More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3644 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3644  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 478 aa  939    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0102527  decreased coverage  0.0000773484 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4094  glycosyl transferase, group 1  69.96 
 
 		 468 aa  614  9.999999999999999e-175  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.537371  normal  0.779331 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3637  glycosyl transferase group 1  45.33 
 
 		 756 aa  337  3.9999999999999995e-91  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.871876  hitchhiker  0.00349398 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4075  glycosyl transferase, group 1  39.83 
 
 		 744 aa  312  7.999999999999999e-84  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4074  glycosyl transferase, group 1  42.69 
 
 		 773 aa  293  6e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 		 378 aa  107  4e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0126  glycosyl transferase group 1  28.62 
 
 		 543 aa  100  6e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3163  glycosyl transferase family 2  23.2 
 
 		 1177 aa  100  7e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2933  glycosyl transferase family 2  23.2 
 
 		 1177 aa  99.8  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3096  glycosyl transferase, group 1  33.47 
 
 		 439 aa  98.6  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.332935  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  30.08 
 
 		 377 aa  94.7  3e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1511  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.96 
 
 		 382 aa  93.2  9e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1817  glycosyl transferase, group 1  35.61 
 
 		 385 aa  92  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3803  glycosyl transferase group 1  24.68 
 
 		 390 aa  90.9  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.395317 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  31.08 
 
 		 423 aa  90.1  7e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1421  glycosyl transferase, group 1  29.38 
 
 		 399 aa  89  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2141  glycosyl transferase group 1  24.53 
 
 		 394 aa  88.2  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.835748  hitchhiker  0.00544709 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  29.38 
 
 		 370 aa  87.8  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10750  glycosyltransferase  30 
 
 		 399 aa  87.4  4e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.944872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3582  glycosyl transferase group 1  26.85 
 
 		 381 aa  87.4  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1181  glycosyltransferase, group 1 family protein  23.42 
 
 		 579 aa  87.8  4e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1456  glycosyl transferase, group 1  37.56 
 
 		 409 aa  87.4  5e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  27.68 
 
 		 377 aa  87  7e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  24.81 
 
 		 394 aa  86.7  8e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0365  glycosyl transferase group 1  32.18 
 
 		 387 aa  86.7  8e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1999  glycosyl transferase group 1  29.52 
 
 		 403 aa  85.9  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1509  glycosyl transferase, group 1  34.67 
 
 		 425 aa  85.1  0.000000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  31.69 
 
 		 399 aa  85.9  0.000000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3139  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.82 
 
 		 400 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.425615 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1972  glycosyl transferase, group 1  29.8 
 
 		 415 aa  85.1  0.000000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2436  glycosyl transferase group 1  27.2 
 
 		 385 aa  84.7  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.830296 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4439  glycosyl transferase group 1  32.28 
 
 		 369 aa  84.3  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2717  glycosyl transferase, group 1  31.96 
 
 		 389 aa  84.3  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114307  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3411  glycosyl transferase, group 1  28.97 
 
 		 425 aa  84.3  0.000000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2385  glycosyl transferase group 1  26.8 
 
 		 385 aa  83.2  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  26.79 
 
 		 373 aa  82.4  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1784  glycosyl transferase, group 1  29.47 
 
 		 379 aa  82.8  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1193  glycosyl transferase, group 1  25.64 
 
 		 371 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2575  glycosyl transferase, group 1  34.81 
 
 		 411 aa  82.4  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15860  glycogen synthase  25.96 
 
 		 397 aa  82  0.00000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.121629  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2681  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 		 376 aa  82.4  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21730  glycogen synthase  28.1 
 
 		 404 aa  81.6  0.00000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0690  glycosyl transferase, group 1  29.7 
 
 		 393 aa  81.6  0.00000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0992271  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0986  glycosyltransferase  29.18 
 
 		 383 aa  81.6  0.00000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.075214 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4231  glycogen synthase  25.08 
 
 		 382 aa  81.6  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.294207 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2719  glycosyl transferase, group 1  29.61 
 
 		 387 aa  81.6  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0541086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1538  glycosyl transferase, group 1  30.46 
 
 		 379 aa  80.9  0.00000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  30.96 
 
 		 414 aa  80.9  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03941  putative glycosyl transferase, group 1  25 
 
 		 421 aa  80.9  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3566  glycosyl transferase group 1  26.67 
 
 		 407 aa  80.9  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0294  glycosyl transferase, group 1  32.91 
 
 		 413 aa  80.5  0.00000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2692  glycosyl transferase, group 1  20.52 
 
 		 367 aa  80.1  0.00000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000235502  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1732  putative glycosyl transferase, group 1  27.17 
 
 		 424 aa  80.5  0.00000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1524  glycosyl transferase, group 1  28.28 
 
 		 379 aa  80.1  0.00000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.986628  normal  0.661565 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1382  glycosyl transferase group 1  28.83 
 
 		 376 aa  80.1  0.00000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0731677  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0183  glycosyl transferase group 1  25 
 
 		 406 aa  80.1  0.00000000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.05 
 
 		 407 aa  80.1  0.00000000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.728152  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0185  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 		 406 aa  80.1  0.00000000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0720154  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3107  glycosyl transferase group 1  32.35 
 
 		 426 aa  80.1  0.00000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11690  glycogen synthase  28.22 
 
 		 398 aa  80.1  0.00000000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.328537  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1276  glycosyl transferase group 1  25.96 
 
 		 378 aa  79.3  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.680838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  25.75 
 
 		 424 aa  79.7  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0393  putative glycosyl transferase, group 1  24.68 
 
 		 388 aa  79.3  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.336091  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2463  glycosyl transferase, group 1  30.42 
 
 		 385 aa  79.7  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1523  glycosyl transferase, group 1  26.37 
 
 		 413 aa  79.7  0.0000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.429358 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04491  putative glycosyl transferase, group 1  27.17 
 
 		 424 aa  79.3  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2715  glycosyl transferase group 1  34.3 
 
 		 421 aa  79.3  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.770455 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4001  glycogen synthase  24.77 
 
 		 382 aa  79  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0312479  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2906  glycosyl transferase group 1  33.52 
 
 		 400 aa  79.3  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.61318 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4075  glycogen synthase  24.77 
 
 		 382 aa  79  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0832432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1032  glycosyl transferase group 1  26.42 
 
 		 390 aa  78.2  0.0000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2518  glycosyl transferase group 1  31.46 
 
 		 411 aa  77.8  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.377974  normal  0.0256247 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0291  glycosyl transferase, group 1  33.48 
 
 		 382 aa  77.8  0.0000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.614818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  30.37 
 
 		 409 aa  77.8  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1622  glycosyl transferase group 1  26.64 
 
 		 402 aa  77.8  0.0000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0202  glycosyl transferase, group 1  29.14 
 
 		 369 aa  77.8  0.0000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3145  glycosyl transferase, group 1  29.31 
 
 		 427 aa  77.8  0.0000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.116626  normal  0.0485856 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1652  glycosyltransferase  27.66 
 
 		 350 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0183  glycosyl transferase, group 1  33.94 
 
 		 476 aa  77.4  0.0000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4615  glycosyl transferase, group 1  24.48 
 
 		 382 aa  77.4  0.0000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.352309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0136  glycosyl transferase, group 1  28.12 
 
 		 417 aa  77.4  0.0000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2716  glycosyl transferase group 1  33.7 
 
 		 400 aa  77  0.0000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2372  glycosyl transferase, group 1  26.68 
 
 		 383 aa  77  0.0000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.732911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2407  glycosyl transferase, group 1  32.97 
 
 		 404 aa  77  0.0000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3880  glycosyl transferase group 1  27.33 
 
 		 455 aa  77.4  0.0000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0838  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.26 
 
 		 419 aa  77  0.0000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0790  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  29.5 
 
 		 400 aa  77  0.0000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000379704 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0579  sulfolipid sulfoquinovosyldiacylglycerol biosynthesis protein  31.15 
 
 		 377 aa  76.6  0.0000000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  0.138904 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1266  glycosyl transferase, group 1  29.7 
 
 		 390 aa  76.6  0.0000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.610895  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3693  glycosyltransferase  27.66 
 
 		 350 aa  76.6  0.0000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1424  glycosyl transferase group 1  32.18 
 
 		 440 aa  76.3  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1091  glycosyl transferase group 1  29.17 
 
 		 378 aa  76.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1780  glycosyl transferase group 1  32.59 
 
 		 412 aa  76.3  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1001  glycosyl transferase group 1  28.65 
 
 		 411 aa  75.9  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2734  glycosyl transferase, group 1  33.17 
 
 		 403 aa  76.3  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1144  glycosyl transferase group 1  31.28 
 
 		 386 aa  75.9  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.157277  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04481  putative glycosyl transferase, group 1  25.34 
 
 		 385 aa  76.3  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.680324  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0477  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.66 
 
 		 349 aa  75.9  0.000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.319799  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1989  glycosyl transferase group 1  28.46 
 
 		 820 aa  75.5  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2152  glycosyl transferase, group 1  27.73 
 
 		 387 aa  75.1  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>