More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3338 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_3338  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
415 aa  838    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.620464  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5790  glycosyl transferase group 1  31.07 
 
 
376 aa  220  3.9999999999999997e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13791  hypothetical protein  24.64 
 
 
389 aa  145  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6700  glycosyl transferase group 1  31.59 
 
 
396 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.49841  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5134  glycosyl transferase group 1  26.78 
 
 
386 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2585  glycosyl transferase group 1  27.93 
 
 
388 aa  125  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.341706  normal  0.530057 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2801  glycosyl transferase group 1  28.14 
 
 
393 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0254  glycosyl transferase group 1  26.36 
 
 
389 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.401969  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2469  glycosyl transferase group 1  27.65 
 
 
380 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.568723  normal  0.290599 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0823  glycosyl transferase group 1  27.94 
 
 
380 aa  104  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3861  putative glycosyltransferase  27.45 
 
 
398 aa  102  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.862741 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1602  hypothetical protein  34.59 
 
 
388 aa  97.4  4e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4436  glycosyl transferase group 1  31.83 
 
 
377 aa  94.4  3e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0869  a-glycosyltransferase  32.93 
 
 
358 aa  92.4  1e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.746857  normal  0.684774 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0557  glycosyl transferase group 1  26.46 
 
 
399 aa  91.3  3e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.808631  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4955  glycosyl transferase group 1  35.5 
 
 
405 aa  91.3  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1293  glycosyl transferase, group 1  28.62 
 
 
410 aa  87  5e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2186  glycosyl transferase group 1  29.94 
 
 
378 aa  86.7  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1686  glycosyl transferase, group 1  20.49 
 
 
359 aa  84.3  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4918  group 1 glycosyl transferase  34.69 
 
 
366 aa  84  0.000000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5854  putative glycosyl transferase  24.61 
 
 
381 aa  83.6  0.000000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0707632  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3905  glycosyl transferase group 1  23.19 
 
 
366 aa  83.6  0.000000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.840872  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  31.86 
 
 
373 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1310  glycosyl transferase group 1  26.1 
 
 
351 aa  80.1  0.00000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1852  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  26.74 
 
 
769 aa  79  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00784394  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3047  glycosyl transferase group 1  35.15 
 
 
374 aa  77.8  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.284334  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2168  glycosyl transferase group 1  28.24 
 
 
399 aa  77.8  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3301  glycosyl transferase, group 1  33.99 
 
 
422 aa  76.6  0.0000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.758108  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0234  glycosyl transferase group 1  37.06 
 
 
385 aa  76.6  0.0000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0580  glycosyl transferase group 1  37.5 
 
 
399 aa  76.3  0.0000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.55279  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  34.64 
 
 
423 aa  75.5  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2088  glycosyl transferase group 1  26.28 
 
 
347 aa  75.9  0.000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  34.76 
 
 
353 aa  75.1  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0984  glycosyl transferase group 1  34.62 
 
 
403 aa  75.5  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0137415 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06690  glycosyltransferase  35.76 
 
 
406 aa  75.1  0.000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3009  glycosyl transferase, group 1  35.25 
 
 
743 aa  75.5  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.188402  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3236  glycosyl transferase group 1  37.58 
 
 
374 aa  73.9  0.000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0188616  hitchhiker  0.000126621 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1133  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  36.49 
 
 
377 aa  73.6  0.000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2463  glycosyl transferase, group 1  38.81 
 
 
385 aa  73.9  0.000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  33.57 
 
 
424 aa  73.6  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3285  glycosyl transferase, group 1  36.69 
 
 
375 aa  73.6  0.000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.254091  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
409 aa  73.6  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3347  glycosyl transferase, group 1  36.69 
 
 
375 aa  73.6  0.000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0957138  normal  0.0861917 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3296  glycosyl transferase, group 1  36.69 
 
 
375 aa  73.6  0.000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.229381 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2285  glycosyl transferase group 1  32.9 
 
 
410 aa  73.2  0.000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0267673  normal  0.0567423 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2177  putative glycosyl transferase  32.1 
 
 
385 aa  72.8  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.010709  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2721  glycosyl transferase, group 1  36.25 
 
 
364 aa  72.8  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.134421  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3257  glycosyl transferase group 1  37.68 
 
 
426 aa  72.8  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4959  glycosyl transferase group 1  27.76 
 
 
399 aa  72.4  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  37.89 
 
 
391 aa  71.2  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4198  glycosyl transferase group 1  32.59 
 
 
405 aa  71.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  30.1 
 
 
370 aa  71.6  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2753  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 
388 aa  71.2  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.580745  normal  0.199234 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0183  glycosyl transferase, group 1  36.25 
 
 
476 aa  71.2  0.00000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  30.13 
 
 
360 aa  71.2  0.00000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1310  group 1 glycosyl transferase  34.44 
 
 
426 aa  70.9  0.00000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0790  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  34.18 
 
 
400 aa  70.9  0.00000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000379704 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0798  glycosyl transferase group 1  29.59 
 
 
396 aa  70.9  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.607654  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5490  glycosyl transferase group 1  36.11 
 
 
402 aa  70.9  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1381  glycosyl transferase group 1  30.54 
 
 
397 aa  71.2  0.00000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000217179 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3411  glycosyl transferase, group 1  34.64 
 
 
425 aa  70.5  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163553  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3592  glycosyl transferase group 1  30.82 
 
 
412 aa  70.5  0.00000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.157633  hitchhiker  0.00114643 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4314  glycosyl transferase group 1  29.76 
 
 
370 aa  70.1  0.00000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.712653  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1159  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.9 
 
 
346 aa  69.7  0.00000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.278047  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0579  sulfolipid sulfoquinovosyldiacylglycerol biosynthesis protein  34.76 
 
 
377 aa  69.7  0.00000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  0.138904 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2028  glycosyltransferase  34.46 
 
 
353 aa  69.7  0.00000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.949426  normal  0.904409 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1181  glycosyl transferase group 1  28.78 
 
 
419 aa  69.7  0.00000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5565  glycosyl transferase group 1  27.62 
 
 
810 aa  69.3  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.896864 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3098  glycosyl transferase, group 1  32.4 
 
 
376 aa  69.3  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.034289  normal  0.933214 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3845  glycosyl transferase, group 1  32.3 
 
 
802 aa  68.9  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.880485  normal  0.505849 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4916  glycosyl transferase group 1  32.43 
 
 
377 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559859 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2962  glycosyl transferase, group 1  38.68 
 
 
409 aa  68.2  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.355294  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1530  glycosyl transferase group 1  36.36 
 
 
393 aa  68.6  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4958  glycosyl transferase group 1  39.13 
 
 
822 aa  68.6  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0651584  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1419  glycosyl transferase, group 1  32.17 
 
 
365 aa  68.6  0.0000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2961  glycosyl transferase, group 1  35.25 
 
 
382 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.197137  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0080  glycosyl transferase group 1  35.07 
 
 
404 aa  68.9  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1751  glycosyl transferase group 1  33.56 
 
 
453 aa  68.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0740  glycosyl transferase, group 1  37.12 
 
 
368 aa  67.8  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1122  glycosyl transferase, group 1  38.02 
 
 
381 aa  68.2  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0425173 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3278  glycosyl transferase group 1  33.59 
 
 
850 aa  67.8  0.0000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
414 aa  68.2  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  30.39 
 
 
419 aa  67.8  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1365  glycosyl transferase group 1  34.4 
 
 
414 aa  67.8  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000226511 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2522  putative glycosyltransferase, group 1  31.79 
 
 
392 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247085  normal  0.0251754 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4446  glycosyl transferase, group 1  30.81 
 
 
426 aa  67.4  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.342615  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2141  glycosyl transferase group 1  31.54 
 
 
394 aa  67.4  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.835748  hitchhiker  0.00544709 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4328  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  32.62 
 
 
381 aa  67.4  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00438832  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2637  glycosyl transferase, group 1  32.56 
 
 
421 aa  67  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.731543  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1803  glycosyl transferase, group 1  32.96 
 
 
409 aa  67.4  0.0000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  37.42 
 
 
392 aa  67.4  0.0000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5198  glycosyl transferase group 1  35.53 
 
 
426 aa  67.4  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.603506  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3735  glycosyl transferase group 1  35.34 
 
 
355 aa  67  0.0000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2493  glycosyl transferase, group 1  32.07 
 
 
353 aa  67  0.0000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0575411  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3119  group 1 glycosyl transferase  33.8 
 
 
400 aa  67  0.0000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1817  glycosyl transferase, group 1  34.83 
 
 
385 aa  66.6  0.0000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4583  glycosyl transferase group 1  31.05 
 
 
396 aa  66.6  0.0000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1581  glycosyl transferase, group 1  24.04 
 
 
359 aa  66.6  0.0000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2654  glycosyl transferase, group 1  31.87 
 
 
388 aa  66.6  0.0000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0179694  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  30.82 
 
 
414 aa  66.6  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>