More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_2906 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_3139  glycosyl transferase, group 1 family protein  83.75 
 
 
400 aa  682    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.425615 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2906  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
400 aa  808    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.61318 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2716  glycosyl transferase group 1  83.75 
 
 
400 aa  663    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2575  glycosyl transferase, group 1  83.25 
 
 
411 aa  679    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1004  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  61.4 
 
 
408 aa  449  1e-125  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.531302 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3566  glycosyl transferase group 1  50.63 
 
 
407 aa  399  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2407  glycosyl transferase, group 1  49.75 
 
 
404 aa  360  3e-98  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0840  glycosyl transferase, group 1  48.87 
 
 
401 aa  344  2e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.609699  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2745  glycosyl transferase, group 1  45.61 
 
 
405 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.712111 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1084  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  45.61 
 
 
405 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2849  glycosyl transferase, group 1  46.85 
 
 
407 aa  325  9e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.639359  normal  0.534113 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3184  glycosyl transferase, group 1  42.36 
 
 
400 aa  252  9.000000000000001e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.845721  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  35.7 
 
 
409 aa  237  3e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  34.61 
 
 
414 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1851  glycosyl transferase group 1  34.84 
 
 
406 aa  228  1e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  35 
 
 
407 aa  228  2e-58  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.728152  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1001  glycosyl transferase group 1  31.39 
 
 
411 aa  224  3e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1812  glycosyl transferase, group 1  32.83 
 
 
406 aa  218  1e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1433  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.34 
 
 
409 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.985375  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3107  glycosyl transferase group 1  33.52 
 
 
426 aa  166  5.9999999999999996e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2371  glycosyl transferase, group 1  33.43 
 
 
430 aa  165  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64695  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1424  glycosyl transferase group 1  31.41 
 
 
440 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2433  glycosyl transferase, group 1  31.79 
 
 
417 aa  150  4e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.287149 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4331  glycosyl transferase group 1  30.08 
 
 
422 aa  144  4e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0666241 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02000  glycosyltransferase  31.13 
 
 
452 aa  143  5e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4271  glycosyl transferase group 1  30.08 
 
 
422 aa  143  7e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2192  glycosyl transferase, group 1  31.08 
 
 
437 aa  139  6e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.111626  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3576  glycosyl transferase group 1  30.21 
 
 
415 aa  139  7.999999999999999e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0615  glycosyl transferase, group 1  29.56 
 
 
420 aa  139  8.999999999999999e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0722468  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0766  glycosyl transferase group 1  29.56 
 
 
420 aa  139  8.999999999999999e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.676437  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0359  glycosyl transferase group 1  29.27 
 
 
410 aa  138  2e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2976  glycosyl transferase group 1  30.07 
 
 
417 aa  133  6e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.82983  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1993  putative glycosyltransferase  29.83 
 
 
414 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00985671  normal  0.577803 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2884  glycosyl transferase group 1  30.07 
 
 
417 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2261  glycosyl transferase, group 1  28.05 
 
 
410 aa  130  5.0000000000000004e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3906  glycosyl transferase, group 1  27.18 
 
 
416 aa  129  8.000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0901376 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2826  glycosyl transferase group 1  29.64 
 
 
426 aa  129  9.000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.342836 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1501  glycosyl transferase, group 1  31.05 
 
 
412 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3085  glycosyl transferase group 1  28.8 
 
 
409 aa  125  1e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0205  glycosyl transferase, group 1  29.92 
 
 
454 aa  124  3e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0738  glycosyltransferase-like  30.29 
 
 
443 aa  123  5e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5245  glycosyl transferase, group 1  29.7 
 
 
410 aa  123  6e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.844139 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2326  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  28.07 
 
 
406 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.45919  normal  0.147649 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2440  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  28.07 
 
 
406 aa  117  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000788378 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3400  O-antigen polymerase  27.51 
 
 
403 aa  117  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2225  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  27.82 
 
 
406 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.044252  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2282  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  27.82 
 
 
406 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000100013 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2333  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  27.05 
 
 
406 aa  114  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.68197 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1938  glycosyl transferase, group 1  32.87 
 
 
401 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.792782  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01950  predicted glycosyl transferase  28.16 
 
 
406 aa  108  1e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.144977  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01939  hypothetical protein  28.16 
 
 
406 aa  108  1e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.156433  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2798  glycosyl transferase group 1  31.64 
 
 
425 aa  108  2e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0488455  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0826  glycosyl transferase group 1  36.81 
 
 
350 aa  106  9e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0154  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.43 
 
 
360 aa  104  2e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4244  glycosyl transferase, group 1  26.07 
 
 
417 aa  105  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.772955 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1597  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
406 aa  104  3e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.308201  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2978  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  28.11 
 
 
406 aa  103  4e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0458092  hitchhiker  0.000111113 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1018  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  28.65 
 
 
406 aa  103  6e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2058  glycosyl transferase group 1  26.5 
 
 
452 aa  103  7e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0147128  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2336  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  28.53 
 
 
406 aa  102  9e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000162166  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1613  glycosyl transferase group 1  28.65 
 
 
406 aa  102  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0151504  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4215  glycosyl transferase, group 1  28.72 
 
 
407 aa  102  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.728114  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2658  glycosyl transferase, group 1  26.88 
 
 
406 aa  102  1e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1188  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  28.38 
 
 
406 aa  101  2e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4446  glycosyl transferase, group 1  37.14 
 
 
426 aa  100  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.342615  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  36.17 
 
 
398 aa  100  6e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  28.71 
 
 
373 aa  99  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4012  glycosyl transferase group 1  27.49 
 
 
403 aa  98.2  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.787898  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0028  LPS glycosyltransferase  31.16 
 
 
373 aa  97.4  4e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000218534  hitchhiker  0.00835571 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1345  glycosyl transferase, group 1  32.24 
 
 
398 aa  97.1  5e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2743  glycosyl transferase group 1  33.56 
 
 
367 aa  95.9  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3090  glycosyl transferase, group 1  41.11 
 
 
440 aa  95.5  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0459  glycosytransferase, putative  24.23 
 
 
350 aa  94.7  2e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00630871  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2186  glycosyl transferase group 1  32.18 
 
 
378 aa  93.2  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2364  Glycosyltransferase-like protein  27.76 
 
 
395 aa  92.8  9e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0691  glycosyl transferase, group 1  28.64 
 
 
377 aa  92.4  1e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0533386  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0387  glycosyl transferase group 1  31.52 
 
 
364 aa  92  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3803  glycosyl transferase group 1  31.3 
 
 
390 aa  92  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.395317 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0253  glycosyl transferase, group 1  35.21 
 
 
358 aa  92  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
378 aa  92  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2655  glycosyl transferase, group 1  32.56 
 
 
395 aa  91.7  2e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.268297  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  36.69 
 
 
360 aa  92  2e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5975  glycosyl transferase group 1  25.98 
 
 
415 aa  91.3  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.696902  normal  0.862392 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4597  glycosyl transferase group 1  26.82 
 
 
415 aa  90.9  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.211799  normal  0.982264 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0610  glycosyl transferase group 1  33.52 
 
 
367 aa  90.5  5e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02463  putative glycosyl transferase in colanic acid gene cluster  22.96 
 
 
419 aa  90.5  5e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00021101  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0158  glycosyl transferase, group 1  36.26 
 
 
398 aa  90.1  6e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1476  glycosyl transferase  32.61 
 
 
346 aa  90.1  6e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.621422  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1131  glycosyl transferase group 1  28.2 
 
 
904 aa  90.1  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.845699  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1381  glycosyl transferase group 1  31.61 
 
 
397 aa  89.7  8e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000217179 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3826  glycosyl transferase group 1  33.51 
 
 
409 aa  89  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.762475  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0783  glycosyl transferase group 1  28.15 
 
 
394 aa  89  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.492233  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0430  glycosyl transferase group 1  26.53 
 
 
379 aa  88.6  2e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0131441  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3080  glycosyl transferase group 1  40.37 
 
 
372 aa  89  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0202  glycosyl transferase, group 1  32.66 
 
 
381 aa  88.2  2e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1498  glycosyl transferase, group 1  22.44 
 
 
373 aa  88.2  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3926  glucosyltransferase  24.82 
 
 
411 aa  87.4  4e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7128  glycosyl transferase group 1  25.81 
 
 
415 aa  87  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.385044 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  38.89 
 
 
389 aa  86.7  6e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0676  glycosyl transferase group 1  38.61 
 
 
374 aa  86.7  6e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>