More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0126 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0126  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 543 aa  1092    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1181  glycosyltransferase, group 1 family protein  34.81 
 
 		 579 aa  315  9.999999999999999e-85  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3637  glycosyl transferase group 1  32.05 
 
 		 756 aa  129  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.871876  hitchhiker  0.00349398 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4075  glycosyl transferase, group 1  29.86 
 
 		 744 aa  120  6e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1511  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.33 
 
 		 382 aa  106  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4074  glycosyl transferase, group 1  27.33 
 
 		 773 aa  106  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3644  glycosyl transferase group 1  28.62 
 
 		 478 aa  100  8e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0102527  decreased coverage  0.0000773484 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4094  glycosyl transferase, group 1  27.88 
 
 		 468 aa  88.2  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.537371  normal  0.779331 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0144  glycosyltransferase-like protein  28.62 
 
 		 368 aa  82.4  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6505  Glycosyltransferase-like protein  44.54 
 
 		 393 aa  80.5  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6393  glycosyl transferase group 1  29.65 
 
 		 391 aa  71.2  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.224471 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1562  glycosyl transferase group 1  33.53 
 
 		 381 aa  71.2  0.00000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.395728  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2253  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.85 
 
 		 371 aa  70.9  0.00000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.531555  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  30.23 
 
 		 398 aa  68.9  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3163  glycosyl transferase family 2  24.2 
 
 		 1177 aa  69.3  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2196  group 1 glycosyl transferase  29.39 
 
 		 391 aa  68.6  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.844277 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2933  glycosyl transferase family 2  23.62 
 
 		 1177 aa  68.2  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2418  glycosyl transferase group 1  31.97 
 
 		 396 aa  66.2  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0392541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  26.24 
 
 		 371 aa  66.6  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3244  glycosyl transferase, group 1  29.21 
 
 		 367 aa  64.3  0.000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.912834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2692  glycosyl transferase, group 1  25.93 
 
 		 367 aa  64.3  0.000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000235502  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  38.74 
 
 		 377 aa  64.3  0.000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0986  glycosyl transferase group 1  27.39 
 
 		 429 aa  63.9  0.000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.32714  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1425  glycosyl transferase group 1  36.51 
 
 		 468 aa  63.2  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.703524  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2597  glycosyl transferase group 1  29.34 
 
 		 367 aa  62.8  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0054  glycosyl transferase group 1  29.41 
 
 		 305 aa  62.4  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.510495  normal  0.478799 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  26.59 
 
 		 399 aa  62.8  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2206  glycosyl transferase group 1  27.01 
 
 		 371 aa  61.6  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0890  glycosyl transferase group 1  28.3 
 
 		 435 aa  62  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.102744  decreased coverage  0.000533539 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0824  glycosyl transferase group 1  26.32 
 
 		 384 aa  61.6  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31396  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0054  glycosyl transferase group 1  28.65 
 
 		 364 aa  61.2  0.00000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.000000226756  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1704  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 410 aa  61.2  0.00000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6757  UDP-N-acetylglucosamine  28.96 
 
 		 417 aa  60.8  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0305  putative glycosyl transferase  33.04 
 
 		 329 aa  60.5  0.00000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  28.03 
 
 		 376 aa  60.1  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2591  glycosyl transferase, group 1  23.97 
 
 		 373 aa  59.7  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  23.97 
 
 		 378 aa  59.7  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2719  glycosyl transferase, group 1  38.61 
 
 		 387 aa  59.7  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0541086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0904  glycosyltransferase  24.85 
 
 		 430 aa  59.7  0.0000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.397336  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0825  glycosyl transferase group 1  36.36 
 
 		 382 aa  59.3  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1111  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.85 
 
 		 427 aa  59.7  0.0000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0854  glycosyl transferase, group 1  35.04 
 
 		 404 aa  58.9  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0579816 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05360  Glycosyl transferase, group 1  36.21 
 
 		 370 aa  59.3  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.012164  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3201  glycosyl transferase group 1  31.58 
 
 		 505 aa  58.9  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11690  glycogen synthase  31.6 
 
 		 398 aa  59.3  0.0000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.328537  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0430  glycosyl transferase group 1  27.48 
 
 		 379 aa  59.3  0.0000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0131441  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1144  general glycosylation pathway protein  25.35 
 
 		 365 aa  58.9  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5001  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.56 
 
 		 365 aa  58.5  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1526  glycosyltransferase  34.23 
 
 		 369 aa  58.5  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2152  glycosyl transferase, group 1  29.46 
 
 		 387 aa  58.5  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0594  general glycosylation pathway protein  25.93 
 
 		 365 aa  58.5  0.0000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15860  glycogen synthase  26.07 
 
 		 397 aa  58.5  0.0000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.121629  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2329  glycosyl transferase, group 1  26.4 
 
 		 390 aa  58.2  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0123279  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1716  glycosyl transferase, group 1  34.71 
 
 		 390 aa  58.2  0.0000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.740017  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4919  group 1 glycosyl transferase  32.41 
 
 		 386 aa  57.8  0.0000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.568144  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0297  glycosyl transferase, group 1  32.39 
 
 		 371 aa  58.2  0.0000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1269  general glycosylation pathway protein  25.35 
 
 		 365 aa  57.8  0.0000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.871601  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1499  glycosyl transferase, group 1  25.23 
 
 		 363 aa  57.8  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2878  glycosyl transferase, group 1  23.08 
 
 		 380 aa  57.8  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00305782 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1247  glycosyl transferase, group 1  29.93 
 
 		 391 aa  57.8  0.0000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.174724  normal  0.678195 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1653  glycosyl transferase, group 1  34.33 
 
 		 374 aa  57.8  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2282  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  30.2 
 
 		 406 aa  57.4  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000100013 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2225  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  30.82 
 
 		 406 aa  57.4  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.044252  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1815  glycosyl transferase, group 1  29.67 
 
 		 381 aa  57.4  0.0000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  31.76 
 
 		 409 aa  57.4  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1682  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.58 
 
 		 420 aa  57  0.0000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.961392 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2440  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  30.2 
 
 		 406 aa  57  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000788378 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2326  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  30.2 
 
 		 406 aa  57  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.45919  normal  0.147649 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2333  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  30.82 
 
 		 406 aa  57  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.68197 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  35.96 
 
 		 393 aa  57  0.0000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0798  glycosyl transferase group 1  30.4 
 
 		 396 aa  57  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.607654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1357  glycosyl transferase, group 1  27.27 
 
 		 364 aa  57  0.0000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3098  glycosyl transferase group 1  34.78 
 
 		 391 aa  57  0.0000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.1957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0742  glycosyl transferase, group 1  27.69 
 
 		 386 aa  56.2  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1252  GalNAc alpha-1,4-transferase  25.95 
 
 		 366 aa  56.6  0.000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4446  glycosyl transferase, group 1  31.67 
 
 		 426 aa  56.6  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.342615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3660  glycosyl transferase, group 1  29.75 
 
 		 754 aa  56.6  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.333169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5285  glycosyl transferase group 1  31.97 
 
 		 527 aa  56.6  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.64584  normal  0.253586 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001321  capsular polysaccharide synthesis enzyme cpsF glycosyltransferase  34.58 
 
 		 350 aa  56.2  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  23.76 
 
 		 379 aa  55.8  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0362  glycosyl transferase group 1  28.41 
 
 		 380 aa  55.8  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0673622  normal  0.109102 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2660  glycosyl transferase, group 1  32.17 
 
 		 389 aa  55.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.138584 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5392  glycosyltransferase  30 
 
 		 374 aa  55.8  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0989  UDP-N-acetylglucosamine  26.3 
 
 		 458 aa  56.2  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0884879  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2715  glycosyl transferase group 1  31.58 
 
 		 421 aa  55.8  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.770455 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0586  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.4 
 
 		 365 aa  55.8  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000129984  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0139  glycosyl transferase, group 1  29.29 
 
 		 402 aa  55.8  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.211857  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2973  UDP-N-acetylglucosamine  26.12 
 
 		 417 aa  55.8  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3401  glycosyl transferase group 1  28.38 
 
 		 369 aa  56.2  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  28.16 
 
 		 394 aa  55.8  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3055  glycosyl transferase, group 1  23.39 
 
 		 439 aa  55.5  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1231  glycosyl transferase group 1  29.33 
 
 		 372 aa  55.5  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0956  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.57 
 
 		 435 aa  55.5  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.611098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2004  glycosyl transferase, group 1  26.55 
 
 		 403 aa  55.5  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0914  capsular polysaccharide biosynthesis protein  22.16 
 
 		 375 aa  55.1  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000157523  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3028  glycosyl transferase family protein  28.14 
 
 		 704 aa  55.1  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0957  glycosyl transferase, group 1  29.92 
 
 		 397 aa  55.1  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.599861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2078  hypothetical protein  34.15 
 
 		 500 aa  55.1  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  31.3 
 
 		 391 aa  54.7  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  26.92 
 
 		 353 aa  55.1  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>