207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1159 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA1159  glycosyl transferase, group 1 family protein  100 
 
 
346 aa  704    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.278047  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1686  glycosyl transferase, group 1  27.65 
 
 
359 aa  92.8  7e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5790  glycosyl transferase group 1  27.18 
 
 
376 aa  86.7  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0254  glycosyl transferase group 1  29.07 
 
 
389 aa  71.2  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.401969  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3338  glycosyl transferase, group 1  25.9 
 
 
415 aa  69.7  0.00000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.620464  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13791  hypothetical protein  22.86 
 
 
389 aa  67.8  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2469  glycosyl transferase group 1  25.52 
 
 
380 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.568723  normal  0.290599 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4918  group 1 glycosyl transferase  31.64 
 
 
366 aa  65.9  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2801  glycosyl transferase group 1  24.35 
 
 
393 aa  65.9  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0300  glycosyl transferase, group 1  27.45 
 
 
398 aa  63.5  0.000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.122036  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5854  putative glycosyl transferase  25.53 
 
 
381 aa  63.5  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0707632  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3569  glycosyl transferase, group 1  27.62 
 
 
369 aa  63.2  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.798632  decreased coverage  0.00507344 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4955  glycosyl transferase group 1  32.17 
 
 
405 aa  63.2  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1381  glycosyl transferase group 1  27.15 
 
 
391 aa  63.2  0.000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0538  glycosyl transferase group 1  26.35 
 
 
391 aa  62.8  0.000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1310  glycosyl transferase group 1  24.1 
 
 
351 aa  62.8  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0823  glycosyl transferase group 1  25.17 
 
 
380 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13048  transferase  32.14 
 
 
414 aa  60.5  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00789661 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3861  putative glycosyltransferase  24.83 
 
 
398 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.862741 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2585  glycosyl transferase group 1  25.39 
 
 
388 aa  58.9  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.341706  normal  0.530057 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2186  glycosyl transferase group 1  29.92 
 
 
378 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2407  glycosyl transferase, group 1  29.7 
 
 
404 aa  57.8  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0557  glycosyl transferase group 1  24.76 
 
 
399 aa  57.8  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.808631  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3106  glycosyl transferase group 1  28.37 
 
 
382 aa  57.4  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277853  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  27.07 
 
 
390 aa  57  0.0000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2612  glycosyl transferase group 1  28.77 
 
 
407 aa  57  0.0000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.198557 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1131  glycosyl transferase group 1  26.9 
 
 
904 aa  56.2  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.845699  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2950  glycosyl transferase group 1  30.56 
 
 
899 aa  55.8  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2088  glycosyl transferase group 1  28.07 
 
 
347 aa  55.5  0.000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2213  glycosyl transferase group 1  30.13 
 
 
395 aa  55.8  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0202  glycosyl transferase, group 1  28.47 
 
 
369 aa  55.8  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2084  glycosyl transferase group 1  22.77 
 
 
390 aa  54.7  0.000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.573542 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3263  glycosyl transferase group 1  28.15 
 
 
425 aa  55.1  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1867  glycosyl transferase, group 1  29.29 
 
 
412 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3090  glycosyl transferase, group 1  27.27 
 
 
440 aa  54.3  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1913  glycosyl transferase, group 1  29.29 
 
 
412 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.434704  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1847  glycosyl transferase, group 1  29.29 
 
 
412 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.469612  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4262  glycosyl transferase, group 1  29.29 
 
 
410 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.666553  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  22.7 
 
 
391 aa  54.7  0.000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6549  glycosyl transferase group 1  33.96 
 
 
427 aa  53.9  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.245344 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3735  glycosyl transferase group 1  27.6 
 
 
355 aa  53.9  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22600  putative glycosyl transferase  32.17 
 
 
351 aa  53.5  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.809409  hitchhiker  0.000260588 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0579  sulfolipid sulfoquinovosyldiacylglycerol biosynthesis protein  32.6 
 
 
377 aa  53.5  0.000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  0.138904 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3765  glycosyl transferase group 1  28.86 
 
 
373 aa  53.5  0.000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0744  glycosyl transferase group 1  32.39 
 
 
363 aa  52.4  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.299994  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1160  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.61 
 
 
383 aa  52  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.121321  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3000  glycosyl transferase, group 1  29.29 
 
 
384 aa  52.4  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0763479  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2372  glycosyl transferase, group 1  25.81 
 
 
383 aa  52.4  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.732911  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1507  glycosyl transferase group 1  31.93 
 
 
395 aa  52  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.255833 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4678  putative glycosyl transferase  28.57 
 
 
406 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.364939  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3860  glycosyl transferase, group 1  27.41 
 
 
442 aa  52  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.185874 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3582  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
381 aa  51.6  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53380  putative glycosyl transferase  27.92 
 
 
406 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0237616 
 
 
-
 
NC_004310  BR0529  mannosyltransferase, putative  29.41 
 
 
372 aa  50.8  0.00004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.142302  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2328  glycosyl transferase group 1  26.62 
 
 
871 aa  50.8  0.00004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2655  glycosyl transferase, group 1  29.49 
 
 
395 aa  50.4  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.268297  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  26.98 
 
 
373 aa  50.4  0.00004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0533  putative mannosyltransferase  29.41 
 
 
372 aa  50.8  0.00004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1373  Glycosyltransferase-like protein  24.77 
 
 
373 aa  50.4  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0758  glycosyl transferase group 1  25.6 
 
 
371 aa  50.8  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.11154 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0253  glycosyl transferase, group 1  26.44 
 
 
358 aa  50.1  0.00005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1818  glycosyl transferase, group 1  24.78 
 
 
382 aa  50.1  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2096  glycosyl transferase, group 1  30.77 
 
 
410 aa  50.4  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3711  glycosyl transferase group 1  22.54 
 
 
376 aa  50.4  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.202497  normal  0.0584888 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2082  glycosyl transferase group 1  32.61 
 
 
384 aa  50.1  0.00006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.3042 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2920  glycosyl transferase group 1  29.94 
 
 
435 aa  50.1  0.00006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3565  glycosyl transferase group 1  27.74 
 
 
390 aa  50.1  0.00006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2860  glycosyltransferase  26.11 
 
 
430 aa  49.7  0.00007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3604  glycosyl transferase group 1  24.82 
 
 
387 aa  49.7  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.592965  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  28.06 
 
 
353 aa  49.7  0.00008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1409  glycosyl transferase group 1  27.22 
 
 
355 aa  49.7  0.00008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.201538 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0182  glycosyl transferase group 1  29.19 
 
 
389 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.700197  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3115  group 1 glycosyl transferase  26.11 
 
 
374 aa  48.9  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1174  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.8 
 
 
403 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1247  glycosyl transferase, group 1  30.94 
 
 
391 aa  48.5  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.174724  normal  0.678195 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0055  glycosyl transferase group 1  21.94 
 
 
376 aa  48.1  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.557703  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  27.1 
 
 
424 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1093  glycosyl transferase group 1  29.94 
 
 
384 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1238  glycosyl transferase group 1  29 
 
 
349 aa  48.5  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0206606  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5311  glycosyl transferase group 1  31.88 
 
 
376 aa  48.5  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1012  glycosyl transferase, group 1  28.08 
 
 
406 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2081  glycosyl transferase group 1  26.29 
 
 
374 aa  47.8  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4841  glycosyl transferase, group 1  27.93 
 
 
374 aa  47.8  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000142373  normal  0.0561788 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0138  glycosyl transferase group 1  24.4 
 
 
405 aa  47.8  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0232  glycosyl transferase group 1  22.66 
 
 
397 aa  47.8  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000273015  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1822  glycosyl transferase, group 1  32.61 
 
 
345 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.179572  normal  0.795159 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3543  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 
373 aa  47.4  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.219559 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  31.72 
 
 
371 aa  47.4  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5134  glycosyl transferase group 1  25.1 
 
 
386 aa  47.4  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1382  glycosyltransferase-like protein  26.74 
 
 
387 aa  47  0.0005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.702037  normal  0.362808 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0202  glycosyl transferase, group 1  24.56 
 
 
381 aa  47  0.0005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1772  group 1 glycosyl transferase  27.54 
 
 
392 aa  47  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.680527  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35640  putative transferase  32.76 
 
 
367 aa  47  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000661418 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2630  glycosyl transferase group 1  33.1 
 
 
438 aa  47  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.451665  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2376  glycosyl transferase group 1  29.73 
 
 
372 aa  46.6  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3540  glycosyl transferase group 1  33.01 
 
 
431 aa  46.6  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.782852  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6548  glycosyl transferase group 1  30.19 
 
 
405 aa  46.6  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.252141 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4023  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
352 aa  46.2  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2869  glycosyl transferase, group 1  27.94 
 
 
816 aa  46.6  0.0007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.541026 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0405  glycosyl transferase group 1  28.18 
 
 
351 aa  46.6  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>