More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3184 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3184  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 400 aa  783    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.845721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2849  glycosyl transferase, group 1  46.23 
 
 		 407 aa  286  5e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.639359  normal  0.534113 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3566  glycosyl transferase group 1  41.06 
 
 		 407 aa  285  9e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0840  glycosyl transferase, group 1  45.23 
 
 		 401 aa  285  9e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.609699  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2906  glycosyl transferase group 1  42.36 
 
 		 400 aa  281  2e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.61318 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2745  glycosyl transferase, group 1  44.14 
 
 		 405 aa  280  2e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.712111 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1084  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  44.14 
 
 		 405 aa  280  5e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2407  glycosyl transferase, group 1  43.72 
 
 		 404 aa  277  2e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2575  glycosyl transferase, group 1  42.86 
 
 		 411 aa  272  6e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3139  glycosyl transferase, group 1 family protein  42.61 
 
 		 400 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.425615 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1004  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  44.11 
 
 		 408 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.531302 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2716  glycosyl transferase group 1  42.36 
 
 		 400 aa  265  1e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.09 
 
 		 407 aa  204  2e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.728152  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  33.25 
 
 		 409 aa  199  5e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1812  glycosyl transferase, group 1  33.66 
 
 		 406 aa  186  6e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  31.47 
 
 		 414 aa  182  7e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1001  glycosyl transferase group 1  32.67 
 
 		 411 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1851  glycosyl transferase group 1  34.36 
 
 		 406 aa  180  2.9999999999999997e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1433  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.34 
 
 		 409 aa  166  9e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.985375  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3400  O-antigen polymerase  35.08 
 
 		 403 aa  155  9e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3576  glycosyl transferase group 1  31.03 
 
 		 415 aa  144  3e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1501  glycosyl transferase, group 1  32.86 
 
 		 412 aa  143  5e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5245  glycosyl transferase, group 1  33.57 
 
 		 410 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844139 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2433  glycosyl transferase, group 1  28.98 
 
 		 417 aa  136  7.000000000000001e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.287149 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4331  glycosyl transferase group 1  30.24 
 
 		 422 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0666241 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4271  glycosyl transferase group 1  29.44 
 
 		 422 aa  134  3e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0359  glycosyl transferase group 1  28.64 
 
 		 410 aa  133  5e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02000  glycosyltransferase  31.46 
 
 		 452 aa  133  6.999999999999999e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3906  glycosyl transferase, group 1  29.79 
 
 		 416 aa  126  6e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0901376 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0766  glycosyl transferase group 1  31.09 
 
 		 420 aa  125  9e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.676437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0615  glycosyl transferase, group 1  31.09 
 
 		 420 aa  125  9e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0722468  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1424  glycosyl transferase group 1  32.69 
 
 		 440 aa  119  9e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1993  putative glycosyltransferase  31.45 
 
 		 414 aa  119  9.999999999999999e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00985671  normal  0.577803 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2371  glycosyl transferase, group 1  32.71 
 
 		 430 aa  115  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2192  glycosyl transferase, group 1  31.32 
 
 		 437 aa  114  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.111626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2826  glycosyl transferase group 1  33.42 
 
 		 426 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.342836 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3107  glycosyl transferase group 1  31.65 
 
 		 426 aa  108  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2884  glycosyl transferase group 1  33.24 
 
 		 417 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2976  glycosyl transferase group 1  32.02 
 
 		 417 aa  107  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.82983  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0205  glycosyl transferase, group 1  35.29 
 
 		 454 aa  107  4e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3085  glycosyl transferase group 1  25.95 
 
 		 409 aa  104  3e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0459  glycosytransferase, putative  24.07 
 
 		 350 aa  102  9e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00630871  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6471  glycosyl transferase group 1  32.68 
 
 		 405 aa  102  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.214546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0054  glycosyl transferase group 1  27.84 
 
 		 364 aa  98.6  2e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.000000226756  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2058  glycosyl transferase group 1  29.02 
 
 		 452 aa  96.7  6e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0147128  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1507  glycosyl transferase group 1  34.02 
 
 		 395 aa  95.5  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.255833 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  30.92 
 
 		 360 aa  94.7  2e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0245  glycosyl transferase group 1  26.76 
 
 		 396 aa  94.7  3e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0172332  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7223  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 		 413 aa  94  5e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0752663  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0838  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.18 
 
 		 419 aa  92.8  9e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0839  glycosyl transferase group 1  30.03 
 
 		 395 aa  91.3  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0770239  normal  0.045052 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0691  glycosyl transferase, group 1  29.73 
 
 		 377 aa  92  2e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0533386  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0321  glycosyl transferase group 1  31.48 
 
 		 388 aa  90.9  4e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5016  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.14 
 
 		 378 aa  90.1  5e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.506111  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4215  glycosyl transferase, group 1  27.41 
 
 		 407 aa  90.5  5e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.728114  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0028  LPS glycosyltransferase  28.66 
 
 		 373 aa  89.4  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000218534  hitchhiker  0.00835571 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2743  glycosyl transferase group 1  33.45 
 
 		 367 aa  88.6  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2372  glycosyl transferase, group 1  34.76 
 
 		 383 aa  88.2  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.732911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3106  glycosyl transferase group 1  35.1 
 
 		 382 aa  87.4  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2261  glycosyl transferase, group 1  25.85 
 
 		 410 aa  87  5e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  29.52 
 
 		 391 aa  86.7  6e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3735  glycosyl transferase group 1  30.18 
 
 		 355 aa  86.7  7e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0199  glycosyl transferase group 1  28.14 
 
 		 394 aa  86.3  8e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00799925  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02463  putative glycosyl transferase in colanic acid gene cluster  23.52 
 
 		 419 aa  85.1  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00021101  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0365  glycosyl transferase group 1  28.09 
 
 		 387 aa  84.7  0.000000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0957  glycosyl transferase, group 1  28.97 
 
 		 386 aa  84  0.000000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.258156  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3213  glycosyl transferase group 1  31.58 
 
 		 383 aa  84  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1586  glycosyl transferase, group 1  25.46 
 
 		 355 aa  83.6  0.000000000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.381696  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0050  glycosyl transferase  26.77 
 
 		 360 aa  83.2  0.000000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000000688339  normal  0.0134291 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0826  glycosyl transferase group 1  36.59 
 
 		 350 aa  82.8  0.000000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4417  glycosyl transferase group 1  34.15 
 
 		 406 aa  82.4  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0430  glycosyl transferase group 1  24.74 
 
 		 379 aa  82.4  0.00000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0131441  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0451  putative glycosyl transferase  26.69 
 
 		 401 aa  82.4  0.00000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5001  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.74 
 
 		 365 aa  81.3  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0552  glycosyl transferase  28.8 
 
 		 383 aa  81.6  0.00000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.219482 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2282  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  26.73 
 
 		 406 aa  82  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000100013 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0857  glycosyl transferase group 1  26.72 
 
 		 355 aa  81.6  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.123894  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0154  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.86 
 
 		 360 aa  81.3  0.00000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0738  glycosyltransferase-like  29.55 
 
 		 443 aa  81.3  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2591  glycosyl transferase, group 1  31.27 
 
 		 373 aa  80.9  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3926  glucosyltransferase  28.47 
 
 		 411 aa  81.3  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2798  glycosyl transferase group 1  31.4 
 
 		 425 aa  80.9  0.00000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0488455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3935  glycosyl transferase group 1  27.11 
 
 		 367 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000241521  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1401  glycosyl transferase group 1  37.93 
 
 		 426 aa  80.9  0.00000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.52181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0407  glycosyl transferase group 1  34.02 
 
 		 750 aa  80.5  0.00000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1102  glycosyl transferase group 1  25.62 
 
 		 358 aa  80.1  0.00000000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0017  glycosyl transferase group 1  33.78 
 
 		 366 aa  80.1  0.00000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0190487  normal  0.0199927 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2152  glycosyl transferase, group 1  27.49 
 
 		 387 aa  79.7  0.00000000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0126  glycosyl transferase group 1  33.91 
 
 		 371 aa  79.7  0.00000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1438  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.67 
 
 		 356 aa  79.3  0.0000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1562  glycosyl transferase group 1  36.63 
 
 		 381 aa  79  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.395728  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2253  glycosyl transferase, group 1  34.74 
 
 		 413 aa  79  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.790793 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0207  glycosyl transferase group 1  38.04 
 
 		 398 aa  79  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1976  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.5 
 
 		 373 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2333  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  26.24 
 
 		 406 aa  78.2  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.68197 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0511  glycosyl transferase group 1  29.08 
 
 		 381 aa  78.2  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1381  glycosyl transferase group 1  32.45 
 
 		 397 aa  78.6  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000217179 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0591  glycosyl transferase, group 1  32.23 
 
 		 373 aa  79  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.42077 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0780  glycosyl transferase group 1  28.31 
 
 		 378 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2514  glycosyl transferase group 1  34.66 
 
 		 351 aa  79  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0260745  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>