1  0.00000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000226511 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4918  group 1 glycosyl transferase  25.91 
 
 
366 aa  79.3  0.0000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2445  glycosyl transferase group 1  33.15 
 
 
375 aa  79.3  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2034  glycosyl transferase, group 1 family protein  27 
 
 
385 aa  78.2  0.0000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3613  glycosyl transferase domain-containing protein  25.11 
 
 
816 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.103069  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1345  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.57 
 
 
373 aa  77.8  0.0000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.976414 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2328  glycosyl transferase group 1  28.96 
 
 
871 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  27.46 
 
 
388 aa  77.4  0.0000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0199  glycosyl transferase group 1  26.02 
 
 
394 aa  77.4  0.0000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00799925  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0017  glycosyl transferase group 1  27.78 
 
 
356 aa  77.4  0.0000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.689138  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1989  glycosyl transferase group 1  26.03 
 
 
820 aa  77  0.0000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1130  glycosyl transferase group 1  34.46 
 
 
357 aa  77  0.0000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1032  glycosyl transferase group 1  31.16 
 
 
390 aa  77  0.0000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1456  glycosyl transferase, group 1  26.28 
 
 
409 aa  77  0.0000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0029  glycosyltransferase  30.51 
 
 
392 aa  76.6  0.0000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000827208  hitchhiker  0.00854387 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  31.67 
 
 
360 aa  77  0.0000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2192  glycosyl transferase group 1  24.25 
 
 
390 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2130  glycosyl transferase, group 1  23.98 
 
 
370 aa  75.5  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.799297  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5565  glycosyl transferase group 1  25.34 
 
 
810 aa  76.3  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.896864 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2141  glycosyl transferase group 1  28 
 
 
394 aa  75.9  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.835748  hitchhiker  0.00544709 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3119  group 1 glycosyl transferase  30.28 
 
 
400 aa  75.1  0.000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0244  glycosyl transferase, group 1  23.2 
 
 
393 aa  75.5  0.000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.270247 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2254  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
390 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0723451 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1106  glycosyl transferase, group 1  32.63 
 
 
389 aa  75.1  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  28.75 
 
 
398 aa  75.5  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3009  glycosyl transferase, group 1  26.17 
 
 
743 aa  74.7  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.188402  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2339  glycosyl transferase, group 1  29.86 
 
 
381 aa  74.3  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4547  glycosyl transferase group 1  32.22 
 
 
370 aa  74.3  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0201  glycosyl transferase, group 1  36.54 
 
 
398 aa  74.3  0.000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3055  glycosyl transferase, group 1  28.76 
 
 
439 aa  74.3  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  27.56 
 
 
408 aa  74.3  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0461  lipopolysaccharide biosynthesis-related protein  22.76 
 
 
383 aa  73.9  0.000000000004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.00755363  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  28.7 
 
 
414 aa  73.9  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3145  glycosyl transferase, group 1  30.27 
 
 
427 aa  73.2  0.000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.116626  normal  0.0485856 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  27.93 
 
 
382 aa  73.2  0.000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0080  glycosyl transferase group 1  31.45 
 
 
404 aa  72.4  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1128  glycosyltransferase  26.88 
 
 
394 aa  72.8  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0685342  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  27 
 
 
371 aa  72.4  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  36.18 
 
 
424 aa  72.8  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1670  glycosyl transferase  22.02 
 
 
376 aa  72.4  0.00000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1181  glycosyl transferase group 1  30.38 
 
 
419 aa  72  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2084  glycosyl transferase group 1  28.26 
 
 
390 aa  72  0.00000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.573542 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0688  glycosyl transferase, group 1  26.4 
 
 
348 aa  72.8  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2081  glycosyl transferase group 1  25.34 
 
 
381 aa  72.4  0.00000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.212135  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4956  glycosyl transferase group 1  26.49 
 
 
340 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  27.27 
 
 
413 aa  71.6  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2688  glycosyl transferase group 1  26.67 
 
 
387 aa  71.6  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.504834  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0965  glycosyl transferase, group 1  35.17 
 
 
398 aa  72  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.699884  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1596  glycosyl transferase, group 1  25.81 
 
 
386 aa  72  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13028  Glycosyl transferase group 1  32.07 
 
 
365 aa  70.5  0.00000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0291  glycosyl transferase, group 1  27.05 
 
 
382 aa  70.9  0.00000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.614818  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  29.67 
 
 
395 aa  70.9  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3693  glycosyl transferase, group 1  28.83 
 
 
371 aa  70.5  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.419352 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0545  glycosyl transferase group 1  27.17 
 
 
413 aa  70.9  0.00000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.194127  normal  0.310608 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  24.46 
 
 
379 aa  70.5  0.00000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1498  glycosyl transferase, group 1  24.67 
 
 
373 aa  70.5  0.00000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2213  glycosyl transferase group 1  30.3 
 
 
395 aa  70.1  0.00000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1425  glycosyl transferase group 1  27.42 
 
 
436 aa  70.1  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4226  glycosyl transferase group 1  24.69 
 
 
370 aa  70.1  0.00000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.333329  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1259  glycosyl transferase group 1  25.54 
 
 
381 aa  70.1  0.00000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.509892  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3843  glycosyl transferase, group 1  29.8 
 
 
358 aa  70.1  0.00000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3512  glycosyl transferase group 1  33.99 
 
 
369 aa  70.1  0.00000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.218401  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1396  glycosyl transferase group 1  28.69 
 
 
440 aa  70.1  0.00000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0657789  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2268  glycosyl transferase, group 1  27.49 
 
 
394 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459114  normal  0.160076 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  30.22 
 
 
392 aa  69.7  0.00000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2669  glycosyl transferase, group 1  29.75 
 
 
404 aa  69.7  0.00000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0504  glycosyl transferase group 1  29.88 
 
 
391 aa  69.7  0.00000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0144  glycosyltransferase-like protein  29.41 
 
 
368 aa  69.7  0.00000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>