More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0305 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0305  putative glycosyl transferase  100 
 
 
329 aa  682    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003534  glycosyltransferase  44.94 
 
 
356 aa  268  8.999999999999999e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02227  hypothetical protein  43.2 
 
 
358 aa  259  3e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2019  glycosyl transferase, group 1  26.59 
 
 
363 aa  89.4  9e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.891192  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2364  Glycosyltransferase-like protein  26.02 
 
 
395 aa  87.8  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  24.72 
 
 
377 aa  86.3  7e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  26.77 
 
 
346 aa  84.3  0.000000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  23.48 
 
 
377 aa  80.9  0.00000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0143  glycosyltransferase-like protein  27.05 
 
 
371 aa  79.7  0.00000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0838  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.5 
 
 
419 aa  75.1  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  25.52 
 
 
379 aa  73.6  0.000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0450  putative polysaccharide biosynthesis protein  28.72 
 
 
365 aa  72.8  0.000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2867  glycosyl transferase, group 1  27.08 
 
 
415 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1793  glycosyl transferase group 1  24.73 
 
 
388 aa  71.2  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.488843  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2889  glycosyl transferase group 1  27.18 
 
 
353 aa  70.5  0.00000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4244  glycosyl transferase group 1  25.08 
 
 
407 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.973071  normal  0.179652 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  24.02 
 
 
394 aa  69.7  0.00000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1097  glycosyl transferase group 1  21.9 
 
 
349 aa  69.3  0.00000000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.372916  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  31.62 
 
 
390 aa  69.3  0.00000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2719  glycosyl transferase, group 1  30.74 
 
 
387 aa  69.3  0.00000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0541086  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2758  glycosyl transferase group 1  24.66 
 
 
356 aa  69.3  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0673851  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2152  glycosyl transferase, group 1  27.54 
 
 
387 aa  68.6  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0321  glycosyl transferase group 1  26.76 
 
 
388 aa  68.9  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0292  glycosyl transferase, group 1  24.08 
 
 
365 aa  68.9  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.937851  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  26.3 
 
 
398 aa  68.9  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2329  glycosyl transferase, group 1  22.96 
 
 
390 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0123279  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  25.09 
 
 
378 aa  67.8  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05360  Glycosyl transferase, group 1  32.54 
 
 
370 aa  67.8  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.012164  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  24.66 
 
 
376 aa  67.8  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0407  glycosyl transferase group 1  28.11 
 
 
750 aa  68.6  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0631  glycosyl transferase group 1  31.25 
 
 
394 aa  67.4  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  24.34 
 
 
371 aa  67  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1438  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.83 
 
 
356 aa  66.6  0.0000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1976  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.87 
 
 
373 aa  66.2  0.0000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4566  glycosyl transferase group 1  28.4 
 
 
371 aa  66.6  0.0000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.416296  normal  0.520192 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2001  glycosyl transferase, group 1  27.34 
 
 
380 aa  66.2  0.0000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0253  glycosyl transferase, group 1  26.42 
 
 
358 aa  66.2  0.0000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1197  glycosyl transferase, group 1  23.23 
 
 
374 aa  65.9  0.0000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9234  putative glycosyl transferase, group 1  28.42 
 
 
388 aa  65.9  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1357  glycosyl transferase, group 1  36.72 
 
 
364 aa  65.9  0.0000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2933  glycosyl transferase family 2  30.65 
 
 
1177 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0459  glycosytransferase, putative  24.64 
 
 
350 aa  65.1  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00630871  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0904  glycosyl transferase, group 1  28.49 
 
 
890 aa  65.9  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.145803  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2739  glycosyl transferase group 1  28 
 
 
377 aa  65.1  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.363262  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3163  glycosyl transferase family 2  30.65 
 
 
1177 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3516  glycosyl transferase group 1  24.86 
 
 
367 aa  64.7  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4950  glycosyl transferase  24.21 
 
 
360 aa  64.3  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00550219  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3453  glycosyl transferase group 1  22.39 
 
 
347 aa  64.3  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1724  group 1 glycosyl transferase  29.03 
 
 
440 aa  64.3  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0814072  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5001  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.93 
 
 
365 aa  63.9  0.000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3114  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
369 aa  63.9  0.000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000549793  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0430  glycosyl transferase group 1  21.02 
 
 
379 aa  63.5  0.000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0131441  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3028  glycosyl transferase family protein  22.92 
 
 
704 aa  63.9  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2084  glycosyl transferase group 1  25.43 
 
 
390 aa  63.9  0.000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.573542 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2765  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.58 
 
 
365 aa  63.5  0.000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.367187  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  22.57 
 
 
446 aa  63.2  0.000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4240  glycosyl transferase group 1  26.64 
 
 
418 aa  62.8  0.000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1204  glycosyl transferase group 1  32.54 
 
 
409 aa  63.2  0.000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07651  glycosyltransferase  23.75 
 
 
365 aa  62.8  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.457452  hitchhiker  0.00512375 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3582  glycosyl transferase group 1  26.56 
 
 
381 aa  62.8  0.000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3271  glycosyl transferase group 1  27.85 
 
 
768 aa  62.4  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  26.05 
 
 
393 aa  62.4  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0775  glycosyltransferase-like protein  26.25 
 
 
371 aa  62.4  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0676  glycosyl transferase group 1  23.77 
 
 
374 aa  62.4  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4246  glycosyl transferase group 1  23.48 
 
 
753 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1723  glycosyl transferase, group 1  30.08 
 
 
380 aa  62.4  0.00000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.952593  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0399  glycosyl transferase group 1  25.26 
 
 
388 aa  62.4  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1201  WbwZ  22.88 
 
 
369 aa  62  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01950  predicted glycosyl transferase  27.37 
 
 
406 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.144977  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1604  glycosyl transferase group 1  25.07 
 
 
362 aa  61.2  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000498756  normal  0.0753767 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1499  glycosyl transferase, group 1  31.01 
 
 
363 aa  61.2  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2196  group 1 glycosyl transferase  24.24 
 
 
391 aa  61.6  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.844277 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1160  glycosyl transferase group 1  28.31 
 
 
385 aa  61.6  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000209348 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1955  glycosyl transferase group 1  30.5 
 
 
768 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.303263  normal  0.277598 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5562  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.34 
 
 
356 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  21.47 
 
 
536 aa  61.6  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0399  glycosyl transferase, group 1  25.3 
 
 
377 aa  61.2  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01939  hypothetical protein  27.37 
 
 
406 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.156433  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1653  glycosyl transferase, group 1  23.89 
 
 
374 aa  61.6  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6505  Glycosyltransferase-like protein  22.87 
 
 
393 aa  61.6  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2209  glycosyl transferase group 1  23.42 
 
 
379 aa  61.6  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  25.43 
 
 
373 aa  62  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3357  glycosyl transferase group 1  29.53 
 
 
388 aa  61.2  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.656502  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1586  glycosyl transferase, group 1  24.82 
 
 
355 aa  61.2  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.381696  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3553  glycosyl transferase group 1  24.18 
 
 
403 aa  60.8  0.00000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0516541  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1112  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.32 
 
 
366 aa  60.8  0.00000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0405  glycosyl transferase group 1  25.79 
 
 
412 aa  61.2  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.224241 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  22.73 
 
 
390 aa  60.8  0.00000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1425  glycosyl transferase group 1  24.16 
 
 
436 aa  60.5  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3626  glycosyl transferase, group 1  23.43 
 
 
393 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1276  glycosyl transferase group 1  24.4 
 
 
378 aa  60.5  0.00000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.680838  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5686  glycosyl transferase group 1  29.09 
 
 
1080 aa  60.1  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0824  glycosyl transferase group 1  24.06 
 
 
384 aa  60.1  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31396  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1102  glycosyl transferase group 1  34.43 
 
 
358 aa  60.1  0.00000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0154  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.05 
 
 
360 aa  59.7  0.00000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01306  Glycosyl transferase, group 1  22.85 
 
 
366 aa  59.7  0.00000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  30.43 
 
 
391 aa  59.7  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1251  GalNAc alpha-1,4-transferase  27.16 
 
 
354 aa  59.7  0.00000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0126  glycosyl transferase group 1  33.04 
 
 
543 aa  60.1  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0054  glycosyl transferase group 1  27.78 
 
 
364 aa  59.7  0.00000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.000000226756  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>