More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6548 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_6548  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
405 aa  799    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.252141 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6549  glycosyl transferase group 1  47.41 
 
 
427 aa  304  2.0000000000000002e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.245344 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2879  glycosyl transferase group 1  31.29 
 
 
385 aa  113  5e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.658622  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2971  glycosyl transferase group 1  31.07 
 
 
391 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.176769  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1818  glycosyl transferase, group 1  29.1 
 
 
382 aa  103  4e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1006  glycosyl transferase group 1  27.93 
 
 
382 aa  103  8e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1382  glycosyltransferase-like protein  27.36 
 
 
387 aa  99.8  8e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.702037  normal  0.362808 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0890  a-glycosyltransferase  25 
 
 
420 aa  95.9  1e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0247924  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4958  glycosyl transferase group 1  24.07 
 
 
419 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.830088 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0380  glycosyl transferase group 1  23.4 
 
 
391 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.941  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0232  glycosyl transferase group 1  29.91 
 
 
397 aa  79.7  0.00000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000273015  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3374  glycosyl transferase group 1  28.28 
 
 
408 aa  73.2  0.000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0766435  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0421  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.82 
 
 
411 aa  72.8  0.00000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0822776  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0364  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.07 
 
 
412 aa  72.4  0.00000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2612  glycosyl transferase group 1  27.68 
 
 
407 aa  71.2  0.00000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.198557 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11840  glycosyltransferase  30.44 
 
 
411 aa  68.6  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.363429  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05800  glycosyltransferase  30.33 
 
 
437 aa  68.6  0.0000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.504823  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10494  mannosyltransferase  28.87 
 
 
480 aa  67.4  0.0000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00261948  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4147  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  35.27 
 
 
379 aa  66.6  0.0000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  35.98 
 
 
389 aa  64.7  0.000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2655  glycosyl transferase, group 1  31.49 
 
 
395 aa  64.7  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.268297  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0476  glycosyl transferase group 1  25.25 
 
 
361 aa  64.7  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4300  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  36.21 
 
 
379 aa  62  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1121  glycosyl transferase group 1  23.04 
 
 
386 aa  60.8  0.00000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.606067  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0142  glycosyl transferase, group 1  27.06 
 
 
404 aa  60.5  0.00000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4278  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  36.21 
 
 
379 aa  60.5  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.54539  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3800  glycosyl transferase group 1  32.63 
 
 
402 aa  60.1  0.00000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17673  normal  0.211423 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0690  glycosyl transferase, group 1  30.2 
 
 
394 aa  60.1  0.00000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0783  glycosyl transferase group 1  34.2 
 
 
394 aa  59.7  0.00000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.492233  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  34.03 
 
 
398 aa  59.7  0.00000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0211  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.7 
 
 
404 aa  58.9  0.0000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5664  putative glycosyl transferase, group 1  36.31 
 
 
385 aa  58.9  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.721613  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1905  glycosyltransferase  32.85 
 
 
402 aa  58.9  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2168  glycosyl transferase group 1  28.8 
 
 
399 aa  58.2  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05360  Glycosyl transferase, group 1  29.88 
 
 
370 aa  58.2  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.012164  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2668  glycosyl transferase, group 1  32.73 
 
 
502 aa  57  0.0000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1351  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.38 
 
 
390 aa  57  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1562  glycosyl transferase group 1  32.42 
 
 
381 aa  56.6  0.0000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.395728  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05710  glycosyltransferase  31.87 
 
 
379 aa  55.8  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2688  glycosyl transferase group 1  28.1 
 
 
387 aa  56.2  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.504834  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4652  glycosyl transferase group 1  28.41 
 
 
396 aa  55.5  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3591  glycosyl transferase group 1  31.82 
 
 
416 aa  55.5  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1287  glycosyl transferase group 1  28.63 
 
 
392 aa  55.1  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4100  glycosyl transferase group 1  23.32 
 
 
358 aa  54.3  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.17338  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3625  glycosyl transferase, group 1  23.32 
 
 
358 aa  54.3  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5160  glycosyl transferase group 1  30.19 
 
 
800 aa  54.3  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.170469  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4961  glycosyl transferase group 1  34.27 
 
 
396 aa  54.3  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2063  glycosyl transferase, group 1  26.32 
 
 
392 aa  54.3  0.000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3447  group 1 glycosyl transferase  26.34 
 
 
395 aa  53.9  0.000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2257  glucosyltransferase  30.29 
 
 
426 aa  53.9  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.150164  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0758  glycosyl transferase group 1  28.34 
 
 
371 aa  53.9  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.11154 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0283  glycosyl transferase group 1  26.6 
 
 
360 aa  53.9  0.000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0016  glycosyl transferase group 1  24.1 
 
 
361 aa  53.5  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1539  glycosyl transferase, group 1  21.68 
 
 
360 aa  53.5  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.29057 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1267  general glycosylation pathway protein  30.71 
 
 
376 aa  53.5  0.000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.832123  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0986  glycosyltransferase  30.8 
 
 
383 aa  53.5  0.000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.075214 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4015  glycosyl transferase, group 1  25.62 
 
 
384 aa  53.5  0.000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3427  glycosyl transferase group 1  31.98 
 
 
435 aa  53.5  0.000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.000419175  normal  0.0303582 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2669  glycosyl transferase, group 1  30.59 
 
 
404 aa  53.1  0.000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2830  glycosyl transferase group 1  29.81 
 
 
380 aa  53.1  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0420061 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0857  glycosyl transferase group 1  23.71 
 
 
355 aa  53.1  0.000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.123894  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0901  hypothetical protein  18.9 
 
 
372 aa  53.1  0.000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0357056 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2761  glycosyl transferase group 1  28.17 
 
 
419 aa  52.8  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.399192  normal  0.235509 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  33 
 
 
367 aa  52.4  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.37 
 
 
407 aa  52.4  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.728152  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1089  glycosyl transferase group 1  23.04 
 
 
355 aa  52.4  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.221071  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1461  glycosyl transferase group 1  24.9 
 
 
362 aa  52.4  0.00001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5854  putative glycosyl transferase  29.21 
 
 
381 aa  52.4  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0707632  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0313  glycosyl transferase group 1  30.16 
 
 
398 aa  52.4  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1142  general glycosylation pathway protein  30.71 
 
 
376 aa  52.4  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5541  glycosyl transferase group 1  34.62 
 
 
518 aa  52.8  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0291  glycosyl transferase, group 1  28.27 
 
 
382 aa  51.6  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.614818  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2134  glycosyl transferase group 1  31.16 
 
 
370 aa  52  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.873369  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1019  glycosyl transferase group 1  29.39 
 
 
402 aa  52.4  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0579  sulfolipid sulfoquinovosyldiacylglycerol biosynthesis protein  26.75 
 
 
377 aa  52  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  0.138904 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2434  glycosyl transferase, group 1  32.37 
 
 
503 aa  51.6  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0653  UDP-N-acetylglucosamine  31.02 
 
 
443 aa  51.6  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.119521  hitchhiker  0.000107829 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5787  glycosyl transferase group 1  25.61 
 
 
415 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2445  glycosyl transferase group 1  30 
 
 
375 aa  51.6  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0650  glycosyl transferase, group 1  26.44 
 
 
439 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.303118  normal  0.416053 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4231  glycogen synthase  29.2 
 
 
382 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.294207 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2436  glycosyl transferase group 1  28.06 
 
 
385 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.830296 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2191  glycogen synthase  32.42 
 
 
382 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2460  glycosyl transferase group 1  33.53 
 
 
381 aa  52  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2912  glycosyl transferase group 1  27.98 
 
 
412 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.341746  normal  0.205284 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  27.59 
 
 
373 aa  51.2  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0826  glycosyl transferase group 1  31.9 
 
 
350 aa  51.2  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0454  nitric oxide reductase large subunit  34.38 
 
 
347 aa  51.2  0.00003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0224888  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2502  glycosyl transferase, group 1  27.27 
 
 
387 aa  51.6  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.417702 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4001  glycogen synthase  28.83 
 
 
382 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0312479  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0461  glycosyl transferase group 1  33.03 
 
 
390 aa  51.6  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.208871  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4075  glycogen synthase  28.83 
 
 
382 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0832432  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02650  UDP-N-acetylglucosamine: 1L-myo-inositol-1-phosphate 1-alpha-D-N-acetylglucosaminyltransferase  29.23 
 
 
431 aa  51.2  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.298746  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1144  glycosyl transferase group 1  24.51 
 
 
386 aa  51.2  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.157277  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0978  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.54 
 
 
382 aa  50.8  0.00004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000355781  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0295  hypothetical protein  28 
 
 
413 aa  50.8  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  26.46 
 
 
401 aa  50.8  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3592  glycosyl transferase group 1  26.02 
 
 
412 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.157633  hitchhiker  0.00114643 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0126  glycosyl transferase group 1  31.18 
 
 
543 aa  50.8  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2807  glycosyl transferase group 1  26.25 
 
 
412 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>